MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 2073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	TTC	2	6	94	99	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707623
2	NC_017665	TGT	2	6	103	108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707623
3	NC_017665	AT	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	386707623
4	NC_017665	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707623
5	NC_017665	CCA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707623
6	NC_017665	TCT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707623
7	NC_017665	TCA	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707623
8	NC_017665	GTT	2	6	428	433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707623
9	NC_017665	CCTCT	2	10	568	577	0 %	40 %	0 %	60 %	386707623
10	NC_017665	GCT	2	6	606	611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707623
11	NC_017665	GAT	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707623
12	NC_017665	TCA	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707623
13	NC_017665	T	6	6	908	913	0 %	100 %	0 %	0 %	386707624
14	NC_017665	GC	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	386707624
15	NC_017665	AGCA	2	8	1120	1127	50 %	0 %	25 %	25 %	386707624
16	NC_017665	AGC	3	9	1135	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707624
17	NC_017665	TGC	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707624
18	NC_017665	GAT	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707624
19	NC_017665	CAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707624
20	NC_017665	AGT	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707624
21	NC_017665	CAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017665	CAG	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017665	CAG	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707625
24	NC_017665	T	6	6	1498	1503	0 %	100 %	0 %	0 %	386707625
25	NC_017665	CAG	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707625
26	NC_017665	CCG	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707625
27	NC_017665	TTA	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707625
28	NC_017665	TCGC	2	8	1872	1879	0 %	25 %	25 %	50 %	386707625
29	NC_017665	A	7	7	1907	1913	100 %	0 %	0 %	0 %	386707625
30	NC_017665	CT	3	6	1934	1939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017665	CCG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017665	CTAT	2	8	1981	1988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017665	CCG	2	6	2026	2031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707626
34	NC_017665	CG	3	6	2235	2240	0 %	0 %	50 %	50 %	386707626
35	NC_017665	GGC	2	6	2293	2298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017665	AGG	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017665	AAG	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707627
38	NC_017665	ACC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707627
39	NC_017665	ACG	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707627
40	NC_017665	CGC	2	6	2363	2368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707627
41	NC_017665	ATG	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
42	NC_017665	CGG	2	6	2438	2443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707627
43	NC_017665	TTG	2	6	2495	2500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707627
44	NC_017665	ACC	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707627
45	NC_017665	GTTAC	2	10	2628	2637	20 %	40 %	20 %	20 %	386707627
46	NC_017665	GGC	2	6	2643	2648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707627
47	NC_017665	AGC	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707627
48	NC_017665	CTGG	2	8	2745	2752	0 %	25 %	50 %	25 %	386707627
49	NC_017665	TGA	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
50	NC_017665	GCT	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707627
51	NC_017665	ATG	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
52	NC_017665	GCT	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707627
53	NC_017665	TGG	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386707627
54	NC_017665	GCTG	2	8	3024	3031	0 %	25 %	50 %	25 %	386707627
55	NC_017665	GCA	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707627
56	NC_017665	TGA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
57	NC_017665	AGGA	2	8	3098	3105	50 %	0 %	50 %	0 %	386707627
58	NC_017665	GAA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707627
59	NC_017665	TCAC	2	8	3212	3219	25 %	25 %	0 %	50 %	386707627
60	NC_017665	TGA	2	6	3220	3225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707627
61	NC_017665	T	6	6	3255	3260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017665	CAG	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017665	GAGCA	2	10	3269	3278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017665	AGC	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017665	GGC	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707628
66	NC_017665	AGG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386707628
67	NC_017665	GAA	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707628
68	NC_017665	TGA	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707628
69	NC_017665	CA	3	6	3475	3480	50 %	0 %	0 %	50 %	386707629
70	NC_017665	TGA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707629
71	NC_017665	GCA	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707629
72	NC_017665	TCC	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386707629
73	NC_017665	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017665	TTTAT	2	10	3758	3767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017665	ATAA	2	8	3792	3799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017665	A	6	6	3804	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017665	GAA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017665	T	7	7	3825	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017665	GTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017665	ACC	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017665	TTG	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017665	CGT	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017665	TTC	2	6	3922	3927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017665	GCG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017665	GT	3	6	3965	3970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017665	GCC	2	6	4013	4018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017665	G	6	6	4053	4058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017665	TACA	2	8	4059	4066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017665	GTC	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017665	GA	3	6	4096	4101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017665	GTG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017665	CTC	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017665	GAG	2	6	4293	4298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017665	TGA	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
95	NC_017665	CTG	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
96	NC_017665	CAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707630
97	NC_017665	GC	3	6	4448	4453	0 %	0 %	50 %	50 %	386707630
98	NC_017665	TCG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
99	NC_017665	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707630
100	NC_017665	TGA	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
101	NC_017665	TGA	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
102	NC_017665	CAGC	2	8	4654	4661	25 %	0 %	25 %	50 %	386707630
103	NC_017665	TGA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707630
104	NC_017665	CCA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707630
105	NC_017665	TGAT	2	8	4758	4765	25 %	50 %	25 %	0 %	386707630
106	NC_017665	AAT	2	6	4799	4804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707630
107	NC_017665	GTC	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
108	NC_017665	ATT	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707630
109	NC_017665	CTG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
110	NC_017665	CTG	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707630
111	NC_017665	AGC	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707630
112	NC_017665	GTT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707630
113	NC_017665	TTG	2	6	5091	5096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707630
114	NC_017665	ATT	2	6	5111	5116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707630
115	NC_017665	T	8	8	5190	5197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017665	ATC	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017665	ATG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017665	TTG	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707631
119	NC_017665	CCTG	2	8	5271	5278	0 %	25 %	25 %	50 %	386707631
120	NC_017665	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707631
121	NC_017665	CGG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707631
122	NC_017665	T	6	6	5325	5330	0 %	100 %	0 %	0 %	386707631
123	NC_017665	AAT	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707631
124	NC_017665	TC	3	6	5366	5371	0 %	50 %	0 %	50 %	386707631
125	NC_017665	TCA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707631
126	NC_017665	AGC	2	6	5523	5528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707631
127	NC_017665	TCA	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707631
128	NC_017665	T	6	6	5562	5567	0 %	100 %	0 %	0 %	386707631
129	NC_017665	TC	3	6	5585	5590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017665	ATC	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017665	AACT	2	8	5624	5631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017665	ATG	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017665	AGTG	2	8	5809	5816	25 %	25 %	50 %	0 %	386707632
134	NC_017665	AAGA	2	8	5827	5834	75 %	0 %	25 %	0 %	386707632
135	NC_017665	TC	3	6	5877	5882	0 %	50 %	0 %	50 %	386707632
136	NC_017665	A	6	6	5906	5911	100 %	0 %	0 %	0 %	386707632
137	NC_017665	GCA	2	6	5954	5959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707632
138	NC_017665	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707632
139	NC_017665	TGTT	2	8	6039	6046	0 %	75 %	25 %	0 %	386707632
140	NC_017665	TTG	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707632
141	NC_017665	TTCG	2	8	6194	6201	0 %	50 %	25 %	25 %	386707633
142	NC_017665	ATGAC	2	10	6232	6241	40 %	20 %	20 %	20 %	386707633
143	NC_017665	TCT	3	9	6261	6269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707633
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146	NC_017665	GGCA	2	8	6466	6473	25 %	0 %	50 %	25 %	386707633
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148	NC_017665	ATCGT	2	10	6799	6808	20 %	40 %	20 %	20 %	386707633
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262	NC_017665	GTG	2	6	13281	13286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386707636
263	NC_017665	GAA	2	6	13335	13340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707636
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266	NC_017665	TCT	2	6	13439	13444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707636
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268	NC_017665	GTT	2	6	13571	13576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_017665	ATG	2	6	20067	20072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707644
403	NC_017665	GT	3	6	20227	20232	0 %	50 %	50 %	0 %	386707644
404	NC_017665	CGG	2	6	20308	20313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707644
405	NC_017665	TCC	2	6	20315	20320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386707644
406	NC_017665	CAT	2	6	20371	20376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707644
407	NC_017665	TGC	2	6	20399	20404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707644
408	NC_017665	CCT	2	6	20557	20562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386707644
409	NC_017665	ATC	2	6	20589	20594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707644
410	NC_017665	TGAT	2	8	20652	20659	25 %	50 %	25 %	0 %	386707644
411	NC_017665	GAC	2	6	20729	20734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707644
412	NC_017665	CTG	2	6	20735	20740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707644
413	NC_017665	CGA	2	6	20758	20763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707644
414	NC_017665	GAT	2	6	20974	20979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707645
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416	NC_017665	GTT	2	6	21194	21199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707645
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418	NC_017665	T	6	6	21361	21366	0 %	100 %	0 %	0 %	386707645
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421	NC_017665	AG	3	6	21839	21844	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
422	NC_017665	TCA	2	6	21988	21993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707646
423	NC_017665	CCT	2	6	22010	22015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386707646
424	NC_017665	GCT	2	6	22067	22072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707646
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428	NC_017665	ATT	2	6	22188	22193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707646
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435	NC_017665	TTC	2	6	22545	22550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707646
436	NC_017665	ATT	2	6	22575	22580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707646
437	NC_017665	ACCGGT	2	12	22656	22667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386707646
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439	NC_017665	CA	3	6	22682	22687	50 %	0 %	0 %	50 %	386707646
440	NC_017665	AAT	2	6	22785	22790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707646
441	NC_017665	TCTTT	2	10	22804	22813	0 %	80 %	0 %	20 %	386707646
442	NC_017665	GGA	2	6	22816	22821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386707646
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459	NC_017665	TCTG	2	8	23722	23729	0 %	50 %	25 %	25 %	386707646
460	NC_017665	ACG	2	6	23730	23735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707646
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462	NC_017665	TCA	2	6	23923	23928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707646
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464	NC_017665	TCT	2	6	24103	24108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707646
465	NC_017665	AG	3	6	24279	24284	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
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470	NC_017665	GAA	2	6	24551	24556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_017665	T	6	6	24575	24580	0 %	100 %	0 %	0 %	386707647
473	NC_017665	ATGA	2	8	24582	24589	50 %	25 %	25 %	0 %	386707647
474	NC_017665	T	6	6	24622	24627	0 %	100 %	0 %	0 %	386707647
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477	NC_017665	CCG	2	6	24758	24763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707647
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489	NC_017665	TTCCGG	2	12	25271	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707647
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493	NC_017665	TCA	2	6	25643	25648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707649
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495	NC_017665	C	6	6	25713	25718	0 %	0 %	0 %	100 %	386707649
496	NC_017665	T	6	6	25731	25736	0 %	100 %	0 %	0 %	386707649
497	NC_017665	TGA	3	9	25794	25802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707649
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499	NC_017665	CAT	2	6	25884	25889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707649
500	NC_017665	AGC	2	6	25897	25902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707649

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