MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017961	AGAA	2	8	730	737	75 %	0 %	25 %	0 %	389870258
2	NC_017961	CTTT	2	8	1162	1169	0 %	75 %	0 %	25 %	389870258
3	NC_017961	ATCA	2	8	1409	1416	50 %	25 %	0 %	25 %	389870258
4	NC_017961	TGCT	2	8	1553	1560	0 %	50 %	25 %	25 %	389870258
5	NC_017961	CTTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	389870258
6	NC_017961	GTTT	2	8	1804	1811	0 %	75 %	25 %	0 %	389870258
7	NC_017961	GATA	2	8	1881	1888	50 %	25 %	25 %	0 %	389870258
8	NC_017961	AATT	2	8	2010	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017961	AATG	2	8	2027	2034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017961	TTCT	2	8	2413	2420	0 %	75 %	0 %	25 %	389870259
11	NC_017961	CTTA	2	8	2425	2432	25 %	50 %	0 %	25 %	389870259
12	NC_017961	AAAG	2	8	2680	2687	75 %	0 %	25 %	0 %	389870259
13	NC_017961	TTTC	2	8	3107	3114	0 %	75 %	0 %	25 %	389870259
14	NC_017961	CTTT	2	8	3136	3143	0 %	75 %	0 %	25 %	389870259
15	NC_017961	TTGA	2	8	4242	4249	25 %	50 %	25 %	0 %	389870261
16	NC_017961	TTTA	2	8	4459	4466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017961	AAAT	2	8	4731	4738	75 %	25 %	0 %	0 %	389870262
18	NC_017961	CTGA	2	8	5135	5142	25 %	25 %	25 %	25 %	389870262
19	NC_017961	AAGA	2	8	5647	5654	75 %	0 %	25 %	0 %	389870263
20	NC_017961	ATAA	2	8	6105	6112	75 %	25 %	0 %	0 %	389870264
21	NC_017961	ACCA	2	8	6734	6741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017961	AACC	2	8	7041	7048	50 %	0 %	0 %	50 %	389870266
23	NC_017961	TCTT	2	8	7738	7745	0 %	75 %	0 %	25 %	389870268
24	NC_017961	TGAT	2	8	7752	7759	25 %	50 %	25 %	0 %	389870268
25	NC_017961	TGAA	2	8	7963	7970	50 %	25 %	25 %	0 %	389870269
26	NC_017961	CAGT	2	8	8629	8636	25 %	25 %	25 %	25 %	389870271
27	NC_017961	AGTA	2	8	8930	8937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017961	TACT	2	8	8965	8972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017961	CATA	2	8	9064	9071	50 %	25 %	0 %	25 %	389870272
30	NC_017961	TCTT	2	8	9140	9147	0 %	75 %	0 %	25 %	389870272
31	NC_017961	TTCT	2	8	9362	9369	0 %	75 %	0 %	25 %	389870273
32	NC_017961	TTCC	2	8	9653	9660	0 %	50 %	0 %	50 %	389870273
33	NC_017961	AGCC	2	8	9875	9882	25 %	0 %	25 %	50 %	389870273
34	NC_017961	ACTT	2	8	9900	9907	25 %	50 %	0 %	25 %	389870273
35	NC_017961	GATC	2	8	9955	9962	25 %	25 %	25 %	25 %	389870273
36	NC_017961	TTTA	2	8	10674	10681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017961	TTTG	2	8	10763	10770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017961	TACA	2	8	10834	10841	50 %	25 %	0 %	25 %	389870274
39	NC_017961	AGCA	2	8	10916	10923	50 %	0 %	25 %	25 %	389870274
40	NC_017961	AATG	2	8	10927	10934	50 %	25 %	25 %	0 %	389870274
41	NC_017961	CTTT	2	8	11615	11622	0 %	75 %	0 %	25 %	389870274
42	NC_017961	AACG	2	8	11681	11688	50 %	0 %	25 %	25 %	389870274
43	NC_017961	TTCA	2	8	11831	11838	25 %	50 %	0 %	25 %	389870274
44	NC_017961	TTGT	2	8	12633	12640	0 %	75 %	25 %	0 %	389870275
45	NC_017961	TTTA	2	8	12720	12727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017961	AAAT	2	8	12967	12974	75 %	25 %	0 %	0 %	389870276
47	NC_017961	TCTT	2	8	13290	13297	0 %	75 %	0 %	25 %	389870276
48	NC_017961	CTTT	2	8	13449	13456	0 %	75 %	0 %	25 %	389870276
49	NC_017961	CTTG	2	8	13556	13563	0 %	50 %	25 %	25 %	389870276
50	NC_017961	GATT	2	8	13630	13637	25 %	50 %	25 %	0 %	389870276
51	NC_017961	ACTC	2	8	13702	13709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017961	GAAA	2	8	13938	13945	75 %	0 %	25 %	0 %	389870278
53	NC_017961	TTTG	2	8	14332	14339	0 %	75 %	25 %	0 %	389870278
54	NC_017961	GTAT	2	8	14368	14375	25 %	50 %	25 %	0 %	389870278
55	NC_017961	AAGC	2	8	14613	14620	50 %	0 %	25 %	25 %	389870278
56	NC_017961	AAAC	2	8	14671	14678	75 %	0 %	0 %	25 %	389870278
57	NC_017961	ATAA	2	8	14724	14731	75 %	25 %	0 %	0 %	389870278
58	NC_017961	ATTG	2	8	14979	14986	25 %	50 %	25 %	0 %	389870279
59	NC_017961	AAAT	2	8	15122	15129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017961	TTGA	2	8	15887	15894	25 %	50 %	25 %	0 %	389870280
61	NC_017961	TTTA	2	8	16104	16111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017961	AACG	2	8	16677	16684	50 %	0 %	25 %	25 %	389870281
63	NC_017961	GCAA	2	8	16858	16865	50 %	0 %	25 %	25 %	389870281
64	NC_017961	GATT	2	8	17111	17118	25 %	50 %	25 %	0 %	389870281
65	NC_017961	CCAA	2	8	17289	17296	50 %	0 %	0 %	50 %	389870281
66	NC_017961	AACT	2	8	17716	17723	50 %	25 %	0 %	25 %	389870281
67	NC_017961	TTCT	2	8	17828	17835	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017961	GTAT	2	8	17902	17909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017961	CAAA	2	8	17982	17989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017961	GAAA	2	8	18229	18236	75 %	0 %	25 %	0 %	389870282
71	NC_017961	GTTG	2	8	18362	18369	0 %	50 %	50 %	0 %	389870282
72	NC_017961	AATA	2	8	18516	18523	75 %	25 %	0 %	0 %	389870282
73	NC_017961	CATG	2	8	18549	18556	25 %	25 %	25 %	25 %	389870282
74	NC_017961	TAAA	2	8	18908	18915	75 %	25 %	0 %	0 %	389870282
75	NC_017961	TCAA	2	8	19125	19132	50 %	25 %	0 %	25 %	389870283
76	NC_017961	CGTT	2	8	20010	20017	0 %	50 %	25 %	25 %	389870284
77	NC_017961	AAGT	2	8	20147	20154	50 %	25 %	25 %	0 %	389870284
78	NC_017961	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	389870284
79	NC_017961	TGAC	2	8	20323	20330	25 %	25 %	25 %	25 %	389870284
80	NC_017961	AGAT	2	8	20875	20882	50 %	25 %	25 %	0 %	389870285
81	NC_017961	AAAT	2	8	21158	21165	75 %	25 %	0 %	0 %	389870285
82	NC_017961	ATGA	2	8	21478	21485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017961	CATT	2	8	21678	21685	25 %	50 %	0 %	25 %	389870287
84	NC_017961	ACGG	2	8	21809	21816	25 %	0 %	50 %	25 %	389870288
85	NC_017961	AAAG	2	8	22031	22038	75 %	0 %	25 %	0 %	389870288
86	NC_017961	AAGT	2	8	22220	22227	50 %	25 %	25 %	0 %	389870289
87	NC_017961	TTCA	2	8	22383	22390	25 %	50 %	0 %	25 %	389870289
88	NC_017961	AAAG	2	8	22407	22414	75 %	0 %	25 %	0 %	389870289
89	NC_017961	CCTG	2	8	22534	22541	0 %	25 %	25 %	50 %	389870290
90	NC_017961	TGCT	2	8	22676	22683	0 %	50 %	25 %	25 %	389870290
91	NC_017961	ACTT	2	8	23165	23172	25 %	50 %	0 %	25 %	389870290
92	NC_017961	CTTA	2	8	23391	23398	25 %	50 %	0 %	25 %	389870290
93	NC_017961	GCTG	2	8	23853	23860	0 %	25 %	50 %	25 %	389870291
94	NC_017961	TGAA	2	8	24042	24049	50 %	25 %	25 %	0 %	389870292
95	NC_017961	TGAA	2	8	24963	24970	50 %	25 %	25 %	0 %	389870292
96	NC_017961	CAGT	2	8	25190	25197	25 %	25 %	25 %	25 %	389870292
97	NC_017961	CTCA	2	8	25982	25989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017961	GCAG	2	8	26201	26208	25 %	0 %	50 %	25 %	389870293
99	NC_017961	CAGC	2	8	26533	26540	25 %	0 %	25 %	50 %	389870293
100	NC_017961	AGTT	2	8	27111	27118	25 %	50 %	25 %	0 %	389870293
101	NC_017961	ACAA	2	8	27350	27357	75 %	0 %	0 %	25 %	389870293
102	NC_017961	TAAA	2	8	27852	27859	75 %	25 %	0 %	0 %	389870293
103	NC_017961	TAAA	2	8	27876	27883	75 %	25 %	0 %	0 %	389870293
104	NC_017961	TAAA	2	8	28251	28258	75 %	25 %	0 %	0 %	389870294
105	NC_017961	AAAG	2	8	28351	28358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017961	TCAT	2	8	28683	28690	25 %	50 %	0 %	25 %	389870295
107	NC_017961	TATG	2	8	28705	28712	25 %	50 %	25 %	0 %	389870295
108	NC_017961	GATT	2	8	28946	28953	25 %	50 %	25 %	0 %	389870296
109	NC_017961	ACAG	2	8	29613	29620	50 %	0 %	25 %	25 %	389870297
110	NC_017961	GACA	2	8	29924	29931	50 %	0 %	25 %	25 %	389870297
111	NC_017961	AATG	2	8	30192	30199	50 %	25 %	25 %	0 %	389870297
112	NC_017961	AGAA	2	8	30248	30255	75 %	0 %	25 %	0 %	389870297
113	NC_017961	ATGA	2	8	30544	30551	50 %	25 %	25 %	0 %	389870297
114	NC_017961	GAAA	2	8	30852	30859	75 %	0 %	25 %	0 %	389870297
115	NC_017961	CTAT	2	8	31441	31448	25 %	50 %	0 %	25 %	389870297
116	NC_017961	GGCT	2	8	32013	32020	0 %	25 %	50 %	25 %	389870298
117	NC_017961	ACAA	2	8	33335	33342	75 %	0 %	0 %	25 %	389870298
118	NC_017961	CAGA	2	8	33508	33515	50 %	0 %	25 %	25 %	389870298
119	NC_017961	CAGC	2	8	33603	33610	25 %	0 %	25 %	50 %	389870298
120	NC_017961	AAGA	2	8	33787	33794	75 %	0 %	25 %	0 %	389870298
121	NC_017961	CGTC	2	8	33864	33871	0 %	25 %	25 %	50 %	389870298
122	NC_017961	TGTT	2	8	34020	34027	0 %	75 %	25 %	0 %	389870299
123	NC_017961	AAAT	2	8	34405	34412	75 %	25 %	0 %	0 %	389870299
124	NC_017961	TTTC	2	8	34795	34802	0 %	75 %	0 %	25 %	389870299
125	NC_017961	TAAA	2	8	36033	36040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.