MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 2

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017962	ATCC	2	8	338	345	25 %	25 %	0 %	50 %	389870173
2	NC_017962	TAAA	2	8	479	486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017962	TCAA	2	8	696	703	50 %	25 %	0 %	25 %	389870174
4	NC_017962	ATTT	2	8	1413	1420	25 %	75 %	0 %	0 %	389870175
5	NC_017962	GCAA	2	8	1556	1563	50 %	0 %	25 %	25 %	389870176
6	NC_017962	TTCT	2	8	1960	1967	0 %	75 %	0 %	25 %	389870176
7	NC_017962	TTGT	2	8	2196	2203	0 %	75 %	25 %	0 %	389870177
8	NC_017962	ATAA	2	8	2215	2222	75 %	25 %	0 %	0 %	389870177
9	NC_017962	TAAC	2	8	2519	2526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017962	TAGT	2	8	3188	3195	25 %	50 %	25 %	0 %	389870179
11	NC_017962	TGGT	2	8	3483	3490	0 %	50 %	50 %	0 %	389870179
12	NC_017962	AACT	2	8	3793	3800	50 %	25 %	0 %	25 %	389870180
13	NC_017962	AACA	2	8	3825	3832	75 %	0 %	0 %	25 %	389870180
14	NC_017962	CAAA	2	8	4012	4019	75 %	0 %	0 %	25 %	389870180
15	NC_017962	ATCA	3	12	4065	4076	50 %	25 %	0 %	25 %	389870180
16	NC_017962	TATT	2	8	4129	4136	25 %	75 %	0 %	0 %	389870180
17	NC_017962	GAAA	2	8	4172	4179	75 %	0 %	25 %	0 %	389870180
18	NC_017962	TATC	2	8	4394	4401	25 %	50 %	0 %	25 %	389870180
19	NC_017962	ACTA	2	8	4898	4905	50 %	25 %	0 %	25 %	389870180
20	NC_017962	TAAA	2	8	5353	5360	75 %	25 %	0 %	0 %	389870180
21	NC_017962	ACTT	2	8	5577	5584	25 %	50 %	0 %	25 %	389870180
22	NC_017962	AAAG	2	8	5869	5876	75 %	0 %	25 %	0 %	389870181
23	NC_017962	TATT	2	8	5921	5928	25 %	75 %	0 %	0 %	389870181
24	NC_017962	ATTA	2	8	6109	6116	50 %	50 %	0 %	0 %	389870181
25	NC_017962	TATT	2	8	6345	6352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017962	TTAT	2	8	6458	6465	25 %	75 %	0 %	0 %	389870182
27	NC_017962	TAGT	2	8	6671	6678	25 %	50 %	25 %	0 %	389870183
28	NC_017962	ATCA	2	8	7246	7253	50 %	25 %	0 %	25 %	389870184
29	NC_017962	CGAT	2	8	7879	7886	25 %	25 %	25 %	25 %	389870185
30	NC_017962	GAAC	2	8	8079	8086	50 %	0 %	25 %	25 %	389870185
31	NC_017962	GATT	2	8	8352	8359	25 %	50 %	25 %	0 %	389870186
32	NC_017962	TTTA	2	8	8517	8524	25 %	75 %	0 %	0 %	389870187
33	NC_017962	TCTT	2	8	8634	8641	0 %	75 %	0 %	25 %	389870187
34	NC_017962	AGCA	2	8	8778	8785	50 %	0 %	25 %	25 %	389870187
35	NC_017962	ACTC	2	8	8884	8891	25 %	25 %	0 %	50 %	389870187
36	NC_017962	ACAT	2	8	9874	9881	50 %	25 %	0 %	25 %	389870188
37	NC_017962	TTGA	2	8	10135	10142	25 %	50 %	25 %	0 %	389870188
38	NC_017962	TTTA	2	8	10352	10359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017962	TGAA	2	8	10513	10520	50 %	25 %	25 %	0 %	389870189
40	NC_017962	TTCT	2	8	10840	10847	0 %	75 %	0 %	25 %	389870190
41	NC_017962	AGCA	2	8	11180	11187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017962	CTTT	2	8	11387	11394	0 %	75 %	0 %	25 %	389870191
43	NC_017962	CTTT	2	8	11663	11670	0 %	75 %	0 %	25 %	389870191
44	NC_017962	CTGA	2	8	12642	12649	25 %	25 %	25 %	25 %	389870191
45	NC_017962	TTCC	2	8	12759	12766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017962	ACGA	2	8	12973	12980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017962	TAAA	2	8	13132	13139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017962	TGTT	2	8	14221	14228	0 %	75 %	25 %	0 %	389870193
49	NC_017962	TTCA	2	8	14296	14303	25 %	50 %	0 %	25 %	389870193
50	NC_017962	GCAT	2	8	15807	15814	25 %	25 %	25 %	25 %	389870194
51	NC_017962	CTTT	2	8	16392	16399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017962	TTTA	2	8	16404	16411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017962	ATTT	2	8	16443	16450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017962	TGTA	2	8	16658	16665	25 %	50 %	25 %	0 %	389870195
55	NC_017962	AGCT	2	8	16919	16926	25 %	25 %	25 %	25 %	389870195
56	NC_017962	TCAA	2	8	17395	17402	50 %	25 %	0 %	25 %	389870195
57	NC_017962	CGTC	2	8	17472	17479	0 %	25 %	25 %	50 %	389870195
58	NC_017962	TTAA	2	8	17950	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017962	TTAA	2	8	18135	18142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017962	AGTT	2	8	18444	18451	25 %	50 %	25 %	0 %	389870196
61	NC_017962	TCGA	2	8	19095	19102	25 %	25 %	25 %	25 %	389870196
62	NC_017962	GATC	2	8	19301	19308	25 %	25 %	25 %	25 %	389870196
63	NC_017962	TGAA	2	8	19984	19991	50 %	25 %	25 %	0 %	389870197
64	NC_017962	AGCA	2	8	20349	20356	50 %	0 %	25 %	25 %	389870199
65	NC_017962	TAAA	2	8	20958	20965	75 %	25 %	0 %	0 %	389870200
66	NC_017962	GTTT	2	8	21127	21134	0 %	75 %	25 %	0 %	389870200
67	NC_017962	TTTA	2	8	21777	21784	25 %	75 %	0 %	0 %	389870200
68	NC_017962	GAAT	2	8	22029	22036	50 %	25 %	25 %	0 %	389870200
69	NC_017962	GTCT	2	8	22084	22091	0 %	50 %	25 %	25 %	389870200
70	NC_017962	AAAT	2	8	22107	22114	75 %	25 %	0 %	0 %	389870200
71	NC_017962	GGTA	2	8	23902	23909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017962	CTTT	2	8	24529	24536	0 %	75 %	0 %	25 %	389870204
73	NC_017962	GAAA	2	8	24657	24664	75 %	0 %	25 %	0 %	389870204
74	NC_017962	ACGA	2	8	25155	25162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017962	GTTT	2	8	25487	25494	0 %	75 %	25 %	0 %	389870205
76	NC_017962	AAAT	2	8	25705	25712	75 %	25 %	0 %	0 %	389870205
77	NC_017962	CATA	2	8	25768	25775	50 %	25 %	0 %	25 %	389870206
78	NC_017962	CATC	2	8	25816	25823	25 %	25 %	0 %	50 %	389870206
79	NC_017962	TTTA	2	8	26078	26085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017962	ATAC	2	8	27127	27134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017962	ATGA	2	8	27537	27544	50 %	25 %	25 %	0 %	389870208
82	NC_017962	CGAT	2	8	27771	27778	25 %	25 %	25 %	25 %	389870208
83	NC_017962	ACCA	2	8	27993	28000	50 %	0 %	0 %	50 %	389870208
84	NC_017962	GTAG	2	8	28437	28444	25 %	25 %	50 %	0 %	389870208
85	NC_017962	TCAA	2	8	28459	28466	50 %	25 %	0 %	25 %	389870208
86	NC_017962	ATCG	2	8	28620	28627	25 %	25 %	25 %	25 %	389870208
87	NC_017962	ACCA	2	8	28888	28895	50 %	0 %	0 %	50 %	389870208
88	NC_017962	ATCA	2	8	28926	28933	50 %	25 %	0 %	25 %	389870208
89	NC_017962	TTGG	2	8	29000	29007	0 %	50 %	50 %	0 %	389870208
90	NC_017962	GTTT	2	8	29137	29144	0 %	75 %	25 %	0 %	389870208
91	NC_017962	ATAG	2	8	29169	29176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017962	TTTC	2	8	29275	29282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017962	AAAT	2	8	29418	29425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017962	ATTG	2	8	30157	30164	25 %	50 %	25 %	0 %	389870209
95	NC_017962	TCAT	2	8	30408	30415	25 %	50 %	0 %	25 %	389870209
96	NC_017962	ATTA	2	8	30968	30975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017962	ATCA	2	8	30984	30991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017962	GCCC	2	8	31673	31680	0 %	0 %	25 %	75 %	389870210
99	NC_017962	TTCG	2	8	32312	32319	0 %	50 %	25 %	25 %	389870211
100	NC_017962	AACT	2	8	32763	32770	50 %	25 %	0 %	25 %	389870212
101	NC_017962	CTTT	2	8	33303	33310	0 %	75 %	0 %	25 %	389870212
102	NC_017962	CGAT	2	8	35439	35446	25 %	25 %	25 %	25 %	389870215
103	NC_017962	TGAA	2	8	35694	35701	50 %	25 %	25 %	0 %	389870215
104	NC_017962	TCAT	2	8	36146	36153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017962	ATCA	2	8	36364	36371	50 %	25 %	0 %	25 %	389870217
106	NC_017962	ATTT	2	8	36525	36532	25 %	75 %	0 %	0 %	389870217
107	NC_017962	CTTG	2	8	36687	36694	0 %	50 %	25 %	25 %	389870217
108	NC_017962	AATT	2	8	37611	37618	50 %	50 %	0 %	0 %	389870217
109	NC_017962	AAAG	2	8	37915	37922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017962	TAGT	2	8	37966	37973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017962	TAAC	2	8	37992	37999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017962	GTTG	2	8	38013	38020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017962	TTGT	2	8	38223	38230	0 %	75 %	25 %	0 %	389870218
114	NC_017962	TCAA	2	8	38239	38246	50 %	25 %	0 %	25 %	389870218
115	NC_017962	TGAT	2	8	38270	38277	25 %	50 %	25 %	0 %	389870218
116	NC_017962	TATC	2	8	38354	38361	25 %	50 %	0 %	25 %	389870218
117	NC_017962	TTTC	2	8	38609	38616	0 %	75 %	0 %	25 %	389870218
118	NC_017962	CTTT	2	8	38785	38792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017962	TAAA	2	8	38815	38822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017962	TCAA	2	8	39032	39039	50 %	25 %	0 %	25 %	389870219
121	NC_017962	TCTG	2	8	39745	39752	0 %	50 %	25 %	25 %	389870220
122	NC_017962	AGCT	2	8	40617	40624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017962	ACTT	2	8	41023	41030	25 %	50 %	0 %	25 %	389870222
124	NC_017962	AGTA	2	8	41195	41202	50 %	25 %	25 %	0 %	389870222
125	NC_017962	CTCA	2	8	41359	41366	25 %	25 %	0 %	50 %	389870222
126	NC_017962	TTCC	2	8	41427	41434	0 %	50 %	0 %	50 %	389870222
127	NC_017962	TTCC	2	8	41559	41566	0 %	50 %	0 %	50 %	389870222
128	NC_017962	TTCC	2	8	41642	41649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017962	ATCC	2	8	42479	42486	25 %	25 %	0 %	50 %	389870224
130	NC_017962	AAAG	2	8	43134	43141	75 %	0 %	25 %	0 %	389870224
131	NC_017962	CCAT	2	8	43777	43784	25 %	25 %	0 %	50 %	389870225
132	NC_017962	CCAG	2	8	43862	43869	25 %	0 %	25 %	50 %	389870225
133	NC_017962	GCGA	2	8	43878	43885	25 %	0 %	50 %	25 %	389870225
134	NC_017962	TTTC	2	8	43932	43939	0 %	75 %	0 %	25 %	389870225
135	NC_017962	TTAT	2	8	43965	43972	25 %	75 %	0 %	0 %	389870226
136	NC_017962	TTCA	2	8	43985	43992	25 %	50 %	0 %	25 %	389870226
137	NC_017962	CTTT	2	8	44122	44129	0 %	75 %	0 %	25 %	389870226
138	NC_017962	CATT	2	8	44965	44972	25 %	50 %	0 %	25 %	389870227
139	NC_017962	ATCA	2	8	45131	45138	50 %	25 %	0 %	25 %	389870227
140	NC_017962	AATT	2	8	45205	45212	50 %	50 %	0 %	0 %	389870228
141	NC_017962	TATT	2	8	45395	45402	25 %	75 %	0 %	0 %	389870228
142	NC_017962	ATGA	2	8	45492	45499	50 %	25 %	25 %	0 %	389870228
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144	NC_017962	CAAA	2	8	45805	45812	75 %	0 %	0 %	25 %	389870228
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.