MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 2

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017962	CT	3	6	138	143	0 %	50 %	0 %	50 %	389870173
2	NC_017962	AT	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017962	AG	3	6	568	573	50 %	0 %	50 %	0 %	389870174
4	NC_017962	TA	3	6	595	600	50 %	50 %	0 %	0 %	389870174
5	NC_017962	TG	3	6	864	869	0 %	50 %	50 %	0 %	389870174
6	NC_017962	GA	3	6	1274	1279	50 %	0 %	50 %	0 %	389870175
7	NC_017962	TA	3	6	1684	1689	50 %	50 %	0 %	0 %	389870176
8	NC_017962	TA	3	6	1728	1733	50 %	50 %	0 %	0 %	389870176
9	NC_017962	AC	3	6	1991	1996	50 %	0 %	0 %	50 %	389870176
10	NC_017962	GT	3	6	2683	2688	0 %	50 %	50 %	0 %	389870178
11	NC_017962	AT	3	6	2742	2747	50 %	50 %	0 %	0 %	389870178
12	NC_017962	AC	3	6	3081	3086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017962	CT	3	6	3520	3525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017962	TA	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	389870180
15	NC_017962	TA	3	6	3717	3722	50 %	50 %	0 %	0 %	389870180
16	NC_017962	AT	3	6	4299	4304	50 %	50 %	0 %	0 %	389870180
17	NC_017962	TA	3	6	4582	4587	50 %	50 %	0 %	0 %	389870180
18	NC_017962	AT	3	6	5185	5190	50 %	50 %	0 %	0 %	389870180
19	NC_017962	TA	3	6	5265	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	389870180
20	NC_017962	CA	3	6	5731	5736	50 %	0 %	0 %	50 %	389870181
21	NC_017962	AT	3	6	6138	6143	50 %	50 %	0 %	0 %	389870181
22	NC_017962	TC	3	6	6363	6368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017962	CG	3	6	7167	7172	0 %	0 %	50 %	50 %	389870184
24	NC_017962	CG	4	8	7215	7222	0 %	0 %	50 %	50 %	389870184
25	NC_017962	AC	3	6	7273	7278	50 %	0 %	0 %	50 %	389870184
26	NC_017962	AC	3	6	7630	7635	50 %	0 %	0 %	50 %	389870185
27	NC_017962	AG	3	6	9265	9270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017962	TG	3	6	9478	9483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017962	AC	3	6	9968	9973	50 %	0 %	0 %	50 %	389870188
30	NC_017962	TA	3	6	10238	10243	50 %	50 %	0 %	0 %	389870188
31	NC_017962	CT	3	6	10265	10270	0 %	50 %	0 %	50 %	389870188
32	NC_017962	AC	3	6	10709	10714	50 %	0 %	0 %	50 %	389870189
33	NC_017962	TA	4	8	12851	12858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017962	TC	3	6	13558	13563	0 %	50 %	0 %	50 %	389870192
35	NC_017962	TG	3	6	13878	13883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017962	AC	3	6	14436	14441	50 %	0 %	0 %	50 %	389870193
37	NC_017962	TA	3	6	16422	16427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017962	TA	3	6	16458	16463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017962	AT	3	6	16484	16489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017962	AT	3	6	16493	16498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017962	AT	3	6	16523	16528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017962	CG	3	6	17522	17527	0 %	0 %	50 %	50 %	389870195
43	NC_017962	AT	3	6	17856	17861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017962	AT	3	6	17984	17989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017962	AT	3	6	18002	18007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017962	AG	3	6	18755	18760	50 %	0 %	50 %	0 %	389870196
47	NC_017962	CA	3	6	19080	19085	50 %	0 %	0 %	50 %	389870196
48	NC_017962	TG	3	6	20272	20277	0 %	50 %	50 %	0 %	389870198
49	NC_017962	GA	3	6	21941	21946	50 %	0 %	50 %	0 %	389870200
50	NC_017962	GT	3	6	22699	22704	0 %	50 %	50 %	0 %	389870202
51	NC_017962	AT	3	6	22915	22920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017962	GT	3	6	22996	23001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017962	AT	3	6	23044	23049	50 %	50 %	0 %	0 %	389870203
54	NC_017962	AG	3	6	23192	23197	50 %	0 %	50 %	0 %	389870203
55	NC_017962	TA	3	6	24076	24081	50 %	50 %	0 %	0 %	389870204
56	NC_017962	TA	3	6	25129	25134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017962	AT	4	8	25232	25239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017962	AT	3	6	25462	25467	50 %	50 %	0 %	0 %	389870205
59	NC_017962	CT	3	6	25881	25886	0 %	50 %	0 %	50 %	389870206
60	NC_017962	CT	3	6	26045	26050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017962	TA	3	6	26064	26069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017962	TA	3	6	26307	26312	50 %	50 %	0 %	0 %	389870207
63	NC_017962	TG	3	6	27570	27575	0 %	50 %	50 %	0 %	389870208
64	NC_017962	AT	3	6	27901	27906	50 %	50 %	0 %	0 %	389870208
65	NC_017962	TA	3	6	29370	29375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017962	TA	3	6	29476	29481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017962	AT	3	6	29841	29846	50 %	50 %	0 %	0 %	389870209
68	NC_017962	GT	3	6	30442	30447	0 %	50 %	50 %	0 %	389870209
69	NC_017962	AT	3	6	30685	30690	50 %	50 %	0 %	0 %	389870209
70	NC_017962	TC	3	6	30899	30904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017962	TC	3	6	31185	31190	0 %	50 %	0 %	50 %	389870210
72	NC_017962	AT	3	6	31383	31388	50 %	50 %	0 %	0 %	389870210
73	NC_017962	TC	3	6	32050	32055	0 %	50 %	0 %	50 %	389870211
74	NC_017962	AT	3	6	32449	32454	50 %	50 %	0 %	0 %	389870211
75	NC_017962	TC	3	6	34108	34113	0 %	50 %	0 %	50 %	389870213
76	NC_017962	AT	3	6	34119	34124	50 %	50 %	0 %	0 %	389870213
77	NC_017962	CT	3	6	34520	34525	0 %	50 %	0 %	50 %	389870213
78	NC_017962	AT	3	6	34533	34538	50 %	50 %	0 %	0 %	389870213
79	NC_017962	TA	3	6	34924	34929	50 %	50 %	0 %	0 %	389870214
80	NC_017962	TA	3	6	35533	35538	50 %	50 %	0 %	0 %	389870215
81	NC_017962	AT	4	8	36073	36080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017962	AT	3	6	36299	36304	50 %	50 %	0 %	0 %	389870217
83	NC_017962	AT	3	6	36817	36822	50 %	50 %	0 %	0 %	389870217
84	NC_017962	TC	3	6	36929	36934	0 %	50 %	0 %	50 %	389870217
85	NC_017962	AT	3	6	37772	37777	50 %	50 %	0 %	0 %	389870217
86	NC_017962	TC	3	6	38166	38171	0 %	50 %	0 %	50 %	389870218
87	NC_017962	AT	3	6	38695	38700	50 %	50 %	0 %	0 %	389870218
88	NC_017962	AG	3	6	38904	38909	50 %	0 %	50 %	0 %	389870219
89	NC_017962	TA	3	6	38931	38936	50 %	50 %	0 %	0 %	389870219
90	NC_017962	TG	3	6	39200	39205	0 %	50 %	50 %	0 %	389870219
91	NC_017962	GA	3	6	39801	39806	50 %	0 %	50 %	0 %	389870220
92	NC_017962	TA	3	6	39863	39868	50 %	50 %	0 %	0 %	389870220
93	NC_017962	CG	3	6	41127	41132	0 %	0 %	50 %	50 %	389870222
94	NC_017962	TA	3	6	41538	41543	50 %	50 %	0 %	0 %	389870222
95	NC_017962	AT	3	6	41909	41914	50 %	50 %	0 %	0 %	389870223
96	NC_017962	GC	3	6	41921	41926	0 %	0 %	50 %	50 %	389870223
97	NC_017962	AT	3	6	42045	42050	50 %	50 %	0 %	0 %	389870223
98	NC_017962	AT	3	6	42070	42075	50 %	50 %	0 %	0 %	389870223
99	NC_017962	CT	3	6	42279	42284	0 %	50 %	0 %	50 %	389870224
100	NC_017962	AT	3	6	42523	42528	50 %	50 %	0 %	0 %	389870224
101	NC_017962	TA	3	6	43551	43556	50 %	50 %	0 %	0 %	389870225
102	NC_017962	AT	3	6	43765	43770	50 %	50 %	0 %	0 %	389870225
103	NC_017962	TA	3	6	44735	44740	50 %	50 %	0 %	0 %	389870226
104	NC_017962	AG	3	6	44745	44750	50 %	0 %	50 %	0 %	389870226
105	NC_017962	CT	3	6	45851	45856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017962	AT	3	6	46028	46033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017962	TA	3	6	46600	46605	50 %	50 %	0 %	0 %	389870229
108	NC_017962	TG	3	6	46848	46853	0 %	50 %	50 %	0 %	389870229
109	NC_017962	AC	3	6	47470	47475	50 %	0 %	0 %	50 %	389870230
110	NC_017962	AT	3	6	47768	47773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017962	AT	3	6	47827	47832	50 %	50 %	0 %	0 %	389870231
112	NC_017962	AC	3	6	48390	48395	50 %	0 %	0 %	50 %	389870232
113	NC_017962	TA	3	6	48660	48665	50 %	50 %	0 %	0 %	389870232
114	NC_017962	CT	3	6	48687	48692	0 %	50 %	0 %	50 %	389870232
115	NC_017962	AT	3	6	49443	49448	50 %	50 %	0 %	0 %	389870234
116	NC_017962	TG	3	6	49808	49813	0 %	50 %	50 %	0 %	389870234
117	NC_017962	TA	3	6	49865	49870	50 %	50 %	0 %	0 %	389870234
118	NC_017962	CA	3	6	50015	50020	50 %	0 %	0 %	50 %	389870234
119	NC_017962	GA	3	6	50364	50369	50 %	0 %	50 %	0 %	389870234
120	NC_017962	CT	3	6	50571	50576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017962	TA	3	6	50784	50789	50 %	50 %	0 %	0 %	389870235
122	NC_017962	TA	3	6	51045	51050	50 %	50 %	0 %	0 %	389870235
123	NC_017962	AG	3	6	51713	51718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017962	TA	3	6	52402	52407	50 %	50 %	0 %	0 %	389870237
125	NC_017962	AC	3	6	52896	52901	50 %	0 %	0 %	50 %	389870238
126	NC_017962	TA	3	6	53166	53171	50 %	50 %	0 %	0 %	389870238
127	NC_017962	CT	3	6	53193	53198	0 %	50 %	0 %	50 %	389870238
128	NC_017962	CT	3	6	53614	53619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017962	AT	3	6	54048	54053	50 %	50 %	0 %	0 %	389870239
130	NC_017962	CT	3	6	54607	54612	0 %	50 %	0 %	50 %	389870239
131	NC_017962	AT	3	6	54718	54723	50 %	50 %	0 %	0 %	389870239
132	NC_017962	AT	3	6	54970	54975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017962	TA	3	6	54984	54989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017962	CT	3	6	56071	56076	0 %	50 %	0 %	50 %	389870241
135	NC_017962	TG	3	6	56448	56453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017962	AT	4	8	56471	56478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017962	TA	3	6	56726	56731	50 %	50 %	0 %	0 %	389870242
138	NC_017962	AC	3	6	57065	57070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017962	TA	5	10	57152	57161	50 %	50 %	0 %	0 %	389870243
140	NC_017962	TA	3	6	57295	57300	50 %	50 %	0 %	0 %	389870243
141	NC_017962	AT	3	6	58718	58723	50 %	50 %	0 %	0 %	389870245
142	NC_017962	GA	3	6	59188	59193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017962	TA	3	6	59338	59343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017962	AG	3	6	59525	59530	50 %	0 %	50 %	0 %	389870246
145	NC_017962	TC	3	6	60368	60373	0 %	50 %	0 %	50 %	389870247
146	NC_017962	AT	3	6	60787	60792	50 %	50 %	0 %	0 %	389870247
147	NC_017962	TA	3	6	60890	60895	50 %	50 %	0 %	0 %	389870247
148	NC_017962	AT	3	6	61242	61247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017962	AT	4	8	61408	61415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017962	TA	3	6	61737	61742	50 %	50 %	0 %	0 %	389870248
151	NC_017962	CT	3	6	62522	62527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017962	CA	3	6	62868	62873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017962	AC	3	6	63979	63984	50 %	0 %	0 %	50 %	389870253
154	NC_017962	TA	3	6	64249	64254	50 %	50 %	0 %	0 %	389870253
155	NC_017962	CT	3	6	64276	64281	0 %	50 %	0 %	50 %	389870253
156	NC_017962	CG	3	6	65233	65238	0 %	0 %	50 %	50 %	389870255
157	NC_017962	TA	3	6	65644	65649	50 %	50 %	0 %	0 %	389870255
158	NC_017962	AT	3	6	66015	66020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017962	GC	3	6	66027	66032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_017962	AT	3	6	66151	66156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017962	AT	3	6	66176	66181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.