MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	AAC	2	6	32	37	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017657	GGA	2	6	38	43	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017657	CAT	2	6	47	52	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
4	NC_017657	ATG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504845
5	NC_017657	GGC	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504845
6	NC_017657	CAT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
7	NC_017657	GGC	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017657	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017657	GTG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504846
10	NC_017657	ACG	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504846
11	NC_017657	GAA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
12	NC_017657	GAA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
13	NC_017657	GCG	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017657	CAC	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017657	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017657	CAG	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017657	GGT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017657	GCA	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017657	GCC	2	6	1129	1134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017657	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017657	GCC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017657	CGT	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017657	GCG	2	6	1512	1517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017657	GTT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017657	GCG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504847
26	NC_017657	GAT	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504847
27	NC_017657	CGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
28	NC_017657	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504848
29	NC_017657	GAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504848
30	NC_017657	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504848
31	NC_017657	CTG	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
32	NC_017657	TGA	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017657	TTG	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017657	CCG	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504849
35	NC_017657	GAT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
36	NC_017657	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
37	NC_017657	ATC	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504849
38	NC_017657	TGA	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
39	NC_017657	ATG	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
40	NC_017657	GAT	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
41	NC_017657	AAT	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
42	NC_017657	ATA	2	6	2735	2740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
43	NC_017657	CGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504849
44	NC_017657	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
45	NC_017657	TAT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017657	TTC	2	6	3117	3122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017657	GTC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017657	TCA	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017657	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017657	CGC	2	6	3480	3485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
51	NC_017657	CGT	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
52	NC_017657	TGG	3	9	3517	3525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504850
53	NC_017657	CTG	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
54	NC_017657	GCC	2	6	3654	3659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
55	NC_017657	TGA	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
56	NC_017657	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
57	NC_017657	CGG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
58	NC_017657	CCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504850
59	NC_017657	CTG	3	9	4011	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
60	NC_017657	GAA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
61	NC_017657	AGA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
62	NC_017657	AGC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
63	NC_017657	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
64	NC_017657	GCT	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
65	NC_017657	AGG	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504850
66	NC_017657	CAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504850
67	NC_017657	GCG	2	6	4458	4463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
68	NC_017657	GCA	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
69	NC_017657	TTC	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504851
70	NC_017657	ATA	2	6	5019	5024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504851
71	NC_017657	TGT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504851
72	NC_017657	AAT	2	6	5344	5349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017657	TGG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017657	CAC	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017657	CAC	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017657	ACA	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017657	GTA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017657	ATT	2	6	5578	5583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017657	TGC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017657	GCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017657	GCT	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017657	ATG	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
83	NC_017657	ATT	2	6	5783	5788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504852
84	NC_017657	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
85	NC_017657	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504852
86	NC_017657	CTT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
87	NC_017657	ATC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
88	NC_017657	ATC	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
89	NC_017657	TGA	3	9	6100	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
90	NC_017657	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017657	CAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504853
92	NC_017657	CTG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504853
93	NC_017657	ATT	2	6	6641	6646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504853
94	NC_017657	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017657	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017657	AGA	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017657	TGA	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017657	TTC	2	6	6754	6759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017657	ATC	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017657	ATG	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017657	ACT	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017657	TAA	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017657	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017657	ATT	2	6	6945	6950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017657	TAA	2	6	6986	6991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017657	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017657	ATT	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017657	AGA	2	6	7062	7067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017657	GAA	2	6	7187	7192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504854
110	NC_017657	TAA	2	6	7211	7216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504854
111	NC_017657	ATC	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504854
112	NC_017657	GAT	2	6	7309	7314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504854
113	NC_017657	AAG	2	6	7559	7564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017657	GCT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504855
115	NC_017657	TGA	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504855
116	NC_017657	TTC	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504855
117	NC_017657	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504855
118	NC_017657	GTT	2	6	7742	7747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504855
119	NC_017657	GTT	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504855
120	NC_017657	ATG	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504855
121	NC_017657	CAT	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504855
122	NC_017657	CGT	2	6	7864	7869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504855
123	NC_017657	GCA	2	6	7993	7998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504856
124	NC_017657	CTG	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504856
125	NC_017657	CAG	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504857
126	NC_017657	TCA	2	6	8479	8484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504857
127	NC_017657	GAA	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504857
128	NC_017657	GTG	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504857
129	NC_017657	AAT	2	6	8800	8805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504858
130	NC_017657	GTG	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504858
131	NC_017657	GGT	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504858
132	NC_017657	CGG	2	6	9007	9012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504858
133	NC_017657	CAA	2	6	9031	9036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504858
134	NC_017657	GAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504858
135	NC_017657	CGG	2	6	9288	9293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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