MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	TC	3	6	98	103	0 %	50 %	0 %	50 %	387504845
2	NC_017657	AC	3	6	363	368	50 %	0 %	0 %	50 %	387504845
3	NC_017657	CG	3	6	1143	1148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017657	AG	4	8	1820	1827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017657	TA	4	8	3234	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017657	TG	4	8	4746	4753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017657	CT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017657	GT	3	6	5612	5617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017657	TC	3	6	5993	5998	0 %	50 %	0 %	50 %	387504852
10	NC_017657	AG	3	6	6495	6500	50 %	0 %	50 %	0 %	387504853
11	NC_017657	TA	3	6	6792	6797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017657	CT	3	6	8308	8313	0 %	50 %	0 %	50 %	387504857
13	NC_017657	AT	3	6	8520	8525	50 %	50 %	0 %	0 %	387504857
14	NC_017657	AT	3	6	9719	9724	50 %	50 %	0 %	0 %	387504859
15	NC_017657	AG	3	6	9808	9813	50 %	0 %	50 %	0 %	387504859
16	NC_017657	GA	3	6	10049	10054	50 %	0 %	50 %	0 %	387504859
17	NC_017657	TG	3	6	11739	11744	0 %	50 %	50 %	0 %	387504862
18	NC_017657	TG	3	6	12422	12427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017657	AT	3	6	12493	12498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017657	TC	3	6	13300	13305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017657	AT	3	6	14285	14290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017657	AT	3	6	14604	14609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017657	GT	3	6	14669	14674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017657	CT	3	6	14819	14824	0 %	50 %	0 %	50 %	387504868
25	NC_017657	TC	3	6	15886	15891	0 %	50 %	0 %	50 %	387504868
26	NC_017657	AC	3	6	16466	16471	50 %	0 %	0 %	50 %	387504868
27	NC_017657	GA	3	6	17551	17556	50 %	0 %	50 %	0 %	387504869
28	NC_017657	CA	3	6	17741	17746	50 %	0 %	0 %	50 %	387504869
29	NC_017657	GA	3	6	18393	18398	50 %	0 %	50 %	0 %	387504869
30	NC_017657	AT	3	6	21718	21723	50 %	50 %	0 %	0 %	387504871
31	NC_017657	GC	3	6	22201	22206	0 %	0 %	50 %	50 %	387504872
32	NC_017657	GC	3	6	23286	23291	0 %	0 %	50 %	50 %	387504873
33	NC_017657	TA	3	6	23405	23410	50 %	50 %	0 %	0 %	387504873
34	NC_017657	AG	3	6	24420	24425	50 %	0 %	50 %	0 %	387504875
35	NC_017657	CG	3	6	24578	24583	0 %	0 %	50 %	50 %	387504876
36	NC_017657	GC	3	6	24956	24961	0 %	0 %	50 %	50 %	387504876
37	NC_017657	GA	3	6	25980	25985	50 %	0 %	50 %	0 %	387504877
38	NC_017657	TG	3	6	26820	26825	0 %	50 %	50 %	0 %	387504878
39	NC_017657	AT	3	6	27167	27172	50 %	50 %	0 %	0 %	387504878
40	NC_017657	TG	3	6	30422	30427	0 %	50 %	50 %	0 %	387504883
41	NC_017657	CA	3	6	31040	31045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017657	TA	3	6	31500	31505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017657	TA	3	6	31511	31516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017657	AT	3	6	32145	32150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017657	TA	5	10	32462	32471	50 %	50 %	0 %	0 %	387504887
46	NC_017657	TG	3	6	32492	32497	0 %	50 %	50 %	0 %	387504887
47	NC_017657	AT	3	6	32664	32669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017657	CT	3	6	32821	32826	0 %	50 %	0 %	50 %	387504888
49	NC_017657	TA	3	6	32879	32884	50 %	50 %	0 %	0 %	387504888
50	NC_017657	TA	3	6	33115	33120	50 %	50 %	0 %	0 %	387504888
51	NC_017657	AG	3	6	33331	33336	50 %	0 %	50 %	0 %	387504888
52	NC_017657	AT	3	6	34570	34575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017657	TC	3	6	34576	34581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017657	GC	3	6	36617	36622	0 %	0 %	50 %	50 %	387504891
55	NC_017657	CT	3	6	36667	36672	0 %	50 %	0 %	50 %	387504891
56	NC_017657	AC	3	6	36704	36709	50 %	0 %	0 %	50 %	387504891
57	NC_017657	GA	3	6	36786	36791	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
58	NC_017657	AG	3	6	36843	36848	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
59	NC_017657	AG	3	6	37789	37794	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
60	NC_017657	AT	3	6	37943	37948	50 %	50 %	0 %	0 %	387504891
61	NC_017657	TA	3	6	38304	38309	50 %	50 %	0 %	0 %	387504892
62	NC_017657	AG	3	6	38481	38486	50 %	0 %	50 %	0 %	387504892
63	NC_017657	AT	3	6	38543	38548	50 %	50 %	0 %	0 %	387504892
64	NC_017657	GC	3	6	39480	39485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017657	AT	3	6	40480	40485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017657	GT	4	8	41435	41442	0 %	50 %	50 %	0 %	387504894
67	NC_017657	AT	3	6	42136	42141	50 %	50 %	0 %	0 %	387504894
68	NC_017657	AT	3	6	42726	42731	50 %	50 %	0 %	0 %	387504894
69	NC_017657	GA	4	8	43144	43151	50 %	0 %	50 %	0 %	387504894
70	NC_017657	GA	3	6	43619	43624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017657	GA	3	6	46688	46693	50 %	0 %	50 %	0 %	387504898
72	NC_017657	TC	4	8	47594	47601	0 %	50 %	0 %	50 %	387504899
73	NC_017657	CG	3	6	47823	47828	0 %	0 %	50 %	50 %	387504899
74	NC_017657	TC	3	6	47937	47942	0 %	50 %	0 %	50 %	387504899
75	NC_017657	AG	3	6	48389	48394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017657	CT	3	6	49771	49776	0 %	50 %	0 %	50 %	387504901
77	NC_017657	AT	3	6	50948	50953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017657	TC	3	6	51149	51154	0 %	50 %	0 %	50 %	387504902
79	NC_017657	AT	3	6	51597	51602	50 %	50 %	0 %	0 %	387504903
80	NC_017657	TG	3	6	52138	52143	0 %	50 %	50 %	0 %	387504904
81	NC_017657	CT	3	6	53177	53182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017657	AT	3	6	53674	53679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017657	AT	3	6	53778	53783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017657	TC	3	6	53801	53806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017657	TA	3	6	53870	53875	50 %	50 %	0 %	0 %	387504907
86	NC_017657	CT	3	6	53920	53925	0 %	50 %	0 %	50 %	387504907
87	NC_017657	GA	3	6	54090	54095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017657	TA	3	6	54121	54126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017657	AT	3	6	54261	54266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017657	AT	3	6	54747	54752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017657	CG	3	6	55317	55322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017657	CA	3	6	55938	55943	50 %	0 %	0 %	50 %	387504910
93	NC_017657	TA	3	6	56170	56175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017657	TA	3	6	56218	56223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017657	CT	3	6	56779	56784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017657	CA	3	6	57077	57082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017657	GT	3	6	57499	57504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017657	CA	3	6	57809	57814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017657	TA	4	8	57966	57973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017657	CT	3	6	57992	57997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017657	AT	3	6	59302	59307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017657	AT	3	6	59355	59360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017657	GA	3	6	60668	60673	50 %	0 %	50 %	0 %	387504916
104	NC_017657	AG	3	6	61015	61020	50 %	0 %	50 %	0 %	387504916
105	NC_017657	TC	3	6	61106	61111	0 %	50 %	0 %	50 %	387504916
106	NC_017657	CT	3	6	62199	62204	0 %	50 %	0 %	50 %	387504918
107	NC_017657	TC	3	6	62292	62297	0 %	50 %	0 %	50 %	387504918
108	NC_017657	CG	3	6	62604	62609	0 %	0 %	50 %	50 %	387504918
109	NC_017657	AG	3	6	62876	62881	50 %	0 %	50 %	0 %	387504919
110	NC_017657	CA	3	6	64018	64023	50 %	0 %	0 %	50 %	387504920
111	NC_017657	GC	3	6	64249	64254	0 %	0 %	50 %	50 %	387504921
112	NC_017657	GA	3	6	64448	64453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017657	CA	3	6	64872	64877	50 %	0 %	0 %	50 %	387504922
114	NC_017657	TG	3	6	65849	65854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.