MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 108171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018658	CAA	2	6	246174	246179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479829
5003	NC_018658	TGA	2	6	246180	246185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479829
5004	NC_018658	GAAAA	2	10	246195	246204	80 %	0 %	20 %	0 %	407479830
5005	NC_018658	GCAAC	2	10	246274	246283	40 %	0 %	20 %	40 %	407479830
5006	NC_018658	GCC	2	6	246310	246315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479830
5007	NC_018658	GCC	3	9	246435	246443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479830
5008	NC_018658	GCA	2	6	246446	246451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479830
5009	NC_018658	GCA	2	6	246479	246484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479830
5010	NC_018658	GTG	2	6	246511	246516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479830
5011	NC_018658	CGCCAT	2	12	246545	246556	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407479830
5012	NC_018658	ATG	2	6	246596	246601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479830
5013	NC_018658	TGC	2	6	246614	246619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479830
5014	NC_018658	A	7	7	246643	246649	100 %	0 %	0 %	0 %	407479830
5015	NC_018658	TTA	2	6	246680	246685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479830
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5017	NC_018658	GAA	2	6	246819	246824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479830
5018	NC_018658	CAA	2	6	246922	246927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479830
5019	NC_018658	TGGTT	2	10	246949	246958	0 %	60 %	40 %	0 %	407479830
5020	NC_018658	CTGG	2	8	246965	246972	0 %	25 %	50 %	25 %	407479830
5021	NC_018658	CAAC	2	8	247034	247041	50 %	0 %	0 %	50 %	407479830
5022	NC_018658	ATC	2	6	247067	247072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479830
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5030	NC_018658	TGAA	2	8	247229	247236	50 %	25 %	25 %	0 %	407479830
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5033	NC_018658	GAA	2	6	247327	247332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479830
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5121	NC_018658	GGC	2	6	251063	251068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479832
5122	NC_018658	TTAC	2	8	251116	251123	25 %	50 %	0 %	25 %	407479832
5123	NC_018658	GCA	2	6	251192	251197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479832
5124	NC_018658	CT	3	6	251241	251246	0 %	50 %	0 %	50 %	407479832
5125	NC_018658	GCG	2	6	251265	251270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479832
5126	NC_018658	CG	4	8	251293	251300	0 %	0 %	50 %	50 %	407479832
5127	NC_018658	GAAGCG	2	12	251397	251408	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407479832
5128	NC_018658	TGC	2	6	251410	251415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479832
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5130	NC_018658	GCTG	2	8	251450	251457	0 %	25 %	50 %	25 %	407479832
5131	NC_018658	GCA	2	6	251465	251470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479832
5132	NC_018658	CCG	2	6	251485	251490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479832
5133	NC_018658	TGC	2	6	251570	251575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479832
5134	NC_018658	GCG	2	6	251586	251591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479832
5135	NC_018658	AC	3	6	251641	251646	50 %	0 %	0 %	50 %	407479832
5136	NC_018658	GCG	2	6	251648	251653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479832
5137	NC_018658	TGGCGC	2	12	251656	251667	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407479832
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5139	NC_018658	CAG	2	6	251697	251702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479832
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5141	NC_018658	TGC	2	6	251764	251769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479832
5142	NC_018658	GGCG	2	8	251795	251802	0 %	0 %	75 %	25 %	407479832
5143	NC_018658	ACG	2	6	251859	251864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479832
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5149	NC_018658	CGG	2	6	252311	252316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479832
5150	NC_018658	GAT	2	6	252330	252335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479832
5151	NC_018658	TGG	2	6	252401	252406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479832
5152	NC_018658	A	6	6	252435	252440	100 %	0 %	0 %	0 %	407479832
5153	NC_018658	CGC	2	6	252615	252620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479832
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5168	NC_018658	GGC	2	6	253149	253154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5169	NC_018658	G	6	6	253169	253174	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5171	NC_018658	T	6	6	253255	253260	0 %	100 %	0 %	0 %	407479833
5172	NC_018658	GCTC	2	8	253329	253336	0 %	25 %	25 %	50 %	407479833
5173	NC_018658	TGC	2	6	253444	253449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479833
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5180	NC_018658	CCCAG	2	10	253769	253778	20 %	0 %	20 %	60 %	407479833
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5186	NC_018658	AAAC	2	8	253980	253987	75 %	0 %	0 %	25 %	407479833
5187	NC_018658	TGA	2	6	253996	254001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479833
5188	NC_018658	TCA	2	6	254002	254007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479833
5189	NC_018658	CTG	3	9	254064	254072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479833
5190	NC_018658	TGG	2	6	254077	254082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479833
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5192	NC_018658	TCCG	2	8	254248	254255	0 %	25 %	25 %	50 %	407479833
5193	NC_018658	TGGCG	2	10	254267	254276	0 %	20 %	60 %	20 %	407479833
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5200	NC_018658	TTGC	2	8	254637	254644	0 %	50 %	25 %	25 %	407479833
5201	NC_018658	TGC	2	6	254668	254673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479833
5202	NC_018658	CT	3	6	254688	254693	0 %	50 %	0 %	50 %	407479833
5203	NC_018658	TGG	2	6	254719	254724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479833
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5207	NC_018658	GAT	2	6	254871	254876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479833
5208	NC_018658	GCA	2	6	254909	254914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479833
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5210	NC_018658	AGC	2	6	254982	254987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479833
5211	NC_018658	TGC	2	6	254993	254998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479833
5212	NC_018658	CTGG	2	8	255071	255078	0 %	25 %	50 %	25 %	407479833
5213	NC_018658	AG	3	6	255146	255151	50 %	0 %	50 %	0 %	407479833
5214	NC_018658	GAA	2	6	255159	255164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479833
5215	NC_018658	TGT	2	6	255276	255281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5216	NC_018658	CT	3	6	255361	255366	0 %	50 %	0 %	50 %	407479834
5217	NC_018658	GAT	2	6	255490	255495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479834
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5219	NC_018658	CGGT	2	8	255558	255565	0 %	25 %	50 %	25 %	407479834
5220	NC_018658	ATT	2	6	255620	255625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479834
5221	NC_018658	ATC	2	6	255632	255637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479834
5222	NC_018658	CGT	2	6	255643	255648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479834
5223	NC_018658	AGCGGT	2	12	255697	255708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407479834
5224	NC_018658	TGC	2	6	255810	255815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479834
5225	NC_018658	GCA	2	6	255855	255860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479834
5226	NC_018658	ATC	2	6	255914	255919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479834
5227	NC_018658	GAA	2	6	256124	256129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479834
5228	NC_018658	CTG	2	6	256130	256135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479834
5229	NC_018658	GGT	2	6	256216	256221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479834
5230	NC_018658	GGC	2	6	256285	256290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479834
5231	NC_018658	CCA	2	6	256333	256338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479834
5232	NC_018658	TGC	2	6	256359	256364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479834
5233	NC_018658	TCT	2	6	256367	256372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479834
5234	NC_018658	GGC	2	6	256378	256383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479834
5235	NC_018658	GGC	2	6	256414	256419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479834
5236	NC_018658	CT	3	6	256424	256429	0 %	50 %	0 %	50 %	407479834
5237	NC_018658	A	6	6	256574	256579	100 %	0 %	0 %	0 %	407479834
5238	NC_018658	AAT	2	6	256595	256600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479834
5239	NC_018658	TCA	2	6	256642	256647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_018658	ACC	2	6	256714	256719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5241	NC_018658	CTT	2	6	256743	256748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5242	NC_018658	T	7	7	256824	256830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_018658	GCGG	2	8	256887	256894	0 %	0 %	75 %	25 %	407479835
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