MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	CCGG	2	8	427	434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017643	CCAG	2	8	1136	1143	25 %	0 %	25 %	50 %	386617282
3	NC_017643	CCGG	2	8	1251	1258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017643	TGCA	2	8	1624	1631	25 %	25 %	25 %	25 %	386617283
5	NC_017643	GGGT	2	8	2033	2040	0 %	25 %	75 %	0 %	386617284
6	NC_017643	TGGC	2	8	2053	2060	0 %	25 %	50 %	25 %	386617284
7	NC_017643	GTGG	2	8	2074	2081	0 %	25 %	75 %	0 %	386617284
8	NC_017643	CAAA	2	8	2106	2113	75 %	0 %	0 %	25 %	386617284
9	NC_017643	GGCG	2	8	2468	2475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017643	AGGA	2	8	2611	2618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017643	TTCC	2	8	2622	2629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017643	TGAA	2	8	2692	2699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017643	CCGG	2	8	2905	2912	0 %	0 %	50 %	50 %	386617285
14	NC_017643	CGTC	2	8	2928	2935	0 %	25 %	25 %	50 %	386617285
15	NC_017643	GCCG	2	8	3136	3143	0 %	0 %	50 %	50 %	386617285
16	NC_017643	CTGG	2	8	3399	3406	0 %	25 %	50 %	25 %	386617285
17	NC_017643	GCCT	2	8	3597	3604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017643	CTCC	2	8	3958	3965	0 %	25 %	0 %	75 %	386617286
19	NC_017643	TGCG	2	8	4730	4737	0 %	25 %	50 %	25 %	386617287
20	NC_017643	AGTG	2	8	4804	4811	25 %	25 %	50 %	0 %	386617287
21	NC_017643	CCGT	2	8	4972	4979	0 %	25 %	25 %	50 %	386617288
22	NC_017643	TCAG	2	8	6615	6622	25 %	25 %	25 %	25 %	386617289
23	NC_017643	CCAT	2	8	7265	7272	25 %	25 %	0 %	50 %	386617290
24	NC_017643	GTCC	2	8	7428	7435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017643	GGAT	2	8	7489	7496	25 %	25 %	50 %	0 %	386617291
26	NC_017643	AAAC	2	8	7570	7577	75 %	0 %	0 %	25 %	386617291
27	NC_017643	CGTG	2	8	8351	8358	0 %	25 %	50 %	25 %	386617291
28	NC_017643	GAAA	2	8	8646	8653	75 %	0 %	25 %	0 %	386617291
29	NC_017643	GTGG	2	8	8699	8706	0 %	25 %	75 %	0 %	386617291
30	NC_017643	ACAG	2	8	9114	9121	50 %	0 %	25 %	25 %	386617291
31	NC_017643	GCTG	2	8	9205	9212	0 %	25 %	50 %	25 %	386617291
32	NC_017643	GGTT	2	8	10125	10132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017643	CAGC	2	8	10671	10678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017643	ATCC	2	8	10944	10951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017643	TGGT	2	8	10987	10994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017643	ACTG	2	8	11052	11059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017643	GCAG	2	8	11602	11609	25 %	0 %	50 %	25 %	386617293
38	NC_017643	AAAG	2	8	11740	11747	75 %	0 %	25 %	0 %	386617293
39	NC_017643	AGTG	2	8	11764	11771	25 %	25 %	50 %	0 %	386617293
40	NC_017643	CAGA	2	8	11774	11781	50 %	0 %	25 %	25 %	386617293
41	NC_017643	ATAA	2	8	11806	11813	75 %	25 %	0 %	0 %	386617293
42	NC_017643	TTAA	2	8	11909	11916	50 %	50 %	0 %	0 %	386617293
43	NC_017643	TCAT	2	8	12077	12084	25 %	50 %	0 %	25 %	386617293
44	NC_017643	CCTT	2	8	12218	12225	0 %	50 %	0 %	50 %	386617294
45	NC_017643	CGCC	2	8	12537	12544	0 %	0 %	25 %	75 %	386617294
46	NC_017643	GGCA	2	8	12742	12749	25 %	0 %	50 %	25 %	386617294
47	NC_017643	CACG	2	8	13219	13226	25 %	0 %	25 %	50 %	386617295
48	NC_017643	CAGC	2	8	13849	13856	25 %	0 %	25 %	50 %	386617295
49	NC_017643	ACTG	2	8	14132	14139	25 %	25 %	25 %	25 %	386617295
50	NC_017643	GCAG	2	8	14778	14785	25 %	0 %	50 %	25 %	386617295
51	NC_017643	CGTC	2	8	15039	15046	0 %	25 %	25 %	50 %	386617295
52	NC_017643	CTGG	2	8	15224	15231	0 %	25 %	50 %	25 %	386617295
53	NC_017643	GTCA	2	8	15836	15843	25 %	25 %	25 %	25 %	386617296
54	NC_017643	ATTG	2	8	16132	16139	25 %	50 %	25 %	0 %	386617297
55	NC_017643	GACT	2	8	16368	16375	25 %	25 %	25 %	25 %	386617297
56	NC_017643	GACG	2	8	16439	16446	25 %	0 %	50 %	25 %	386617297
57	NC_017643	GTGA	2	8	17405	17412	25 %	25 %	50 %	0 %	386617297
58	NC_017643	CAGA	2	8	17761	17768	50 %	0 %	25 %	25 %	386617297
59	NC_017643	CAGG	2	8	18097	18104	25 %	0 %	50 %	25 %	386617297
60	NC_017643	GCAG	2	8	18511	18518	25 %	0 %	50 %	25 %	386617298
61	NC_017643	CTGA	2	8	18928	18935	25 %	25 %	25 %	25 %	386617298
62	NC_017643	AGAA	2	8	19062	19069	75 %	0 %	25 %	0 %	386617298
63	NC_017643	CTGT	2	8	19290	19297	0 %	50 %	25 %	25 %	386617299
64	NC_017643	CAGC	2	8	19658	19665	25 %	0 %	25 %	50 %	386617299
65	NC_017643	TTCT	2	8	19832	19839	0 %	75 %	0 %	25 %	386617299
66	NC_017643	TGGC	2	8	19841	19848	0 %	25 %	50 %	25 %	386617299
67	NC_017643	CCTG	2	8	19980	19987	0 %	25 %	25 %	50 %	386617299
68	NC_017643	AACA	2	8	20576	20583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017643	GAAA	2	8	20615	20622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017643	GAAT	2	8	20706	20713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017643	CAAT	2	8	21230	21237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017643	TATT	2	8	22145	22152	25 %	75 %	0 %	0 %	386617301
73	NC_017643	CTTT	2	8	22602	22609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017643	AGAA	2	8	22724	22731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017643	CACG	2	8	22841	22848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017643	CGTT	2	8	23044	23051	0 %	50 %	25 %	25 %	386617302
77	NC_017643	TTTG	2	8	23116	23123	0 %	75 %	25 %	0 %	386617302
78	NC_017643	TTTA	2	8	25812	25819	25 %	75 %	0 %	0 %	386617304
79	NC_017643	GAAA	2	8	25835	25842	75 %	0 %	25 %	0 %	386617304
80	NC_017643	ATAA	2	8	26038	26045	75 %	25 %	0 %	0 %	386617304
81	NC_017643	AACA	2	8	26426	26433	75 %	0 %	0 %	25 %	386617305
82	NC_017643	TAAT	2	8	26659	26666	50 %	50 %	0 %	0 %	386617305
83	NC_017643	TCTG	2	8	28176	28183	0 %	50 %	25 %	25 %	386617307
84	NC_017643	GGCG	2	8	28515	28522	0 %	0 %	75 %	25 %	386617308
85	NC_017643	GCGG	2	8	28642	28649	0 %	0 %	75 %	25 %	386617308
86	NC_017643	ATTC	2	8	29430	29437	25 %	50 %	0 %	25 %	386617308
87	NC_017643	AGGG	2	8	30455	30462	25 %	0 %	75 %	0 %	386617308
88	NC_017643	CCGT	2	8	30659	30666	0 %	25 %	25 %	50 %	386617308
89	NC_017643	CAGG	2	8	30709	30716	25 %	0 %	50 %	25 %	386617308
90	NC_017643	CATC	2	8	30843	30850	25 %	25 %	0 %	50 %	386617308
91	NC_017643	CCGG	2	8	34657	34664	0 %	0 %	50 %	50 %	386617313
92	NC_017643	CAGC	2	8	34901	34908	25 %	0 %	25 %	50 %	386617313
93	NC_017643	CGGC	2	8	36295	36302	0 %	0 %	50 %	50 %	386617314
94	NC_017643	CAGC	2	8	36952	36959	25 %	0 %	25 %	50 %	386617315
95	NC_017643	GGGC	2	8	38043	38050	0 %	0 %	75 %	25 %	386617317
96	NC_017643	GCAG	2	8	38129	38136	25 %	0 %	50 %	25 %	386617317
97	NC_017643	CTGC	2	8	38181	38188	0 %	25 %	25 %	50 %	386617317
98	NC_017643	TTTG	2	8	38535	38542	0 %	75 %	25 %	0 %	386617317
99	NC_017643	TGGC	2	8	38609	38616	0 %	25 %	50 %	25 %	386617317
100	NC_017643	GGCT	2	8	38970	38977	0 %	25 %	50 %	25 %	386617317
101	NC_017643	CTGG	2	8	38980	38987	0 %	25 %	50 %	25 %	386617317
102	NC_017643	ATCC	2	8	39070	39077	25 %	25 %	0 %	50 %	386617317
103	NC_017643	CATT	2	8	39789	39796	25 %	50 %	0 %	25 %	386617317
104	NC_017643	CCGT	2	8	40361	40368	0 %	25 %	25 %	50 %	386617317
105	NC_017643	CCAT	2	8	40754	40761	25 %	25 %	0 %	50 %	386617317
106	NC_017643	AAAG	2	8	41166	41173	75 %	0 %	25 %	0 %	386617318
107	NC_017643	ACGG	2	8	41447	41454	25 %	0 %	50 %	25 %	386617319
108	NC_017643	ACTG	2	8	41481	41488	25 %	25 %	25 %	25 %	386617319
109	NC_017643	CGTC	2	8	41534	41541	0 %	25 %	25 %	50 %	386617319
110	NC_017643	CAGA	2	8	41683	41690	50 %	0 %	25 %	25 %	386617319
111	NC_017643	GTCA	2	8	42268	42275	25 %	25 %	25 %	25 %	386617319
112	NC_017643	GGGC	2	8	42814	42821	0 %	0 %	75 %	25 %	386617320
113	NC_017643	TTCA	2	8	43134	43141	25 %	50 %	0 %	25 %	386617320
114	NC_017643	CGCC	2	8	43331	43338	0 %	0 %	25 %	75 %	386617321
115	NC_017643	ATGG	2	8	43394	43401	25 %	25 %	50 %	0 %	386617321
116	NC_017643	CGGG	2	8	43592	43599	0 %	0 %	75 %	25 %	386617321
117	NC_017643	GCCA	2	8	43659	43666	25 %	0 %	25 %	50 %	386617321
118	NC_017643	CTTT	2	8	44054	44061	0 %	75 %	0 %	25 %	386617322
119	NC_017643	GTTG	2	8	44518	44525	0 %	50 %	50 %	0 %	386617323
120	NC_017643	ATTT	2	8	44723	44730	25 %	75 %	0 %	0 %	386617324
121	NC_017643	ATTT	2	8	45238	45245	25 %	75 %	0 %	0 %	386617325
122	NC_017643	CAGC	2	8	45859	45866	25 %	0 %	25 %	50 %	386617325
123	NC_017643	AGAA	2	8	46308	46315	75 %	0 %	25 %	0 %	386617326
124	NC_017643	CGAT	2	8	46698	46705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017643	ATTT	2	8	46722	46729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017643	GAAA	2	8	46972	46979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017643	CCGG	2	8	47628	47635	0 %	0 %	50 %	50 %	386617327
128	NC_017643	GAAA	2	8	47730	47737	75 %	0 %	25 %	0 %	386617327
129	NC_017643	CTGC	2	8	48145	48152	0 %	25 %	25 %	50 %	386617327
130	NC_017643	GCTG	2	8	48279	48286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017643	TCCG	2	8	48363	48370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017643	ATCA	2	8	49006	49013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017643	ATTT	2	8	49528	49535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017643	GATT	2	8	49614	49621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017643	ACTC	2	8	49783	49790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017643	TGGA	2	8	49879	49886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017643	TTTG	2	8	50163	50170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017643	AAAC	2	8	50497	50504	75 %	0 %	0 %	25 %	386617329
139	NC_017643	TTTG	2	8	50575	50582	0 %	75 %	25 %	0 %	386617329
140	NC_017643	AAAG	2	8	50964	50971	75 %	0 %	25 %	0 %	386617329
141	NC_017643	AAAT	2	8	51075	51082	75 %	25 %	0 %	0 %	386617330
142	NC_017643	AGGC	2	8	51434	51441	25 %	0 %	50 %	25 %	386617330
143	NC_017643	ATAA	2	8	51508	51515	75 %	25 %	0 %	0 %	386617330
144	NC_017643	AATC	2	8	51573	51580	50 %	25 %	0 %	25 %	386617330
145	NC_017643	TGGT	2	8	52181	52188	0 %	50 %	50 %	0 %	386617330
146	NC_017643	GCAT	2	8	52806	52813	25 %	25 %	25 %	25 %	386617330
147	NC_017643	ATTA	2	8	53937	53944	50 %	50 %	0 %	0 %	386617330
148	NC_017643	TTGC	2	8	54297	54304	0 %	50 %	25 %	25 %	386617331
149	NC_017643	TCAT	2	8	54993	55000	25 %	50 %	0 %	25 %	386617331
150	NC_017643	AATC	2	8	55143	55150	50 %	25 %	0 %	25 %	386617331
151	NC_017643	ACAA	2	8	55228	55235	75 %	0 %	0 %	25 %	386617331
152	NC_017643	TGCT	2	8	55402	55409	0 %	50 %	25 %	25 %	386617331
153	NC_017643	AATT	2	8	55696	55703	50 %	50 %	0 %	0 %	386617331
154	NC_017643	TTAT	2	8	55882	55889	25 %	75 %	0 %	0 %	386617331
155	NC_017643	GTCT	2	8	56146	56153	0 %	50 %	25 %	25 %	386617331
156	NC_017643	AGAA	2	8	56284	56291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017643	AATT	2	8	56440	56447	50 %	50 %	0 %	0 %	386617332
158	NC_017643	AGTC	2	8	56647	56654	25 %	25 %	25 %	25 %	386617332
159	NC_017643	TAAA	2	8	56785	56792	75 %	25 %	0 %	0 %	386617332
160	NC_017643	AATA	2	8	57075	57082	75 %	25 %	0 %	0 %	386617332
161	NC_017643	ACAA	2	8	57215	57222	75 %	0 %	0 %	25 %	386617332
162	NC_017643	CAAT	2	8	58554	58561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_017643	TCAG	2	8	58876	58883	25 %	25 %	25 %	25 %	386617334
164	NC_017643	GGAT	2	8	59113	59120	25 %	25 %	50 %	0 %	386617334
165	NC_017643	AGAA	2	8	59389	59396	75 %	0 %	25 %	0 %	386617334
166	NC_017643	TGGC	2	8	59409	59416	0 %	25 %	50 %	25 %	386617334
167	NC_017643	CTGA	2	8	59451	59458	25 %	25 %	25 %	25 %	386617334
168	NC_017643	AGGC	2	8	59668	59675	25 %	0 %	50 %	25 %	386617334
169	NC_017643	TGGC	2	8	59904	59911	0 %	25 %	50 %	25 %	386617334
170	NC_017643	ACCC	2	8	60505	60512	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
171	NC_017643	TATT	2	8	60604	60611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017643	TTTA	2	8	60770	60777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017643	GACT	2	8	60912	60919	25 %	25 %	25 %	25 %	386617336
174	NC_017643	TGCC	2	8	61254	61261	0 %	25 %	25 %	50 %	386617336
175	NC_017643	GATG	2	8	61432	61439	25 %	25 %	50 %	0 %	386617336
176	NC_017643	AGAA	2	8	61865	61872	75 %	0 %	25 %	0 %	386617337
177	NC_017643	GACA	2	8	61962	61969	50 %	0 %	25 %	25 %	386617337
178	NC_017643	TCGT	2	8	62036	62043	0 %	50 %	25 %	25 %	386617337
179	NC_017643	CCTG	2	8	62091	62098	0 %	25 %	25 %	50 %	386617337
180	NC_017643	CTGG	2	8	62364	62371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
181	NC_017643	TGCG	2	8	62611	62618	0 %	25 %	50 %	25 %	386617338
182	NC_017643	GCAG	2	8	63100	63107	25 %	0 %	50 %	25 %	386617338
183	NC_017643	ATGA	2	8	63349	63356	50 %	25 %	25 %	0 %	386617339
184	NC_017643	GTTG	2	8	63574	63581	0 %	50 %	50 %	0 %	386617339
185	NC_017643	GCGG	2	8	63955	63962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
186	NC_017643	CAGT	2	8	64243	64250	25 %	25 %	25 %	25 %	386617340
187	NC_017643	TGCA	2	8	65294	65301	25 %	25 %	25 %	25 %	386617341
188	NC_017643	TGGA	2	8	65432	65439	25 %	25 %	50 %	0 %	386617341

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.