MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 3

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017963	CA	3	6	608	613	50 %	0 %	0 %	50 %	389869888
2	NC_017963	CT	3	6	868	873	0 %	50 %	0 %	50 %	389869888
3	NC_017963	CA	3	6	2079	2084	50 %	0 %	0 %	50 %	389869889
4	NC_017963	AG	3	6	4963	4968	50 %	0 %	50 %	0 %	389869892
5	NC_017963	TC	3	6	4992	4997	0 %	50 %	0 %	50 %	389869892
6	NC_017963	TA	3	6	5051	5056	50 %	50 %	0 %	0 %	389869892
7	NC_017963	TC	3	6	5110	5115	0 %	50 %	0 %	50 %	389869892
8	NC_017963	TA	3	6	5188	5193	50 %	50 %	0 %	0 %	389869892
9	NC_017963	GA	3	6	5659	5664	50 %	0 %	50 %	0 %	389869892
10	NC_017963	TG	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	389869892
11	NC_017963	TG	3	6	6687	6692	0 %	50 %	50 %	0 %	389869894
12	NC_017963	AT	3	6	7747	7752	50 %	50 %	0 %	0 %	389869895
13	NC_017963	GT	3	6	8524	8529	0 %	50 %	50 %	0 %	389869895
14	NC_017963	AT	3	6	9481	9486	50 %	50 %	0 %	0 %	389869897
15	NC_017963	CA	3	6	10786	10791	50 %	0 %	0 %	50 %	389869899
16	NC_017963	TG	3	6	11222	11227	0 %	50 %	50 %	0 %	389869899
17	NC_017963	CA	3	6	13560	13565	50 %	0 %	0 %	50 %	389869900
18	NC_017963	TC	3	6	13910	13915	0 %	50 %	0 %	50 %	389869901
19	NC_017963	AT	3	6	14839	14844	50 %	50 %	0 %	0 %	389869903
20	NC_017963	TG	3	6	15033	15038	0 %	50 %	50 %	0 %	389869904
21	NC_017963	TA	3	6	17093	17098	50 %	50 %	0 %	0 %	389869904
22	NC_017963	AT	3	6	17631	17636	50 %	50 %	0 %	0 %	389869905
23	NC_017963	CT	3	6	19970	19975	0 %	50 %	0 %	50 %	389869906
24	NC_017963	AC	3	6	20774	20779	50 %	0 %	0 %	50 %	389869906
25	NC_017963	CT	3	6	21062	21067	0 %	50 %	0 %	50 %	389869906
26	NC_017963	AT	3	6	21248	21253	50 %	50 %	0 %	0 %	389869906
27	NC_017963	CT	3	6	21545	21550	0 %	50 %	0 %	50 %	389869906
28	NC_017963	TG	3	6	23530	23535	0 %	50 %	50 %	0 %	389869910
29	NC_017963	TG	3	6	23543	23548	0 %	50 %	50 %	0 %	389869910
30	NC_017963	CA	3	6	25552	25557	50 %	0 %	0 %	50 %	389869912
31	NC_017963	TG	3	6	26116	26121	0 %	50 %	50 %	0 %	389869912
32	NC_017963	GT	4	8	26358	26365	0 %	50 %	50 %	0 %	389869913
33	NC_017963	TG	3	6	28407	28412	0 %	50 %	50 %	0 %	389869914
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35	NC_017963	AC	3	6	29606	29611	50 %	0 %	0 %	50 %	389869915
36	NC_017963	AT	3	6	29876	29881	50 %	50 %	0 %	0 %	389869916
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38	NC_017963	TA	3	6	31569	31574	50 %	50 %	0 %	0 %	389869920
39	NC_017963	CT	3	6	32274	32279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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41	NC_017963	TC	3	6	33164	33169	0 %	50 %	0 %	50 %	389869921
42	NC_017963	AT	3	6	33901	33906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017963	AT	3	6	33926	33931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017963	TA	3	6	33978	33983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017963	AT	4	8	34019	34026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017963	AT	4	8	34342	34349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017963	TA	3	6	34446	34451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017963	TA	3	6	34550	34555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017963	TA	3	6	34691	34696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017963	GT	3	6	36332	36337	0 %	50 %	50 %	0 %	389869923
51	NC_017963	AT	3	6	36564	36569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017963	TA	3	6	36588	36593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017963	TA	4	8	36989	36996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56	NC_017963	AT	3	6	38169	38174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_017963	AT	3	6	39214	39219	50 %	50 %	0 %	0 %	389869927
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63	NC_017963	TA	3	6	40439	40444	50 %	50 %	0 %	0 %	389869931
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109	NC_017963	AG	3	6	66909	66914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_017963	AT	4	8	70337	70344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.