MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	GC	3	6	1892	1897	0 %	0 %	50 %	50 %	386627439
2	NC_017647	TC	3	6	2376	2381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017647	CT	3	6	2943	2948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017647	TC	4	8	3194	3201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017647	TC	3	6	3618	3623	0 %	50 %	0 %	50 %	386627442
6	NC_017647	CG	3	6	3736	3741	0 %	0 %	50 %	50 %	386627442
7	NC_017647	GC	3	6	4265	4270	0 %	0 %	50 %	50 %	386627443
8	NC_017647	TC	3	6	4541	4546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017647	CG	3	6	5824	5829	0 %	0 %	50 %	50 %	386627446
10	NC_017647	TG	4	8	6472	6479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017647	CT	3	6	6640	6645	0 %	50 %	0 %	50 %	386627447
12	NC_017647	GC	3	6	6765	6770	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
13	NC_017647	CG	3	6	6839	6844	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
14	NC_017647	GC	3	6	6924	6929	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
15	NC_017647	GC	3	6	7473	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
16	NC_017647	GC	3	6	7675	7680	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
17	NC_017647	GC	3	6	8028	8033	0 %	0 %	50 %	50 %	386627447
18	NC_017647	CG	3	6	8747	8752	0 %	0 %	50 %	50 %	386627448
19	NC_017647	CT	3	6	10046	10051	0 %	50 %	0 %	50 %	386627449
20	NC_017647	AG	3	6	10741	10746	50 %	0 %	50 %	0 %	386627450
21	NC_017647	GC	3	6	11336	11341	0 %	0 %	50 %	50 %	386627450
22	NC_017647	CT	3	6	12662	12667	0 %	50 %	0 %	50 %	386627451
23	NC_017647	GC	3	6	12713	12718	0 %	0 %	50 %	50 %	386627451
24	NC_017647	CG	3	6	12962	12967	0 %	0 %	50 %	50 %	386627451
25	NC_017647	GT	4	8	13462	13469	0 %	50 %	50 %	0 %	386627452
26	NC_017647	GC	3	6	14158	14163	0 %	0 %	50 %	50 %	386627453
27	NC_017647	GA	3	6	14191	14196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017647	AT	3	6	14460	14465	50 %	50 %	0 %	0 %	386627454
29	NC_017647	GC	4	8	14935	14942	0 %	0 %	50 %	50 %	386627455
30	NC_017647	TA	3	6	15129	15134	50 %	50 %	0 %	0 %	386627455
31	NC_017647	TC	3	6	15601	15606	0 %	50 %	0 %	50 %	386627456
32	NC_017647	TG	3	6	17516	17521	0 %	50 %	50 %	0 %	386627459
33	NC_017647	GC	3	6	17869	17874	0 %	0 %	50 %	50 %	386627459
34	NC_017647	GT	3	6	18556	18561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017647	GA	3	6	18563	18568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017647	CG	3	6	18750	18755	0 %	0 %	50 %	50 %	386627461
37	NC_017647	TG	3	6	19589	19594	0 %	50 %	50 %	0 %	386627462
38	NC_017647	GT	3	6	20142	20147	0 %	50 %	50 %	0 %	386627462
39	NC_017647	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017647	CG	3	6	20597	20602	0 %	0 %	50 %	50 %	386627463
41	NC_017647	AG	3	6	20995	21000	50 %	0 %	50 %	0 %	386627463
42	NC_017647	GC	3	6	21377	21382	0 %	0 %	50 %	50 %	386627463
43	NC_017647	GT	3	6	21549	21554	0 %	50 %	50 %	0 %	386627463
44	NC_017647	CG	3	6	21585	21590	0 %	0 %	50 %	50 %	386627463
45	NC_017647	AT	3	6	22067	22072	50 %	50 %	0 %	0 %	386627463
46	NC_017647	AG	3	6	24008	24013	50 %	0 %	50 %	0 %	386627465
47	NC_017647	AC	3	6	24355	24360	50 %	0 %	0 %	50 %	386627465
48	NC_017647	AT	3	6	24673	24678	50 %	50 %	0 %	0 %	386627465
49	NC_017647	GC	3	6	24961	24966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017647	TG	3	6	25020	25025	0 %	50 %	50 %	0 %	386627466
51	NC_017647	GC	3	6	25290	25295	0 %	0 %	50 %	50 %	386627466
52	NC_017647	CA	3	6	25433	25438	50 %	0 %	0 %	50 %	386627466
53	NC_017647	TC	3	6	25960	25965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017647	AT	3	6	26433	26438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017647	TA	3	6	27153	27158	50 %	50 %	0 %	0 %	386627467
56	NC_017647	AG	3	6	27330	27335	50 %	0 %	50 %	0 %	386627467
57	NC_017647	AT	3	6	27392	27397	50 %	50 %	0 %	0 %	386627467
58	NC_017647	GC	4	8	28627	28634	0 %	0 %	50 %	50 %	386627470
59	NC_017647	GC	3	6	29572	29577	0 %	0 %	50 %	50 %	386627472
60	NC_017647	AC	3	6	31072	31077	50 %	0 %	0 %	50 %	386627475
61	NC_017647	GT	3	6	31691	31696	0 %	50 %	50 %	0 %	386627476
62	NC_017647	CG	3	6	31868	31873	0 %	0 %	50 %	50 %	386627476
63	NC_017647	GC	3	6	32737	32742	0 %	0 %	50 %	50 %	386627476
64	NC_017647	TC	3	6	32891	32896	0 %	50 %	0 %	50 %	386627476
65	NC_017647	AT	3	6	33393	33398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017647	AT	3	6	34292	34297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017647	AT	3	6	34355	34360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017647	TA	3	6	34528	34533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017647	AC	3	6	34857	34862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017647	GT	3	6	35252	35257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017647	AT	3	6	35308	35313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017647	AT	3	6	35531	35536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017647	TA	3	6	35582	35587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017647	TA	3	6	36583	36588	50 %	50 %	0 %	0 %	386627478
75	NC_017647	AG	3	6	36942	36947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017647	CG	3	6	37498	37503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017647	TA	3	6	38351	38356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017647	TC	3	6	38549	38554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017647	CT	3	6	38919	38924	0 %	50 %	0 %	50 %	386627480
80	NC_017647	CA	3	6	39217	39222	50 %	0 %	0 %	50 %	386627480
81	NC_017647	GT	3	6	39639	39644	0 %	50 %	50 %	0 %	386627481
82	NC_017647	AT	3	6	40002	40007	50 %	50 %	0 %	0 %	386627482
83	NC_017647	GA	3	6	41295	41300	50 %	0 %	50 %	0 %	386627483
84	NC_017647	GA	4	8	41559	41566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017647	AT	3	6	41609	41614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017647	TG	4	8	42343	42350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017647	GC	3	6	43619	43624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017647	AT	3	6	43644	43649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017647	AG	4	8	43938	43945	50 %	0 %	50 %	0 %	386627485
90	NC_017647	GC	3	6	44457	44462	0 %	0 %	50 %	50 %	386627486
91	NC_017647	AG	3	6	45291	45296	50 %	0 %	50 %	0 %	386627487
92	NC_017647	GC	3	6	45337	45342	0 %	0 %	50 %	50 %	386627487
93	NC_017647	TC	3	6	45613	45618	0 %	50 %	0 %	50 %	386627488
94	NC_017647	GT	3	6	46904	46909	0 %	50 %	50 %	0 %	386627489
95	NC_017647	AC	3	6	47310	47315	50 %	0 %	0 %	50 %	386627490
96	NC_017647	AT	3	6	47674	47679	50 %	50 %	0 %	0 %	386627490
97	NC_017647	TG	3	6	47994	47999	0 %	50 %	50 %	0 %	386627491
98	NC_017647	CT	3	6	50135	50140	0 %	50 %	0 %	50 %	386627495
99	NC_017647	GA	3	6	50535	50540	50 %	0 %	50 %	0 %	386627495
100	NC_017647	GA	3	6	50552	50557	50 %	0 %	50 %	0 %	386627495
101	NC_017647	AG	3	6	50755	50760	50 %	0 %	50 %	0 %	386627495
102	NC_017647	AC	3	6	51348	51353	50 %	0 %	0 %	50 %	386627496
103	NC_017647	TG	3	6	51477	51482	0 %	50 %	50 %	0 %	386627496
104	NC_017647	AC	3	6	52664	52669	50 %	0 %	0 %	50 %	386627498
105	NC_017647	GT	3	6	53471	53476	0 %	50 %	50 %	0 %	386627500
106	NC_017647	AT	3	6	53544	53549	50 %	50 %	0 %	0 %	386627500
107	NC_017647	TG	3	6	53585	53590	0 %	50 %	50 %	0 %	386627500

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.