MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018661	TCA	2	6	246615	246620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_018661	ACC	2	6	246687	246692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_018661	CTT	2	6	246716	246721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_018661	T	7	7	246797	246803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018661	GCGG	2	8	246860	246867	0 %	0 %	75 %	25 %	407471513
5006	NC_018661	TGA	2	6	246873	246878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471513
5007	NC_018661	CTG	2	6	246885	246890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5008	NC_018661	GCAG	2	8	246898	246905	25 %	0 %	50 %	25 %	407471513
5009	NC_018661	ACC	2	6	246974	246979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471513
5010	NC_018661	C	6	6	246978	246983	0 %	0 %	0 %	100 %	407471513
5011	NC_018661	CTG	2	6	247013	247018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5012	NC_018661	TCGC	2	8	247031	247038	0 %	25 %	25 %	50 %	407471513
5013	NC_018661	ACA	2	6	247048	247053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471513
5014	NC_018661	GCA	2	6	247112	247117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5015	NC_018661	GCA	2	6	247135	247140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5016	NC_018661	GCC	2	6	247165	247170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471513
5017	NC_018661	CT	3	6	247247	247252	0 %	50 %	0 %	50 %	407471513
5018	NC_018661	TGG	2	6	247326	247331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471513
5019	NC_018661	TGG	2	6	247361	247366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471513
5020	NC_018661	AAC	2	6	247422	247427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471513
5021	NC_018661	A	6	6	247440	247445	100 %	0 %	0 %	0 %	407471513
5022	NC_018661	TGG	3	9	247494	247502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471513
5023	NC_018661	GC	3	6	247514	247519	0 %	0 %	50 %	50 %	407471513
5024	NC_018661	TGCG	2	8	247605	247612	0 %	25 %	50 %	25 %	407471513
5025	NC_018661	TAT	2	6	247624	247629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471513
5026	NC_018661	TATC	2	8	247656	247663	25 %	50 %	0 %	25 %	407471513
5027	NC_018661	CTG	2	6	247706	247711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5028	NC_018661	TGCG	2	8	247827	247834	0 %	25 %	50 %	25 %	407471513
5029	NC_018661	TGG	2	6	247890	247895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471513
5030	NC_018661	GAA	2	6	247934	247939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471513
5031	NC_018661	GCC	2	6	247991	247996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471513
5032	NC_018661	CGTT	2	8	248039	248046	0 %	50 %	25 %	25 %	407471513
5033	NC_018661	GTC	2	6	248057	248062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5034	NC_018661	CAG	2	6	248147	248152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5035	NC_018661	CTG	2	6	248177	248182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5036	NC_018661	GGC	2	6	248224	248229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471513
5037	NC_018661	CTG	3	9	248256	248264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471513
5038	NC_018661	TGA	2	6	248340	248345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018661	TGC	2	6	248417	248422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_018661	CGC	2	6	248457	248462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471512
5041	NC_018661	CGC	2	6	248503	248508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471512
5042	NC_018661	GCC	2	6	248521	248526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471512
5043	NC_018661	GGT	2	6	248575	248580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471512
5044	NC_018661	TTTC	2	8	248592	248599	0 %	75 %	0 %	25 %	407471512
5045	NC_018661	CCG	2	6	248610	248615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471512
5046	NC_018661	CAC	3	9	248674	248682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471512
5047	NC_018661	GC	3	6	248707	248712	0 %	0 %	50 %	50 %	407471512
5048	NC_018661	TTG	2	6	248797	248802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471512
5049	NC_018661	CTG	2	6	248809	248814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471512
5050	NC_018661	TCT	2	6	248819	248824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471512
5051	NC_018661	CCG	2	6	248873	248878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471512
5052	NC_018661	GCA	2	6	248895	248900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471512
5053	NC_018661	AGC	2	6	248906	248911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471512
5054	NC_018661	CGC	2	6	248995	249000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471512
5055	NC_018661	CCAG	2	8	249015	249022	25 %	0 %	25 %	50 %	407471512
5056	NC_018661	GGC	3	9	249028	249036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471512
5057	NC_018661	AGT	2	6	249048	249053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471512
5058	NC_018661	GTA	2	6	249088	249093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471512
5059	NC_018661	CGC	2	6	249270	249275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471512
5060	NC_018661	A	6	6	249374	249379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018661	TGG	2	6	249399	249404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018661	ATT	2	6	249437	249442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_018661	T	7	7	249441	249447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_018661	GCA	2	6	249554	249559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_018661	TGA	2	6	249584	249589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471511
5066	NC_018661	AAGC	2	8	249623	249630	50 %	0 %	25 %	25 %	407471511
5067	NC_018661	GCGG	2	8	249707	249714	0 %	0 %	75 %	25 %	407471511
5068	NC_018661	GGT	2	6	249738	249743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471511
5069	NC_018661	GCC	2	6	249774	249779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471511
5070	NC_018661	GATT	2	8	249837	249844	25 %	50 %	25 %	0 %	407471511
5071	NC_018661	CTT	2	6	249864	249869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471511
5072	NC_018661	CTG	2	6	249883	249888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471511
5073	NC_018661	TGG	2	6	249986	249991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471511
5074	NC_018661	TG	3	6	250031	250036	0 %	50 %	50 %	0 %	407471511
5075	NC_018661	GAT	2	6	250057	250062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471511
5076	NC_018661	AAGTG	2	10	250095	250104	40 %	20 %	40 %	0 %	407471511
5077	NC_018661	CG	3	6	250125	250130	0 %	0 %	50 %	50 %	407471511
5078	NC_018661	TGC	2	6	250145	250150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471511
5079	NC_018661	CGC	2	6	250281	250286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471511
5080	NC_018661	TTTC	2	8	250297	250304	0 %	75 %	0 %	25 %	407471511
5081	NC_018661	CGG	2	6	250334	250339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471511
5082	NC_018661	CTGG	2	8	250371	250378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_018661	GAA	2	6	250401	250406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_018661	AGGC	2	8	250430	250437	25 %	0 %	50 %	25 %	407471510
5085	NC_018661	TTG	3	9	250468	250476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471510
5086	NC_018661	GTG	2	6	250594	250599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471510
5087	NC_018661	CTGG	2	8	250622	250629	0 %	25 %	50 %	25 %	407471510
5088	NC_018661	CAT	2	6	250668	250673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471510
5089	NC_018661	GCT	2	6	250752	250757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471510
5090	NC_018661	CG	3	6	250803	250808	0 %	0 %	50 %	50 %	407471510
5091	NC_018661	GAT	2	6	250861	250866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471510
5092	NC_018661	ATA	2	6	250913	250918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471510
5093	NC_018661	TGA	2	6	250947	250952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471510
5094	NC_018661	TTG	2	6	250982	250987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471510
5095	NC_018661	CGT	2	6	251220	251225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471510
5096	NC_018661	CTG	2	6	251314	251319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471510
5097	NC_018661	CCG	2	6	251329	251334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471510
5098	NC_018661	TCG	2	6	251380	251385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471510
5099	NC_018661	GCGATA	2	12	251420	251431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407471510
5100	NC_018661	ACC	2	6	251452	251457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471510
5101	NC_018661	AGA	2	6	251579	251584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471510
5102	NC_018661	A	6	6	251591	251596	100 %	0 %	0 %	0 %	407471510
5103	NC_018661	TGC	2	6	251618	251623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471510
5104	NC_018661	GCG	2	6	251685	251690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471510
5105	NC_018661	ATC	2	6	251737	251742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471510
5106	NC_018661	GGCG	2	8	251787	251794	0 %	0 %	75 %	25 %	407471510
5107	NC_018661	GCA	2	6	251795	251800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471510
5108	NC_018661	GCG	2	6	251803	251808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471510
5109	NC_018661	GGGC	2	8	251845	251852	0 %	0 %	75 %	25 %	407471510
5110	NC_018661	TCG	2	6	251865	251870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471510
5111	NC_018661	ACTGAA	2	12	251871	251882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407471510
5112	NC_018661	AGA	2	6	251912	251917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471510
5113	NC_018661	GGC	2	6	251970	251975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471510
5114	NC_018661	TGA	2	6	252011	252016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471510
5115	NC_018661	ATG	2	6	252017	252022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471510
5116	NC_018661	TTG	2	6	252050	252055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471510
5117	NC_018661	GCG	3	9	252121	252129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471510
5118	NC_018661	GC	3	6	252154	252159	0 %	0 %	50 %	50 %	407471510
5119	NC_018661	CGGCA	2	10	252207	252216	20 %	0 %	40 %	40 %	407471510
5120	NC_018661	CGC	2	6	252290	252295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471510
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5122	NC_018661	TGC	2	6	252369	252374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471510
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5494	NC_018661	GCA	2	6	270677	270682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471495
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5496	NC_018661	ATTTTT	2	12	270842	270853	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407471494
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5499	NC_018661	AAAT	2	8	270975	270982	75 %	25 %	0 %	0 %	407471494
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