MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	GT	3	6	356	361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017637	TG	3	6	1272	1277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017637	CG	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	386611791
4	NC_017637	TG	4	8	2766	2773	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
5	NC_017637	TG	3	6	3488	3493	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
6	NC_017637	TC	3	6	3854	3859	0 %	50 %	0 %	50 %	386611792
7	NC_017637	GT	3	6	6703	6708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017637	AT	3	6	7132	7137	50 %	50 %	0 %	0 %	386611796
9	NC_017637	GC	3	6	8068	8073	0 %	0 %	50 %	50 %	386611797
10	NC_017637	CT	3	6	8949	8954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017637	CG	3	6	9250	9255	0 %	0 %	50 %	50 %	386611799
12	NC_017637	CA	3	6	10490	10495	50 %	0 %	0 %	50 %	386611802
13	NC_017637	GT	3	6	10980	10985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017637	GA	3	6	11111	11116	50 %	0 %	50 %	0 %	386611803
15	NC_017637	GC	3	6	11463	11468	0 %	0 %	50 %	50 %	386611804
16	NC_017637	TC	3	6	12381	12386	0 %	50 %	0 %	50 %	386611805
17	NC_017637	TC	3	6	12600	12605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017637	TC	3	6	12892	12897	0 %	50 %	0 %	50 %	386611806
19	NC_017637	CA	3	6	14676	14681	50 %	0 %	0 %	50 %	386611807
20	NC_017637	CA	3	6	15119	15124	50 %	0 %	0 %	50 %	386611807
21	NC_017637	GA	3	6	17162	17167	50 %	0 %	50 %	0 %	386611808
22	NC_017637	CA	3	6	17380	17385	50 %	0 %	0 %	50 %	386611808
23	NC_017637	CA	3	6	18472	18477	50 %	0 %	0 %	50 %	386611809
24	NC_017637	AG	3	6	18909	18914	50 %	0 %	50 %	0 %	386611809
25	NC_017637	CT	3	6	19696	19701	0 %	50 %	0 %	50 %	386611810
26	NC_017637	TG	3	6	20095	20100	0 %	50 %	50 %	0 %	386611810
27	NC_017637	AT	3	6	20916	20921	50 %	50 %	0 %	0 %	386611811
28	NC_017637	TA	3	6	21173	21178	50 %	50 %	0 %	0 %	386611811
29	NC_017637	AG	3	6	21604	21609	50 %	0 %	50 %	0 %	386611811
30	NC_017637	AT	3	6	22768	22773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017637	TG	3	6	23276	23281	0 %	50 %	50 %	0 %	386611813
32	NC_017637	AT	3	6	23373	23378	50 %	50 %	0 %	0 %	386611813
33	NC_017637	TA	3	6	23705	23710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017637	TC	3	6	23742	23747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017637	AT	3	6	23767	23772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017637	AT	4	8	24191	24198	50 %	50 %	0 %	0 %	386611814
37	NC_017637	CT	3	6	25027	25032	0 %	50 %	0 %	50 %	386611814
38	NC_017637	CA	3	6	25985	25990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017637	AT	3	6	26929	26934	50 %	50 %	0 %	0 %	386611816
40	NC_017637	GT	3	6	27242	27247	0 %	50 %	50 %	0 %	386611816
41	NC_017637	AG	3	6	28854	28859	50 %	0 %	50 %	0 %	386611818
42	NC_017637	GC	3	6	29298	29303	0 %	0 %	50 %	50 %	386611818
43	NC_017637	AG	3	6	29691	29696	50 %	0 %	50 %	0 %	386611818
44	NC_017637	CA	3	6	29697	29702	50 %	0 %	0 %	50 %	386611818
45	NC_017637	TG	3	6	30596	30601	0 %	50 %	50 %	0 %	386611818
46	NC_017637	AG	3	6	31294	31299	50 %	0 %	50 %	0 %	386611818
47	NC_017637	AG	3	6	31755	31760	50 %	0 %	50 %	0 %	386611819
48	NC_017637	GT	3	6	32177	32182	0 %	50 %	50 %	0 %	386611819
49	NC_017637	AT	3	6	33033	33038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017637	TG	3	6	34068	34073	0 %	50 %	50 %	0 %	386611823
51	NC_017637	AT	3	6	34967	34972	50 %	50 %	0 %	0 %	386611824
52	NC_017637	AG	3	6	36235	36240	50 %	0 %	50 %	0 %	386611825
53	NC_017637	GA	3	6	37656	37661	50 %	0 %	50 %	0 %	386611828
54	NC_017637	CT	3	6	38568	38573	0 %	50 %	0 %	50 %	386611828
55	NC_017637	TG	3	6	38703	38708	0 %	50 %	50 %	0 %	386611828
56	NC_017637	GA	3	6	41616	41621	50 %	0 %	50 %	0 %	386611830
57	NC_017637	AT	3	6	41726	41731	50 %	50 %	0 %	0 %	386611830
58	NC_017637	AT	3	6	42537	42542	50 %	50 %	0 %	0 %	386611832
59	NC_017637	AT	3	6	42897	42902	50 %	50 %	0 %	0 %	386611832
60	NC_017637	GA	3	6	44290	44295	50 %	0 %	50 %	0 %	386611833
61	NC_017637	AC	3	6	44609	44614	50 %	0 %	0 %	50 %	386611834
62	NC_017637	GA	3	6	45893	45898	50 %	0 %	50 %	0 %	386611836
63	NC_017637	AT	3	6	47281	47286	50 %	50 %	0 %	0 %	386611837
64	NC_017637	AC	3	6	48319	48324	50 %	0 %	0 %	50 %	386611838
65	NC_017637	AT	3	6	49156	49161	50 %	50 %	0 %	0 %	386611838
66	NC_017637	TA	3	6	49425	49430	50 %	50 %	0 %	0 %	386611838
67	NC_017637	AC	3	6	49741	49746	50 %	0 %	0 %	50 %	386611839
68	NC_017637	TA	3	6	49759	49764	50 %	50 %	0 %	0 %	386611839
69	NC_017637	GT	4	8	50112	50119	0 %	50 %	50 %	0 %	386611839
70	NC_017637	GA	3	6	50226	50231	50 %	0 %	50 %	0 %	386611839
71	NC_017637	CT	3	6	50329	50334	0 %	50 %	0 %	50 %	386611840
72	NC_017637	TG	3	6	50960	50965	0 %	50 %	50 %	0 %	386611841
73	NC_017637	AG	3	6	52281	52286	50 %	0 %	50 %	0 %	386611842
74	NC_017637	GC	3	6	53606	53611	0 %	0 %	50 %	50 %	386611843
75	NC_017637	GA	3	6	53820	53825	50 %	0 %	50 %	0 %	386611843
76	NC_017637	TC	3	6	57220	57225	0 %	50 %	0 %	50 %	386611846
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78	NC_017637	AT	3	6	57514	57519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017637	TA	3	6	59049	59054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017637	GA	3	6	59135	59140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017637	AT	3	6	59445	59450	50 %	50 %	0 %	0 %	386611849
82	NC_017637	GT	3	6	59666	59671	0 %	50 %	50 %	0 %	386611849
83	NC_017637	TC	3	6	61187	61192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017637	AT	3	6	62209	62214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017637	GA	3	6	63595	63600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017637	CA	3	6	64235	64240	50 %	0 %	0 %	50 %	386611855
87	NC_017637	GC	3	6	64664	64669	0 %	0 %	50 %	50 %	386611855
88	NC_017637	CA	3	6	65292	65297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017637	CA	3	6	66287	66292	50 %	0 %	0 %	50 %	386611857
90	NC_017637	TG	4	8	66310	66317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017637	TA	3	6	67083	67088	50 %	50 %	0 %	0 %	386611859
92	NC_017637	TA	3	6	67570	67575	50 %	50 %	0 %	0 %	386611860
93	NC_017637	CA	3	6	67645	67650	50 %	0 %	0 %	50 %	386611860
94	NC_017637	AT	3	6	68494	68499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017637	TC	3	6	68500	68505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017637	GC	3	6	70540	70545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017637	CT	3	6	70590	70595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017637	AC	3	6	70627	70632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017637	GA	3	6	70709	70714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017637	AG	3	6	70766	70771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_017637	TG	3	6	72201	72206	0 %	50 %	50 %	0 %	386611864
103	NC_017637	AT	3	6	73528	73533	50 %	50 %	0 %	0 %	386611866
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105	NC_017637	GT	3	6	75413	75418	0 %	50 %	50 %	0 %	386611868
106	NC_017637	AC	3	6	76622	76627	50 %	0 %	0 %	50 %	386611868
107	NC_017637	AG	3	6	77902	77907	50 %	0 %	50 %	0 %	386611870
108	NC_017637	CG	3	6	80045	80050	0 %	0 %	50 %	50 %	386611873
109	NC_017637	GC	4	8	80420	80427	0 %	0 %	50 %	50 %	386611873
110	NC_017637	AT	3	6	81008	81013	50 %	50 %	0 %	0 %	386611873
111	NC_017637	AG	3	6	81303	81308	50 %	0 %	50 %	0 %	386611873
112	NC_017637	AG	3	6	81557	81562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017637	CA	4	8	81889	81896	50 %	0 %	0 %	50 %	386611874
114	NC_017637	TA	3	6	83092	83097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017637	GA	3	6	83119	83124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017637	CT	3	6	83369	83374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017637	GC	3	6	83541	83546	0 %	0 %	50 %	50 %	386611876
118	NC_017637	CA	3	6	84058	84063	50 %	0 %	0 %	50 %	386611877
119	NC_017637	TG	3	6	84202	84207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017637	AT	3	6	84691	84696	50 %	50 %	0 %	0 %	386611878
121	NC_017637	CG	3	6	85655	85660	0 %	0 %	50 %	50 %	386611878
122	NC_017637	GC	3	6	86470	86475	0 %	0 %	50 %	50 %	386611879
123	NC_017637	GC	3	6	86680	86685	0 %	0 %	50 %	50 %	386611879
124	NC_017637	TC	3	6	87273	87278	0 %	50 %	0 %	50 %	386611879
125	NC_017637	GA	3	6	87284	87289	50 %	0 %	50 %	0 %	386611879
126	NC_017637	CA	3	6	87952	87957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017637	CG	3	6	89170	89175	0 %	0 %	50 %	50 %	386611882
128	NC_017637	GA	3	6	89375	89380	50 %	0 %	50 %	0 %	386611882
129	NC_017637	CT	3	6	89544	89549	0 %	50 %	0 %	50 %	386611882
130	NC_017637	TG	3	6	89604	89609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017637	GA	3	6	90138	90143	50 %	0 %	50 %	0 %	386611883
132	NC_017637	AT	3	6	90546	90551	50 %	50 %	0 %	0 %	386611884
133	NC_017637	AT	3	6	91322	91327	50 %	50 %	0 %	0 %	386611884
134	NC_017637	GC	3	6	91561	91566	0 %	0 %	50 %	50 %	386611885
135	NC_017637	AT	3	6	92168	92173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017637	GT	3	6	92956	92961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017637	AT	3	6	93292	93297	50 %	50 %	0 %	0 %	386611887
138	NC_017637	AG	3	6	93311	93316	50 %	0 %	50 %	0 %	386611887
139	NC_017637	TG	3	6	93377	93382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017637	TG	3	6	93615	93620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017637	TG	3	6	94595	94600	0 %	50 %	50 %	0 %	386611888
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145	NC_017637	GC	3	6	96309	96314	0 %	0 %	50 %	50 %	386611890
146	NC_017637	CA	3	6	96318	96323	50 %	0 %	0 %	50 %	386611890
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.