MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli ETEC H10407

Total Repeats: 105651

< Previous12...200201202203204205206207208209210211212Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105501	NC_017633	ATC	2	6	5145773	5145778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615166
105502	NC_017633	CAT	2	6	5145799	5145804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615166
105503	NC_017633	A	6	6	5145846	5145851	100 %	0 %	0 %	0 %	387615166
105504	NC_017633	GAA	3	9	5145872	5145880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615166
105505	NC_017633	GCT	2	6	5146015	5146020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615166
105506	NC_017633	CGC	2	6	5146088	5146093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615166
105507	NC_017633	CG	3	6	5146119	5146124	0 %	0 %	50 %	50 %	387615166
105508	NC_017633	TGGC	2	8	5146145	5146152	0 %	25 %	50 %	25 %	387615166
105509	NC_017633	CTGG	2	8	5146155	5146162	0 %	25 %	50 %	25 %	387615166
105510	NC_017633	GTT	2	6	5146163	5146168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615166
105511	NC_017633	ACG	2	6	5146228	5146233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615166
105512	NC_017633	CAG	2	6	5146243	5146248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615167
105513	NC_017633	TCT	2	6	5146289	5146294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615167
105514	NC_017633	GTA	2	6	5146300	5146305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615167
105515	NC_017633	GCAT	2	8	5146350	5146357	25 %	25 %	25 %	25 %	387615167
105516	NC_017633	CGC	2	6	5146428	5146433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615167
105517	NC_017633	GCA	2	6	5146437	5146442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615167
105518	NC_017633	GGT	2	6	5146495	5146500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615167
105519	NC_017633	CTT	2	6	5146509	5146514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615167
105520	NC_017633	TCG	2	6	5146517	5146522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615167
105521	NC_017633	TTCA	2	8	5146546	5146553	25 %	50 %	0 %	25 %	387615167
105522	NC_017633	CGG	2	6	5146567	5146572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615167
105523	NC_017633	GCG	2	6	5146683	5146688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615167
105524	NC_017633	GCG	2	6	5146743	5146748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615167
105525	NC_017633	CGG	2	6	5146781	5146786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615167
105526	NC_017633	CTT	2	6	5146813	5146818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615167
105527	NC_017633	CCG	2	6	5146905	5146910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615167
105528	NC_017633	ACG	2	6	5146921	5146926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615167
105529	NC_017633	CGC	2	6	5147008	5147013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615167
105530	NC_017633	CCAG	2	8	5147052	5147059	25 %	0 %	25 %	50 %	387615167
105531	NC_017633	AAT	2	6	5147074	5147079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615167
105532	NC_017633	CAA	2	6	5147113	5147118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105533	NC_017633	ATA	2	6	5147144	5147149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105534	NC_017633	T	6	6	5147153	5147158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105535	NC_017633	T	7	7	5147178	5147184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105536	NC_017633	TAG	2	6	5147187	5147192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105537	NC_017633	AGA	2	6	5147367	5147372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615168
105538	NC_017633	TTG	2	6	5147423	5147428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615168
105539	NC_017633	GTA	2	6	5147611	5147616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615168
105540	NC_017633	A	6	6	5147620	5147625	100 %	0 %	0 %	0 %	387615168
105541	NC_017633	CGCT	2	8	5147687	5147694	0 %	25 %	25 %	50 %	387615168
105542	NC_017633	GGC	2	6	5147768	5147773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615168
105543	NC_017633	GCA	2	6	5147859	5147864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615169
105544	NC_017633	CAG	2	6	5147923	5147928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615169
105545	NC_017633	GCC	2	6	5147987	5147992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615169
105546	NC_017633	GAC	2	6	5148085	5148090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615169
105547	NC_017633	GAA	2	6	5148156	5148161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615169
105548	NC_017633	TCG	2	6	5148166	5148171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615169
105549	NC_017633	TGAAT	2	10	5148201	5148210	40 %	40 %	20 %	0 %	387615169
105550	NC_017633	GC	3	6	5148408	5148413	0 %	0 %	50 %	50 %	387615169
105551	NC_017633	TGC	2	6	5148499	5148504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615170
105552	NC_017633	T	6	6	5148512	5148517	0 %	100 %	0 %	0 %	387615170
105553	NC_017633	TGG	2	6	5148520	5148525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615170
105554	NC_017633	GGC	2	6	5148530	5148535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615170
105555	NC_017633	AAG	2	6	5148562	5148567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615170
105556	NC_017633	CT	3	6	5148651	5148656	0 %	50 %	0 %	50 %	387615170
105557	NC_017633	ACA	2	6	5148701	5148706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615170
105558	NC_017633	ATT	2	6	5148826	5148831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615170
105559	NC_017633	GC	3	6	5148876	5148881	0 %	0 %	50 %	50 %	387615170
105560	NC_017633	ATGT	2	8	5148921	5148928	25 %	50 %	25 %	0 %	387615170
105561	NC_017633	AGCG	2	8	5149017	5149024	25 %	0 %	50 %	25 %	387615170
105562	NC_017633	TGG	2	6	5149089	5149094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615170
105563	NC_017633	GGC	2	6	5149292	5149297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615170
105564	NC_017633	GCG	2	6	5149308	5149313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615170
105565	NC_017633	GTG	2	6	5149344	5149349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615170
105566	NC_017633	ACA	2	6	5149363	5149368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615170
105567	NC_017633	TAC	2	6	5149411	5149416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615170
105568	NC_017633	TGT	2	6	5149457	5149462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615170
105569	NC_017633	GGC	2	6	5149469	5149474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615170
105570	NC_017633	ATT	2	6	5149475	5149480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615170
105571	NC_017633	CGC	2	6	5149482	5149487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615170
105572	NC_017633	GC	3	6	5149497	5149502	0 %	0 %	50 %	50 %	387615170
105573	NC_017633	A	7	7	5149519	5149525	100 %	0 %	0 %	0 %	387615170
105574	NC_017633	TGC	2	6	5149562	5149567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615170
105575	NC_017633	A	6	6	5149774	5149779	100 %	0 %	0 %	0 %	387615170
105576	NC_017633	GTTT	2	8	5149819	5149826	0 %	75 %	25 %	0 %	387615170
105577	NC_017633	TTC	2	6	5149912	5149917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105578	NC_017633	CTG	2	6	5149936	5149941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105579	NC_017633	C	6	6	5149972	5149977	0 %	0 %	0 %	100 %	387615171
105580	NC_017633	ACC	2	6	5149992	5149997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615171
105581	NC_017633	TGT	2	6	5150017	5150022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615171
105582	NC_017633	GAA	2	6	5150262	5150267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615171
105583	NC_017633	ATC	2	6	5150367	5150372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615171
105584	NC_017633	TGGTG	2	10	5150420	5150429	0 %	40 %	60 %	0 %	387615171
105585	NC_017633	AACGG	2	10	5150445	5150454	40 %	0 %	40 %	20 %	387615171
105586	NC_017633	TGCC	2	8	5150596	5150603	0 %	25 %	25 %	50 %	387615171
105587	NC_017633	T	6	6	5150651	5150656	0 %	100 %	0 %	0 %	387615171
105588	NC_017633	T	6	6	5150663	5150668	0 %	100 %	0 %	0 %	387615171
105589	NC_017633	GCCA	2	8	5150669	5150676	25 %	0 %	25 %	50 %	387615171
105590	NC_017633	AGC	2	6	5150718	5150723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615171
105591	NC_017633	TAA	2	6	5150732	5150737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615171
105592	NC_017633	GAC	2	6	5150807	5150812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615171
105593	NC_017633	CTG	2	6	5150862	5150867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615171
105594	NC_017633	TGG	2	6	5150944	5150949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615171
105595	NC_017633	TATT	2	8	5151056	5151063	25 %	75 %	0 %	0 %	387615171
105596	NC_017633	TGT	2	6	5151097	5151102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615171
105597	NC_017633	TGT	2	6	5151115	5151120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615171
105598	NC_017633	GC	3	6	5151163	5151168	0 %	0 %	50 %	50 %	387615171
105599	NC_017633	TGT	2	6	5151169	5151174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615171
105600	NC_017633	TGG	3	9	5151190	5151198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615171
105601	NC_017633	ATG	2	6	5151210	5151215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615171
105602	NC_017633	AAG	2	6	5151274	5151279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615171
105603	NC_017633	T	8	8	5151349	5151356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105604	NC_017633	GGT	2	6	5151360	5151365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105605	NC_017633	TGG	2	6	5151418	5151423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615172
105606	NC_017633	GAT	2	6	5151425	5151430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615172
105607	NC_017633	CGG	2	6	5151471	5151476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615172
105608	NC_017633	CAG	2	6	5151533	5151538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615172
105609	NC_017633	AACG	2	8	5151639	5151646	50 %	0 %	25 %	25 %	387615172
105610	NC_017633	ACG	2	6	5151695	5151700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615172
105611	NC_017633	TTC	2	6	5151701	5151706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615172
105612	NC_017633	CAG	2	6	5151737	5151742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615172
105613	NC_017633	AGA	2	6	5151900	5151905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615172
105614	NC_017633	AG	3	6	5151959	5151964	50 %	0 %	50 %	0 %	387615172
105615	NC_017633	CAT	2	6	5152003	5152008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615172
105616	NC_017633	CCTG	2	8	5152145	5152152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105617	NC_017633	ATGC	2	8	5152153	5152160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105618	NC_017633	CAA	2	6	5152233	5152238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615173
105619	NC_017633	CAT	2	6	5152239	5152244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615173
105620	NC_017633	AT	3	6	5152373	5152378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105621	NC_017633	TGA	2	6	5152407	5152412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105622	NC_017633	ATC	2	6	5152414	5152419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105623	NC_017633	ATT	2	6	5152445	5152450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105624	NC_017633	TAA	2	6	5152452	5152457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105625	NC_017633	CAT	2	6	5152470	5152475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105626	NC_017633	TAA	2	6	5152481	5152486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105627	NC_017633	GTG	2	6	5152489	5152494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105628	NC_017633	ATTT	2	8	5152510	5152517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105629	NC_017633	T	6	6	5152515	5152520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105630	NC_017633	T	6	6	5152558	5152563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105631	NC_017633	T	6	6	5152604	5152609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105632	NC_017633	TAA	2	6	5152669	5152674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105633	NC_017633	AAG	2	6	5152711	5152716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105634	NC_017633	ATT	2	6	5152738	5152743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615174
105635	NC_017633	GCG	2	6	5152780	5152785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615174
105636	NC_017633	AGCC	2	8	5152847	5152854	25 %	0 %	25 %	50 %	387615174
105637	NC_017633	ATT	2	6	5152885	5152890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615174
105638	NC_017633	ATA	2	6	5152892	5152897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615174
105639	NC_017633	CCA	2	6	5152952	5152957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615174
105640	NC_017633	GC	3	6	5152960	5152965	0 %	0 %	50 %	50 %	387615174
105641	NC_017633	TAC	2	6	5152984	5152989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615174
105642	NC_017633	TGG	2	6	5153129	5153134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615174
105643	NC_017633	GCAG	2	8	5153160	5153167	25 %	0 %	50 %	25 %	387615174
105644	NC_017633	ACA	2	6	5153202	5153207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615174
105645	NC_017633	CGA	2	6	5153210	5153215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615174
105646	NC_017633	GAC	2	6	5153280	5153285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615174
105647	NC_017633	TGGCAG	2	12	5153288	5153299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387615174
105648	NC_017633	TGC	2	6	5153377	5153382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105649	NC_017633	A	7	7	5153392	5153398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105650	NC_017633	A	6	6	5153410	5153415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105651	NC_017633	AGTA	2	8	5153422	5153429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...200201202203204205206207208209210211212Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.