MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli UM146 chromosome

Total Repeats: 3207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017632	AGATT	2	10	824	833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017632	ATCAA	2	10	1230	1239	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017632	CCCAG	2	10	7386	7395	20 %	0 %	20 %	60 %	386602650
4	NC_017632	CGCAT	2	10	8901	8910	20 %	20 %	20 %	40 %	386602650
5	NC_017632	AACGT	2	10	10237	10246	40 %	20 %	20 %	20 %	386602651
6	NC_017632	TGTTT	2	10	10794	10803	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017632	GCGAC	2	10	12050	12059	20 %	0 %	40 %	40 %	386602654
8	NC_017632	AGATC	2	10	12719	12728	40 %	20 %	20 %	20 %	386602654
9	NC_017632	CCCAG	2	10	16650	16659	20 %	0 %	20 %	60 %	386602658
10	NC_017632	CGCAT	2	10	16805	16814	20 %	20 %	20 %	40 %	386602658
11	NC_017632	GAAAA	2	10	19075	19084	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017632	GCACA	2	10	19870	19879	40 %	0 %	20 %	40 %	386602662
13	NC_017632	GTAAA	2	10	20020	20029	60 %	20 %	20 %	0 %	386602662
14	NC_017632	GAAAA	2	10	21851	21860	80 %	0 %	20 %	0 %	386602664
15	NC_017632	CATTG	2	10	22942	22951	20 %	40 %	20 %	20 %	386602665
16	NC_017632	ATTTT	2	10	24000	24009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017632	TGGGG	2	10	25438	25447	0 %	20 %	80 %	0 %	386602666
18	NC_017632	GCAAT	2	10	27093	27102	40 %	20 %	20 %	20 %	386602667
19	NC_017632	AGCGT	2	10	28342	28351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017632	CCCAG	2	10	28930	28939	20 %	0 %	20 %	60 %	386602670
21	NC_017632	AAAGC	2	10	29635	29644	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017632	TTTTC	2	10	31929	31938	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017632	GCGTG	2	10	39099	39108	0 %	20 %	60 %	20 %	386602678
24	NC_017632	GCGTC	2	10	41166	41175	0 %	20 %	40 %	40 %	386602679
25	NC_017632	GCCAG	2	10	41700	41709	20 %	0 %	40 %	40 %	386602679
26	NC_017632	CTTAT	2	10	45350	45359	20 %	60 %	0 %	20 %	386602683
27	NC_017632	CAGAG	2	10	49625	49634	40 %	0 %	40 %	20 %	386602688
28	NC_017632	AATCA	2	10	49661	49670	60 %	20 %	0 %	20 %	386602688
29	NC_017632	TGATC	2	10	50260	50269	20 %	40 %	20 %	20 %	386602688
30	NC_017632	GGCGC	2	10	50406	50415	0 %	0 %	60 %	40 %	386602688
31	NC_017632	AATCC	2	10	51299	51308	40 %	20 %	0 %	40 %	386602689
32	NC_017632	CCTGG	2	10	51933	51942	0 %	20 %	40 %	40 %	386602689
33	NC_017632	CGACG	2	10	51946	51955	20 %	0 %	40 %	40 %	386602689
34	NC_017632	GCATC	2	10	55661	55670	20 %	20 %	20 %	40 %	386602694
35	NC_017632	GTTCA	2	10	57605	57614	20 %	40 %	20 %	20 %	386602697
36	NC_017632	TTCTC	2	10	58794	58803	0 %	60 %	0 %	40 %	386602698
37	NC_017632	GTGCC	2	10	59955	59964	0 %	20 %	40 %	40 %	386602698
38	NC_017632	GATGC	2	10	60637	60646	20 %	20 %	40 %	20 %	386602699
39	NC_017632	TGGCA	2	10	61861	61870	20 %	20 %	40 %	20 %	386602701
40	NC_017632	TGGCC	2	10	63443	63452	0 %	20 %	40 %	40 %	386602702
41	NC_017632	GATCG	2	10	64239	64248	20 %	20 %	40 %	20 %	386602703
42	NC_017632	CGGCG	2	10	67224	67233	0 %	0 %	60 %	40 %	386602703
43	NC_017632	AAATT	2	10	68344	68353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017632	GCATC	2	10	69171	69180	20 %	20 %	20 %	40 %	386602706
45	NC_017632	TGAAC	2	10	71336	71345	40 %	20 %	20 %	20 %	386602707
46	NC_017632	ATGGG	2	10	73337	73346	20 %	20 %	60 %	0 %	386602709
47	NC_017632	GTTCC	2	10	83448	83457	0 %	40 %	20 %	40 %	386602722
48	NC_017632	CAGAC	2	10	84933	84942	40 %	0 %	20 %	40 %	386602725
49	NC_017632	ATCGT	2	10	86897	86906	20 %	40 %	20 %	20 %	386602728
50	NC_017632	GAGGG	2	10	88072	88081	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017632	TGGCG	2	10	90550	90559	0 %	20 %	60 %	20 %	386602733
52	NC_017632	CTGGC	2	10	90830	90839	0 %	20 %	40 %	40 %	386602733
53	NC_017632	GCTGG	2	10	91918	91927	0 %	20 %	60 %	20 %	386602734
54	NC_017632	AAGTT	2	10	92488	92497	40 %	40 %	20 %	0 %	386602735
55	NC_017632	TGTCA	2	10	93174	93183	20 %	40 %	20 %	20 %	386602735
56	NC_017632	AGATC	2	10	96103	96112	40 %	20 %	20 %	20 %	386602739
57	NC_017632	CGAGC	2	10	96187	96196	20 %	0 %	40 %	40 %	386602739
58	NC_017632	CGTAG	2	10	97256	97265	20 %	20 %	40 %	20 %	386602739
59	NC_017632	GATCA	2	10	99314	99323	40 %	20 %	20 %	20 %	386602741
60	NC_017632	ACCCC	2	10	102588	102597	20 %	0 %	0 %	80 %	386602743
61	NC_017632	GTGCT	2	10	104770	104779	0 %	40 %	40 %	20 %	386602745
62	NC_017632	GCGGT	2	10	108283	108292	0 %	20 %	60 %	20 %	386602747
63	NC_017632	GTACG	2	10	117473	117482	20 %	20 %	40 %	20 %	386602754
64	NC_017632	GGCAG	2	10	121096	121105	20 %	0 %	60 %	20 %	386602757
65	NC_017632	GAAGC	2	10	121921	121930	40 %	0 %	40 %	20 %	386602759
66	NC_017632	AGGTC	2	10	121992	122001	20 %	20 %	40 %	20 %	386602759
67	NC_017632	CTGGT	2	10	122306	122315	0 %	40 %	40 %	20 %	386602759
68	NC_017632	CGACG	2	10	123852	123861	20 %	0 %	40 %	40 %	386602763
69	NC_017632	TTTGA	2	10	125499	125508	20 %	60 %	20 %	0 %	386602764
70	NC_017632	GCCGC	2	10	126977	126986	0 %	0 %	40 %	60 %	386602767
71	NC_017632	CAACT	2	10	128946	128955	40 %	20 %	0 %	40 %	386602768
72	NC_017632	ATCGC	2	10	131412	131421	20 %	20 %	20 %	40 %	386602771
73	NC_017632	ATTCG	2	10	133222	133231	20 %	40 %	20 %	20 %	386602774
74	NC_017632	GACGG	2	10	134246	134255	20 %	0 %	60 %	20 %	386602775
75	NC_017632	TTTCA	2	10	135299	135308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017632	AGAAA	2	10	135341	135350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017632	CATCG	2	10	137632	137641	20 %	20 %	20 %	40 %	386602778
78	NC_017632	AATCA	2	10	140266	140275	60 %	20 %	0 %	20 %	386602781
79	NC_017632	GTTTG	2	10	140480	140489	0 %	60 %	40 %	0 %	386602781
80	NC_017632	TCTGA	2	10	140705	140714	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017632	GTTGA	2	10	141153	141162	20 %	40 %	40 %	0 %	386602782
82	NC_017632	GAATT	2	10	141718	141727	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017632	CGCCA	2	10	142755	142764	20 %	0 %	20 %	60 %	386602783
84	NC_017632	CTGGG	2	10	144000	144009	0 %	20 %	60 %	20 %	386602784
85	NC_017632	GCTGG	2	10	144768	144777	0 %	20 %	60 %	20 %	386602784
86	NC_017632	AGCAG	2	10	145338	145347	40 %	0 %	40 %	20 %	386602785
87	NC_017632	GGAGG	2	10	148043	148052	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017632	ATAAA	2	10	149041	149050	80 %	20 %	0 %	0 %	386602788
89	NC_017632	TTCAT	2	10	149408	149417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017632	TCGGC	2	10	149534	149543	0 %	20 %	40 %	40 %	386602789
91	NC_017632	TGAAA	2	10	149700	149709	60 %	20 %	20 %	0 %	386602789
92	NC_017632	AGGAT	2	10	151502	151511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017632	TGGCT	2	10	154156	154165	0 %	40 %	40 %	20 %	386602793
94	NC_017632	AACCT	2	10	155228	155237	40 %	20 %	0 %	40 %	386602793
95	NC_017632	GTACA	2	10	155587	155596	40 %	20 %	20 %	20 %	386602793
96	NC_017632	ACCCG	2	10	156723	156732	20 %	0 %	20 %	60 %	386602794
97	NC_017632	GCCGT	2	10	157592	157601	0 %	20 %	40 %	40 %	386602795
98	NC_017632	TGGTG	2	10	160353	160362	0 %	40 %	60 %	0 %	386602797
99	NC_017632	ATGGC	2	10	160882	160891	20 %	20 %	40 %	20 %	386602797
100	NC_017632	GATGC	2	10	161212	161221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017632	TCCCA	2	10	161755	161764	20 %	20 %	0 %	60 %	386602799
102	NC_017632	GGCGA	2	10	161771	161780	20 %	0 %	60 %	20 %	386602799
103	NC_017632	TGGCG	2	10	163028	163037	0 %	20 %	60 %	20 %	386602800
104	NC_017632	GAACT	2	10	163395	163404	40 %	20 %	20 %	20 %	386602801
105	NC_017632	TGCGG	2	10	169389	169398	0 %	20 %	60 %	20 %	386602811
106	NC_017632	GCACC	2	10	169747	169756	20 %	0 %	20 %	60 %	386602811
107	NC_017632	ACCAA	2	10	169796	169805	60 %	0 %	0 %	40 %	386602811
108	NC_017632	GCCAT	2	10	170137	170146	20 %	20 %	20 %	40 %	386602811
109	NC_017632	TGAAC	2	10	172562	172571	40 %	20 %	20 %	20 %	386602812
110	NC_017632	TTCAT	2	10	173244	173253	20 %	60 %	0 %	20 %	386602813
111	NC_017632	GAAGG	2	10	175636	175645	40 %	0 %	60 %	0 %	386602815
112	NC_017632	CCAGC	2	10	182062	182071	20 %	0 %	20 %	60 %	386602821
113	NC_017632	CGCAC	2	10	182616	182625	20 %	0 %	20 %	60 %	386602821
114	NC_017632	ACGCC	2	10	183064	183073	20 %	0 %	20 %	60 %	386602821
115	NC_017632	CACCG	2	10	184774	184783	20 %	0 %	20 %	60 %	386602822
116	NC_017632	GCTTT	2	10	186240	186249	0 %	60 %	20 %	20 %	386602823
117	NC_017632	AATAA	2	10	188244	188253	80 %	20 %	0 %	0 %	386602824
118	NC_017632	TGAAC	2	10	196393	196402	40 %	20 %	20 %	20 %	386602830
119	NC_017632	GATGC	2	10	197115	197124	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017632	GCGCC	2	10	197382	197391	0 %	0 %	40 %	60 %	386602831
121	NC_017632	AACGC	2	10	197392	197401	40 %	0 %	20 %	40 %	386602831
122	NC_017632	CTTCG	2	10	199796	199805	0 %	40 %	20 %	40 %	386602834
123	NC_017632	GATCT	2	10	201452	201461	20 %	40 %	20 %	20 %	386602834
124	NC_017632	ACCGT	2	10	204240	204249	20 %	20 %	20 %	40 %	386602837
125	NC_017632	CCGCT	2	10	208526	208535	0 %	20 %	20 %	60 %	386602841
126	NC_017632	CACGA	2	10	210818	210827	40 %	0 %	20 %	40 %	386602844
127	NC_017632	AAGCC	2	10	212869	212878	40 %	0 %	20 %	40 %	386602846
128	NC_017632	TCTAC	2	10	214565	214574	20 %	40 %	0 %	40 %	386602847
129	NC_017632	GTGTA	2	10	217359	217368	20 %	40 %	40 %	0 %	386602848
130	NC_017632	GTGAT	2	10	217925	217934	20 %	40 %	40 %	0 %	386602849
131	NC_017632	TGGTG	2	10	218748	218757	0 %	40 %	60 %	0 %	386602849
132	NC_017632	TAAAG	2	10	219377	219386	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017632	CTGCG	2	10	220229	220238	0 %	20 %	40 %	40 %	386602850
134	NC_017632	TCTGC	2	10	220537	220546	0 %	40 %	20 %	40 %	386602850
135	NC_017632	GGGCG	2	10	222981	222990	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017632	GCTGC	2	10	223282	223291	0 %	20 %	40 %	40 %	386602854
137	NC_017632	TTTGG	2	10	225781	225790	0 %	60 %	40 %	0 %	386602857
138	NC_017632	ACGGT	2	10	226152	226161	20 %	20 %	40 %	20 %	386602857
139	NC_017632	GTCGT	2	10	227842	227851	0 %	40 %	40 %	20 %	386602857
140	NC_017632	ATATA	2	10	229223	229232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017632	ATGAG	2	10	230335	230344	40 %	20 %	40 %	0 %	386602860
142	NC_017632	ACCGG	2	10	232602	232611	20 %	0 %	40 %	40 %	386602863
143	NC_017632	GAGAG	2	10	233424	233433	40 %	0 %	60 %	0 %	386602864
144	NC_017632	AAAGT	2	10	234899	234908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017632	TGCCA	2	10	236626	236635	20 %	20 %	20 %	40 %	386602866
146	NC_017632	TCGCG	2	10	238338	238347	0 %	20 %	40 %	40 %	386602867
147	NC_017632	TGAGC	2	10	240267	240276	20 %	20 %	40 %	20 %	386602870
148	NC_017632	CCTGA	2	10	248935	248944	20 %	20 %	20 %	40 %	386602877
149	NC_017632	GAGGC	2	10	250185	250194	20 %	0 %	60 %	20 %	386602878
150	NC_017632	AATTG	2	10	251968	251977	40 %	40 %	20 %	0 %	386602881
151	NC_017632	TCTTA	2	10	253071	253080	20 %	60 %	0 %	20 %	386602883
152	NC_017632	TCATG	2	10	253296	253305	20 %	40 %	20 %	20 %	386602884
153	NC_017632	ATTTC	2	10	254583	254592	20 %	60 %	0 %	20 %	386602884
154	NC_017632	CTGGC	2	10	254875	254884	0 %	20 %	40 %	40 %	386602885
155	NC_017632	ATTTT	2	10	255316	255325	20 %	80 %	0 %	0 %	386602886
156	NC_017632	ACCCG	2	10	259054	259063	20 %	0 %	20 %	60 %	386602890
157	NC_017632	ACCAG	2	10	264330	264339	40 %	0 %	20 %	40 %	386602894
158	NC_017632	TTGTT	2	10	268180	268189	0 %	80 %	20 %	0 %	386602898
159	NC_017632	GAAAG	2	10	269525	269534	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017632	GTTGC	2	10	272012	272021	0 %	40 %	40 %	20 %	386602900
161	NC_017632	TCTTT	2	10	273822	273831	0 %	80 %	0 %	20 %	386602902
162	NC_017632	CTGAT	2	10	282622	282631	20 %	40 %	20 %	20 %	386602911
163	NC_017632	TGCTT	2	10	283824	283833	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017632	AAAAC	2	10	288577	288586	80 %	0 %	0 %	20 %	386602917
165	NC_017632	CTGCA	2	10	288977	288986	20 %	20 %	20 %	40 %	386602918
166	NC_017632	TGGCC	2	10	290603	290612	0 %	20 %	40 %	40 %	386602919
167	NC_017632	GCTGC	2	10	290757	290766	0 %	20 %	40 %	40 %	386602919
168	NC_017632	CCCGG	2	10	291007	291016	0 %	0 %	40 %	60 %	386602920
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175	NC_017632	ATCGC	2	10	306783	306792	20 %	20 %	20 %	40 %	386602938
176	NC_017632	CTGGA	2	10	310874	310883	20 %	20 %	40 %	20 %	386602941
177	NC_017632	CGCGC	2	10	311861	311870	0 %	0 %	40 %	60 %	386602941
178	NC_017632	CGACC	2	10	312452	312461	20 %	0 %	20 %	60 %	386602942
179	NC_017632	GGGGC	2	10	313123	313132	0 %	0 %	80 %	20 %	386602942
180	NC_017632	CATCG	2	10	313173	313182	20 %	20 %	20 %	40 %	386602942
181	NC_017632	GTCAG	2	10	314165	314174	20 %	20 %	40 %	20 %	386602943
182	NC_017632	TCTGT	2	10	316480	316489	0 %	60 %	20 %	20 %	386602945
183	NC_017632	TTTGT	2	10	319671	319680	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017632	AGCAA	2	10	326335	326344	60 %	0 %	20 %	20 %	386602950
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187	NC_017632	TCACC	2	10	333499	333508	20 %	20 %	0 %	60 %	386602957
188	NC_017632	GCGTC	2	10	333840	333849	0 %	20 %	40 %	40 %	386602958
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196	NC_017632	ATGAT	2	10	353741	353750	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017632	TGAAC	2	10	354284	354293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_017632	TTTAT	2	10	354367	354376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017632	CTCGT	2	10	354530	354539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
200	NC_017632	CTCTT	2	10	355519	355528	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
201	NC_017632	TGGGG	2	10	357707	357716	0 %	20 %	80 %	0 %	386602976
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204	NC_017632	CGAAC	2	10	362885	362894	40 %	0 %	20 %	40 %	386602982
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216	NC_017632	GCATC	2	10	382890	382899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
217	NC_017632	GCTGG	2	10	384851	384860	0 %	20 %	60 %	20 %	386603007
218	NC_017632	CAGGC	2	10	384919	384928	20 %	0 %	40 %	40 %	386603007
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221	NC_017632	CGCGG	2	10	388219	388228	0 %	0 %	60 %	40 %	386603010
222	NC_017632	AAAAT	2	10	390750	390759	80 %	20 %	0 %	0 %	386603012
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224	NC_017632	GCCAG	2	10	392835	392844	20 %	0 %	40 %	40 %	386603016
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227	NC_017632	CAGGG	2	10	397884	397893	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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234	NC_017632	GACAA	2	10	404560	404569	60 %	0 %	20 %	20 %	386603029
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247	NC_017632	GATGC	2	10	419520	419529	20 %	20 %	40 %	20 %	386603042
248	NC_017632	ATCAT	2	10	419863	419872	40 %	40 %	0 %	20 %	386603042
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251	NC_017632	TGGCG	2	10	426556	426565	0 %	20 %	60 %	20 %	386603051
252	NC_017632	ATCTC	2	10	429100	429109	20 %	40 %	0 %	40 %	386603053
253	NC_017632	AGAAA	2	10	431147	431156	80 %	0 %	20 %	0 %	386603056
254	NC_017632	GAGAA	2	10	432547	432556	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017632	CTTTG	2	10	437419	437428	0 %	60 %	20 %	20 %	386603060
256	NC_017632	CGCAG	2	10	437892	437901	20 %	0 %	40 %	40 %	386603060
257	NC_017632	ACGGT	2	10	440870	440879	20 %	20 %	40 %	20 %	386603062
258	NC_017632	TAAAG	2	10	442419	442428	60 %	20 %	20 %	0 %	386603062
259	NC_017632	TCCAG	2	10	443047	443056	20 %	20 %	20 %	40 %	386603063
260	NC_017632	ACTGC	2	10	444561	444570	20 %	20 %	20 %	40 %	386603064
261	NC_017632	GCGTT	2	10	446215	446224	0 %	40 %	40 %	20 %	386603065
262	NC_017632	CATTT	2	10	448947	448956	20 %	60 %	0 %	20 %	386603067
263	NC_017632	ACGAC	2	10	451637	451646	40 %	0 %	20 %	40 %	386603069
264	NC_017632	CCACA	2	10	452647	452656	40 %	0 %	0 %	60 %	386603070
265	NC_017632	CGCGG	2	10	452935	452944	0 %	0 %	60 %	40 %	386603070
266	NC_017632	CCCAG	2	10	455169	455178	20 %	0 %	20 %	60 %	386603072
267	NC_017632	AGGCC	2	10	455196	455205	20 %	0 %	40 %	40 %	386603072
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303	NC_017632	ATTAT	2	10	515967	515976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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