MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli UM146 chromosome

Total Repeats: 102503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017632	CCA	2	6	144680	144685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386602784
3002	NC_017632	CAA	2	6	144705	144710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386602784
3003	NC_017632	CAC	2	6	144711	144716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386602784
3004	NC_017632	TGG	2	6	144719	144724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602784
3005	NC_017632	CTTT	2	8	144743	144750	0 %	75 %	0 %	25 %	386602784
3006	NC_017632	GCTGG	2	10	144768	144777	0 %	20 %	60 %	20 %	386602784
3007	NC_017632	TTG	2	6	144809	144814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386602784
3008	NC_017632	GCG	3	9	144821	144829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602784
3009	NC_017632	GCA	2	6	144913	144918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602784
3010	NC_017632	CT	4	8	145100	145107	0 %	50 %	0 %	50 %	386602785
3011	NC_017632	CTGG	2	8	145149	145156	0 %	25 %	50 %	25 %	386602785
3012	NC_017632	CAGCGC	2	12	145224	145235	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386602785
3013	NC_017632	AGT	2	6	145239	145244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602785
3014	NC_017632	ATT	2	6	145270	145275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602785
3015	NC_017632	TCT	2	6	145281	145286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386602785
3016	NC_017632	AGCAG	2	10	145338	145347	40 %	0 %	40 %	20 %	386602785
3017	NC_017632	ATT	2	6	145433	145438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602785
3018	NC_017632	CAG	2	6	145486	145491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602785
3019	NC_017632	TCG	2	6	145544	145549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602785
3020	NC_017632	GC	3	6	145643	145648	0 %	0 %	50 %	50 %	386602785
3021	NC_017632	CGT	2	6	145693	145698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602785
3022	NC_017632	A	6	6	145786	145791	100 %	0 %	0 %	0 %	386602785
3023	NC_017632	ACC	3	9	145794	145802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386602785
3024	NC_017632	AG	3	6	145809	145814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017632	TGAT	2	8	145816	145823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017632	TGG	2	6	145906	145911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602786
3027	NC_017632	TGC	2	6	145949	145954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602786
3028	NC_017632	TCA	3	9	146005	146013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602786
3029	NC_017632	TGC	2	6	146017	146022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602786
3030	NC_017632	ATT	2	6	146067	146072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602786
3031	NC_017632	GCG	2	6	146191	146196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602786
3032	NC_017632	TGG	2	6	146233	146238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602786
3033	NC_017632	GCG	2	6	146239	146244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602786
3034	NC_017632	TGA	2	6	146275	146280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602786
3035	NC_017632	GTG	2	6	146298	146303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602786
3036	NC_017632	TGC	2	6	146372	146377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602786
3037	NC_017632	GC	3	6	146581	146586	0 %	0 %	50 %	50 %	386602786
3038	NC_017632	GAT	2	6	146615	146620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602786
3039	NC_017632	CTA	2	6	146675	146680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602786
3040	NC_017632	CGT	2	6	146718	146723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602786
3041	NC_017632	AAAG	2	8	146841	146848	75 %	0 %	25 %	0 %	386602787
3042	NC_017632	GGT	2	6	146940	146945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602787
3043	NC_017632	GAT	2	6	146963	146968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602787
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3045	NC_017632	ATT	2	6	147195	147200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602787
3046	NC_017632	GGC	2	6	147210	147215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602787
3047	NC_017632	CCA	2	6	147220	147225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386602787
3048	NC_017632	ACG	2	6	147226	147231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602787
3049	NC_017632	GCG	2	6	147232	147237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602787
3050	NC_017632	GGC	2	6	147300	147305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602787
3051	NC_017632	TGATAT	2	12	147326	147337	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386602787
3052	NC_017632	GTG	2	6	147415	147420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602787
3053	NC_017632	GAT	2	6	147461	147466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602787
3054	NC_017632	ATA	2	6	147478	147483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386602787
3055	NC_017632	CT	3	6	147486	147491	0 %	50 %	0 %	50 %	386602787
3056	NC_017632	A	6	6	147510	147515	100 %	0 %	0 %	0 %	386602787
3057	NC_017632	GCGG	2	8	147558	147565	0 %	0 %	75 %	25 %	386602787
3058	NC_017632	GCG	2	6	147573	147578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602787
3059	NC_017632	GGA	2	6	147644	147649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386602787
3060	NC_017632	GAA	2	6	147746	147751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386602787
3061	NC_017632	ATG	2	6	147793	147798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602787
3062	NC_017632	CGC	2	6	147917	147922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386602787
3063	NC_017632	GC	3	6	147962	147967	0 %	0 %	50 %	50 %	386602787
3064	NC_017632	GC	3	6	147982	147987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_017632	CGC	2	6	148006	148011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_017632	TCG	3	9	148013	148021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017632	GGAGG	2	10	148043	148052	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017632	G	7	7	148093	148099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017632	AG	3	6	148120	148125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017632	CCG	2	6	148130	148135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017632	CG	3	6	148190	148195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_017632	GCT	2	6	148285	148290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017632	ATGA	2	8	148318	148325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017632	CGG	2	6	148387	148392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_017632	TAA	2	6	148437	148442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017632	AAG	2	6	148453	148458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017632	TTA	2	6	148459	148464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017632	TC	3	6	148506	148511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_017632	AAT	2	6	148585	148590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017632	TGCC	2	8	148679	148686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_017632	TCA	2	6	148689	148694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017632	ACAA	2	8	148697	148704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_017632	A	6	6	148747	148752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017632	TTG	2	6	148832	148837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017632	ATT	2	6	148869	148874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017632	GAA	2	6	148923	148928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017632	AGA	2	6	148969	148974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386602788
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3089	NC_017632	ATAAA	2	10	149041	149050	80 %	20 %	0 %	0 %	386602788
3090	NC_017632	TGTT	2	8	149051	149058	0 %	75 %	25 %	0 %	386602788
3091	NC_017632	CAA	2	6	149062	149067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386602788
3092	NC_017632	A	6	6	149076	149081	100 %	0 %	0 %	0 %	386602788
3093	NC_017632	ATT	2	6	149095	149100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602788
3094	NC_017632	GTTT	2	8	149115	149122	0 %	75 %	25 %	0 %	386602788
3095	NC_017632	ATA	2	6	149123	149128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386602788
3096	NC_017632	T	6	6	149213	149218	0 %	100 %	0 %	0 %	386602788
3097	NC_017632	ATG	2	6	149237	149242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602788
3098	NC_017632	T	8	8	149274	149281	0 %	100 %	0 %	0 %	386602788
3099	NC_017632	TTG	2	6	149322	149327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017632	TTCAT	2	10	149408	149417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3101	NC_017632	TTC	3	9	149474	149482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386602789
3102	NC_017632	GCA	2	6	149490	149495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602789
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3104	NC_017632	TCGGC	2	10	149534	149543	0 %	20 %	40 %	40 %	386602789
3105	NC_017632	ATT	2	6	149603	149608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602789
3106	NC_017632	GTG	2	6	149623	149628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602789
3107	NC_017632	TGAAA	2	10	149700	149709	60 %	20 %	20 %	0 %	386602789
3108	NC_017632	TCT	2	6	149737	149742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386602789
3109	NC_017632	GGT	2	6	149748	149753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602789
3110	NC_017632	ATTG	2	8	149778	149785	25 %	50 %	25 %	0 %	386602789
3111	NC_017632	GAT	2	6	149805	149810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602789
3112	NC_017632	CAA	2	6	149811	149816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386602789
3113	NC_017632	TATG	2	8	149850	149857	25 %	50 %	25 %	0 %	386602789
3114	NC_017632	CAC	3	9	150018	150026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386602789
3115	NC_017632	GAA	2	6	150039	150044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386602789
3116	NC_017632	TAC	2	6	150079	150084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602789
3117	NC_017632	ACT	2	6	150090	150095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602789
3118	NC_017632	TAC	2	6	150096	150101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602789
3119	NC_017632	TTA	2	6	150239	150244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602789
3120	NC_017632	GAA	2	6	150256	150261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386602789
3121	NC_017632	A	6	6	150313	150318	100 %	0 %	0 %	0 %	386602789
3122	NC_017632	GCA	2	6	150319	150324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602789
3123	NC_017632	TGG	2	6	150332	150337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602789
3124	NC_017632	AATT	2	8	150383	150390	50 %	50 %	0 %	0 %	386602789
3125	NC_017632	ATAA	2	8	150423	150430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017632	CTGT	2	8	150436	150443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_017632	CGGTTA	2	12	150455	150466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3128	NC_017632	TGA	2	6	150533	150538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602790
3129	NC_017632	CAT	2	6	150539	150544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602790
3130	NC_017632	CTGG	2	8	150561	150568	0 %	25 %	50 %	25 %	386602790
3131	NC_017632	TAA	2	6	150689	150694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386602790
3132	NC_017632	ACTG	2	8	150704	150711	25 %	25 %	25 %	25 %	386602790
3133	NC_017632	GTG	2	6	150807	150812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602790
3134	NC_017632	ACT	2	6	150856	150861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602790
3135	NC_017632	GAT	2	6	150960	150965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602790
3136	NC_017632	ATG	2	6	151021	151026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602790
3137	NC_017632	GGC	3	9	151050	151058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602790
3138	NC_017632	GGC	2	6	151148	151153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602790
3139	NC_017632	CCCG	2	8	151222	151229	0 %	0 %	25 %	75 %	386602790
3140	NC_017632	TCGT	2	8	151249	151256	0 %	50 %	25 %	25 %	386602790
3141	NC_017632	GTC	2	6	151335	151340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602790
3142	NC_017632	AGGCGC	2	12	151346	151357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386602790
3143	NC_017632	TGC	2	6	151367	151372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602790
3144	NC_017632	ATT	2	6	151373	151378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602790
3145	NC_017632	AT	3	6	151397	151402	50 %	50 %	0 %	0 %	386602790
3146	NC_017632	TAT	2	6	151424	151429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602790
3147	NC_017632	CGG	2	6	151433	151438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602790
3148	NC_017632	TC	3	6	151459	151464	0 %	50 %	0 %	50 %	386602790
3149	NC_017632	TTAA	2	8	151487	151494	50 %	50 %	0 %	0 %	386602790
3150	NC_017632	AGGAT	2	10	151502	151511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_017632	CCAG	2	8	151537	151544	25 %	0 %	25 %	50 %	386602791
3152	NC_017632	TTC	2	6	151626	151631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386602791
3153	NC_017632	TTC	2	6	151666	151671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386602791
3154	NC_017632	GGC	2	6	151797	151802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602791
3155	NC_017632	CTT	2	6	151823	151828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386602791
3156	NC_017632	TGT	2	6	151843	151848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386602791
3157	NC_017632	TTACCA	2	12	151861	151872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602791
3158	NC_017632	TGC	2	6	151948	151953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602791
3159	NC_017632	TGA	2	6	151999	152004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602791
3160	NC_017632	CTGG	2	8	152144	152151	0 %	25 %	50 %	25 %	386602791
3161	NC_017632	CAT	2	6	152159	152164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602791
3162	NC_017632	CTTC	2	8	152197	152204	0 %	50 %	0 %	50 %	386602791
3163	NC_017632	GTT	2	6	152205	152210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386602791
3164	NC_017632	ATC	2	6	152274	152279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602791
3165	NC_017632	TC	3	6	152278	152283	0 %	50 %	0 %	50 %	386602791
3166	NC_017632	GTG	2	6	152307	152312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602791
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3168	NC_017632	CAT	2	6	152471	152476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602791
3169	NC_017632	TCTT	2	8	152499	152506	0 %	75 %	0 %	25 %	386602791
3170	NC_017632	GTT	2	6	152640	152645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386602791
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3185	NC_017632	GC	4	8	153420	153427	0 %	0 %	50 %	50 %	386602792
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3192	NC_017632	ATT	2	6	153672	153677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386602792
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3195	NC_017632	GCT	2	6	153802	153807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602792
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3199	NC_017632	TCG	2	6	153870	153875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602792
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3203	NC_017632	CATT	2	8	154035	154042	25 %	50 %	0 %	25 %	386602792
3204	NC_017632	AG	3	6	154095	154100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3205	NC_017632	ATT	2	6	154101	154106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3206	NC_017632	TGGCT	2	10	154156	154165	0 %	40 %	40 %	20 %	386602793
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3211	NC_017632	A	6	6	154406	154411	100 %	0 %	0 %	0 %	386602793
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3230	NC_017632	CTGG	2	8	155577	155584	0 %	25 %	50 %	25 %	386602793
3231	NC_017632	GTACA	2	10	155587	155596	40 %	20 %	20 %	20 %	386602793
3232	NC_017632	GC	3	6	155600	155605	0 %	0 %	50 %	50 %	386602793
3233	NC_017632	TGA	2	6	155769	155774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602793
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3238	NC_017632	CGC	2	6	155992	155997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386602793
3239	NC_017632	GCG	2	6	156139	156144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602793
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3242	NC_017632	CCA	2	6	156204	156209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386602793
3243	NC_017632	TCAACG	2	12	156239	156250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386602793
3244	NC_017632	TGC	2	6	156266	156271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602793
3245	NC_017632	GGA	2	6	156410	156415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386602793
3246	NC_017632	GCA	2	6	156489	156494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602794
3247	NC_017632	TGC	2	6	156604	156609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602794
3248	NC_017632	ATC	2	6	156629	156634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602794
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3294	NC_017632	TAA	2	6	158485	158490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3353	NC_017632	GC	3	6	161531	161536	0 %	0 %	50 %	50 %	386602799
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3356	NC_017632	ATG	2	6	161719	161724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602799
3357	NC_017632	TCCCA	2	10	161755	161764	20 %	20 %	0 %	60 %	386602799
3358	NC_017632	GGCGA	2	10	161771	161780	20 %	0 %	60 %	20 %	386602799
3359	NC_017632	TGC	2	6	161786	161791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602799
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3361	NC_017632	GGCA	2	8	161841	161848	25 %	0 %	50 %	25 %	386602799
3362	NC_017632	AG	3	6	161926	161931	50 %	0 %	50 %	0 %	386602799
3363	NC_017632	TCCA	2	8	161995	162002	25 %	25 %	0 %	50 %	386602799
3364	NC_017632	GGC	2	6	162049	162054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602799
3365	NC_017632	AGT	2	6	162120	162125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602799
3366	NC_017632	GTA	2	6	162197	162202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386602799
3367	NC_017632	CT	3	6	162218	162223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3368	NC_017632	AAAG	2	8	162318	162325	75 %	0 %	25 %	0 %	386602800
3369	NC_017632	CGAT	2	8	162361	162368	25 %	25 %	25 %	25 %	386602800
3370	NC_017632	GCG	4	12	162384	162395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386602800
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3491	NC_017632	GTT	2	6	168325	168330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_017632	GAGG	2	8	168380	168387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_017632	CGA	2	6	168431	168436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_017632	TGG	2	6	168490	168495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386602810
3495	NC_017632	CAC	2	6	168509	168514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386602810
3496	NC_017632	TCG	2	6	168558	168563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602810
3497	NC_017632	TGC	2	6	168603	168608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386602810
3498	NC_017632	AGC	2	6	168623	168628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386602810
3499	NC_017632	TCA	2	6	168672	168677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386602810
3500	NC_017632	T	6	6	168719	168724	0 %	100 %	0 %	0 %	386602810

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