MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 107796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_018650	CG	3	6	99481	99486	0 %	0 %	50 %	50 %	410480257
2003	NC_018650	GAT	2	6	99496	99501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480257
2004	NC_018650	ATG	3	9	99509	99517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480257
2005	NC_018650	AC	3	6	99644	99649	50 %	0 %	0 %	50 %	410480257
2006	NC_018650	CAG	2	6	99692	99697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480257
2007	NC_018650	CAA	2	6	99754	99759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480257
2008	NC_018650	CTTTA	2	10	99871	99880	20 %	60 %	0 %	20 %	410480257
2009	NC_018650	AGC	2	6	99883	99888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480257
2010	NC_018650	GAA	2	6	99931	99936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480257
2011	NC_018650	TGT	2	6	99958	99963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480257
2012	NC_018650	TGG	2	6	100014	100019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480257
2013	NC_018650	TGC	2	6	100180	100185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480258
2014	NC_018650	GCG	2	6	100189	100194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480258
2015	NC_018650	TGC	2	6	100451	100456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480258
2016	NC_018650	CGA	2	6	100483	100488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480258
2017	NC_018650	CGG	3	9	100511	100519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480258
2018	NC_018650	AACC	2	8	100684	100691	50 %	0 %	0 %	50 %	410480258
2019	NC_018650	TCCA	2	8	100702	100709	25 %	25 %	0 %	50 %	410480258
2020	NC_018650	CAT	2	6	100760	100765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480258
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2022	NC_018650	GGTC	2	8	101003	101010	0 %	25 %	50 %	25 %	410480258
2023	NC_018650	ACG	2	6	101069	101074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480258
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2025	NC_018650	TGG	2	6	101276	101281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480258
2026	NC_018650	CAT	2	6	101288	101293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480258
2027	NC_018650	CGC	2	6	101375	101380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480258
2028	NC_018650	GC	3	6	101393	101398	0 %	0 %	50 %	50 %	410480258
2029	NC_018650	GCG	2	6	101471	101476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480258
2030	NC_018650	CAG	2	6	101511	101516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480258
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2037	NC_018650	CCG	2	6	101926	101931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2038	NC_018650	TGG	2	6	101952	101957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480259
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2040	NC_018650	GGA	2	6	102006	102011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480259
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2042	NC_018650	GGC	2	6	102153	102158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480259
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2044	NC_018650	TGT	2	6	102211	102216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480259
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2049	NC_018650	CGGAC	2	10	102423	102432	20 %	0 %	40 %	40 %	410480259
2050	NC_018650	GCA	3	9	102515	102523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480259
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2053	NC_018650	GTAA	2	8	102671	102678	50 %	25 %	25 %	0 %	410480259
2054	NC_018650	CAG	3	9	102729	102737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480259
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2069	NC_018650	T	6	6	103436	103441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2093	NC_018650	TGG	2	6	104725	104730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480260
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2097	NC_018650	CGCTT	2	10	104868	104877	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2099	NC_018650	GCC	2	6	104974	104979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2112	NC_018650	GAC	2	6	105611	105616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480261
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2119	NC_018650	ATC	2	6	105940	105945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480261
2120	NC_018650	CTG	2	6	105972	105977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480261
2121	NC_018650	AGCC	2	8	106012	106019	25 %	0 %	25 %	50 %	410480261
2122	NC_018650	TGC	2	6	106066	106071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480261
2123	NC_018650	CGCA	2	8	106125	106132	25 %	0 %	25 %	50 %	410480261
2124	NC_018650	GCG	2	6	106135	106140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480261
2125	NC_018650	GCG	2	6	106144	106149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480261
2126	NC_018650	CAT	2	6	106191	106196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480261
2127	NC_018650	GGC	2	6	106272	106277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480261
2128	NC_018650	GAG	2	6	106278	106283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480261
2129	NC_018650	CAG	2	6	106374	106379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480261
2130	NC_018650	TTC	2	6	106380	106385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480261
2131	NC_018650	GAC	2	6	106394	106399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480261
2132	NC_018650	TGC	2	6	106411	106416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480261
2133	NC_018650	GGCG	2	8	106450	106457	0 %	0 %	75 %	25 %	410480261
2134	NC_018650	TCA	2	6	106487	106492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480261
2135	NC_018650	CGG	2	6	106509	106514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480261
2136	NC_018650	TTC	2	6	106521	106526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480261
2137	NC_018650	GTT	2	6	106600	106605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480261
2138	NC_018650	ATC	2	6	106678	106683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480261
2139	NC_018650	CGG	2	6	106729	106734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480261
2140	NC_018650	TCA	2	6	106820	106825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480261
2141	NC_018650	CCG	2	6	106827	106832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480261
2142	NC_018650	CCG	2	6	106834	106839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480261
2143	NC_018650	AGT	2	6	106894	106899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480261
2144	NC_018650	TGC	2	6	107004	107009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480261
2145	NC_018650	TAG	2	6	107086	107091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480262
2146	NC_018650	CCA	2	6	107093	107098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480262
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2148	NC_018650	GCC	2	6	107186	107191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480262
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2150	NC_018650	GTT	2	6	107206	107211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480262
2151	NC_018650	ATC	2	6	107334	107339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480262
2152	NC_018650	ATG	3	9	107343	107351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480262
2153	NC_018650	GT	3	6	107531	107536	0 %	50 %	50 %	0 %	410480262
2154	NC_018650	TAC	2	6	107557	107562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480262
2155	NC_018650	CCG	2	6	107563	107568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480262
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2157	NC_018650	GCC	2	6	107710	107715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480262
2158	NC_018650	TTTCGG	2	12	107769	107780	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410480263
2159	NC_018650	GTG	2	6	107925	107930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480263
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2161	NC_018650	GC	3	6	107956	107961	0 %	0 %	50 %	50 %	410480263
2162	NC_018650	TGA	2	6	107964	107969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480263
2163	NC_018650	TGA	2	6	107995	108000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480263
2164	NC_018650	TGG	2	6	108087	108092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480263
2165	NC_018650	GCA	2	6	108152	108157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480263
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2168	NC_018650	TTCA	2	8	108368	108375	25 %	50 %	0 %	25 %	410480263
2169	NC_018650	ACC	2	6	108386	108391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480263
2170	NC_018650	GAC	2	6	108409	108414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480263
2171	NC_018650	ATC	2	6	108431	108436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480263
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2173	NC_018650	GGCA	2	8	108668	108675	25 %	0 %	50 %	25 %	410480263
2174	NC_018650	CAG	2	6	108785	108790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480263
2175	NC_018650	GGT	2	6	108824	108829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480263
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2177	NC_018650	GCT	2	6	109117	109122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480263
2178	NC_018650	AG	3	6	109220	109225	50 %	0 %	50 %	0 %	410480263
2179	NC_018650	T	6	6	109228	109233	0 %	100 %	0 %	0 %	410480263
2180	NC_018650	ATC	2	6	109236	109241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480263
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2187	NC_018650	ATC	2	6	109506	109511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480263
2188	NC_018650	GCA	2	6	109660	109665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480263
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2190	NC_018650	AGGT	2	8	109830	109837	25 %	25 %	50 %	0 %	410480263
2191	NC_018650	ACG	2	6	109895	109900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480264
2192	NC_018650	GTT	2	6	109985	109990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480264
2193	NC_018650	CTT	2	6	109999	110004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480264
2194	NC_018650	TTC	2	6	110042	110047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480264
2195	NC_018650	CG	3	6	110094	110099	0 %	0 %	50 %	50 %	410480264
2196	NC_018650	GAA	2	6	110188	110193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2197	NC_018650	CAA	2	6	110231	110236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480265
2198	NC_018650	GCT	2	6	110260	110265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480265
2199	NC_018650	GGC	2	6	110269	110274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480265
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2201	NC_018650	TCA	2	6	110334	110339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480265
2202	NC_018650	GACCGC	2	12	110428	110439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410480265
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2204	NC_018650	CGG	2	6	110468	110473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480265
2205	NC_018650	CG	3	6	110490	110495	0 %	0 %	50 %	50 %	410480265
2206	NC_018650	TGC	2	6	110517	110522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480265
2207	NC_018650	GC	3	6	110521	110526	0 %	0 %	50 %	50 %	410480265
2208	NC_018650	TCA	2	6	110664	110669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480265
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2212	NC_018650	TTA	2	6	110892	110897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2213	NC_018650	GTT	2	6	110948	110953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2214	NC_018650	CAC	2	6	111059	111064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2215	NC_018650	ATGG	2	8	111111	111118	25 %	25 %	50 %	0 %	410480266
2216	NC_018650	TAA	2	6	111125	111130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480266
2217	NC_018650	ATC	2	6	111147	111152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480266
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2219	NC_018650	GCCA	2	8	111180	111187	25 %	0 %	25 %	50 %	410480266
2220	NC_018650	GAA	2	6	111196	111201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480266
2221	NC_018650	ACT	2	6	111242	111247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480266
2222	NC_018650	GGAA	3	12	111248	111259	50 %	0 %	50 %	0 %	410480266
2223	NC_018650	GCT	2	6	111320	111325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480266
2224	NC_018650	GAGC	2	8	111330	111337	25 %	0 %	50 %	25 %	410480266
2225	NC_018650	TGA	2	6	111347	111352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480266
2226	NC_018650	GCC	2	6	111354	111359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480266
2227	NC_018650	TGG	2	6	111410	111415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480266
2228	NC_018650	CGGGA	2	10	111505	111514	20 %	0 %	60 %	20 %	410480266
2229	NC_018650	CAA	3	9	111670	111678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480266
2230	NC_018650	G	6	6	111681	111686	0 %	0 %	100 %	0 %	410480266
2231	NC_018650	TGA	2	6	111716	111721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480266
2232	NC_018650	TGA	2	6	111873	111878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480266
2233	NC_018650	GC	3	6	111883	111888	0 %	0 %	50 %	50 %	410480266
2234	NC_018650	GTG	2	6	111900	111905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480266
2235	NC_018650	CCAGG	2	10	111982	111991	20 %	0 %	40 %	40 %	410480266
2236	NC_018650	TGG	2	6	112001	112006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480266
2237	NC_018650	GGT	2	6	112086	112091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480266
2238	NC_018650	GAT	2	6	112117	112122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480266
2239	NC_018650	A	6	6	112123	112128	100 %	0 %	0 %	0 %	410480266
2240	NC_018650	TGA	2	6	112233	112238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480266
2241	NC_018650	ACC	2	6	112275	112280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480266
2242	NC_018650	CTGG	2	8	112356	112363	0 %	25 %	50 %	25 %	410480266
2243	NC_018650	GC	4	8	112410	112417	0 %	0 %	50 %	50 %	410480266
2244	NC_018650	TTA	2	6	112459	112464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480266
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2362	NC_018650	GTTT	2	8	117766	117773	0 %	75 %	25 %	0 %	410480272
2363	NC_018650	GGC	2	6	117817	117822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2364	NC_018650	GAC	2	6	117894	117899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480273
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2366	NC_018650	CGGT	2	8	117926	117933	0 %	25 %	50 %	25 %	410480273
2367	NC_018650	CCA	2	6	117948	117953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480273
2368	NC_018650	TAC	2	6	117970	117975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480273
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2370	NC_018650	ATC	2	6	118052	118057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480273
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2375	NC_018650	CG	3	6	118308	118313	0 %	0 %	50 %	50 %	410480273
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2467	NC_018650	CAG	2	6	122489	122494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480280
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2486	NC_018650	CG	3	6	123276	123281	0 %	0 %	50 %	50 %	410480280
2487	NC_018650	GC	4	8	123526	123533	0 %	0 %	50 %	50 %	410480280
2488	NC_018650	CGC	2	6	123545	123550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480280
2489	NC_018650	GACGGA	2	12	123563	123574	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410480280
2490	NC_018650	GCA	2	6	123577	123582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480280
2491	NC_018650	GCC	2	6	123587	123592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480280
2492	NC_018650	T	7	7	123860	123866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_018650	CTG	2	6	123892	123897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2494	NC_018650	AGGA	2	8	123905	123912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_018650	TGAT	2	8	123958	123965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2496	NC_018650	CAA	2	6	123981	123986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2497	NC_018650	AAG	2	6	124022	124027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_018650	CAA	2	6	124131	124136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2499	NC_018650	GAA	2	6	124165	124170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480281
2500	NC_018650	TTA	2	6	124206	124211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480281

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