MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018661	CCG	2	6	26458	26463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471722
502	NC_018661	CGA	2	6	26583	26588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471722
503	NC_018661	CG	4	8	26646	26653	0 %	0 %	50 %	50 %	407471722
504	NC_018661	TGG	2	6	26672	26677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471722
505	NC_018661	ATG	2	6	26684	26689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471722
506	NC_018661	TAC	2	6	26746	26751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471722
507	NC_018661	TGA	2	6	26838	26843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471722
508	NC_018661	TGA	2	6	26889	26894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471722
509	NC_018661	TCA	2	6	26909	26914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471722
510	NC_018661	ATG	2	6	26977	26982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471722
511	NC_018661	GCG	2	6	27010	27015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471722
512	NC_018661	GAC	2	6	27022	27027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471722
513	NC_018661	ATC	2	6	27046	27051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471722
514	NC_018661	CGC	2	6	27056	27061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471722
515	NC_018661	GCG	2	6	27069	27074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471722
516	NC_018661	CAGT	2	8	27089	27096	25 %	25 %	25 %	25 %	407471722
517	NC_018661	ATG	2	6	27118	27123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471722
518	NC_018661	TGG	2	6	27200	27205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471722
519	NC_018661	TGA	2	6	27309	27314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471722
520	NC_018661	AAATG	2	10	27339	27348	60 %	20 %	20 %	0 %	407471722
521	NC_018661	GAT	2	6	27361	27366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471722
522	NC_018661	GCA	2	6	27386	27391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471722
523	NC_018661	GGT	2	6	27537	27542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471722
524	NC_018661	A	6	6	27592	27597	100 %	0 %	0 %	0 %	407471722
525	NC_018661	TGA	2	6	27623	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018661	CGG	2	6	27634	27639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018661	ATT	2	6	27642	27647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018661	GCT	2	6	27651	27656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471721
529	NC_018661	CCG	2	6	27669	27674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471721
530	NC_018661	AGGA	2	8	27678	27685	50 %	0 %	50 %	0 %	407471721
531	NC_018661	A	6	6	27685	27690	100 %	0 %	0 %	0 %	407471721
532	NC_018661	TGC	2	6	27709	27714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471721
533	NC_018661	CGC	2	6	27760	27765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471721
534	NC_018661	GC	3	6	27775	27780	0 %	0 %	50 %	50 %	407471721
535	NC_018661	GCA	2	6	27837	27842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471721
536	NC_018661	T	6	6	27896	27901	0 %	100 %	0 %	0 %	407471721
537	NC_018661	GGT	2	6	27908	27913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471721
538	NC_018661	T	6	6	27916	27921	0 %	100 %	0 %	0 %	407471721
539	NC_018661	GGT	2	6	27996	28001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471721
540	NC_018661	CAT	2	6	28037	28042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471721
541	NC_018661	ATTTT	2	10	28080	28089	20 %	80 %	0 %	0 %	407471721
542	NC_018661	CCT	2	6	28110	28115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_018661	A	8	8	28164	28171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018661	CAA	2	6	28209	28214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471720
545	NC_018661	GGC	2	6	28312	28317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471720
546	NC_018661	CTG	2	6	28373	28378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471720
547	NC_018661	GTT	3	9	28381	28389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471720
548	NC_018661	CGG	2	6	28402	28407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471720
549	NC_018661	TTA	2	6	28490	28495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471720
550	NC_018661	TC	3	6	28845	28850	0 %	50 %	0 %	50 %	407471719
551	NC_018661	TATT	2	8	28891	28898	25 %	75 %	0 %	0 %	407471719
552	NC_018661	GA	3	6	28899	28904	50 %	0 %	50 %	0 %	407471719
553	NC_018661	TGA	2	6	29056	29061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471718
554	NC_018661	CAG	2	6	29091	29096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471718
555	NC_018661	CCGCA	2	10	29328	29337	20 %	0 %	20 %	60 %	407471718
556	NC_018661	AGC	2	6	29364	29369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471718
557	NC_018661	TGA	2	6	29388	29393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471718
558	NC_018661	TGC	2	6	29397	29402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471718
559	NC_018661	CAGC	2	8	29457	29464	25 %	0 %	25 %	50 %	407471717
560	NC_018661	CAA	2	6	29475	29480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471717
561	NC_018661	TCA	2	6	29492	29497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471717
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563	NC_018661	CCG	2	6	29578	29583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471717
564	NC_018661	GC	3	6	29588	29593	0 %	0 %	50 %	50 %	407471717
565	NC_018661	CGC	2	6	29630	29635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471717
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568	NC_018661	TCA	2	6	29708	29713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471717
569	NC_018661	AGCC	2	8	29744	29751	25 %	0 %	25 %	50 %	407471717
570	NC_018661	GCAG	2	8	29753	29760	25 %	0 %	50 %	25 %	407471717
571	NC_018661	A	6	6	29826	29831	100 %	0 %	0 %	0 %	407471717
572	NC_018661	GGC	2	6	29925	29930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471717
573	NC_018661	ATCAGC	2	12	29950	29961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407471717
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576	NC_018661	CAG	2	6	30135	30140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471717
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578	NC_018661	CGC	2	6	30257	30262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471717
579	NC_018661	GGC	2	6	30294	30299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471717
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582	NC_018661	CAG	2	6	30438	30443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471717
583	NC_018661	CG	3	6	30491	30496	0 %	0 %	50 %	50 %	407471717
584	NC_018661	TGA	2	6	30679	30684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018661	GGGA	2	8	30764	30771	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018661	CT	3	6	30789	30794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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588	NC_018661	CTG	2	6	30925	30930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018661	AGA	2	6	30933	30938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018661	TGC	2	6	31057	31062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471716
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593	NC_018661	TTG	2	6	31208	31213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018661	CAC	2	6	31255	31260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_018661	TAAA	2	8	31349	31356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018661	ATA	2	6	31474	31479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471715
597	NC_018661	GGC	2	6	31507	31512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471715
598	NC_018661	TGA	2	6	31513	31518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471715
599	NC_018661	CGG	2	6	31529	31534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471715
600	NC_018661	T	6	6	31537	31542	0 %	100 %	0 %	0 %	407471715
601	NC_018661	CAA	2	6	31658	31663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471715
602	NC_018661	ACT	2	6	31675	31680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471715
603	NC_018661	ACT	2	6	31698	31703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471715
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607	NC_018661	GTC	2	6	31750	31755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471715
608	NC_018661	AAC	2	6	31778	31783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018661	AC	3	6	31782	31787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_018661	CCG	2	6	31800	31805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_018661	CGGG	2	8	31814	31821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
612	NC_018661	AGA	2	6	31857	31862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018661	CAG	2	6	31948	31953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471714
614	NC_018661	CCTG	2	8	31992	31999	0 %	25 %	25 %	50 %	407471714
615	NC_018661	GC	3	6	32086	32091	0 %	0 %	50 %	50 %	407471714
616	NC_018661	CGG	2	6	32105	32110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471714
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619	NC_018661	GCC	2	6	32357	32362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471714
620	NC_018661	GCC	3	9	32446	32454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471714
621	NC_018661	GAA	2	6	32467	32472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471714
622	NC_018661	GCG	2	6	32488	32493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471714
623	NC_018661	GCG	2	6	32531	32536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471714
624	NC_018661	ACC	2	6	32593	32598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471714
625	NC_018661	GCA	2	6	32675	32680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471714
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629	NC_018661	ATT	2	6	32782	32787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471714
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