MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 3486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018661	GCGGA	2	10	212	221	20 %	0 %	60 %	20 %	407471750
2	NC_018661	TTTAC	2	10	2884	2893	20 %	60 %	0 %	20 %	407471748
3	NC_018661	TGGCG	2	10	7563	7572	0 %	20 %	60 %	20 %	407471744
4	NC_018661	TGAAA	2	10	8755	8764	60 %	20 %	20 %	0 %	407471742
5	NC_018661	TTATG	2	10	9669	9678	20 %	60 %	20 %	0 %	407471741
6	NC_018661	AAACT	2	10	10140	10149	60 %	20 %	0 %	20 %	407471741
7	NC_018661	GGTAC	2	10	10322	10331	20 %	20 %	40 %	20 %	407471740
8	NC_018661	AGTGA	2	10	10400	10409	40 %	20 %	40 %	0 %	407471740
9	NC_018661	TTATT	2	10	12260	12269	20 %	80 %	0 %	0 %	407471738
10	NC_018661	TCTCT	2	10	13093	13102	0 %	60 %	0 %	40 %	407471738
11	NC_018661	ACCTG	2	10	16261	16270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018661	CGCAG	2	10	17225	17234	20 %	0 %	40 %	40 %	407471733
13	NC_018661	TGGTG	2	10	21207	21216	0 %	40 %	60 %	0 %	407471730
14	NC_018661	TGAAA	2	10	22659	22668	60 %	20 %	20 %	0 %	407471727
15	NC_018661	AAATG	2	10	27339	27348	60 %	20 %	20 %	0 %	407471722
16	NC_018661	ATTTT	2	10	28080	28089	20 %	80 %	0 %	0 %	407471721
17	NC_018661	CCGCA	2	10	29328	29337	20 %	0 %	20 %	60 %	407471718
18	NC_018661	TGGGC	2	10	33117	33126	0 %	20 %	60 %	20 %	407471714
19	NC_018661	GGCGC	2	10	33157	33166	0 %	0 %	60 %	40 %	407471714
20	NC_018661	GTGTT	2	10	33187	33196	0 %	60 %	40 %	0 %	407471714
21	NC_018661	TCCGA	2	10	33814	33823	20 %	20 %	20 %	40 %	407471713
22	NC_018661	TCTGG	2	10	35077	35086	0 %	40 %	40 %	20 %	407471711
23	NC_018661	CTGGC	2	10	35186	35195	0 %	20 %	40 %	40 %	407471711
24	NC_018661	GCACG	2	10	35980	35989	20 %	0 %	40 %	40 %	407471711
25	NC_018661	GCTGC	2	10	36563	36572	0 %	20 %	40 %	40 %	407471710
26	NC_018661	GCGGA	2	10	39548	39557	20 %	0 %	60 %	20 %	407471708
27	NC_018661	TGCCT	2	10	40267	40276	0 %	40 %	20 %	40 %	407471708
28	NC_018661	ATTCC	2	10	41560	41569	20 %	40 %	0 %	40 %	407471707
29	NC_018661	CTCGC	2	10	42557	42566	0 %	20 %	20 %	60 %	407471706
30	NC_018661	TCAGG	2	10	42585	42594	20 %	20 %	40 %	20 %	407471706
31	NC_018661	CGCGG	2	10	42943	42952	0 %	0 %	60 %	40 %	407471705
32	NC_018661	CGTTT	2	10	44590	44599	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018661	CGACC	2	10	45072	45081	20 %	0 %	20 %	60 %	407471703
34	NC_018661	GTATT	2	10	47760	47769	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018661	TTGAT	2	10	47936	47945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018661	AATAG	2	10	48029	48038	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018661	CATCT	2	10	48612	48621	20 %	40 %	0 %	40 %	407471699
38	NC_018661	TCTGG	2	10	49430	49439	0 %	40 %	40 %	20 %	407471698
39	NC_018661	GAAAG	2	10	51830	51839	60 %	0 %	40 %	0 %	407471692
40	NC_018661	ATGAA	2	10	53578	53587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018661	CACCG	2	10	57220	57229	20 %	0 %	20 %	60 %	407471686
42	NC_018661	TTGAT	2	10	60109	60118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018661	ACTCA	2	10	61031	61040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018661	CACTT	2	10	62267	62276	20 %	40 %	0 %	40 %	407471681
45	NC_018661	ACCAG	2	10	64760	64769	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018661	TGCTC	2	10	67714	67723	0 %	40 %	20 %	40 %	407471674
47	NC_018661	AGGCC	2	10	67903	67912	20 %	0 %	40 %	40 %	407471674
48	NC_018661	CTCCC	2	10	68677	68686	0 %	20 %	0 %	80 %	407471673
49	NC_018661	AAGGC	2	10	68909	68918	40 %	0 %	40 %	20 %	407471672
50	NC_018661	CCAGC	2	10	70922	70931	20 %	0 %	20 %	60 %	407471670
51	NC_018661	ACGTC	2	10	71587	71596	20 %	20 %	20 %	40 %	407471670
52	NC_018661	GGCCT	2	10	72535	72544	0 %	20 %	40 %	40 %	407471668
53	NC_018661	GAGCA	2	10	72724	72733	40 %	0 %	40 %	20 %	407471668
54	NC_018661	TTTAA	2	10	74586	74595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018661	TGCTC	2	10	75571	75580	0 %	40 %	20 %	40 %	407471664
56	NC_018661	AGGCC	2	10	75760	75769	20 %	0 %	40 %	40 %	407471664
57	NC_018661	ATCCT	2	10	75978	75987	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018661	GTTCG	2	10	77496	77505	0 %	40 %	40 %	20 %	407471661
59	NC_018661	TTGAA	2	10	77751	77760	40 %	40 %	20 %	0 %	407471660
60	NC_018661	AGGAA	2	10	77945	77954	60 %	0 %	40 %	0 %	407471660
61	NC_018661	ATTTT	2	10	78587	78596	20 %	80 %	0 %	0 %	407471659
62	NC_018661	CAGCG	2	10	79179	79188	20 %	0 %	40 %	40 %	407471658
63	NC_018661	GGGAT	2	10	79322	79331	20 %	20 %	60 %	0 %	407471658
64	NC_018661	GGCCT	2	10	79679	79688	0 %	20 %	40 %	40 %	407471657
65	NC_018661	GAGCA	2	10	79868	79877	40 %	0 %	40 %	20 %	407471657
66	NC_018661	GCCAA	2	10	81578	81587	40 %	0 %	20 %	40 %	407471655
67	NC_018661	GCATC	2	10	82069	82078	20 %	20 %	20 %	40 %	407471655
68	NC_018661	CGCGC	2	10	83248	83257	0 %	0 %	40 %	60 %	407471655
69	NC_018661	TAATA	2	10	84818	84827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018661	TCTTT	2	10	85942	85951	0 %	80 %	0 %	20 %	407471651
71	NC_018661	CTTAC	2	10	87130	87139	20 %	40 %	0 %	40 %	407471650
72	NC_018661	TTAAT	2	10	87284	87293	40 %	60 %	0 %	0 %	407471650
73	NC_018661	GTTTG	2	10	89754	89763	0 %	60 %	40 %	0 %	407471649
74	NC_018661	CTTTA	2	10	90300	90309	20 %	60 %	0 %	20 %	407471649
75	NC_018661	CGGAC	2	10	92852	92861	20 %	0 %	40 %	40 %	407471647
76	NC_018661	CGCTT	2	10	95297	95306	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_018661	GTGTG	2	10	101151	101160	0 %	40 %	60 %	0 %	407471641
78	NC_018661	CGGGA	2	10	101934	101943	20 %	0 %	60 %	20 %	407471640
79	NC_018661	CCAGG	2	10	102411	102420	20 %	0 %	40 %	40 %	407471640
80	NC_018661	GAATC	2	10	106825	106834	40 %	20 %	20 %	20 %	407471636
81	NC_018661	CAGAT	2	10	108923	108932	40 %	20 %	20 %	20 %	407471632
82	NC_018661	TGGCG	2	10	110361	110370	0 %	20 %	60 %	20 %	407471631
83	NC_018661	ACGCT	2	10	112398	112407	20 %	20 %	20 %	40 %	407471627
84	NC_018661	GAATG	2	10	116978	116987	40 %	20 %	40 %	0 %	407471623
85	NC_018661	TCTAT	2	10	117728	117737	20 %	60 %	0 %	20 %	407471622
86	NC_018661	ATTTA	2	10	118873	118882	40 %	60 %	0 %	0 %	407471621
87	NC_018661	TATAA	2	10	119217	119226	60 %	40 %	0 %	0 %	407471621
88	NC_018661	AACAA	2	10	119515	119524	80 %	0 %	0 %	20 %	407471620
89	NC_018661	AATTA	2	10	119609	119618	60 %	40 %	0 %	0 %	407471620
90	NC_018661	CAATG	2	10	122035	122044	40 %	20 %	20 %	20 %	407471618
91	NC_018661	TGTGC	2	10	124357	124366	0 %	40 %	40 %	20 %	407471616
92	NC_018661	ACGGA	2	10	130845	130854	40 %	0 %	40 %	20 %	407471610
93	NC_018661	GCGCG	2	10	131138	131147	0 %	0 %	60 %	40 %	407471610
94	NC_018661	TCATC	2	10	132596	132605	20 %	40 %	0 %	40 %	407471609
95	NC_018661	GCACA	2	10	135466	135475	40 %	0 %	20 %	40 %	407471606
96	NC_018661	AACAA	2	10	135610	135619	80 %	0 %	0 %	20 %	407471605
97	NC_018661	GCGGT	2	10	136641	136650	0 %	20 %	60 %	20 %	407471604
98	NC_018661	CCACG	2	10	137639	137648	20 %	0 %	20 %	60 %	407471603
99	NC_018661	GGGAT	2	10	137977	137986	20 %	20 %	60 %	0 %	407471603
100	NC_018661	GGGCA	2	10	138172	138181	20 %	0 %	60 %	20 %	407471602
101	NC_018661	CAAAG	2	10	140269	140278	60 %	0 %	20 %	20 %	407471600
102	NC_018661	TCTTT	2	10	140284	140293	0 %	80 %	0 %	20 %	407471600
103	NC_018661	CATGC	2	10	140320	140329	20 %	20 %	20 %	40 %	407471600
104	NC_018661	TTGTG	2	10	142408	142417	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018661	CGGTG	2	10	144600	144609	0 %	20 %	60 %	20 %	407471598
106	NC_018661	CAGAG	2	10	144811	144820	40 %	0 %	40 %	20 %	407471598
107	NC_018661	TTTGG	2	10	146154	146163	0 %	60 %	40 %	0 %	407471598
108	NC_018661	CGCTG	2	10	146805	146814	0 %	20 %	40 %	40 %	407471598
109	NC_018661	CTAAA	2	10	149400	149409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018661	TGCAT	2	10	149775	149784	20 %	40 %	20 %	20 %	407471594
111	NC_018661	GCAGT	2	10	149837	149846	20 %	20 %	40 %	20 %	407471594
112	NC_018661	ATTGC	2	10	150267	150276	20 %	40 %	20 %	20 %	407471593
113	NC_018661	ACCGT	2	10	151887	151896	20 %	20 %	20 %	40 %	407471592
114	NC_018661	GGTCA	2	10	152255	152264	20 %	20 %	40 %	20 %	407471592
115	NC_018661	TTTTG	2	10	153834	153843	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018661	TATTT	2	10	156178	156187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018661	CGGTG	2	10	162062	162071	0 %	20 %	60 %	20 %	407471585
118	NC_018661	CGGGC	2	10	163983	163992	0 %	0 %	60 %	40 %	407471585
119	NC_018661	CGCAG	2	10	166198	166207	20 %	0 %	40 %	40 %	407471583
120	NC_018661	CGCGG	2	10	167634	167643	0 %	0 %	60 %	40 %	407471582
121	NC_018661	TGATG	2	10	170698	170707	20 %	40 %	40 %	0 %	407471580
122	NC_018661	AGATG	2	10	172645	172654	40 %	20 %	40 %	0 %	407471577
123	NC_018661	AGGTA	2	10	173131	173140	40 %	20 %	40 %	0 %	407471577
124	NC_018661	GGCGA	2	10	176615	176624	20 %	0 %	60 %	20 %	407471573
125	NC_018661	AGCCC	2	10	178271	178280	20 %	0 %	20 %	60 %	407471570
126	NC_018661	TTGGG	2	10	180422	180431	0 %	40 %	60 %	0 %	407471567
127	NC_018661	AGCGG	2	10	181443	181452	20 %	0 %	60 %	20 %	407471566
128	NC_018661	CCCAA	2	10	183374	183383	40 %	0 %	0 %	60 %	407471563
129	NC_018661	GCCCA	2	10	183839	183848	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_018661	GTTTT	2	10	184588	184597	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018661	CATGG	2	10	187380	187389	20 %	20 %	40 %	20 %	407471561
132	NC_018661	AAAGC	2	10	188008	188017	60 %	0 %	20 %	20 %	407471561
133	NC_018661	ATGCC	2	10	190353	190362	20 %	20 %	20 %	40 %	407471559
134	NC_018661	AGCGT	2	10	190790	190799	20 %	20 %	40 %	20 %	407471559
135	NC_018661	ATTTT	2	10	192452	192461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018661	CTGGG	2	10	193501	193510	0 %	20 %	60 %	20 %	407471557
137	NC_018661	GCGCA	2	10	196604	196613	20 %	0 %	40 %	40 %	407471553
138	NC_018661	CTGGG	2	10	198429	198438	0 %	20 %	60 %	20 %	407471551
139	NC_018661	ATCGA	2	10	199878	199887	40 %	20 %	20 %	20 %	407471550
140	NC_018661	GTTAC	2	10	201705	201714	20 %	40 %	20 %	20 %	407471548
141	NC_018661	GATTC	2	10	202588	202597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018661	TTACG	2	10	203220	203229	20 %	40 %	20 %	20 %	407471546
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150	NC_018661	GAAAG	2	10	212652	212661	60 %	0 %	40 %	0 %	407471537
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165	NC_018661	ATTTT	2	10	232072	232081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_018661	GTTCA	2	10	350665	350674	20 %	40 %	20 %	20 %	407471420
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263	NC_018661	AGCGC	2	10	358440	358449	20 %	0 %	40 %	40 %	407471412
264	NC_018661	GTCCG	2	10	359277	359286	0 %	20 %	40 %	40 %	407471411
265	NC_018661	ACGGC	2	10	360254	360263	20 %	0 %	40 %	40 %	407471411
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267	NC_018661	CCGTT	2	10	361992	362001	0 %	40 %	20 %	40 %	407471408
268	NC_018661	GATTT	2	10	362336	362345	20 %	60 %	20 %	0 %	407471408
269	NC_018661	GTGGC	2	10	363665	363674	0 %	20 %	60 %	20 %	407471406
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271	NC_018661	TGCGC	2	10	366189	366198	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
272	NC_018661	CATGT	2	10	366448	366457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_018661	TGACC	2	10	367578	367587	20 %	20 %	20 %	40 %	407471403
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384	NC_018661	CAAAA	2	10	568883	568892	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
385	NC_018661	GCATC	2	10	569461	569470	20 %	20 %	20 %	40 %	407471198
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389	NC_018661	GTTCA	2	10	573087	573096	20 %	40 %	20 %	20 %	407471194
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395	NC_018661	TGACC	2	10	577577	577586	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
396	NC_018661	GAATG	2	10	577745	577754	40 %	20 %	40 %	0 %	407471189
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