MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018661	AAG	2	6	222545	222550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471531
4502	NC_018661	CAT	2	6	222559	222564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471530
4503	NC_018661	CAA	2	6	222646	222651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471530
4504	NC_018661	GTC	2	6	222659	222664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471530
4505	NC_018661	CGT	2	6	222676	222681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471530
4506	NC_018661	CGG	2	6	222732	222737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471530
4507	NC_018661	GGC	2	6	222782	222787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471530
4508	NC_018661	GC	3	6	222854	222859	0 %	0 %	50 %	50 %	407471530
4509	NC_018661	GCT	2	6	222865	222870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471530
4510	NC_018661	GGC	2	6	222941	222946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471530
4511	NC_018661	CAT	2	6	222958	222963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471530
4512	NC_018661	CTG	3	9	223001	223009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471530
4513	NC_018661	GCTGGT	2	12	223012	223023	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407471530
4514	NC_018661	CGC	2	6	223051	223056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471530
4515	NC_018661	TTGCC	2	10	223074	223083	0 %	40 %	20 %	40 %	407471530
4516	NC_018661	CGC	2	6	223105	223110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471530
4517	NC_018661	TGG	2	6	223116	223121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471530
4518	NC_018661	TTA	2	6	223185	223190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471530
4519	NC_018661	GCT	2	6	223265	223270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471530
4520	NC_018661	GCC	2	6	223297	223302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471530
4521	NC_018661	TGG	2	6	223358	223363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471530
4522	NC_018661	CTG	2	6	223391	223396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471530
4523	NC_018661	TTA	2	6	223482	223487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471529
4524	NC_018661	CGA	2	6	223517	223522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471529
4525	NC_018661	GC	3	6	223525	223530	0 %	0 %	50 %	50 %	407471529
4526	NC_018661	TGAT	2	8	223642	223649	25 %	50 %	25 %	0 %	407471529
4527	NC_018661	CGC	2	6	223722	223727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471529
4528	NC_018661	TGG	2	6	223732	223737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471529
4529	NC_018661	GAT	2	6	223751	223756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471529
4530	NC_018661	CAA	2	6	223841	223846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471529
4531	NC_018661	AGCG	2	8	223861	223868	25 %	0 %	50 %	25 %	407471529
4532	NC_018661	CTG	2	6	223875	223880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471529
4533	NC_018661	CGG	2	6	223940	223945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471529
4534	NC_018661	TGA	2	6	223960	223965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471529
4535	NC_018661	CTG	2	6	223995	224000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471529
4536	NC_018661	ACC	2	6	224016	224021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471529
4537	NC_018661	ATC	2	6	224049	224054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471529
4538	NC_018661	ACT	2	6	224057	224062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471529
4539	NC_018661	CAG	2	6	224073	224078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471529
4540	NC_018661	TGG	2	6	224122	224127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471529
4541	NC_018661	ATC	2	6	224145	224150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471529
4542	NC_018661	GGT	2	6	224168	224173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471529
4543	NC_018661	TGC	2	6	224233	224238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471529
4544	NC_018661	CGT	2	6	224278	224283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471529
4545	NC_018661	CTGC	2	8	224324	224331	0 %	25 %	25 %	50 %	407471529
4546	NC_018661	GAA	2	6	224373	224378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471529
4547	NC_018661	TGA	2	6	224432	224437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471529
4548	NC_018661	CAA	2	6	224480	224485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471528
4549	NC_018661	A	6	6	224510	224515	100 %	0 %	0 %	0 %	407471528
4550	NC_018661	GAA	2	6	224527	224532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471528
4551	NC_018661	CGTTT	2	10	224575	224584	0 %	60 %	20 %	20 %	407471528
4552	NC_018661	AGT	2	6	224611	224616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471528
4553	NC_018661	TCGG	2	8	224646	224653	0 %	25 %	50 %	25 %	407471528
4554	NC_018661	GAT	2	6	224662	224667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471528
4555	NC_018661	A	6	6	224801	224806	100 %	0 %	0 %	0 %	407471528
4556	NC_018661	GCT	2	6	224830	224835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471528
4557	NC_018661	GAT	2	6	224884	224889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471528
4558	NC_018661	CGG	2	6	224944	224949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471528
4559	NC_018661	GTGC	2	8	225041	225048	0 %	25 %	50 %	25 %	407471528
4560	NC_018661	TGA	2	6	225063	225068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471528
4561	NC_018661	CAG	2	6	225077	225082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471528
4562	NC_018661	GTGATG	2	12	225149	225160	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407471528
4563	NC_018661	GCT	2	6	225235	225240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471528
4564	NC_018661	CGC	2	6	225249	225254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471528
4565	NC_018661	CGC	2	6	225272	225277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471528
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4567	NC_018661	GTC	2	6	225351	225356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471528
4568	NC_018661	CAGC	2	8	225383	225390	25 %	0 %	25 %	50 %	407471528
4569	NC_018661	CGG	2	6	225403	225408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471528
4570	NC_018661	TGG	2	6	225414	225419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471528
4571	NC_018661	CAG	2	6	225538	225543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471527
4572	NC_018661	ACGAA	2	10	225673	225682	60 %	0 %	20 %	20 %	407471527
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4574	NC_018661	AAT	2	6	225784	225789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471527
4575	NC_018661	ATGA	2	8	225874	225881	50 %	25 %	25 %	0 %	407471527
4576	NC_018661	GCCAGT	2	12	225905	225916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407471527
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4579	NC_018661	AATA	2	8	226111	226118	75 %	25 %	0 %	0 %	407471527
4580	NC_018661	AAG	2	6	226127	226132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471527
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4582	NC_018661	AAT	2	6	226240	226245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471527
4583	NC_018661	ACC	3	9	226256	226264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471527
4584	NC_018661	CAC	2	6	226296	226301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471527
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4586	NC_018661	GA	4	8	226418	226425	50 %	0 %	50 %	0 %	407471527
4587	NC_018661	ATC	2	6	226448	226453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471527
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4590	NC_018661	TAAA	2	8	226555	226562	75 %	25 %	0 %	0 %	407471527
4591	NC_018661	TAA	2	6	226608	226613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471527
4592	NC_018661	ATA	2	6	226686	226691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471527
4593	NC_018661	GT	3	6	226746	226751	0 %	50 %	50 %	0 %	407471527
4594	NC_018661	TGC	2	6	226754	226759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471527
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4596	NC_018661	A	6	6	226854	226859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_018661	GAG	2	6	226889	226894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_018661	TGG	2	6	227100	227105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_018661	GA	4	8	227118	227125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_018661	TA	3	6	227146	227151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_018661	ACA	2	6	227156	227161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_018661	ACA	2	6	227220	227225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_018661	GGC	2	6	227228	227233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_018661	ATA	2	6	227454	227459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_018661	GCA	2	6	227473	227478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_018661	TGG	2	6	227582	227587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_018661	GA	4	8	227600	227607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_018661	ACA	2	6	227638	227643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_018661	GGC	2	6	227710	227715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_018661	ATA	2	6	227937	227942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_018661	GCA	2	6	227956	227961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_018661	TGG	2	6	228065	228070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_018661	GA	4	8	228083	228090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_018661	ACA	2	6	228121	228126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_018661	AAC	2	6	228151	228156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_018661	ACA	2	6	228185	228190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_018661	GGC	2	6	228193	228198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_018661	ATA	2	6	228420	228425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_018661	GCA	2	6	228439	228444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_018661	TGG	2	6	228548	228553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_018661	GA	4	8	228566	228573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_018661	ACA	2	6	228604	228609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_018661	AAC	2	6	228634	228639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_018661	ACA	2	6	228668	228673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_018661	GGC	2	6	228676	228681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_018661	CGC	2	6	228902	228907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471523
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4681	NC_018661	TGC	2	6	231469	231474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4991	NC_018661	GGT	2	6	246189	246194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471514
4992	NC_018661	GGC	2	6	246258	246263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471514
4993	NC_018661	CCA	2	6	246306	246311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471514
4994	NC_018661	TGC	2	6	246332	246337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471514
4995	NC_018661	TCT	2	6	246340	246345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471514
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4999	NC_018661	A	6	6	246547	246552	100 %	0 %	0 %	0 %	407471514
5000	NC_018661	AAT	2	6	246568	246573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471514

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