MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018661	CTT	2	6	149163	149168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471596
3002	NC_018661	GATAAA	2	12	149185	149196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_018661	TGA	2	6	149240	149245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_018661	ATTA	2	8	149304	149311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_018661	A	6	6	149324	149329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_018661	ATA	2	6	149331	149336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_018661	CAG	2	6	149339	149344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_018661	GAT	2	6	149347	149352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_018661	CTAAA	2	10	149400	149409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3010	NC_018661	GGC	2	6	149413	149418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_018661	ATC	2	6	149451	149456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_018661	CTT	2	6	149484	149489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471595
3013	NC_018661	A	6	6	149544	149549	100 %	0 %	0 %	0 %	407471595
3014	NC_018661	TCC	2	6	149552	149557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471595
3015	NC_018661	TCCG	2	8	149570	149577	0 %	25 %	25 %	50 %	407471595
3016	NC_018661	TAT	2	6	149622	149627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471595
3017	NC_018661	T	7	7	149693	149699	0 %	100 %	0 %	0 %	407471594
3018	NC_018661	TCAG	2	8	149721	149728	25 %	25 %	25 %	25 %	407471594
3019	NC_018661	TTG	2	6	149740	149745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471594
3020	NC_018661	TGCAT	2	10	149775	149784	20 %	40 %	20 %	20 %	407471594
3021	NC_018661	CTG	2	6	149797	149802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471594
3022	NC_018661	GGC	2	6	149814	149819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471594
3023	NC_018661	GGT	2	6	149820	149825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471594
3024	NC_018661	CGC	2	6	149828	149833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471594
3025	NC_018661	GCAGT	2	10	149837	149846	20 %	20 %	40 %	20 %	407471594
3026	NC_018661	TCG	3	9	149868	149876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471594
3027	NC_018661	CGT	2	6	149896	149901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471594
3028	NC_018661	TTC	2	6	149909	149914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471594
3029	NC_018661	CAG	2	6	149927	149932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471594
3030	NC_018661	CCGTCG	2	12	150015	150026	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407471594
3031	NC_018661	AGA	2	6	150087	150092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471594
3032	NC_018661	CGG	2	6	150118	150123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471594
3033	NC_018661	TTG	2	6	150202	150207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471594
3034	NC_018661	CCA	2	6	150259	150264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471594
3035	NC_018661	ATTGC	2	10	150267	150276	20 %	40 %	20 %	20 %	407471593
3036	NC_018661	GCC	2	6	150344	150349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471593
3037	NC_018661	TGC	2	6	150373	150378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471593
3038	NC_018661	ATC	2	6	150397	150402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471593
3039	NC_018661	CAT	2	6	150546	150551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471593
3040	NC_018661	CGC	2	6	150598	150603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471593
3041	NC_018661	CAC	2	6	150645	150650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471593
3042	NC_018661	TTC	2	6	150652	150657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471593
3043	NC_018661	ACC	2	6	150671	150676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471593
3044	NC_018661	TCG	2	6	150689	150694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471593
3045	NC_018661	TGA	2	6	150716	150721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471593
3046	NC_018661	GCCGAA	2	12	150914	150925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471593
3047	NC_018661	CGG	2	6	150945	150950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471593
3048	NC_018661	TTC	2	6	150970	150975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471593
3049	NC_018661	TCA	2	6	151008	151013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471593
3050	NC_018661	GAT	2	6	151060	151065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471593
3051	NC_018661	CGG	2	6	151155	151160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471593
3052	NC_018661	CAT	2	6	151197	151202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471593
3053	NC_018661	TGC	2	6	151209	151214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471593
3054	NC_018661	ACCA	2	8	151258	151265	50 %	0 %	0 %	50 %	407471593
3055	NC_018661	ACC	2	6	151307	151312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471593
3056	NC_018661	CAG	2	6	151354	151359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471593
3057	NC_018661	TCA	2	6	151425	151430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_018661	GAG	2	6	151488	151493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_018661	GCG	2	6	151510	151515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_018661	CAA	2	6	151552	151557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_018661	TTAC	2	8	151643	151650	25 %	50 %	0 %	25 %	407471592
3062	NC_018661	TGG	2	6	151684	151689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471592
3063	NC_018661	TG	3	6	151690	151695	0 %	50 %	50 %	0 %	407471592
3064	NC_018661	TCA	2	6	151716	151721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471592
3065	NC_018661	GTT	2	6	151763	151768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471592
3066	NC_018661	TCT	3	9	151806	151814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471592
3067	NC_018661	ACCGT	2	10	151887	151896	20 %	20 %	20 %	40 %	407471592
3068	NC_018661	GCT	2	6	151996	152001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3069	NC_018661	CTT	3	9	152020	152028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471592
3070	NC_018661	GCA	2	6	152154	152159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3071	NC_018661	GGTCA	2	10	152255	152264	20 %	20 %	40 %	20 %	407471592
3072	NC_018661	GTGA	2	8	152267	152274	25 %	25 %	50 %	0 %	407471592
3073	NC_018661	GGC	2	6	152292	152297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471592
3074	NC_018661	GTT	2	6	152300	152305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471592
3075	NC_018661	GAT	2	6	152414	152419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471592
3076	NC_018661	TACG	2	8	152422	152429	25 %	25 %	25 %	25 %	407471592
3077	NC_018661	CAG	2	6	152455	152460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3078	NC_018661	ACG	2	6	152504	152509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3079	NC_018661	TGC	2	6	152513	152518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3080	NC_018661	ATC	2	6	152525	152530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471592
3081	NC_018661	TTC	2	6	152531	152536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471592
3082	NC_018661	CGC	2	6	152591	152596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471592
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3084	NC_018661	ACC	2	6	152687	152692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471592
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3087	NC_018661	ACC	2	6	152795	152800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471592
3088	NC_018661	GAT	2	6	152810	152815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471592
3089	NC_018661	CCGC	2	8	152823	152830	0 %	0 %	25 %	75 %	407471592
3090	NC_018661	CAG	2	6	152870	152875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3091	NC_018661	ACCTGG	2	12	152885	152896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3092	NC_018661	GAA	2	6	152912	152917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471592
3093	NC_018661	CTG	2	6	152942	152947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3094	NC_018661	GCG	2	6	152956	152961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471592
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3100	NC_018661	CAA	2	6	153094	153099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471592
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3104	NC_018661	CGA	2	6	153286	153291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471592
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3108	NC_018661	CAG	2	6	153368	153373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471592
3109	NC_018661	ATC	2	6	153390	153395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471592
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3111	NC_018661	AATA	2	8	153443	153450	75 %	25 %	0 %	0 %	407471592
3112	NC_018661	TGA	2	6	153457	153462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471592
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3115	NC_018661	GGC	2	6	153620	153625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_018661	TG	3	6	153698	153703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018661	AG	3	6	153730	153735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_018661	TCA	2	6	153752	153757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_018661	A	6	6	153772	153777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018661	CAA	2	6	153779	153784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_018661	TTTTG	2	10	153834	153843	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3369	NC_018661	GC	3	6	165356	165361	0 %	0 %	50 %	50 %	407471583
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3494	NC_018661	GTG	2	6	170513	170518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471580
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