MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 1797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017653	CGA	2	6	24583	24588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504742
502	NC_017653	CAC	2	6	24626	24631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504742
503	NC_017653	AGC	2	6	24666	24671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504742
504	NC_017653	TGG	2	6	24691	24696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504742
505	NC_017653	ACC	2	6	24702	24707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504742
506	NC_017653	TGC	2	6	24740	24745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504743
507	NC_017653	GGC	2	6	24758	24763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504743
508	NC_017653	GCC	2	6	24771	24776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504743
509	NC_017653	ATGT	2	8	24804	24811	25 %	50 %	25 %	0 %	387504743
510	NC_017653	CGA	2	6	24868	24873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504743
511	NC_017653	CAT	2	6	24913	24918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504743
512	NC_017653	GTT	2	6	24928	24933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504743
513	NC_017653	ACC	2	6	24947	24952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504743
514	NC_017653	CGC	2	6	25034	25039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504743
515	NC_017653	TTA	2	6	25304	25309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504744
516	NC_017653	TCA	2	6	25337	25342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504744
517	NC_017653	T	6	6	25464	25469	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
518	NC_017653	TGG	2	6	25512	25517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504744
519	NC_017653	ACTC	2	8	25620	25627	25 %	25 %	0 %	50 %	387504744
520	NC_017653	ATA	2	6	25684	25689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504744
521	NC_017653	TCA	2	6	25700	25705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504744
522	NC_017653	GCC	2	6	25751	25756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504744
523	NC_017653	TCC	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504744
524	NC_017653	TTC	2	6	25864	25869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504744
525	NC_017653	CGC	2	6	26016	26021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504744
526	NC_017653	GC	3	6	26115	26120	0 %	0 %	50 %	50 %	387504744
527	NC_017653	CCA	2	6	26129	26134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504744
528	NC_017653	CCA	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504744
529	NC_017653	TCA	2	6	26360	26365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504744
530	NC_017653	T	6	6	26374	26379	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
531	NC_017653	CTT	2	6	26380	26385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504744
532	NC_017653	T	6	6	26500	26505	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
533	NC_017653	AAT	2	6	26611	26616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504744
534	NC_017653	GCC	2	6	26668	26673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504744
535	NC_017653	CG	5	10	26677	26686	0 %	0 %	50 %	50 %	387504744
536	NC_017653	AGA	2	6	26856	26861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504744
537	NC_017653	TCC	2	6	26876	26881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504744
538	NC_017653	TCA	2	6	26898	26903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504744
539	NC_017653	TCA	3	9	26939	26947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504744
540	NC_017653	TATTGA	2	12	26997	27008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387504744
541	NC_017653	CTG	2	6	27131	27136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504745
542	NC_017653	TTGA	2	8	27137	27144	25 %	50 %	25 %	0 %	387504745
543	NC_017653	ACC	2	6	27180	27185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504745
544	NC_017653	AT	3	6	27403	27408	50 %	50 %	0 %	0 %	387504745
545	NC_017653	CGT	2	6	27445	27450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504745
546	NC_017653	TTTAAC	2	12	27470	27481	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387504745
547	NC_017653	GTT	2	6	27492	27497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504745
548	NC_017653	CGC	2	6	27548	27553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504745
549	NC_017653	TTA	2	6	27644	27649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504746
550	NC_017653	AT	3	6	27763	27768	50 %	50 %	0 %	0 %	387504746
551	NC_017653	GTT	2	6	27827	27832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504746
552	NC_017653	GTC	2	6	27847	27852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504746
553	NC_017653	GGCTAA	2	12	28011	28022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387504746
554	NC_017653	CAA	2	6	28237	28242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504747
555	NC_017653	CAA	2	6	28262	28267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504747
556	NC_017653	CATC	2	8	28294	28301	25 %	25 %	0 %	50 %	387504747
557	NC_017653	CCA	2	6	28317	28322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504747
558	NC_017653	TG	3	6	28365	28370	0 %	50 %	50 %	0 %	387504747
559	NC_017653	CCT	2	6	28385	28390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_017653	AGG	2	6	28399	28404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017653	AAT	2	6	28483	28488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017653	TCAT	2	8	28538	28545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_017653	CGG	2	6	28590	28595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017653	AAG	2	6	28678	28683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017653	T	6	6	28716	28721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017653	ACA	2	6	28728	28733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017653	AAC	2	6	28742	28747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017653	CA	4	8	28778	28785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_017653	TTAA	2	8	28795	28802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017653	AATA	2	8	28817	28824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017653	AGC	2	6	28949	28954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017653	A	6	6	28955	28960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017653	A	6	6	28978	28983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017653	ACA	2	6	29032	29037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017653	CAG	2	6	29064	29069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017653	CG	3	6	29096	29101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_017653	GAT	2	6	29187	29192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504748
578	NC_017653	TCG	2	6	29202	29207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504748
579	NC_017653	AAT	2	6	29224	29229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504748
580	NC_017653	CTG	2	6	29243	29248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504748
581	NC_017653	TGT	2	6	29282	29287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504748
582	NC_017653	TC	3	6	29359	29364	0 %	50 %	0 %	50 %	387504748
583	NC_017653	AATT	2	8	29368	29375	50 %	50 %	0 %	0 %	387504748
584	NC_017653	CATGA	2	10	29401	29410	40 %	20 %	20 %	20 %	387504748
585	NC_017653	A	6	6	29410	29415	100 %	0 %	0 %	0 %	387504748
586	NC_017653	CTGT	2	8	29447	29454	0 %	50 %	25 %	25 %	387504748
587	NC_017653	CTC	2	6	29488	29493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504748
588	NC_017653	AGC	2	6	29579	29584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504748
589	NC_017653	AC	3	6	29700	29705	50 %	0 %	0 %	50 %	387504748
590	NC_017653	AAC	2	6	29729	29734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017653	TAGG	2	8	29767	29774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017653	ACC	2	6	29852	29857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504749
593	NC_017653	GCTG	2	8	29863	29870	0 %	25 %	50 %	25 %	387504749
594	NC_017653	GCA	2	6	29883	29888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504749
595	NC_017653	TCT	2	6	29892	29897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504749
596	NC_017653	CCA	2	6	29929	29934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504749
597	NC_017653	GAT	2	6	29976	29981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504749
598	NC_017653	TAT	2	6	30010	30015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504749
599	NC_017653	ATG	2	6	30025	30030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504749
600	NC_017653	TTG	2	6	30043	30048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504749
601	NC_017653	TAT	2	6	30118	30123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504749
602	NC_017653	ATT	2	6	30147	30152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504749
603	NC_017653	GCA	2	6	30255	30260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504749
604	NC_017653	GGCT	2	8	30340	30347	0 %	25 %	50 %	25 %	387504750
605	NC_017653	AGC	2	6	30360	30365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504750
606	NC_017653	CTG	2	6	30371	30376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504750
607	NC_017653	GACG	2	8	30457	30464	25 %	0 %	50 %	25 %	387504750
608	NC_017653	ATT	2	6	30554	30559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504750
609	NC_017653	GTG	2	6	30595	30600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504750
610	NC_017653	CAA	2	6	30614	30619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504750
611	NC_017653	GCA	2	6	30772	30777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504750
612	NC_017653	CAC	2	6	30846	30851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504751
613	NC_017653	AGC	2	6	30877	30882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504751
614	NC_017653	TCT	2	6	30887	30892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504751
615	NC_017653	GAT	2	6	30971	30976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504751
616	NC_017653	ATT	2	6	31050	31055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504751
617	NC_017653	CTG	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504751
618	NC_017653	ATA	2	6	31155	31160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504751
619	NC_017653	CAT	2	6	31176	31181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504751
620	NC_017653	CAC	2	6	31360	31365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504752
621	NC_017653	AGC	2	6	31391	31396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504752
622	NC_017653	TCT	2	6	31401	31406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504752
623	NC_017653	GAT	2	6	31485	31490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504752
624	NC_017653	GGT	2	6	31534	31539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504752
625	NC_017653	ATA	2	6	31558	31563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504752
626	NC_017653	G	7	7	31614	31620	0 %	0 %	100 %	0 %	387504752
627	NC_017653	TGT	2	6	31627	31632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504752
628	NC_017653	AAG	2	6	31651	31656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504752
629	NC_017653	G	6	6	31704	31709	0 %	0 %	100 %	0 %	387504752
630	NC_017653	AGC	2	6	31754	31759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504752
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