MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 108585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017656	AAT	2	6	22992	22997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504954
502	NC_017656	ATC	2	6	23012	23017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017656	TTAA	2	8	23019	23026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017656	GTT	2	6	23072	23077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017656	ATT	2	6	23078	23083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017656	T	6	6	23100	23105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017656	TGA	2	6	23124	23129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017656	ATT	2	6	23154	23159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017656	CTT	2	6	23162	23167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017656	AAG	2	6	23171	23176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017656	CAT	2	6	23187	23192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017656	ATT	2	6	23231	23236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017656	T	6	6	23235	23240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017656	TTAA	2	8	23253	23260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017656	CTT	2	6	23293	23298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017656	T	6	6	23297	23302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017656	TGA	2	6	23318	23323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504955
518	NC_017656	T	7	7	23328	23334	0 %	100 %	0 %	0 %	387504955
519	NC_017656	CAT	2	6	23433	23438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504955
520	NC_017656	TCA	2	6	23510	23515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504955
521	NC_017656	ATA	2	6	23597	23602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504955
522	NC_017656	T	6	6	23618	23623	0 %	100 %	0 %	0 %	387504955
523	NC_017656	T	7	7	23661	23667	0 %	100 %	0 %	0 %	387504955
524	NC_017656	GTT	2	6	23677	23682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504955
525	NC_017656	AT	3	6	23733	23738	50 %	50 %	0 %	0 %	387504955
526	NC_017656	ATA	2	6	23742	23747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504955
527	NC_017656	ATA	2	6	23758	23763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504955
528	NC_017656	TATTAA	2	12	23820	23831	50 %	50 %	0 %	0 %	387504955
529	NC_017656	TAT	2	6	23886	23891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504955
530	NC_017656	TAA	2	6	23896	23901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504955
531	NC_017656	ACA	2	6	23942	23947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504955
532	NC_017656	T	6	6	24017	24022	0 %	100 %	0 %	0 %	387504955
533	NC_017656	ATC	2	6	24100	24105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504955
534	NC_017656	ATTGC	2	10	24127	24136	20 %	40 %	20 %	20 %	387504955
535	NC_017656	T	6	6	24164	24169	0 %	100 %	0 %	0 %	387504955
536	NC_017656	TTA	2	6	24188	24193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504955
537	NC_017656	T	7	7	24201	24207	0 %	100 %	0 %	0 %	387504955
538	NC_017656	TGA	2	6	24248	24253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504955
539	NC_017656	TAA	2	6	24351	24356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504955
540	NC_017656	AT	3	6	24376	24381	50 %	50 %	0 %	0 %	387504955
541	NC_017656	TCA	2	6	24416	24421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504955
542	NC_017656	A	7	7	24460	24466	100 %	0 %	0 %	0 %	387504955
543	NC_017656	TC	3	6	24515	24520	0 %	50 %	0 %	50 %	387504955
544	NC_017656	A	7	7	24535	24541	100 %	0 %	0 %	0 %	387504955
545	NC_017656	GGA	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504955
546	NC_017656	TCA	2	6	24590	24595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504955
547	NC_017656	TATT	2	8	24660	24667	25 %	75 %	0 %	0 %	387504955
548	NC_017656	CAT	2	6	24672	24677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504955
549	NC_017656	CTA	2	6	24678	24683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504955
550	NC_017656	TGA	2	6	24749	24754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017656	TTAAT	2	10	24762	24771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017656	ACT	2	6	24787	24792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017656	AAG	2	6	24816	24821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017656	TAA	2	6	24861	24866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017656	GAG	2	6	24882	24887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017656	TA	3	6	24908	24913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017656	GT	3	6	25115	25120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017656	TC	3	6	25121	25126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_017656	AGC	2	6	25139	25144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017656	A	7	7	25151	25157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017656	TTG	2	6	25212	25217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504956
562	NC_017656	AGC	2	6	25277	25282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504956
563	NC_017656	GCA	2	6	25326	25331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504956
564	NC_017656	TGA	2	6	25369	25374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504956
565	NC_017656	CAT	2	6	25382	25387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504956
566	NC_017656	GC	3	6	25434	25439	0 %	0 %	50 %	50 %	387504956
567	NC_017656	CTT	2	6	25529	25534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017656	GCA	2	6	25652	25657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504957
569	NC_017656	CAGT	2	8	25660	25667	25 %	25 %	25 %	25 %	387504957
570	NC_017656	TTC	2	6	25668	25673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504957
571	NC_017656	CCATGA	2	12	25686	25697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387504957
572	NC_017656	CTT	2	6	25711	25716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504957
573	NC_017656	CATA	2	8	25817	25824	50 %	25 %	0 %	25 %	387504958
574	NC_017656	AAG	2	6	25843	25848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504958
575	NC_017656	GT	3	6	25850	25855	0 %	50 %	50 %	0 %	387504958
576	NC_017656	CG	3	6	25896	25901	0 %	0 %	50 %	50 %	387504958
577	NC_017656	GAA	2	6	25920	25925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504958
578	NC_017656	GCGCAA	2	12	25928	25939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504958
579	NC_017656	GGTGAT	2	12	25946	25957	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387504958
580	NC_017656	TCA	2	6	26119	26124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504958
581	NC_017656	TCT	2	6	26129	26134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504958
582	NC_017656	GAT	2	6	26172	26177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504958
583	NC_017656	TTA	2	6	26214	26219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504958
584	NC_017656	GCGT	2	8	26281	26288	0 %	25 %	50 %	25 %	387504958
585	NC_017656	CAG	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504958
586	NC_017656	CCG	2	6	26299	26304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504958
587	NC_017656	TGA	2	6	26393	26398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504958
588	NC_017656	CAG	2	6	26559	26564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504958
589	NC_017656	AGT	2	6	26618	26623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504958
590	NC_017656	A	7	7	26631	26637	100 %	0 %	0 %	0 %	387504958
591	NC_017656	AGC	2	6	26647	26652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504958
592	NC_017656	TGA	2	6	26693	26698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504958
593	NC_017656	CCGC	2	8	26704	26711	0 %	0 %	25 %	75 %	387504958
594	NC_017656	T	6	6	26715	26720	0 %	100 %	0 %	0 %	387504958
595	NC_017656	TGA	2	6	26782	26787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504959
596	NC_017656	TGA	3	9	26882	26890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504959
597	NC_017656	CAT	2	6	26900	26905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504959
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599	NC_017656	A	7	7	26925	26931	100 %	0 %	0 %	0 %	387504959
600	NC_017656	ATG	2	6	26944	26949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504959
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602	NC_017656	GCA	2	6	26968	26973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504959
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604	NC_017656	CCG	3	9	27136	27144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504959
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609	NC_017656	GCT	2	6	27689	27694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504959
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611	NC_017656	TCG	2	6	27928	27933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504959
612	NC_017656	GCT	2	6	27938	27943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504959
613	NC_017656	GC	3	6	27955	27960	0 %	0 %	50 %	50 %	387504959
614	NC_017656	TGC	2	6	27961	27966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504959
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619	NC_017656	GC	4	8	28073	28080	0 %	0 %	50 %	50 %	387504959
620	NC_017656	GAA	2	6	28263	28268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504959
621	NC_017656	GTG	2	6	28304	28309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504959
622	NC_017656	ACTC	2	8	28401	28408	25 %	25 %	0 %	50 %	387504959
623	NC_017656	TGT	2	6	28412	28417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504959
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