MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 107796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018650	CCG	2	6	26478	26483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480168
502	NC_018650	CGA	2	6	26603	26608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480168
503	NC_018650	CG	4	8	26666	26673	0 %	0 %	50 %	50 %	410480168
504	NC_018650	TGG	2	6	26692	26697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480168
505	NC_018650	ATG	2	6	26704	26709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480168
506	NC_018650	TAC	2	6	26766	26771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480168
507	NC_018650	TGA	2	6	26858	26863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480168
508	NC_018650	TGA	2	6	26909	26914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480168
509	NC_018650	TCA	2	6	26929	26934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480168
510	NC_018650	ATG	2	6	26997	27002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480168
511	NC_018650	GCG	2	6	27030	27035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480168
512	NC_018650	GAC	2	6	27042	27047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480168
513	NC_018650	ATC	2	6	27066	27071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480168
514	NC_018650	CGC	2	6	27076	27081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480168
515	NC_018650	GCG	2	6	27089	27094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480168
516	NC_018650	CAGT	2	8	27109	27116	25 %	25 %	25 %	25 %	410480168
517	NC_018650	ATG	2	6	27138	27143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480168
518	NC_018650	TGG	2	6	27220	27225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480168
519	NC_018650	TGA	2	6	27329	27334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480168
520	NC_018650	AAATG	2	10	27359	27368	60 %	20 %	20 %	0 %	410480168
521	NC_018650	GAT	2	6	27381	27386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480168
522	NC_018650	GCA	2	6	27406	27411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480168
523	NC_018650	GGT	2	6	27557	27562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480168
524	NC_018650	A	6	6	27612	27617	100 %	0 %	0 %	0 %	410480168
525	NC_018650	TGA	2	6	27643	27648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018650	CGG	2	6	27654	27659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018650	ATT	2	6	27662	27667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018650	GCT	2	6	27671	27676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480169
529	NC_018650	CCG	2	6	27689	27694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480169
530	NC_018650	AGGA	2	8	27698	27705	50 %	0 %	50 %	0 %	410480169
531	NC_018650	A	6	6	27705	27710	100 %	0 %	0 %	0 %	410480169
532	NC_018650	TGC	2	6	27729	27734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480169
533	NC_018650	CGC	2	6	27780	27785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480169
534	NC_018650	GC	3	6	27795	27800	0 %	0 %	50 %	50 %	410480169
535	NC_018650	GCA	2	6	27857	27862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480169
536	NC_018650	T	6	6	27916	27921	0 %	100 %	0 %	0 %	410480169
537	NC_018650	GGT	2	6	27928	27933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480169
538	NC_018650	T	6	6	27936	27941	0 %	100 %	0 %	0 %	410480169
539	NC_018650	GGT	2	6	28016	28021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480169
540	NC_018650	CAT	2	6	28057	28062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480169
541	NC_018650	ATTTT	2	10	28100	28109	20 %	80 %	0 %	0 %	410480169
542	NC_018650	CCT	2	6	28130	28135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_018650	A	8	8	28184	28191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018650	CAA	2	6	28229	28234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480170
545	NC_018650	GGC	2	6	28332	28337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480170
546	NC_018650	CTG	2	6	28393	28398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480170
547	NC_018650	GTT	3	9	28401	28409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480170
548	NC_018650	CGG	2	6	28422	28427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480170
549	NC_018650	TTA	2	6	28510	28515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480170
550	NC_018650	TC	3	6	28865	28870	0 %	50 %	0 %	50 %	410480171
551	NC_018650	TATT	2	8	28911	28918	25 %	75 %	0 %	0 %	410480171
552	NC_018650	GA	3	6	28919	28924	50 %	0 %	50 %	0 %	410480171
553	NC_018650	TGA	2	6	29076	29081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480172
554	NC_018650	CAG	2	6	29111	29116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480172
555	NC_018650	CCGCA	2	10	29348	29357	20 %	0 %	20 %	60 %	410480172
556	NC_018650	AGC	2	6	29384	29389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480172
557	NC_018650	TGA	2	6	29408	29413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480172
558	NC_018650	TGC	2	6	29417	29422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480172
559	NC_018650	CAGC	2	8	29477	29484	25 %	0 %	25 %	50 %	410480173
560	NC_018650	CAA	2	6	29495	29500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480173
561	NC_018650	TCA	2	6	29512	29517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480173
562	NC_018650	AG	3	6	29558	29563	50 %	0 %	50 %	0 %	410480173
563	NC_018650	CCG	2	6	29598	29603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480173
564	NC_018650	GC	3	6	29608	29613	0 %	0 %	50 %	50 %	410480173
565	NC_018650	CGC	2	6	29650	29655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480173
566	NC_018650	GCG	2	6	29700	29705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480173
567	NC_018650	AGC	2	6	29712	29717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480173
568	NC_018650	TCA	2	6	29728	29733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480173
569	NC_018650	AGCC	2	8	29764	29771	25 %	0 %	25 %	50 %	410480173
570	NC_018650	GCAG	2	8	29773	29780	25 %	0 %	50 %	25 %	410480173
571	NC_018650	A	6	6	29846	29851	100 %	0 %	0 %	0 %	410480173
572	NC_018650	GGC	2	6	29945	29950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480173
573	NC_018650	ATCAGC	2	12	29970	29981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410480173
574	NC_018650	CAA	2	6	30113	30118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480173
575	NC_018650	GC	3	6	30132	30137	0 %	0 %	50 %	50 %	410480173
576	NC_018650	CAG	2	6	30155	30160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480173
577	NC_018650	CCG	2	6	30162	30167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480173
578	NC_018650	CGC	2	6	30277	30282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480173
579	NC_018650	GGC	2	6	30314	30319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480173
580	NC_018650	CGA	2	6	30385	30390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480173
581	NC_018650	CGG	2	6	30402	30407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480173
582	NC_018650	CAG	2	6	30458	30463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480173
583	NC_018650	CG	3	6	30511	30516	0 %	0 %	50 %	50 %	410480173
584	NC_018650	TGA	2	6	30699	30704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018650	GGGA	2	8	30784	30791	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018650	CT	3	6	30809	30814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_018650	ACC	2	6	30836	30841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_018650	CTG	2	6	30945	30950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018650	AGA	2	6	30953	30958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018650	TGC	2	6	31077	31082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480174
591	NC_018650	CCA	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480174
592	NC_018650	TGT	2	6	31191	31196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018650	TTG	2	6	31228	31233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018650	CAC	2	6	31275	31280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_018650	TAAA	2	8	31369	31376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018650	ATA	2	6	31494	31499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480175
597	NC_018650	GGC	2	6	31527	31532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480175
598	NC_018650	TGA	2	6	31533	31538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480175
599	NC_018650	CGG	2	6	31549	31554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480175
600	NC_018650	T	6	6	31557	31562	0 %	100 %	0 %	0 %	410480175
601	NC_018650	CAA	2	6	31678	31683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480175
602	NC_018650	ACT	2	6	31695	31700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480175
603	NC_018650	ACT	2	6	31718	31723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480175
604	NC_018650	CCG	2	6	31738	31743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480175
605	NC_018650	GTC	2	6	31749	31754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480175
606	NC_018650	GTG	3	9	31761	31769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480175
607	NC_018650	GTC	2	6	31770	31775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480175
608	NC_018650	AAC	2	6	31798	31803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480175
609	NC_018650	AC	3	6	31802	31807	50 %	0 %	0 %	50 %	410480175
610	NC_018650	CCG	2	6	31820	31825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480175
611	NC_018650	CGGG	2	8	31834	31841	0 %	0 %	75 %	25 %	410480175
612	NC_018650	AGA	2	6	31877	31882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480175
613	NC_018650	CAG	2	6	31968	31973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480176
614	NC_018650	CCTG	2	8	32012	32019	0 %	25 %	25 %	50 %	410480176
615	NC_018650	GC	3	6	32106	32111	0 %	0 %	50 %	50 %	410480176
616	NC_018650	CGG	2	6	32125	32130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480176
617	NC_018650	GAT	2	6	32240	32245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480176
618	NC_018650	GAA	2	6	32328	32333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480176
619	NC_018650	GCC	2	6	32377	32382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480176
620	NC_018650	GCC	3	9	32466	32474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480176
621	NC_018650	GAA	2	6	32487	32492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480176
622	NC_018650	GCG	2	6	32508	32513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480176
623	NC_018650	GCG	2	6	32551	32556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480176
624	NC_018650	ACC	2	6	32613	32618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480176
625	NC_018650	GCA	2	6	32695	32700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480176
626	NC_018650	AGG	2	6	32716	32721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480176
627	NC_018650	TTG	2	6	32727	32732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480176
628	NC_018650	TGA	2	6	32753	32758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480176
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655	NC_018650	AAC	2	6	33893	33898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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