MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017722	CA	3	6	82	87	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017722	GA	3	6	481	486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017722	CA	3	6	4131	4136	50 %	0 %	0 %	50 %	387610319
4	NC_017722	AT	3	6	4172	4177	50 %	50 %	0 %	0 %	387610319
5	NC_017722	CA	3	6	4243	4248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017722	AC	3	6	4809	4814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017722	TG	3	6	5123	5128	0 %	50 %	50 %	0 %	387610321
8	NC_017722	AC	3	6	5471	5476	50 %	0 %	0 %	50 %	387610321
9	NC_017722	CT	3	6	6285	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017722	CA	3	6	6461	6466	50 %	0 %	0 %	50 %	387610323
11	NC_017722	GA	3	6	9125	9130	50 %	0 %	50 %	0 %	387610325
12	NC_017722	TG	3	6	9956	9961	0 %	50 %	50 %	0 %	387610325
13	NC_017722	CT	3	6	10077	10082	0 %	50 %	0 %	50 %	387610325
14	NC_017722	TG	3	6	10577	10582	0 %	50 %	50 %	0 %	387610325
15	NC_017722	CT	3	6	11168	11173	0 %	50 %	0 %	50 %	387610325
16	NC_017722	AT	3	6	12358	12363	50 %	50 %	0 %	0 %	387610325
17	NC_017722	GT	3	6	12485	12490	0 %	50 %	50 %	0 %	387610325
18	NC_017722	CA	3	6	13984	13989	50 %	0 %	0 %	50 %	387610326
19	NC_017722	GT	3	6	14324	14329	0 %	50 %	50 %	0 %	387610326
20	NC_017722	AC	4	8	15706	15713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017722	GA	3	6	15818	15823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017722	GA	3	6	17782	17787	50 %	0 %	50 %	0 %	387610328
23	NC_017722	CA	3	6	18096	18101	50 %	0 %	0 %	50 %	387610329
24	NC_017722	AT	3	6	18579	18584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017722	AG	3	6	18908	18913	50 %	0 %	50 %	0 %	387610330
26	NC_017722	AG	3	6	19709	19714	50 %	0 %	50 %	0 %	387610332
27	NC_017722	AT	3	6	21827	21832	50 %	50 %	0 %	0 %	387610334
28	NC_017722	TC	3	6	23065	23070	0 %	50 %	0 %	50 %	387610337
29	NC_017722	CG	3	6	23093	23098	0 %	0 %	50 %	50 %	387610337
30	NC_017722	GC	3	6	23788	23793	0 %	0 %	50 %	50 %	387610338
31	NC_017722	GC	3	6	24851	24856	0 %	0 %	50 %	50 %	387610339
32	NC_017722	AT	3	6	25795	25800	50 %	50 %	0 %	0 %	387610340
33	NC_017722	AG	3	6	26007	26012	50 %	0 %	50 %	0 %	387610340
34	NC_017722	TA	3	6	27523	27528	50 %	50 %	0 %	0 %	387610344
35	NC_017722	TC	3	6	27819	27824	0 %	50 %	0 %	50 %	387610344
36	NC_017722	GA	3	6	28322	28327	50 %	0 %	50 %	0 %	387610345
37	NC_017722	AG	3	6	28835	28840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017722	GT	3	6	28909	28914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017722	CA	4	8	29568	29575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017722	TA	4	8	29636	29643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017722	CA	3	6	30246	30251	50 %	0 %	0 %	50 %	387610347
42	NC_017722	AT	3	6	30494	30499	50 %	50 %	0 %	0 %	387610347
43	NC_017722	GC	3	6	31753	31758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017722	CA	3	6	32211	32216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017722	GA	3	6	33515	33520	50 %	0 %	50 %	0 %	387610353
46	NC_017722	GT	3	6	33666	33671	0 %	50 %	50 %	0 %	387610353
47	NC_017722	AC	4	8	34606	34613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017722	CG	3	6	35164	35169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017722	AT	3	6	35785	35790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017722	CT	3	6	35845	35850	0 %	50 %	0 %	50 %	387610354
51	NC_017722	TC	3	6	36089	36094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017722	AC	3	6	37877	37882	50 %	0 %	0 %	50 %	387610356
53	NC_017722	GT	3	6	37887	37892	0 %	50 %	50 %	0 %	387610356
54	NC_017722	CA	3	6	38123	38128	50 %	0 %	0 %	50 %	387610356
55	NC_017722	TG	3	6	38166	38171	0 %	50 %	50 %	0 %	387610356
56	NC_017722	AT	4	8	38198	38205	50 %	50 %	0 %	0 %	387610356
57	NC_017722	CA	3	6	38809	38814	50 %	0 %	0 %	50 %	387610356
58	NC_017722	GT	3	6	39079	39084	0 %	50 %	50 %	0 %	387610356
59	NC_017722	CT	3	6	39192	39197	0 %	50 %	0 %	50 %	387610356
60	NC_017722	GC	3	6	39833	39838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017722	GC	3	6	39898	39903	0 %	0 %	50 %	50 %	387610357
62	NC_017722	CG	3	6	39947	39952	0 %	0 %	50 %	50 %	387610357
63	NC_017722	CA	3	6	40226	40231	50 %	0 %	0 %	50 %	387610357
64	NC_017722	GC	3	6	40417	40422	0 %	0 %	50 %	50 %	387610357
65	NC_017722	TC	3	6	41625	41630	0 %	50 %	0 %	50 %	387610358
66	NC_017722	GA	3	6	41639	41644	50 %	0 %	50 %	0 %	387610358
67	NC_017722	CG	3	6	41800	41805	0 %	0 %	50 %	50 %	387610358
68	NC_017722	GT	4	8	42301	42308	0 %	50 %	50 %	0 %	387610359
69	NC_017722	CA	3	6	42895	42900	50 %	0 %	0 %	50 %	387610360
70	NC_017722	GC	3	6	42927	42932	0 %	0 %	50 %	50 %	387610360
71	NC_017722	GT	3	6	43157	43162	0 %	50 %	50 %	0 %	387610361
72	NC_017722	AC	3	6	44112	44117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017722	AC	4	8	44122	44129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017722	AC	3	6	44300	44305	50 %	0 %	0 %	50 %	387610362
75	NC_017722	TC	3	6	44753	44758	0 %	50 %	0 %	50 %	387610362
76	NC_017722	CA	4	8	45034	45041	50 %	0 %	0 %	50 %	387610362
77	NC_017722	AT	3	6	45343	45348	50 %	50 %	0 %	0 %	387610363
78	NC_017722	TA	3	6	46898	46903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017722	AT	3	6	47280	47285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017722	CA	3	6	49445	49450	50 %	0 %	0 %	50 %	387610367
81	NC_017722	TG	3	6	50059	50064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017722	TA	3	6	50184	50189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017722	TA	3	6	50480	50485	50 %	50 %	0 %	0 %	387610368
84	NC_017722	TG	3	6	50488	50493	0 %	50 %	50 %	0 %	387610368
85	NC_017722	AG	3	6	50548	50553	50 %	0 %	50 %	0 %	387610368
86	NC_017722	TA	3	6	50617	50622	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
87	NC_017722	AT	3	6	50687	50692	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
88	NC_017722	TC	3	6	50790	50795	0 %	50 %	0 %	50 %	387610369
89	NC_017722	AT	3	6	50942	50947	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
90	NC_017722	AT	4	8	51059	51066	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
91	NC_017722	TA	3	6	51382	51387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017722	CA	3	6	51691	51696	50 %	0 %	0 %	50 %	387610371
93	NC_017722	TG	3	6	52316	52321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017722	AT	3	6	52835	52840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017722	TC	3	6	53055	53060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017722	GC	3	6	53518	53523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017722	CT	3	6	53620	53625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017722	TG	3	6	54731	54736	0 %	50 %	50 %	0 %	387610372
99	NC_017722	TC	3	6	55045	55050	0 %	50 %	0 %	50 %	387610373
100	NC_017722	TA	3	6	57385	57390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017722	TA	3	6	57406	57411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017722	TA	3	6	57524	57529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017722	CA	3	6	58738	58743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017722	GT	3	6	59196	59201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017722	GA	3	6	59203	59208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017722	TG	3	6	59323	59328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017722	CG	3	6	59390	59395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017722	AG	3	6	59503	59508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017722	GC	3	6	60106	60111	0 %	0 %	50 %	50 %	387610378
110	NC_017722	CA	3	6	61358	61363	50 %	0 %	0 %	50 %	387610379
111	NC_017722	CG	3	6	61373	61378	0 %	0 %	50 %	50 %	387610379
112	NC_017722	CG	3	6	61475	61480	0 %	0 %	50 %	50 %	387610379
113	NC_017722	AG	3	6	61950	61955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017722	TC	3	6	62589	62594	0 %	50 %	0 %	50 %	387610381
115	NC_017722	GC	3	6	63078	63083	0 %	0 %	50 %	50 %	387610381
116	NC_017722	AT	3	6	64830	64835	50 %	50 %	0 %	0 %	387610383
117	NC_017722	TC	3	6	65095	65100	0 %	50 %	0 %	50 %	387610383
118	NC_017722	AT	4	8	65213	65220	50 %	50 %	0 %	0 %	387610383
119	NC_017722	TA	3	6	65794	65799	50 %	50 %	0 %	0 %	387610383
120	NC_017722	TA	3	6	66305	66310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017722	TC	3	6	66371	66376	0 %	50 %	0 %	50 %	387610384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.