MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	T	6	6	342	347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018651	T	7	7	2952	2958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018651	T	6	6	3380	3385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018651	T	7	7	4130	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	410485113
5	NC_018651	T	6	6	4360	4365	0 %	100 %	0 %	0 %	410485114
6	NC_018651	T	6	6	4958	4963	0 %	100 %	0 %	0 %	410485114
7	NC_018651	T	6	6	5460	5465	0 %	100 %	0 %	0 %	410485116
8	NC_018651	T	6	6	9101	9106	0 %	100 %	0 %	0 %	410485121
9	NC_018651	T	6	6	9657	9662	0 %	100 %	0 %	0 %	410485122
10	NC_018651	T	6	6	11045	11050	0 %	100 %	0 %	0 %	410485122
11	NC_018651	T	7	7	12236	12242	0 %	100 %	0 %	0 %	410485123
12	NC_018651	T	6	6	13336	13341	0 %	100 %	0 %	0 %	410485125
13	NC_018651	T	6	6	15814	15819	0 %	100 %	0 %	0 %	410485129
14	NC_018651	A	6	6	16230	16235	100 %	0 %	0 %	0 %	410485129
15	NC_018651	A	6	6	16269	16274	100 %	0 %	0 %	0 %	410485129
16	NC_018651	A	7	7	18132	18138	100 %	0 %	0 %	0 %	410485131
17	NC_018651	A	7	7	18281	18287	100 %	0 %	0 %	0 %	410485131
18	NC_018651	T	6	6	18614	18619	0 %	100 %	0 %	0 %	410485132
19	NC_018651	A	6	6	18713	18718	100 %	0 %	0 %	0 %	410485132
20	NC_018651	A	6	6	18872	18877	100 %	0 %	0 %	0 %	410485132
21	NC_018651	A	6	6	18902	18907	100 %	0 %	0 %	0 %	410485132
22	NC_018651	T	6	6	19002	19007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018651	A	6	6	19028	19033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018651	A	6	6	19690	19695	100 %	0 %	0 %	0 %	410485134
25	NC_018651	A	7	7	20109	20115	100 %	0 %	0 %	0 %	410485134
26	NC_018651	T	6	6	20540	20545	0 %	100 %	0 %	0 %	410485135
27	NC_018651	A	7	7	20905	20911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018651	T	6	6	20924	20929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018651	A	6	6	21476	21481	100 %	0 %	0 %	0 %	410485136
30	NC_018651	T	8	8	21914	21921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018651	A	7	7	22078	22084	100 %	0 %	0 %	0 %	410485138
32	NC_018651	T	6	6	22189	22194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018651	T	6	6	22630	22635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018651	A	6	6	22666	22671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018651	T	6	6	23683	23688	0 %	100 %	0 %	0 %	410485140
36	NC_018651	A	6	6	23741	23746	100 %	0 %	0 %	0 %	410485140
37	NC_018651	T	6	6	23951	23956	0 %	100 %	0 %	0 %	410485140
38	NC_018651	A	7	7	24567	24573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018651	T	6	6	24932	24937	0 %	100 %	0 %	0 %	410485142
40	NC_018651	T	6	6	27130	27135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018651	T	7	7	34655	34661	0 %	100 %	0 %	0 %	410485155
42	NC_018651	T	7	7	34716	34722	0 %	100 %	0 %	0 %	410485155
43	NC_018651	T	6	6	35544	35549	0 %	100 %	0 %	0 %	410485157
44	NC_018651	T	6	6	36500	36505	0 %	100 %	0 %	0 %	410485160
45	NC_018651	T	7	7	40013	40019	0 %	100 %	0 %	0 %	410485164
46	NC_018651	A	6	6	40431	40436	100 %	0 %	0 %	0 %	410485164
47	NC_018651	A	8	8	40795	40802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018651	T	7	7	42159	42165	0 %	100 %	0 %	0 %	410485167
49	NC_018651	T	6	6	43340	43345	0 %	100 %	0 %	0 %	410485170
50	NC_018651	T	6	6	43691	43696	0 %	100 %	0 %	0 %	410485170
51	NC_018651	T	6	6	44197	44202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018651	T	7	7	44761	44767	0 %	100 %	0 %	0 %	410485172
53	NC_018651	T	6	6	45313	45318	0 %	100 %	0 %	0 %	410485172
54	NC_018651	T	7	7	45436	45442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018651	T	7	7	45933	45939	0 %	100 %	0 %	0 %	410485173
56	NC_018651	T	7	7	46237	46243	0 %	100 %	0 %	0 %	410485173
57	NC_018651	A	6	6	46508	46513	100 %	0 %	0 %	0 %	410485174
58	NC_018651	T	6	6	47102	47107	0 %	100 %	0 %	0 %	410485175
59	NC_018651	T	6	6	47470	47475	0 %	100 %	0 %	0 %	410485175
60	NC_018651	C	6	6	47663	47668	0 %	0 %	0 %	100 %	410485176
61	NC_018651	A	6	6	50244	50249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018651	T	6	6	50338	50343	0 %	100 %	0 %	0 %	410485180
63	NC_018651	T	6	6	55078	55083	0 %	100 %	0 %	0 %	410485183
64	NC_018651	A	6	6	55257	55262	100 %	0 %	0 %	0 %	410485183
65	NC_018651	T	7	7	55479	55485	0 %	100 %	0 %	0 %	410485183
66	NC_018651	C	6	6	55997	56002	0 %	0 %	0 %	100 %	410485184
67	NC_018651	T	6	6	56576	56581	0 %	100 %	0 %	0 %	410485185
68	NC_018651	A	6	6	60694	60699	100 %	0 %	0 %	0 %	410485188
69	NC_018651	A	6	6	60701	60706	100 %	0 %	0 %	0 %	410485188
70	NC_018651	A	6	6	61643	61648	100 %	0 %	0 %	0 %	410485188
71	NC_018651	A	6	6	62226	62231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018651	A	6	6	63919	63924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018651	T	7	7	64038	64044	0 %	100 %	0 %	0 %	410485194
74	NC_018651	T	7	7	64289	64295	0 %	100 %	0 %	0 %	410485194
75	NC_018651	T	6	6	64621	64626	0 %	100 %	0 %	0 %	410485195
76	NC_018651	T	6	6	64722	64727	0 %	100 %	0 %	0 %	410485195
77	NC_018651	T	6	6	65037	65042	0 %	100 %	0 %	0 %	410485195
78	NC_018651	T	8	8	65133	65140	0 %	100 %	0 %	0 %	410485196
79	NC_018651	T	6	6	65234	65239	0 %	100 %	0 %	0 %	410485196
80	NC_018651	T	6	6	65472	65477	0 %	100 %	0 %	0 %	410485196
81	NC_018651	T	6	6	65874	65879	0 %	100 %	0 %	0 %	410485196
82	NC_018651	A	6	6	67157	67162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018651	T	6	6	72573	72578	0 %	100 %	0 %	0 %	410485204
84	NC_018651	T	6	6	72586	72591	0 %	100 %	0 %	0 %	410485204
85	NC_018651	T	7	7	74773	74779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018651	T	6	6	74946	74951	0 %	100 %	0 %	0 %	410485205
87	NC_018651	T	6	6	75924	75929	0 %	100 %	0 %	0 %	410485205
88	NC_018651	T	7	7	76139	76145	0 %	100 %	0 %	0 %	410485205
89	NC_018651	T	6	6	76887	76892	0 %	100 %	0 %	0 %	410485206
90	NC_018651	T	6	6	77387	77392	0 %	100 %	0 %	0 %	410485206
91	NC_018651	T	6	6	78363	78368	0 %	100 %	0 %	0 %	410485206
92	NC_018651	A	6	6	78847	78852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018651	T	7	7	79678	79684	0 %	100 %	0 %	0 %	410485209
94	NC_018651	T	7	7	79837	79843	0 %	100 %	0 %	0 %	410485209
95	NC_018651	T	7	7	80549	80555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018651	T	7	7	81026	81032	0 %	100 %	0 %	0 %	410485210
97	NC_018651	T	6	6	82046	82051	0 %	100 %	0 %	0 %	410485210
98	NC_018651	A	6	6	82597	82602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018651	T	6	6	84381	84386	0 %	100 %	0 %	0 %	410485211
100	NC_018651	A	6	6	85137	85142	100 %	0 %	0 %	0 %	410485214
101	NC_018651	T	7	7	86431	86437	0 %	100 %	0 %	0 %	410485215
102	NC_018651	A	6	6	87013	87018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018651	A	6	6	87504	87509	100 %	0 %	0 %	0 %	410485217
104	NC_018651	T	6	6	89151	89156	0 %	100 %	0 %	0 %	410485219
105	NC_018651	T	6	6	90509	90514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018651	T	6	6	91549	91554	0 %	100 %	0 %	0 %	410485221
107	NC_018651	T	8	8	91769	91776	0 %	100 %	0 %	0 %	410485221
108	NC_018651	T	7	7	92085	92091	0 %	100 %	0 %	0 %	410485221
109	NC_018651	A	6	6	92503	92508	100 %	0 %	0 %	0 %	410485221
110	NC_018651	T	7	7	92588	92594	0 %	100 %	0 %	0 %	410485221
111	NC_018651	A	7	7	92795	92801	100 %	0 %	0 %	0 %	410485221
112	NC_018651	T	6	6	92960	92965	0 %	100 %	0 %	0 %	410485221
113	NC_018651	T	6	6	93126	93131	0 %	100 %	0 %	0 %	410485221
114	NC_018651	A	6	6	94383	94388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018651	A	6	6	94563	94568	100 %	0 %	0 %	0 %	410485224
116	NC_018651	A	6	6	94982	94987	100 %	0 %	0 %	0 %	410485225
117	NC_018651	T	6	6	96490	96495	0 %	100 %	0 %	0 %	410485228
118	NC_018651	C	6	6	97215	97220	0 %	0 %	0 %	100 %	410485229
119	NC_018651	T	6	6	97896	97901	0 %	100 %	0 %	0 %	410485230
120	NC_018651	C	7	7	98158	98164	0 %	0 %	0 %	100 %	410485230
121	NC_018651	T	7	7	100949	100955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018651	T	7	7	103487	103493	0 %	100 %	0 %	0 %	410485231
123	NC_018651	T	7	7	105139	105145	0 %	100 %	0 %	0 %	410485231
124	NC_018651	T	6	6	105233	105238	0 %	100 %	0 %	0 %	410485231
125	NC_018651	T	7	7	105608	105614	0 %	100 %	0 %	0 %	410485231
126	NC_018651	C	6	6	107662	107667	0 %	0 %	0 %	100 %	410485234
127	NC_018651	T	6	6	108121	108126	0 %	100 %	0 %	0 %	410485235

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.