MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_018661	GCG	2	6	196845	196850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471553
4003	NC_018661	TG	3	6	196875	196880	0 %	50 %	50 %	0 %	407471553
4004	NC_018661	CAT	2	6	196883	196888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471553
4005	NC_018661	GTA	2	6	196922	196927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471553
4006	NC_018661	AT	3	6	196944	196949	50 %	50 %	0 %	0 %	407471553
4007	NC_018661	CAC	2	6	197021	197026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471553
4008	NC_018661	CCG	2	6	197049	197054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471553
4009	NC_018661	TTC	2	6	197058	197063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471553
4010	NC_018661	GAA	2	6	197105	197110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471553
4011	NC_018661	GCA	2	6	197140	197145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471553
4012	NC_018661	A	6	6	197215	197220	100 %	0 %	0 %	0 %	407471553
4013	NC_018661	A	6	6	197273	197278	100 %	0 %	0 %	0 %	407471553
4014	NC_018661	GTG	2	6	197397	197402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471553
4015	NC_018661	ATC	2	6	197406	197411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471553
4016	NC_018661	ACC	2	6	197412	197417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471553
4017	NC_018661	A	7	7	197491	197497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018661	AAT	2	6	197532	197537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_018661	ATAA	2	8	197605	197612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018661	ATG	3	9	197645	197653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471552
4021	NC_018661	CTTT	2	8	197658	197665	0 %	75 %	0 %	25 %	407471552
4022	NC_018661	GTT	2	6	197694	197699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471552
4023	NC_018661	CGTT	2	8	197750	197757	0 %	50 %	25 %	25 %	407471552
4024	NC_018661	GGC	2	6	197785	197790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471552
4025	NC_018661	A	6	6	197814	197819	100 %	0 %	0 %	0 %	407471552
4026	NC_018661	T	6	6	197920	197925	0 %	100 %	0 %	0 %	407471552
4027	NC_018661	TCCA	2	8	197978	197985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_018661	CCTT	2	8	198001	198008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_018661	ATA	2	6	198034	198039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471551
4030	NC_018661	GC	4	8	198176	198183	0 %	0 %	50 %	50 %	407471551
4031	NC_018661	GGC	2	6	198200	198205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471551
4032	NC_018661	TCG	2	6	198224	198229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471551
4033	NC_018661	CCGA	2	8	198231	198238	25 %	0 %	25 %	50 %	407471551
4034	NC_018661	ACT	2	6	198274	198279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471551
4035	NC_018661	GGT	2	6	198290	198295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471551
4036	NC_018661	CTGGG	2	10	198429	198438	0 %	20 %	60 %	20 %	407471551
4037	NC_018661	ACTT	2	8	198474	198481	25 %	50 %	0 %	25 %	407471551
4038	NC_018661	CAG	2	6	198483	198488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471551
4039	NC_018661	TGG	2	6	198491	198496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471551
4040	NC_018661	ACC	2	6	198615	198620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471551
4041	NC_018661	GCA	2	6	198728	198733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471551
4042	NC_018661	GCT	2	6	198734	198739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471551
4043	NC_018661	CCGCTG	2	12	198753	198764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407471551
4044	NC_018661	GCC	2	6	198789	198794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471551
4045	NC_018661	CTG	2	6	198807	198812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471551
4046	NC_018661	TAC	2	6	198897	198902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471551
4047	NC_018661	CAA	2	6	198935	198940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471551
4048	NC_018661	TAAG	2	8	198944	198951	50 %	25 %	25 %	0 %	407471551
4049	NC_018661	GGC	2	6	198953	198958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_018661	TGG	2	6	198979	198984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471550
4051	NC_018661	CCA	2	6	199005	199010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471550
4052	NC_018661	TGC	2	6	199040	199045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4053	NC_018661	TGC	2	6	199103	199108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4054	NC_018661	CGT	2	6	199113	199118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4055	NC_018661	GCT	2	6	199304	199309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4056	NC_018661	CTG	2	6	199347	199352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4057	NC_018661	CTG	3	9	199455	199463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4058	NC_018661	GAA	2	6	199617	199622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471550
4059	NC_018661	GAA	2	6	199650	199655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471550
4060	NC_018661	CTG	2	6	199698	199703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4061	NC_018661	GAA	2	6	199704	199709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471550
4062	NC_018661	TGG	2	6	199720	199725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471550
4063	NC_018661	ACG	2	6	199837	199842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4064	NC_018661	CTG	2	6	199848	199853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
4065	NC_018661	ATCGA	2	10	199878	199887	40 %	20 %	20 %	20 %	407471550
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4069	NC_018661	ACCG	2	8	199965	199972	25 %	0 %	25 %	50 %	407471550
4070	NC_018661	A	6	6	199974	199979	100 %	0 %	0 %	0 %	407471550
4071	NC_018661	GCTG	3	12	200069	200080	0 %	25 %	50 %	25 %	407471550
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4074	NC_018661	TGA	2	6	200279	200284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471550
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4080	NC_018661	CGT	2	6	200613	200618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471550
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4082	NC_018661	GGC	3	9	200696	200704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471550
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4085	NC_018661	TGA	2	6	200936	200941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471550
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4089	NC_018661	ATA	2	6	201084	201089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_018661	TAA	2	6	201100	201105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_018661	TCT	2	6	201106	201111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_018661	AT	3	6	201131	201136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018661	T	7	7	201150	201156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018661	GAA	2	6	201173	201178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_018661	TTA	2	6	201185	201190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_018661	CAGA	2	8	201246	201253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_018661	CTTT	2	8	201376	201383	0 %	75 %	0 %	25 %	407471549
4098	NC_018661	GAT	2	6	201420	201425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471549
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4102	NC_018661	ATTT	2	8	201571	201578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018661	ATA	2	6	201588	201593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018661	CGAT	2	8	201609	201616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_018661	TATT	2	8	201617	201624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018661	A	7	7	201640	201646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018661	GTTAC	2	10	201705	201714	20 %	40 %	20 %	20 %	407471548
4108	NC_018661	TGA	2	6	201844	201849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471548
4109	NC_018661	TAA	2	6	201921	201926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_018661	TAC	2	6	202031	202036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_018661	CAA	2	6	202101	202106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_018661	TCA	2	6	202150	202155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_018661	CTTA	2	8	202203	202210	25 %	50 %	0 %	25 %	407471547
4114	NC_018661	ATC	2	6	202326	202331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471547
4115	NC_018661	GTT	2	6	202381	202386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471547
4116	NC_018661	GCT	2	6	202440	202445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471547
4117	NC_018661	CTC	2	6	202485	202490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_018661	GATTC	2	10	202588	202597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4119	NC_018661	AT	3	6	202649	202654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_018661	A	6	6	202725	202730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018661	T	6	6	202747	202752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018661	ACA	2	6	202762	202767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_018661	GT	3	6	202870	202875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018661	T	7	7	202886	202892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018661	GCG	2	6	202954	202959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471546
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4374	NC_018661	TTG	2	6	215828	215833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471535
4375	NC_018661	ATT	2	6	215842	215847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471535
4376	NC_018661	A	6	6	215880	215885	100 %	0 %	0 %	0 %	407471535
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4380	NC_018661	CTG	2	6	216423	216428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471534
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4386	NC_018661	CG	3	6	217066	217071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4387	NC_018661	GTTT	2	8	217163	217170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4390	NC_018661	T	6	6	217255	217260	0 %	100 %	0 %	0 %	407471533
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4398	NC_018661	GCC	2	6	217381	217386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471533
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4429	NC_018661	T	6	6	219062	219067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4430	NC_018661	TCGAC	2	10	219113	219122	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4432	NC_018661	AC	3	6	219209	219214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4434	NC_018661	T	7	7	219287	219293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_018661	T	7	7	219309	219315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4436	NC_018661	TGGC	2	8	219326	219333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4437	NC_018661	T	7	7	219404	219410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4438	NC_018661	CTG	2	6	219495	219500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4439	NC_018661	T	7	7	219518	219524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4440	NC_018661	TTTG	2	8	219529	219536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4443	NC_018661	A	6	6	219706	219711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_018661	ACA	2	6	219747	219752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4497	NC_018661	CGA	2	6	222474	222479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471531
4498	NC_018661	CTG	2	6	222497	222502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471531
4499	NC_018661	CTG	2	6	222509	222514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471531
4500	NC_018661	GTG	2	6	222521	222526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471531

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