MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018659	T	8	8	73561	73568	0 %	100 %	0 %	0 %	407484755
1502	NC_018659	ATG	2	6	73569	73574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484755
1503	NC_018659	GGT	2	6	73601	73606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484755
1504	NC_018659	TCG	2	6	73722	73727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484755
1505	NC_018659	GCC	2	6	73828	73833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484755
1506	NC_018659	ATG	2	6	73933	73938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484755
1507	NC_018659	AGT	2	6	73974	73979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484755
1508	NC_018659	CGG	2	6	73993	73998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484755
1509	NC_018659	AAC	2	6	74043	74048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484755
1510	NC_018659	GCT	2	6	74055	74060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484755
1511	NC_018659	GAA	2	6	74085	74090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484755
1512	NC_018659	TCAA	2	8	74149	74156	50 %	25 %	0 %	25 %	407484755
1513	NC_018659	GTT	2	6	74247	74252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484755
1514	NC_018659	CTT	2	6	74267	74272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484755
1515	NC_018659	CGG	2	6	74276	74281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484755
1516	NC_018659	TAC	2	6	74303	74308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484755
1517	NC_018659	TGT	2	6	74376	74381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484755
1518	NC_018659	TCA	2	6	74491	74496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484755
1519	NC_018659	T	6	6	74529	74534	0 %	100 %	0 %	0 %	407484755
1520	NC_018659	GATATC	2	12	74706	74717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407484755
1521	NC_018659	GA	3	6	74788	74793	50 %	0 %	50 %	0 %	407484755
1522	NC_018659	TGT	2	6	74800	74805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484755
1523	NC_018659	TTC	2	6	74814	74819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484755
1524	NC_018659	CTT	2	6	74900	74905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484755
1525	NC_018659	ATC	2	6	74916	74921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484755
1526	NC_018659	CA	3	6	75006	75011	50 %	0 %	0 %	50 %	407484755
1527	NC_018659	C	6	6	75073	75078	0 %	0 %	0 %	100 %	407484755
1528	NC_018659	GCA	2	6	75092	75097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484755
1529	NC_018659	T	6	6	75173	75178	0 %	100 %	0 %	0 %	407484755
1530	NC_018659	CAC	2	6	75179	75184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484755
1531	NC_018659	TCC	2	6	75210	75215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484755
1532	NC_018659	GGT	2	6	75387	75392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484755
1533	NC_018659	CTT	2	6	75550	75555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484755
1534	NC_018659	AAC	2	6	75661	75666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484755
1535	NC_018659	CCA	2	6	75716	75721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484755
1536	NC_018659	GGT	2	6	75838	75843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484756
1537	NC_018659	GCT	2	6	75983	75988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484756
1538	NC_018659	GTT	2	6	76013	76018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484756
1539	NC_018659	TCT	2	6	76019	76024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484756
1540	NC_018659	TCA	2	6	76032	76037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484756
1541	NC_018659	GCA	2	6	76073	76078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484756
1542	NC_018659	CA	3	6	76098	76103	50 %	0 %	0 %	50 %	407484756
1543	NC_018659	GTG	2	6	76107	76112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484756
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1547	NC_018659	GTTC	2	8	76250	76257	0 %	50 %	25 %	25 %	407484756
1548	NC_018659	T	6	6	76390	76395	0 %	100 %	0 %	0 %	407484756
1549	NC_018659	CTG	2	6	76473	76478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484756
1550	NC_018659	ATC	2	6	76501	76506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484756
1551	NC_018659	AG	3	6	76535	76540	50 %	0 %	50 %	0 %	407484756
1552	NC_018659	CTG	2	6	76604	76609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484756
1553	NC_018659	GCG	2	6	76612	76617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484756
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1555	NC_018659	ATCA	2	8	76690	76697	50 %	25 %	0 %	25 %	407484756
1556	NC_018659	ATT	2	6	76753	76758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484756
1557	NC_018659	AAT	2	6	76801	76806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484756
1558	NC_018659	GTC	2	6	76942	76947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484757
1559	NC_018659	GCG	2	6	76972	76977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484757
1560	NC_018659	CCG	2	6	77035	77040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484757
1561	NC_018659	TCA	2	6	77057	77062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484757
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1563	NC_018659	CCA	2	6	77124	77129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484757
1564	NC_018659	TGT	2	6	77282	77287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484757
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1567	NC_018659	ATC	2	6	77443	77448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484757
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1572	NC_018659	TG	3	6	77721	77726	0 %	50 %	50 %	0 %	407484757
1573	NC_018659	GGC	2	6	77884	77889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484757
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1585	NC_018659	TAG	2	6	78362	78367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_018659	TGA	2	6	78933	78938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484758
1596	NC_018659	TAT	2	6	78939	78944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484758
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1599	NC_018659	ATC	2	6	79000	79005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484758
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1603	NC_018659	AGTAT	2	10	79088	79097	40 %	40 %	20 %	0 %	407484758
1604	NC_018659	TA	3	6	79238	79243	50 %	50 %	0 %	0 %	407484758
1605	NC_018659	TG	3	6	79257	79262	0 %	50 %	50 %	0 %	407484758
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1757	NC_018659	CGA	2	6	86309	86314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484768
1758	NC_018659	GAT	2	6	86525	86530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484769
1759	NC_018659	ACG	2	6	86540	86545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484769
1760	NC_018659	ATC	2	6	86642	86647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484769
1761	NC_018659	GTT	2	6	86745	86750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484769
1762	NC_018659	CAA	2	6	86774	86779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484769
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1765	NC_018659	GCCC	2	8	87049	87056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1766	NC_018659	AG	3	6	87390	87395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1767	NC_018659	TCA	2	6	87539	87544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1772	NC_018659	GCCT	2	8	87708	87715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1773	NC_018659	ATT	2	6	87739	87744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1774	NC_018659	GCG	2	6	87838	87843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1776	NC_018659	GCC	2	6	87974	87979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1777	NC_018659	CCA	2	6	88036	88041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1778	NC_018659	CAT	2	6	88047	88052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1779	NC_018659	CCA	2	6	88089	88094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1780	NC_018659	TTC	2	6	88096	88101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1781	NC_018659	ATT	2	6	88126	88131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1782	NC_018659	ACCGGT	2	12	88207	88218	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1783	NC_018659	AG	3	6	88227	88232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1784	NC_018659	CA	3	6	88233	88238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1785	NC_018659	AAT	2	6	88336	88341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1786	NC_018659	TCTTT	2	10	88355	88364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1787	NC_018659	GAT	2	6	88457	88462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.