MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_018661	CGC	2	6	613035	613040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471152
12503	NC_018661	CTG	2	6	613072	613077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471152
12504	NC_018661	GCT	2	6	613267	613272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471152
12505	NC_018661	CAA	2	6	613278	613283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471152
12506	NC_018661	ATG	2	6	613330	613335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471152
12507	NC_018661	TGA	2	6	613358	613363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471152
12508	NC_018661	AGAA	2	8	613373	613380	75 %	0 %	25 %	0 %	407471152
12509	NC_018661	TCT	2	6	613493	613498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471152
12510	NC_018661	GGT	2	6	613564	613569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471152
12511	NC_018661	AGA	2	6	613578	613583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471152
12512	NC_018661	ATC	2	6	613585	613590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471152
12513	NC_018661	CTG	2	6	613699	613704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471152
12514	NC_018661	GAA	3	9	613711	613719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471152
12515	NC_018661	CGTAG	2	10	613738	613747	20 %	20 %	40 %	20 %	407471152
12516	NC_018661	ATC	2	6	613783	613788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471152
12517	NC_018661	TGA	2	6	613920	613925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471152
12518	NC_018661	GAA	2	6	613966	613971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471152
12519	NC_018661	CTC	2	6	614015	614020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471152
12520	NC_018661	TGA	2	6	614028	614033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471152
12521	NC_018661	AAGT	2	8	614083	614090	50 %	25 %	25 %	0 %	407471152
12522	NC_018661	T	6	6	614144	614149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_018661	CAT	2	6	614174	614179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471151
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12525	NC_018661	TGA	2	6	614314	614319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471151
12526	NC_018661	CGA	2	6	614332	614337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471151
12527	NC_018661	TGG	2	6	614348	614353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471151
12528	NC_018661	GCG	2	6	614373	614378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471151
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12533	NC_018661	TTCGGT	2	12	614739	614750	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407471151
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12535	NC_018661	GC	3	6	614781	614786	0 %	0 %	50 %	50 %	407471151
12536	NC_018661	TGG	2	6	614821	614826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471151
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12540	NC_018661	CAT	2	6	614933	614938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471151
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12543	NC_018661	GC	3	6	615130	615135	0 %	0 %	50 %	50 %	407471150
12544	NC_018661	ATT	3	9	615151	615159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471150
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12550	NC_018661	TGG	2	6	615551	615556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471150
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12552	NC_018661	CG	3	6	615685	615690	0 %	0 %	50 %	50 %	407471150
12553	NC_018661	GCTG	2	8	615705	615712	0 %	25 %	50 %	25 %	407471150
12554	NC_018661	GGCGAT	2	12	615742	615753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407471150
12555	NC_018661	GATCA	2	10	615796	615805	40 %	20 %	20 %	20 %	407471150
12556	NC_018661	ATC	2	6	615811	615816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471150
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12569	NC_018661	T	6	6	616396	616401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_018661	T	7	7	616427	616433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12582	NC_018661	T	6	6	617048	617053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_018661	TTG	2	6	617431	617436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12600	NC_018661	CTT	2	6	617843	617848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471148
12601	NC_018661	T	7	7	617847	617853	0 %	100 %	0 %	0 %	407471148
12602	NC_018661	TAA	3	9	617859	617867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471148
12603	NC_018661	ATG	2	6	617871	617876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471148
12604	NC_018661	A	7	7	617890	617896	100 %	0 %	0 %	0 %	407471148
12605	NC_018661	ATT	2	6	617908	617913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471148
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12607	NC_018661	A	6	6	617978	617983	100 %	0 %	0 %	0 %	407471148
12608	NC_018661	AT	3	6	617995	618000	50 %	50 %	0 %	0 %	407471148
12609	NC_018661	T	6	6	618032	618037	0 %	100 %	0 %	0 %	407471148
12610	NC_018661	AGC	2	6	618058	618063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471148
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12614	NC_018661	CTG	2	6	618312	618317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471148
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12742	NC_018661	AGC	2	6	623846	623851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471144
12743	NC_018661	GAA	2	6	623858	623863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471144
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12745	NC_018661	GAA	2	6	623898	623903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471144
12746	NC_018661	GCA	2	6	623910	623915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471144
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12752	NC_018661	TGC	2	6	624224	624229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471144
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12754	NC_018661	CAT	2	6	624257	624262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471144
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12857	NC_018661	TGC	2	6	628656	628661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471140
12858	NC_018661	ACAA	2	8	628703	628710	75 %	0 %	0 %	25 %	407471140
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12860	NC_018661	GCT	2	6	628758	628763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471140
12861	NC_018661	GTT	2	6	628828	628833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471140
12862	NC_018661	TGC	2	6	628916	628921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471140
12863	NC_018661	TGA	2	6	629013	629018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471140
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12865	NC_018661	GTC	2	6	629129	629134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471140
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12882	NC_018661	AAG	2	6	629987	629992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471140
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12886	NC_018661	G	6	6	630081	630086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12887	NC_018661	TTCA	2	8	630132	630139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12903	NC_018661	GTT	3	9	631107	631115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12957	NC_018661	T	7	7	633183	633189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12959	NC_018661	GA	3	6	633257	633262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12977	NC_018661	GTACG	2	10	633959	633968	20 %	20 %	40 %	20 %	407471137
12978	NC_018661	CGA	2	6	634006	634011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471137
12979	NC_018661	GCG	2	6	634090	634095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471137
12980	NC_018661	CTG	2	6	634122	634127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471137
12981	NC_018661	GTTC	2	8	634156	634163	0 %	50 %	25 %	25 %	407471137
12982	NC_018661	GTTT	2	8	634180	634187	0 %	75 %	25 %	0 %	407471137
12983	NC_018661	TGT	2	6	634268	634273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471137
12984	NC_018661	GGT	2	6	634275	634280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471137
12985	NC_018661	AGC	2	6	634328	634333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471137
12986	NC_018661	GGC	2	6	634343	634348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471137
12987	NC_018661	GGC	2	6	634416	634421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471137
12988	NC_018661	GAT	2	6	634427	634432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471137
12989	NC_018661	CTG	2	6	634539	634544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12990	NC_018661	AC	3	6	634627	634632	50 %	0 %	0 %	50 %	407471136
12991	NC_018661	CAA	2	6	634638	634643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471136
12992	NC_018661	CATC	2	8	634655	634662	25 %	25 %	0 %	50 %	407471136
12993	NC_018661	TGG	2	6	634690	634695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471136
12994	NC_018661	CTG	2	6	634806	634811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471136
12995	NC_018661	GGC	2	6	634864	634869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471136
12996	NC_018661	TGC	2	6	634909	634914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471136
12997	NC_018661	CGG	2	6	634952	634957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471136
12998	NC_018661	ATA	2	6	634960	634965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471136
12999	NC_018661	TGC	2	6	635018	635023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471136
13000	NC_018661	AAC	2	6	635044	635049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471136

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