MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	GGT	2	6	280	285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480054
2	NC_018654	TTG	2	6	314	319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480054
3	NC_018654	AAG	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480054
4	NC_018654	TGA	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480054
5	NC_018654	AGG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480054
6	NC_018654	GAA	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480054
7	NC_018654	TGG	2	6	1027	1032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480055
8	NC_018654	CTT	3	9	1051	1059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480055
9	NC_018654	GTC	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480055
10	NC_018654	TTC	2	6	1345	1350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018654	TGA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
12	NC_018654	GGA	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480056
13	NC_018654	GAT	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
14	NC_018654	TGT	2	6	1936	1941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480056
15	NC_018654	CAG	2	6	1961	1966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480056
16	NC_018654	CAA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480056
17	NC_018654	TTC	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480056
18	NC_018654	GAT	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
19	NC_018654	GGT	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480056
20	NC_018654	TTA	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480056
21	NC_018654	ATG	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
22	NC_018654	TCA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480056
23	NC_018654	TGG	3	9	2542	2550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480056
24	NC_018654	GAA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480056
25	NC_018654	TGA	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
26	NC_018654	GGT	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480056
27	NC_018654	TGA	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
28	NC_018654	GCT	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480057
29	NC_018654	GCG	2	6	2820	2825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480057
30	NC_018654	GAT	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480057
31	NC_018654	TAA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480057
32	NC_018654	CTC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480057
33	NC_018654	AGA	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480057
34	NC_018654	TCA	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480058
35	NC_018654	AAT	2	6	3284	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480058
36	NC_018654	GCG	2	6	3389	3394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018654	AAT	2	6	3397	3402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018654	GTC	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480059
39	NC_018654	AAC	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480059
40	NC_018654	CTG	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480059
41	NC_018654	GGT	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480059
42	NC_018654	CTT	2	6	3647	3652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480059
43	NC_018654	TTG	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480059
44	NC_018654	TGA	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480059
45	NC_018654	TCA	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480059
46	NC_018654	TCT	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480059
47	NC_018654	CAG	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480060
48	NC_018654	CAG	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480060
49	NC_018654	CTG	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480060
50	NC_018654	AAC	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480060
51	NC_018654	GGT	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018654	GCC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018654	GCG	2	6	4855	4860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480061
54	NC_018654	TCC	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480061
55	NC_018654	TGA	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480061
56	NC_018654	GTT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480061
57	NC_018654	GAC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480061
58	NC_018654	ATC	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480061
59	NC_018654	CTG	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480061
60	NC_018654	TGC	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480061
61	NC_018654	ACG	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480061
62	NC_018654	GAA	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480061
63	NC_018654	GAA	2	6	5286	5291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480061
64	NC_018654	TCT	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018654	CAC	3	9	5610	5618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018654	ACG	2	6	5667	5672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018654	AGG	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018654	ATT	2	6	5802	5807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018654	TAA	2	6	6060	6065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480062
70	NC_018654	AGA	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480062
71	NC_018654	GAA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480063
72	NC_018654	CAA	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480063
73	NC_018654	TTC	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480063
74	NC_018654	TTA	2	6	6448	6453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480063
75	NC_018654	TAT	2	6	6490	6495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480063
76	NC_018654	GCC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480063
77	NC_018654	TCC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480063
78	NC_018654	AGA	2	6	6677	6682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480063
79	NC_018654	GAT	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480063
80	NC_018654	TCT	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480063
81	NC_018654	GTG	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480063
82	NC_018654	GGT	2	6	6996	7001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480063
83	NC_018654	CAT	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018654	ATA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018654	TTA	2	6	7138	7143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018654	AGG	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018654	AGA	2	6	7347	7352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480064
88	NC_018654	AGA	2	6	7437	7442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480064
89	NC_018654	GAT	2	6	7534	7539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
90	NC_018654	TTG	2	6	7555	7560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480064
91	NC_018654	TTC	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480064
92	NC_018654	TGA	2	6	7845	7850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
93	NC_018654	GGT	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
94	NC_018654	TAC	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480064
95	NC_018654	TGG	2	6	8223	8228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
96	NC_018654	ACA	2	6	8328	8333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480064
97	NC_018654	TGC	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480064
98	NC_018654	ATA	2	6	8504	8509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
99	NC_018654	CGG	2	6	8515	8520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480064
100	NC_018654	CGG	2	6	8574	8579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480064
101	NC_018654	TGA	2	6	8583	8588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
102	NC_018654	AAT	3	9	8677	8685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
103	NC_018654	ATT	2	6	8693	8698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480064
104	NC_018654	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
105	NC_018654	ATG	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
106	NC_018654	GGT	2	6	8953	8958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
107	NC_018654	TGA	2	6	9072	9077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
108	NC_018654	TGC	2	6	9093	9098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480064
109	NC_018654	TGG	2	6	9123	9128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
110	NC_018654	ATT	2	6	9199	9204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480064
111	NC_018654	ATA	2	6	9230	9235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
112	NC_018654	GTT	2	6	9373	9378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480064
113	NC_018654	GAT	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
114	NC_018654	AGG	2	6	9581	9586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018654	TTA	2	6	9653	9658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480065
116	NC_018654	GAA	2	6	9735	9740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480065
117	NC_018654	TCT	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480065
118	NC_018654	GAA	2	6	9923	9928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480065
119	NC_018654	GTG	2	6	10002	10007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480065
120	NC_018654	TAA	2	6	10067	10072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018654	ATA	2	6	10073	10078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018654	GAA	2	6	10154	10159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480066
123	NC_018654	CAA	2	6	10222	10227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480066
124	NC_018654	CTC	2	6	10286	10291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480066
125	NC_018654	CAA	2	6	10313	10318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480066
126	NC_018654	TAA	2	6	10407	10412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480066
127	NC_018654	TGC	2	6	10617	10622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480066
128	NC_018654	CAC	2	6	10699	10704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018654	AAG	2	6	10811	10816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480067
130	NC_018654	CTG	2	6	10917	10922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480067
131	NC_018654	TGT	2	6	11001	11006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480067
132	NC_018654	ACG	2	6	11017	11022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480067
133	NC_018654	TTC	2	6	11035	11040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480067
134	NC_018654	AGT	2	6	11092	11097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480067
135	NC_018654	ACA	2	6	11161	11166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480068
136	NC_018654	ACT	2	6	11181	11186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480068
137	NC_018654	GCA	2	6	11206	11211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480068
138	NC_018654	CGC	2	6	11226	11231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018654	CTG	2	6	11246	11251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018654	GTG	2	6	11387	11392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018654	CCA	2	6	11394	11399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018654	AGT	2	6	11404	11409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480069
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153	NC_018654	CCT	2	6	12000	12005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480070
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161	NC_018654	GCG	2	6	12549	12554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480072
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181	NC_018654	ATA	2	6	13822	13827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480073
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191	NC_018654	TAA	2	6	14749	14754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_018654	TAA	2	6	15688	15693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_018654	TCA	2	6	17592	17597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_018654	TAT	2	6	17614	17619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_018654	TAA	2	6	17722	17727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_018654	GAG	2	6	18767	18772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480082
252	NC_018654	AGC	2	6	18834	18839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480082
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254	NC_018654	GCT	2	6	18964	18969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480082
255	NC_018654	GAA	2	6	19087	19092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_018654	GAA	2	6	19149	19154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_018654	TAG	2	6	19208	19213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_018654	TGC	2	6	19325	19330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_018654	GCA	2	6	36761	36766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_018654	TTA	2	6	36974	36979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480098

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