MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	TG	3	6	334	339	0 %	50 %	50 %	0 %	386612082
2	NC_017640	AG	3	6	632	637	50 %	0 %	50 %	0 %	386612082
3	NC_017640	TA	3	6	1194	1199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017640	TA	3	6	1242	1247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017640	GT	3	6	1473	1478	0 %	50 %	50 %	0 %	386612083
6	NC_017640	GC	3	6	2094	2099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017640	AG	3	6	2275	2280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017640	AT	3	6	2483	2488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017640	AT	4	8	2562	2569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017640	CT	3	6	3400	3405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017640	AT	3	6	3828	3833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017640	TA	4	8	3888	3895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017640	AT	3	6	4062	4067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017640	TA	3	6	4255	4260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017640	TA	3	6	4364	4369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017640	TA	3	6	4376	4381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017640	CT	3	6	4816	4821	0 %	50 %	0 %	50 %	386612084
18	NC_017640	AT	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
19	NC_017640	AT	3	6	5098	5103	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
20	NC_017640	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017640	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017640	TG	3	6	6040	6045	0 %	50 %	50 %	0 %	386612085
23	NC_017640	CA	3	6	6148	6153	50 %	0 %	0 %	50 %	386612085
24	NC_017640	CT	3	6	7851	7856	0 %	50 %	0 %	50 %	386612088
25	NC_017640	AT	3	6	10029	10034	50 %	50 %	0 %	0 %	386612090
26	NC_017640	CT	3	6	10587	10592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017640	GT	3	6	11758	11763	0 %	50 %	50 %	0 %	386612091
28	NC_017640	AG	3	6	12518	12523	50 %	0 %	50 %	0 %	386612091
29	NC_017640	AG	3	6	13473	13478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017640	AT	3	6	14683	14688	50 %	50 %	0 %	0 %	386612096
31	NC_017640	CA	3	6	14804	14809	50 %	0 %	0 %	50 %	386612096
32	NC_017640	AG	3	6	15142	15147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017640	TG	3	6	16181	16186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017640	AG	3	6	16448	16453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017640	TG	3	6	16569	16574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017640	TA	3	6	16681	16686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017640	GC	3	6	16694	16699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017640	TG	3	6	16712	16717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017640	TG	3	6	16804	16809	0 %	50 %	50 %	0 %	386612099
40	NC_017640	GC	3	6	16852	16857	0 %	0 %	50 %	50 %	386612099
41	NC_017640	CT	3	6	17095	17100	0 %	50 %	0 %	50 %	386612099
42	NC_017640	GT	3	6	17169	17174	0 %	50 %	50 %	0 %	386612099
43	NC_017640	CA	3	6	17726	17731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017640	TA	3	6	17829	17834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017640	AC	3	6	18141	18146	50 %	0 %	0 %	50 %	386612100
46	NC_017640	TA	3	6	18753	18758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017640	AT	3	6	19465	19470	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
48	NC_017640	TA	4	8	19786	19793	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
49	NC_017640	AT	3	6	19906	19911	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
50	NC_017640	GA	3	6	20058	20063	50 %	0 %	50 %	0 %	386612101
51	NC_017640	AT	3	6	20161	20166	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
52	NC_017640	AT	3	6	20230	20235	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
53	NC_017640	CT	3	6	20300	20305	0 %	50 %	0 %	50 %	386612102
54	NC_017640	AC	3	6	20359	20364	50 %	0 %	0 %	50 %	386612102
55	NC_017640	AT	3	6	20367	20372	50 %	50 %	0 %	0 %	386612102
56	NC_017640	TA	3	6	20664	20669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017640	CA	3	6	20789	20794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017640	CT	3	6	22700	22705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017640	TG	3	6	23496	23501	0 %	50 %	50 %	0 %	386612106
60	NC_017640	AT	3	6	23655	23660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017640	CA	3	6	23726	23731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017640	CA	3	6	24418	24423	50 %	0 %	0 %	50 %	386612107
63	NC_017640	GT	3	6	25597	25602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017640	GA	3	6	27079	27084	50 %	0 %	50 %	0 %	386612109
65	NC_017640	TG	3	6	27910	27915	0 %	50 %	50 %	0 %	386612109
66	NC_017640	GC	3	6	27988	27993	0 %	0 %	50 %	50 %	386612109
67	NC_017640	CT	3	6	28031	28036	0 %	50 %	0 %	50 %	386612109
68	NC_017640	TG	3	6	28531	28536	0 %	50 %	50 %	0 %	386612109
69	NC_017640	CT	3	6	29061	29066	0 %	50 %	0 %	50 %	386612109
70	NC_017640	CT	3	6	29122	29127	0 %	50 %	0 %	50 %	386612109
71	NC_017640	GT	3	6	30439	30444	0 %	50 %	50 %	0 %	386612109
72	NC_017640	CA	3	6	31846	31851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017640	GT	3	6	32185	32190	0 %	50 %	50 %	0 %	386612110
74	NC_017640	AT	3	6	32805	32810	50 %	50 %	0 %	0 %	386612110
75	NC_017640	AT	3	6	33990	33995	50 %	50 %	0 %	0 %	386612111
76	NC_017640	TG	3	6	35975	35980	0 %	50 %	50 %	0 %	386612113
77	NC_017640	AC	3	6	36159	36164	50 %	0 %	0 %	50 %	386612113
78	NC_017640	GT	3	6	37950	37955	0 %	50 %	50 %	0 %	386612114
79	NC_017640	TG	3	6	38708	38713	0 %	50 %	50 %	0 %	386612114
80	NC_017640	AT	3	6	39273	39278	50 %	50 %	0 %	0 %	386612116
81	NC_017640	GA	3	6	40011	40016	50 %	0 %	50 %	0 %	386612116
82	NC_017640	TG	3	6	40346	40351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017640	TG	3	6	42570	42575	0 %	50 %	50 %	0 %	386612120
84	NC_017640	AT	3	6	44237	44242	50 %	50 %	0 %	0 %	386612121
85	NC_017640	TC	3	6	44282	44287	0 %	50 %	0 %	50 %	386612122
86	NC_017640	AC	3	6	44625	44630	50 %	0 %	0 %	50 %	386612122
87	NC_017640	CG	3	6	47617	47622	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
88	NC_017640	TG	3	6	47666	47671	0 %	50 %	50 %	0 %	386612126
89	NC_017640	GC	3	6	48085	48090	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
90	NC_017640	CA	3	6	48291	48296	50 %	0 %	0 %	50 %	386612126
91	NC_017640	CT	3	6	48554	48559	0 %	50 %	0 %	50 %	386612126
92	NC_017640	GC	3	6	48560	48565	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
93	NC_017640	AC	3	6	49148	49153	50 %	0 %	0 %	50 %	386612126
94	NC_017640	TG	3	6	49268	49273	0 %	50 %	50 %	0 %	386612126
95	NC_017640	CG	3	6	49584	49589	0 %	0 %	50 %	50 %	386612126
96	NC_017640	CG	3	6	51625	51630	0 %	0 %	50 %	50 %	386612129
97	NC_017640	GC	3	6	52320	52325	0 %	0 %	50 %	50 %	386612130
98	NC_017640	GC	3	6	53383	53388	0 %	0 %	50 %	50 %	386612131
99	NC_017640	AT	3	6	54327	54332	50 %	50 %	0 %	0 %	386612132
100	NC_017640	AG	3	6	54539	54544	50 %	0 %	50 %	0 %	386612132
101	NC_017640	CT	3	6	55391	55396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017640	TA	3	6	56173	56178	50 %	50 %	0 %	0 %	386612135
103	NC_017640	CT	3	6	56180	56185	0 %	50 %	0 %	50 %	386612135
104	NC_017640	CA	3	6	56367	56372	50 %	0 %	0 %	50 %	386612135
105	NC_017640	TC	3	6	56613	56618	0 %	50 %	0 %	50 %	386612136
106	NC_017640	GA	3	6	56677	56682	50 %	0 %	50 %	0 %	386612136
107	NC_017640	AT	3	6	57087	57092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017640	CA	4	8	57925	57932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017640	TA	4	8	57993	58000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017640	GA	3	6	59088	59093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017640	CT	4	8	59409	59416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017640	GC	3	6	60134	60139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017640	AC	3	6	60427	60432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017640	AC	4	8	60438	60445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017640	CA	3	6	60592	60597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017640	CT	3	6	60820	60825	0 %	50 %	0 %	50 %	386612140
117	NC_017640	GA	3	6	61652	61657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017640	CA	3	6	62017	62022	50 %	0 %	0 %	50 %	386612141
119	NC_017640	AC	4	8	62736	62743	50 %	0 %	0 %	50 %	386612141
120	NC_017640	AT	3	6	63915	63920	50 %	50 %	0 %	0 %	386612141
121	NC_017640	CT	3	6	63975	63980	0 %	50 %	0 %	50 %	386612142
122	NC_017640	GC	3	6	64586	64591	0 %	0 %	50 %	50 %	386612142
123	NC_017640	GC	3	6	65567	65572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017640	CA	3	6	65960	65965	50 %	0 %	0 %	50 %	386612144
125	NC_017640	GC	3	6	66151	66156	0 %	0 %	50 %	50 %	386612144
126	NC_017640	TC	3	6	67359	67364	0 %	50 %	0 %	50 %	386612145
127	NC_017640	CG	3	6	67534	67539	0 %	0 %	50 %	50 %	386612145
128	NC_017640	CG	3	6	68828	68833	0 %	0 %	50 %	50 %	386612146
129	NC_017640	GA	3	6	69898	69903	50 %	0 %	50 %	0 %	386612148
130	NC_017640	CA	3	6	70527	70532	50 %	0 %	0 %	50 %	386612150
131	NC_017640	GT	4	8	71210	71217	0 %	50 %	50 %	0 %	386612151
132	NC_017640	GC	3	6	71471	71476	0 %	0 %	50 %	50 %	386612151
133	NC_017640	GC	3	6	71836	71841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017640	TA	3	6	73385	73390	50 %	50 %	0 %	0 %	386612153
135	NC_017640	TA	4	8	73433	73440	50 %	50 %	0 %	0 %	386612153
136	NC_017640	AT	3	6	73754	73759	50 %	50 %	0 %	0 %	386612153
137	NC_017640	CA	4	8	74039	74046	50 %	0 %	0 %	50 %	386612153
138	NC_017640	CA	3	6	75597	75602	50 %	0 %	0 %	50 %	386612155
139	NC_017640	CA	3	6	76448	76453	50 %	0 %	0 %	50 %	386612156
140	NC_017640	CG	3	6	76505	76510	0 %	0 %	50 %	50 %	386612156
141	NC_017640	GA	3	6	76755	76760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017640	GA	3	6	77536	77541	50 %	0 %	50 %	0 %	386612157
143	NC_017640	CT	3	6	77627	77632	0 %	50 %	0 %	50 %	386612157
144	NC_017640	TC	3	6	77974	77979	0 %	50 %	0 %	50 %	386612157
145	NC_017640	AT	3	6	79287	79292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017640	AT	3	6	79340	79345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017640	AC	3	6	80871	80876	50 %	0 %	0 %	50 %	386612162
148	NC_017640	AC	3	6	81387	81392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.