MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli Xuzhou21 plasmid pO157

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017907	GATGG	2	10	1235	1244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017907	GCTGA	2	10	1588	1597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017907	GTTTT	2	10	2815	2824	0 %	80 %	20 %	0 %	387885601
4	NC_017907	GTCAG	2	10	6627	6636	20 %	20 %	40 %	20 %	387885603
5	NC_017907	CCCTT	2	10	7558	7567	0 %	40 %	0 %	60 %	387885604
6	NC_017907	GAGGT	2	10	9060	9069	20 %	20 %	60 %	0 %	387885606
7	NC_017907	GAGGT	2	10	11515	11524	20 %	20 %	60 %	0 %	387885610
8	NC_017907	AGTGG	2	10	12475	12484	20 %	20 %	60 %	0 %	387885611
9	NC_017907	CGCTT	2	10	12802	12811	0 %	40 %	20 %	40 %	387885611
10	NC_017907	TTTCG	2	10	13478	13487	0 %	60 %	20 %	20 %	387885612
11	NC_017907	GGTTA	2	10	13503	13512	20 %	40 %	40 %	0 %	387885612
12	NC_017907	TATAA	2	10	15898	15907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017907	TGTTA	2	10	20564	20573	20 %	60 %	20 %	0 %	387885618
14	NC_017907	CAGGT	2	10	20907	20916	20 %	20 %	40 %	20 %	387885618
15	NC_017907	AGAAC	2	10	21615	21624	60 %	0 %	20 %	20 %	387885618
16	NC_017907	TCTCT	2	10	21992	22001	0 %	60 %	0 %	40 %	387885619
17	NC_017907	CAGAA	2	10	22379	22388	60 %	0 %	20 %	20 %	387885619
18	NC_017907	AATGG	2	10	23336	23345	40 %	20 %	40 %	0 %	387885620
19	NC_017907	CACAC	2	10	24837	24846	40 %	0 %	0 %	60 %	387885623
20	NC_017907	ACATA	2	10	25100	25109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017907	CAGCT	2	10	25216	25225	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017907	CAGCA	2	10	28324	28333	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017907	GGCGT	2	10	38260	38269	0 %	20 %	60 %	20 %	387885638
24	NC_017907	CGCGG	2	10	39064	39073	0 %	0 %	60 %	40 %	387885639
25	NC_017907	ACGGG	2	10	39116	39125	20 %	0 %	60 %	20 %	387885639
26	NC_017907	GCTGG	2	10	39762	39771	0 %	20 %	60 %	20 %	387885640
27	NC_017907	CCGCC	2	10	41435	41444	0 %	0 %	20 %	80 %	387885643
28	NC_017907	GGCAC	2	10	41905	41914	20 %	0 %	40 %	40 %	387885644
29	NC_017907	ACCGT	2	10	42195	42204	20 %	20 %	20 %	40 %	387885645
30	NC_017907	TGTAC	2	10	42430	42439	20 %	40 %	20 %	20 %	387885646
31	NC_017907	GGAAG	2	10	43106	43115	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017907	GGCGG	2	10	43296	43305	0 %	0 %	80 %	20 %	387885647
33	NC_017907	CCGGG	2	10	44518	44527	0 %	0 %	60 %	40 %	387885649
34	NC_017907	GGCGG	2	10	46589	46598	0 %	0 %	80 %	20 %	387885651
35	NC_017907	AAGTG	2	10	48646	48655	40 %	20 %	40 %	0 %	387885654
36	NC_017907	CCGCC	2	10	49910	49919	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_017907	ACTGA	2	10	49958	49967	40 %	20 %	20 %	20 %	387885655
38	NC_017907	TTACG	2	10	52874	52883	20 %	40 %	20 %	20 %	387885658
39	NC_017907	AAGGT	2	10	54569	54578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017907	TCTAC	2	10	56366	56375	20 %	40 %	0 %	40 %	387885662
41	NC_017907	GACTT	2	10	57222	57231	20 %	40 %	20 %	20 %	387885662
42	NC_017907	ATCAG	2	10	57454	57463	40 %	20 %	20 %	20 %	387885662
43	NC_017907	AAACG	2	10	59198	59207	60 %	0 %	20 %	20 %	387885662
44	NC_017907	TGCAT	2	10	60124	60133	20 %	40 %	20 %	20 %	387885662
45	NC_017907	GAAAG	2	10	60280	60289	60 %	0 %	40 %	0 %	387885662
46	NC_017907	AAAAT	2	10	60972	60981	80 %	20 %	0 %	0 %	387885662
47	NC_017907	CATTC	2	10	61160	61169	20 %	40 %	0 %	40 %	387885662
48	NC_017907	AATTA	2	10	61720	61729	60 %	40 %	0 %	0 %	387885662
49	NC_017907	ATATT	2	10	63039	63048	40 %	60 %	0 %	0 %	387885662
50	NC_017907	GATGT	2	10	63132	63141	20 %	40 %	40 %	0 %	387885662
51	NC_017907	TTTAT	2	10	63364	63373	20 %	80 %	0 %	0 %	387885662
52	NC_017907	TAAAT	2	10	63805	63814	60 %	40 %	0 %	0 %	387885662
53	NC_017907	AGAAA	2	10	63817	63826	80 %	0 %	20 %	0 %	387885662
54	NC_017907	ATTGT	2	10	64691	64700	20 %	60 %	20 %	0 %	387885662
55	NC_017907	TGATT	2	10	65041	65050	20 %	60 %	20 %	0 %	387885662
56	NC_017907	CGCCC	2	10	66609	66618	0 %	0 %	20 %	80 %	387885665
57	NC_017907	ACCGG	2	10	66878	66887	20 %	0 %	40 %	40 %	387885665
58	NC_017907	ACCTG	2	10	67487	67496	20 %	20 %	20 %	40 %	387885665
59	NC_017907	CTGGT	2	10	67825	67834	0 %	40 %	40 %	20 %	387885666
60	NC_017907	GAACG	2	10	68276	68285	40 %	0 %	40 %	20 %	387885666
61	NC_017907	CCGGG	2	10	70985	70994	0 %	0 %	60 %	40 %	387885670
62	NC_017907	CCTGT	2	10	73754	73763	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017907	GCCCC	2	10	73910	73919	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_017907	GGGTT	2	10	74437	74446	0 %	40 %	60 %	0 %	387885675
65	NC_017907	GAAGA	2	10	77431	77440	60 %	0 %	40 %	0 %	387885682
66	NC_017907	GTCTT	2	10	81858	81867	0 %	60 %	20 %	20 %	387885686
67	NC_017907	AAAAC	2	10	82582	82591	80 %	0 %	0 %	20 %	387885686
68	NC_017907	ATGCG	2	10	83481	83490	20 %	20 %	40 %	20 %	387885686
69	NC_017907	TGGTA	2	10	88481	88490	20 %	40 %	40 %	0 %	387885689
70	NC_017907	GTTCC	2	10	90320	90329	0 %	40 %	20 %	40 %	387885690
71	NC_017907	GTTTT	2	10	92216	92225	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.