MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Escherichia coli DH1

Total Repeats: 94885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017638	TGC	2	6	48221	48226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1003	NC_017638	TGG	2	6	48254	48259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619820
1004	NC_017638	GAT	2	6	48261	48266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619820
1005	NC_017638	CGA	3	9	48293	48301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1006	NC_017638	CT	3	6	48314	48319	0 %	50 %	0 %	50 %	387619820
1007	NC_017638	GCTGGT	2	12	48342	48353	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387619820
1008	NC_017638	TGC	2	6	48464	48469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1009	NC_017638	CGATGG	2	12	48488	48499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387619820
1010	NC_017638	GGCG	2	8	48510	48517	0 %	0 %	75 %	25 %	387619820
1011	NC_017638	CTG	2	6	48520	48525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1012	NC_017638	GCT	2	6	48633	48638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1013	NC_017638	TGC	2	6	48665	48670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1014	NC_017638	TCA	3	9	48680	48688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619820
1015	NC_017638	CGT	2	6	48742	48747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1016	NC_017638	GTT	2	6	48759	48764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619820
1017	NC_017638	AGGGC	2	10	48765	48774	20 %	0 %	60 %	20 %	387619820
1018	NC_017638	GGCGC	2	10	48799	48808	0 %	0 %	60 %	40 %	387619820
1019	NC_017638	GCA	2	6	48874	48879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1020	NC_017638	CTG	2	6	48889	48894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1021	NC_017638	TCT	2	6	48919	48924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619820
1022	NC_017638	CGA	2	6	48954	48959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619820
1023	NC_017638	CG	3	6	48968	48973	0 %	0 %	50 %	50 %	387619820
1024	NC_017638	TGG	2	6	49043	49048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619820
1025	NC_017638	GGAT	2	8	49124	49131	25 %	25 %	50 %	0 %	387619820
1026	NC_017638	GCG	2	6	49150	49155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619820
1027	NC_017638	CGA	2	6	49182	49187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619820
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1029	NC_017638	ATT	2	6	49246	49251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387619820
1030	NC_017638	GCCCGC	2	12	49252	49263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619820
1031	NC_017638	CAGG	2	8	49291	49298	25 %	0 %	50 %	25 %	387619820
1032	NC_017638	CCG	2	6	49410	49415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619820
1033	NC_017638	TGG	2	6	49430	49435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619820
1034	NC_017638	CG	3	6	49471	49476	0 %	0 %	50 %	50 %	387619820
1035	NC_017638	TGGC	2	8	49557	49564	0 %	25 %	50 %	25 %	387619820
1036	NC_017638	GAA	2	6	49573	49578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387619820
1037	NC_017638	GAAAC	2	10	49612	49621	60 %	0 %	20 %	20 %	387619820
1038	NC_017638	TAA	2	6	49630	49635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387619820
1039	NC_017638	TGTT	2	8	49667	49674	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017638	GCG	2	6	49691	49696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017638	GA	3	6	49705	49710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017638	CAG	2	6	49723	49728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619821
1043	NC_017638	CAT	2	6	49748	49753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619821
1044	NC_017638	CGA	2	6	49766	49771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619821
1045	NC_017638	T	8	8	49802	49809	0 %	100 %	0 %	0 %	387619821
1046	NC_017638	GCG	2	6	49839	49844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619821
1047	NC_017638	CCTG	2	8	49892	49899	0 %	25 %	25 %	50 %	387619821
1048	NC_017638	TAAA	2	8	49930	49937	75 %	25 %	0 %	0 %	387619821
1049	NC_017638	GCC	2	6	49951	49956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619821
1050	NC_017638	AATC	2	8	49966	49973	50 %	25 %	0 %	25 %	387619821
1051	NC_017638	GTC	2	6	49975	49980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619821
1052	NC_017638	CAG	2	6	50009	50014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619821
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1055	NC_017638	GCG	2	6	50294	50299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619821
1056	NC_017638	CGC	3	9	50387	50395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619822
1057	NC_017638	GCAG	2	8	50455	50462	25 %	0 %	50 %	25 %	387619822
1058	NC_017638	ACC	2	6	50471	50476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619822
1059	NC_017638	CAG	3	9	50478	50486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619822
1060	NC_017638	TA	3	6	50502	50507	50 %	50 %	0 %	0 %	387619822
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1063	NC_017638	GCG	2	6	50848	50853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619822
1064	NC_017638	TCG	2	6	50889	50894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619822
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1067	NC_017638	TCG	2	6	50934	50939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619822
1068	NC_017638	CAG	2	6	50954	50959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619822
1069	NC_017638	CAG	2	6	51011	51016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619822
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1071	NC_017638	GCA	2	6	51163	51168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619822
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1073	NC_017638	AATG	2	8	51232	51239	50 %	25 %	25 %	0 %	387619823
1074	NC_017638	GCCATT	2	12	51437	51448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387619823
1075	NC_017638	CAA	2	6	51470	51475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387619823
1076	NC_017638	AACGT	2	10	51524	51533	40 %	20 %	20 %	20 %	387619823
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1082	NC_017638	ACG	2	6	51857	51862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619824
1083	NC_017638	GTG	3	9	51879	51887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619824
1084	NC_017638	CGG	2	6	51898	51903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619824
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1088	NC_017638	GCC	2	6	52283	52288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619824
1089	NC_017638	TGG	2	6	52412	52417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619824
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1092	NC_017638	CGGCGT	2	12	52637	52648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387619825
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1094	NC_017638	AAT	2	6	52737	52742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387619825
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1099	NC_017638	CGT	2	6	53033	53038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619825
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1103	NC_017638	CGG	2	6	53372	53377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619825
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1107	NC_017638	TCA	2	6	53497	53502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619826
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1110	NC_017638	GA	3	6	53716	53721	50 %	0 %	50 %	0 %	387619826
1111	NC_017638	GCA	2	6	53736	53741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619826
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1113	NC_017638	GTCA	2	8	53804	53811	25 %	25 %	25 %	25 %	387619826
1114	NC_017638	CAG	2	6	53828	53833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619826
1115	NC_017638	CGC	2	6	53878	53883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619826
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1117	NC_017638	TTC	2	6	53949	53954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619826
1118	NC_017638	GCC	2	6	54017	54022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619826
1119	NC_017638	CTG	2	6	54032	54037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619826
1120	NC_017638	GC	4	8	54102	54109	0 %	0 %	50 %	50 %	387619826
1121	NC_017638	CGT	2	6	54196	54201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619826
1122	NC_017638	CTG	2	6	54215	54220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619826
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1237	NC_017638	ATG	2	6	59358	59363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1239	NC_017638	CGT	2	6	59392	59397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1242	NC_017638	A	6	6	59614	59619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_017638	CAA	2	6	59766	59771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387619831
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1246	NC_017638	CCA	2	6	59921	59926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619831
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1248	NC_017638	GATG	2	8	60034	60041	25 %	25 %	50 %	0 %	387619831
1249	NC_017638	GCTCGC	2	12	60074	60085	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387619831
1250	NC_017638	CGC	2	6	60140	60145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619831
1251	NC_017638	CTGC	2	8	60176	60183	0 %	25 %	25 %	50 %	387619831
1252	NC_017638	TCA	2	6	60206	60211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619831
1253	NC_017638	GAC	2	6	60233	60238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619831
1254	NC_017638	ACA	2	6	60248	60253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387619831
1255	NC_017638	TTG	2	6	60265	60270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619831
1256	NC_017638	ACC	2	6	60271	60276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619831
1257	NC_017638	ATA	2	6	60277	60282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387619831
1258	NC_017638	AACC	2	8	60303	60310	50 %	0 %	0 %	50 %	387619831
1259	NC_017638	CCTG	2	8	60405	60412	0 %	25 %	25 %	50 %	387619832
1260	NC_017638	CTG	2	6	60431	60436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619832
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1263	NC_017638	ATCA	2	8	60554	60561	50 %	25 %	0 %	25 %	387619832
1264	NC_017638	CTG	2	6	60620	60625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1265	NC_017638	TGC	2	6	60643	60648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619832
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1271	NC_017638	T	6	6	60849	60854	0 %	100 %	0 %	0 %	387619832
1272	NC_017638	TGC	2	6	60868	60873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619832
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1278	NC_017638	ATA	2	6	61089	61094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387619832
1279	NC_017638	CAG	2	6	61199	61204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1280	NC_017638	GAC	2	6	61477	61482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1281	NC_017638	GCT	2	6	61489	61494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1282	NC_017638	TGGC	2	8	61536	61543	0 %	25 %	50 %	25 %	387619832
1283	NC_017638	CAG	2	6	61583	61588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1284	NC_017638	TCT	2	6	61605	61610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619832
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1287	NC_017638	CCA	2	6	61811	61816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619832
1288	NC_017638	TCGCTG	2	12	62085	62096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1289	NC_017638	TGC	2	6	62099	62104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1290	NC_017638	ATC	2	6	62136	62141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619832
1291	NC_017638	CAG	2	6	62186	62191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1292	NC_017638	CAG	2	6	62273	62278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1293	NC_017638	CAG	3	9	62330	62338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619832
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1299	NC_017638	CAG	2	6	62665	62670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619832
1300	NC_017638	AG	3	6	62675	62680	50 %	0 %	50 %	0 %	387619832
1301	NC_017638	ATC	2	6	62697	62702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619832
1302	NC_017638	CAGC	2	8	62737	62744	25 %	0 %	25 %	50 %	387619832
1303	NC_017638	CG	3	6	62749	62754	0 %	0 %	50 %	50 %	387619832
1304	NC_017638	GGC	2	6	62761	62766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619832
1305	NC_017638	CAT	2	6	62773	62778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619832
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1308	NC_017638	CTT	2	6	63046	63051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619832
1309	NC_017638	TGCG	2	8	63130	63137	0 %	25 %	50 %	25 %	387619832
1310	NC_017638	AAAGT	2	10	63166	63175	60 %	20 %	20 %	0 %	387619832
1311	NC_017638	ACC	2	6	63302	63307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1312	NC_017638	GTG	2	6	63329	63334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1313	NC_017638	T	8	8	63420	63427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1314	NC_017638	GTG	2	6	63543	63548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619833
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1328	NC_017638	TTC	3	9	64099	64107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619833
1329	NC_017638	CGT	2	6	64161	64166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619833
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1331	NC_017638	TGA	2	6	64208	64213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619833
1332	NC_017638	CGA	2	6	64228	64233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619833
1333	NC_017638	GAA	2	6	64249	64254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387619833
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1336	NC_017638	GGCA	2	8	64382	64389	25 %	0 %	50 %	25 %	387619833
1337	NC_017638	CCA	2	6	64464	64469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619833
1338	NC_017638	ATCA	2	8	64480	64487	50 %	25 %	0 %	25 %	387619833
1339	NC_017638	GAT	2	6	64498	64503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619833
1340	NC_017638	CCAGCA	2	12	64527	64538	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387619833
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1343	NC_017638	GCC	2	6	64667	64672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619833
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1345	NC_017638	CGG	2	6	64823	64828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619833
1346	NC_017638	A	6	6	64984	64989	100 %	0 %	0 %	0 %	387619833
1347	NC_017638	TAT	2	6	65031	65036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387619833
1348	NC_017638	GCA	2	6	65082	65087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619833
1349	NC_017638	CAC	2	6	65104	65109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619833
1350	NC_017638	GAT	2	6	65119	65124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619833
1351	NC_017638	GCGG	2	8	65175	65182	0 %	0 %	75 %	25 %	387619833
1352	NC_017638	GAG	2	6	65213	65218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387619833
1353	NC_017638	GGT	2	6	65302	65307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619833
1354	NC_017638	GCG	2	6	65334	65339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619833
1355	NC_017638	GGTGA	2	10	65414	65423	20 %	20 %	60 %	0 %	387619833
1356	NC_017638	TCA	2	6	65511	65516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619833
1357	NC_017638	CGG	2	6	65640	65645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619833
1358	NC_017638	GCCA	2	8	65705	65712	25 %	0 %	25 %	50 %	387619833
1359	NC_017638	CCTG	2	8	65768	65775	0 %	25 %	25 %	50 %	387619833
1360	NC_017638	A	6	6	65796	65801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1361	NC_017638	CAG	2	6	65907	65912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619834
1362	NC_017638	TGC	2	6	65917	65922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619834
1363	NC_017638	GCG	2	6	65936	65941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619834
1364	NC_017638	GTGG	2	8	66198	66205	0 %	25 %	75 %	0 %	387619834
1365	NC_017638	TGG	2	6	66245	66250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619834
1366	NC_017638	GCC	2	6	66276	66281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619834
1367	NC_017638	AGC	2	6	66304	66309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619834
1368	NC_017638	GGA	2	6	66327	66332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387619834
1369	NC_017638	CGC	2	6	66440	66445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619834
1370	NC_017638	TCT	2	6	66541	66546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619834
1371	NC_017638	CGA	2	6	66840	66845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619835
1372	NC_017638	CAGCG	2	10	66867	66876	20 %	0 %	40 %	40 %	387619835
1373	NC_017638	GT	3	6	66898	66903	0 %	50 %	50 %	0 %	387619835
1374	NC_017638	ATCA	2	8	66908	66915	50 %	25 %	0 %	25 %	387619835
1375	NC_017638	GC	3	6	66994	66999	0 %	0 %	50 %	50 %	387619835
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