MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pB

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018223	ACATG	2	10	630	639	40 %	20 %	20 %	20 %	397698508
2	NC_018223	GTGTA	2	10	1685	1694	20 %	40 %	40 %	0 %	397698509
3	NC_018223	AGAAA	2	10	2914	2923	80 %	0 %	20 %	0 %	397698509
4	NC_018223	AAATG	2	10	3939	3948	60 %	20 %	20 %	0 %	397698510
5	NC_018223	AGTTA	2	10	4122	4131	40 %	40 %	20 %	0 %	397698510
6	NC_018223	TGTGA	2	10	5344	5353	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018223	ACATT	2	10	5745	5754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018223	AAATA	2	10	5988	5997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018223	TTTTA	2	10	7310	7319	20 %	80 %	0 %	0 %	397698516
10	NC_018223	TTAGC	2	10	9365	9374	20 %	40 %	20 %	20 %	397698520
11	NC_018223	AAAAT	2	10	10164	10173	80 %	20 %	0 %	0 %	397698521
12	NC_018223	AAACT	2	10	10623	10632	60 %	20 %	0 %	20 %	397698522
13	NC_018223	TGGAA	2	10	11286	11295	40 %	20 %	40 %	0 %	397698524
14	NC_018223	AATAT	2	10	11399	11408	60 %	40 %	0 %	0 %	397698525
15	NC_018223	CTTAG	2	10	11740	11749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018223	TTTTC	2	10	12078	12087	0 %	80 %	0 %	20 %	397698526
17	NC_018223	AAAGA	2	10	18221	18230	80 %	0 %	20 %	0 %	397698530
18	NC_018223	CAAAT	2	10	22287	22296	60 %	20 %	0 %	20 %	397698535
19	NC_018223	AAAAG	2	10	23884	23893	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018223	AATTG	2	10	24810	24819	40 %	40 %	20 %	0 %	397698538
21	NC_018223	AGGAG	2	10	27099	27108	40 %	0 %	60 %	0 %	397698541
22	NC_018223	AAAAC	2	10	27363	27372	80 %	0 %	0 %	20 %	397698542
23	NC_018223	CGTCT	2	10	30370	30379	0 %	40 %	20 %	40 %	397698545
24	NC_018223	CAAAC	2	10	35137	35146	60 %	0 %	0 %	40 %	397698547
25	NC_018223	TTTGT	2	10	39835	39844	0 %	80 %	20 %	0 %	397698553
26	NC_018223	AAACC	2	10	40707	40716	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_018223	AGCCA	2	10	41479	41488	40 %	0 %	20 %	40 %	397698555
28	NC_018223	TGGAT	2	10	43278	43287	20 %	40 %	40 %	0 %	397698557
29	NC_018223	ATTTT	2	10	43507	43516	20 %	80 %	0 %	0 %	397698557
30	NC_018223	GGCAT	2	10	43601	43610	20 %	20 %	40 %	20 %	397698557
31	NC_018223	TGATT	2	10	45609	45618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018223	AGTAA	2	10	45930	45939	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018223	TTTCT	2	10	46584	46593	0 %	80 %	0 %	20 %	397698561
34	NC_018223	AAAAG	2	10	49679	49688	80 %	0 %	20 %	0 %	397698567
35	NC_018223	AAAGA	2	10	50371	50380	80 %	0 %	20 %	0 %	397698567
36	NC_018223	AGTAA	2	10	50746	50755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018223	AATAC	2	10	50818	50827	60 %	20 %	0 %	20 %	397698568
38	NC_018223	TGCGT	2	10	51124	51133	0 %	40 %	40 %	20 %	397698568
39	NC_018223	AGAAA	2	10	52824	52833	80 %	0 %	20 %	0 %	397698570
40	NC_018223	AAAAC	2	10	53150	53159	80 %	0 %	0 %	20 %	397698571
41	NC_018223	TAATA	2	10	53469	53478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018223	TAAAA	2	10	53727	53736	80 %	20 %	0 %	0 %	397698573
43	NC_018223	TTATT	2	10	55147	55156	20 %	80 %	0 %	0 %	397698576
44	NC_018223	ACAAT	2	10	55250	55259	60 %	20 %	0 %	20 %	397698576
45	NC_018223	TTATT	2	10	57926	57935	20 %	80 %	0 %	0 %	397698579
46	NC_018223	GCATT	2	10	60928	60937	20 %	40 %	20 %	20 %	397698582
47	NC_018223	ATGCA	2	10	61271	61280	40 %	20 %	20 %	20 %	397698582

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.