MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 107796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018650	GAT	2	6	245760	245765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480387
5003	NC_018650	CCTGG	2	10	245766	245775	0 %	20 %	40 %	40 %	410480387
5004	NC_018650	CGCGTC	2	12	245855	245866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410480387
5005	NC_018650	TGA	2	6	246042	246047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480387
5006	NC_018650	A	6	6	246049	246054	100 %	0 %	0 %	0 %	410480387
5007	NC_018650	GCG	2	6	246081	246086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480387
5008	NC_018650	ATC	2	6	246100	246105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480387
5009	NC_018650	TGC	2	6	246182	246187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480387
5010	NC_018650	CGG	2	6	246211	246216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480387
5011	NC_018650	TGG	2	6	246283	246288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480387
5012	NC_018650	GTA	2	6	246400	246405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480387
5013	NC_018650	GTG	2	6	246502	246507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480387
5014	NC_018650	CGG	2	6	246579	246584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480387
5015	NC_018650	AT	3	6	246627	246632	50 %	50 %	0 %	0 %	410480387
5016	NC_018650	CAA	2	6	246672	246677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480387
5017	NC_018650	GAT	2	6	246792	246797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480387
5018	NC_018650	CAC	2	6	246808	246813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480387
5019	NC_018650	TTC	2	6	246814	246819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480387
5020	NC_018650	CGAA	2	8	246866	246873	50 %	0 %	25 %	25 %	410480387
5021	NC_018650	TCT	2	6	246929	246934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480387
5022	NC_018650	GGC	2	6	246979	246984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480387
5023	NC_018650	CGT	2	6	247036	247041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480387
5024	NC_018650	GGC	2	6	247074	247079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480387
5025	NC_018650	GC	3	6	247132	247137	0 %	0 %	50 %	50 %	410480387
5026	NC_018650	CTT	2	6	247230	247235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480387
5027	NC_018650	CTG	2	6	247282	247287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480387
5028	NC_018650	CAT	2	6	247299	247304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480387
5029	NC_018650	TGA	2	6	247319	247324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480387
5030	NC_018650	TGC	2	6	247337	247342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480387
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5032	NC_018650	TGG	2	6	247457	247462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480387
5033	NC_018650	TGG	2	6	247514	247519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480387
5034	NC_018650	AAG	2	6	247520	247525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480387
5035	NC_018650	TGG	2	6	247580	247585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480387
5036	NC_018650	GTC	2	6	247645	247650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480387
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5039	NC_018650	GATCAA	2	12	247830	247841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410480387
5040	NC_018650	CAG	2	6	247897	247902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480387
5041	NC_018650	GC	3	6	247927	247932	0 %	0 %	50 %	50 %	410480387
5042	NC_018650	CAC	2	6	247971	247976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480387
5043	NC_018650	CTG	2	6	248074	248079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480387
5044	NC_018650	CTT	2	6	248132	248137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480387
5045	NC_018650	CGC	2	6	248200	248205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480387
5046	NC_018650	CGGAG	2	10	248207	248216	20 %	0 %	60 %	20 %	410480387
5047	NC_018650	CAA	2	6	248251	248256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480387
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5050	NC_018650	GCAAC	2	10	248351	248360	40 %	0 %	20 %	40 %	410480388
5051	NC_018650	GCC	2	6	248387	248392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480388
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5053	NC_018650	GCA	2	6	248523	248528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480388
5054	NC_018650	GCA	2	6	248556	248561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480388
5055	NC_018650	GTG	2	6	248588	248593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480388
5056	NC_018650	CGCCAT	2	12	248622	248633	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410480388
5057	NC_018650	ATG	2	6	248673	248678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480388
5058	NC_018650	TGC	2	6	248691	248696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480388
5059	NC_018650	A	7	7	248720	248726	100 %	0 %	0 %	0 %	410480388
5060	NC_018650	TTA	2	6	248757	248762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480388
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5065	NC_018650	CTGG	2	8	249042	249049	0 %	25 %	50 %	25 %	410480388
5066	NC_018650	CAAC	2	8	249111	249118	50 %	0 %	0 %	50 %	410480388
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5088	NC_018650	GAC	2	6	249809	249814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480388
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5101	NC_018650	TTA	2	6	250441	250446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480388
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5104	NC_018650	CTG	2	6	250562	250567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480388
5105	NC_018650	ATT	2	6	250571	250576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480388
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5109	NC_018650	TCAG	2	8	250722	250729	25 %	25 %	25 %	25 %	410480389
5110	NC_018650	CG	3	6	250756	250761	0 %	0 %	50 %	50 %	410480389
5111	NC_018650	CAC	2	6	250768	250773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480389
5112	NC_018650	GGC	2	6	250810	250815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480389
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5116	NC_018650	CG	3	6	251059	251064	0 %	0 %	50 %	50 %	410480389
5117	NC_018650	GGA	2	6	251065	251070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480389
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5238	NC_018650	TGGCG	2	10	256344	256353	0 %	20 %	60 %	20 %	410480391
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5242	NC_018650	AG	3	6	256494	256499	50 %	0 %	50 %	0 %	410480391
5243	NC_018650	ATC	2	6	256523	256528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480391
5244	NC_018650	ATCG	2	8	256645	256652	25 %	25 %	25 %	25 %	410480391
5245	NC_018650	TTGC	2	8	256714	256721	0 %	50 %	25 %	25 %	410480391
5246	NC_018650	TGC	2	6	256745	256750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480391
5247	NC_018650	CT	3	6	256765	256770	0 %	50 %	0 %	50 %	410480391
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5249	NC_018650	GAC	2	6	256882	256887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480391
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5252	NC_018650	GAT	2	6	256948	256953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480391
5253	NC_018650	GCA	2	6	256986	256991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480391
5254	NC_018650	TGTT	2	8	257033	257040	0 %	75 %	25 %	0 %	410480391
5255	NC_018650	AGC	2	6	257059	257064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480391
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5258	NC_018650	AG	3	6	257223	257228	50 %	0 %	50 %	0 %	410480391
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5261	NC_018650	CT	3	6	257438	257443	0 %	50 %	0 %	50 %	410480392
5262	NC_018650	GAT	2	6	257567	257572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480392
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5264	NC_018650	CGGT	2	8	257635	257642	0 %	25 %	50 %	25 %	410480392
5265	NC_018650	ATT	2	6	257697	257702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480392
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5268	NC_018650	AGCGGT	2	12	257774	257785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410480392
5269	NC_018650	TGC	2	6	257887	257892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480392
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5271	NC_018650	ATC	2	6	257991	257996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480392
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5282	NC_018650	A	6	6	258651	258656	100 %	0 %	0 %	0 %	410480392
5283	NC_018650	AAT	2	6	258672	258677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480392
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5285	NC_018650	ACC	2	6	258791	258796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5286	NC_018650	CTT	2	6	258820	258825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5287	NC_018650	T	7	7	258901	258907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5288	NC_018650	GCGG	2	8	258964	258971	0 %	0 %	75 %	25 %	410480393
5289	NC_018650	TGA	2	6	258977	258982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480393
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5292	NC_018650	ACC	2	6	259078	259083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480393
5293	NC_018650	C	6	6	259082	259087	0 %	0 %	0 %	100 %	410480393
5294	NC_018650	CTG	2	6	259117	259122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480393
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5322	NC_018650	TGC	2	6	260521	260526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5339	NC_018650	GGC	3	9	261132	261140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480394
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5341	NC_018650	GTA	2	6	261192	261197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480394
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5343	NC_018650	A	6	6	261478	261483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5344	NC_018650	TGG	2	6	261503	261508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5345	NC_018650	ATT	2	6	261541	261546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5346	NC_018650	T	7	7	261545	261551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5347	NC_018650	GCA	2	6	261658	261663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5348	NC_018650	TGA	2	6	261688	261693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480395
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5350	NC_018650	GCGG	2	8	261811	261818	0 %	0 %	75 %	25 %	410480395
5351	NC_018650	GGT	2	6	261842	261847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480395
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5353	NC_018650	GATT	2	8	261941	261948	25 %	50 %	25 %	0 %	410480395
5354	NC_018650	CTT	2	6	261968	261973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480395
5355	NC_018650	CTG	2	6	261987	261992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480395
5356	NC_018650	TGG	2	6	262090	262095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480395
5357	NC_018650	TG	3	6	262135	262140	0 %	50 %	50 %	0 %	410480395
5358	NC_018650	GAT	2	6	262161	262166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480395
5359	NC_018650	AAGTG	2	10	262199	262208	40 %	20 %	40 %	0 %	410480395
5360	NC_018650	CG	3	6	262229	262234	0 %	0 %	50 %	50 %	410480395
5361	NC_018650	TGC	2	6	262249	262254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480395
5362	NC_018650	CGC	2	6	262385	262390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480395
5363	NC_018650	TTTC	2	8	262401	262408	0 %	75 %	0 %	25 %	410480395
5364	NC_018650	CGG	2	6	262438	262443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480395
5365	NC_018650	CTGG	2	8	262475	262482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5366	NC_018650	GAA	2	6	262505	262510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_018650	AGGC	2	8	262534	262541	25 %	0 %	50 %	25 %	410480396
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5370	NC_018650	CTGG	2	8	262726	262733	0 %	25 %	50 %	25 %	410480396
5371	NC_018650	CAT	2	6	262772	262777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480396
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5374	NC_018650	GAT	2	6	262965	262970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480396
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5393	NC_018650	TCG	2	6	263969	263974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480396
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5411	NC_018650	TCTCCC	2	12	264765	264776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5446	NC_018650	TCT	2	6	266275	266280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5485	NC_018650	GCAAA	2	10	268431	268440	60 %	0 %	20 %	20 %	410480399
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5488	NC_018650	TGA	2	6	268482	268487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480399
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