MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli UM146 plasmid pUM146

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017630	TAAT	2	8	215	222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017630	ATGA	2	8	461	468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017630	TTTA	2	8	484	491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017630	CATT	2	8	646	653	25 %	50 %	0 %	25 %	386602512
5	NC_017630	ATAA	2	8	914	921	75 %	25 %	0 %	0 %	386602512
6	NC_017630	TTCC	2	8	1402	1409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017630	GGCA	2	8	1663	1670	25 %	0 %	50 %	25 %	386602513
8	NC_017630	ATTC	2	8	2617	2624	25 %	50 %	0 %	25 %	386602514
9	NC_017630	GCTG	2	8	2665	2672	0 %	25 %	50 %	25 %	386602514
10	NC_017630	CCAC	2	8	3438	3445	25 %	0 %	0 %	75 %	386602515
11	NC_017630	CAGC	2	8	4072	4079	25 %	0 %	25 %	50 %	386602516
12	NC_017630	CAGC	2	8	4378	4385	25 %	0 %	25 %	50 %	386602516
13	NC_017630	CCTG	2	8	4620	4627	0 %	25 %	25 %	50 %	386602516
14	NC_017630	CCGT	2	8	5319	5326	0 %	25 %	25 %	50 %	386602516
15	NC_017630	ACCG	2	8	6034	6041	25 %	0 %	25 %	50 %	386602516
16	NC_017630	CAGG	2	8	6841	6848	25 %	0 %	50 %	25 %	386602516
17	NC_017630	GCCC	2	8	6860	6867	0 %	0 %	25 %	75 %	386602516
18	NC_017630	TCGC	2	8	6967	6974	0 %	25 %	25 %	50 %	386602516
19	NC_017630	CCGG	2	8	6996	7003	0 %	0 %	50 %	50 %	386602516
20	NC_017630	CGGT	2	8	7162	7169	0 %	25 %	50 %	25 %	386602516
21	NC_017630	CCAG	2	8	7200	7207	25 %	0 %	25 %	50 %	386602516
22	NC_017630	GCGA	2	8	7700	7707	25 %	0 %	50 %	25 %	386602516
23	NC_017630	GACG	2	8	7821	7828	25 %	0 %	50 %	25 %	386602516
24	NC_017630	CGGA	2	8	7933	7940	25 %	0 %	50 %	25 %	386602516
25	NC_017630	TGCG	2	8	8200	8207	0 %	25 %	50 %	25 %	386602516
26	NC_017630	ACTC	2	8	8501	8508	25 %	25 %	0 %	50 %	386602516
27	NC_017630	GTCC	2	8	8723	8730	0 %	25 %	25 %	50 %	386602516
28	NC_017630	CTGC	2	8	9076	9083	0 %	25 %	25 %	50 %	386602516
29	NC_017630	CAGC	2	8	10104	10111	25 %	0 %	25 %	50 %	386602517
30	NC_017630	CAGA	2	8	10675	10682	50 %	0 %	25 %	25 %	386602517
31	NC_017630	TGTC	2	8	10782	10789	0 %	50 %	25 %	25 %	386602517
32	NC_017630	CTGG	2	8	11013	11020	0 %	25 %	50 %	25 %	386602517
33	NC_017630	GTCA	2	8	11374	11381	25 %	25 %	25 %	25 %	386602518
34	NC_017630	ATTT	2	8	12103	12110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017630	ATTT	2	8	12134	12141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017630	GATT	2	8	12235	12242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017630	CCAG	2	8	13415	13422	25 %	0 %	25 %	50 %	386602520
38	NC_017630	TATT	2	8	13601	13608	25 %	75 %	0 %	0 %	386602521
39	NC_017630	CAAT	2	8	14357	14364	50 %	25 %	0 %	25 %	386602521
40	NC_017630	CATC	2	8	14802	14809	25 %	25 %	0 %	50 %	386602521
41	NC_017630	CTGC	2	8	14963	14970	0 %	25 %	25 %	50 %	386602521
42	NC_017630	GGAC	2	8	15255	15262	25 %	0 %	50 %	25 %	386602521
43	NC_017630	CTGG	2	8	15514	15521	0 %	25 %	50 %	25 %	386602521
44	NC_017630	TTCA	2	8	16315	16322	25 %	50 %	0 %	25 %	386602521
45	NC_017630	CTCC	2	8	16330	16337	0 %	25 %	0 %	75 %	386602521
46	NC_017630	GCGG	2	8	16371	16378	0 %	0 %	75 %	25 %	386602521
47	NC_017630	TCAC	2	8	16723	16730	25 %	25 %	0 %	50 %	386602522
48	NC_017630	CCCT	2	8	17702	17709	0 %	25 %	0 %	75 %	386602522
49	NC_017630	ACAT	2	8	17843	17850	50 %	25 %	0 %	25 %	386602523
50	NC_017630	ATCC	2	8	18146	18153	25 %	25 %	0 %	50 %	386602523
51	NC_017630	ATCC	2	8	18371	18378	25 %	25 %	0 %	50 %	386602523
52	NC_017630	CCTG	2	8	18679	18686	0 %	25 %	25 %	50 %	386602524
53	NC_017630	CTCC	2	8	19330	19337	0 %	25 %	0 %	75 %	386602526
54	NC_017630	ATTT	2	8	19356	19363	25 %	75 %	0 %	0 %	386602526
55	NC_017630	TTAT	2	8	19376	19383	25 %	75 %	0 %	0 %	386602526
56	NC_017630	ACAA	2	8	19602	19609	75 %	0 %	0 %	25 %	386602526
57	NC_017630	ACTG	2	8	19653	19660	25 %	25 %	25 %	25 %	386602527
58	NC_017630	TACA	2	8	19733	19740	50 %	25 %	0 %	25 %	386602527
59	NC_017630	TTTC	2	8	20653	20660	0 %	75 %	0 %	25 %	386602528
60	NC_017630	GTCA	2	8	20676	20683	25 %	25 %	25 %	25 %	386602528
61	NC_017630	CCTG	2	8	20911	20918	0 %	25 %	25 %	50 %	386602529
62	NC_017630	CAGA	2	8	21183	21190	50 %	0 %	25 %	25 %	386602530
63	NC_017630	GTTT	2	8	21236	21243	0 %	75 %	25 %	0 %	386602530
64	NC_017630	CCAC	2	8	21827	21834	25 %	0 %	0 %	75 %	386602530
65	NC_017630	TGAA	2	8	22420	22427	50 %	25 %	25 %	0 %	386602530
66	NC_017630	GTCC	2	8	24206	24213	0 %	25 %	25 %	50 %	386602533
67	NC_017630	CGTC	2	8	24442	24449	0 %	25 %	25 %	50 %	386602534
68	NC_017630	CTGA	2	8	24563	24570	25 %	25 %	25 %	25 %	386602534
69	NC_017630	GACG	2	8	25077	25084	25 %	0 %	50 %	25 %	386602535
70	NC_017630	GGCT	2	8	25462	25469	0 %	25 %	50 %	25 %	386602536
71	NC_017630	GGAA	2	8	25939	25946	50 %	0 %	50 %	0 %	386602537
72	NC_017630	GACG	2	8	26343	26350	25 %	0 %	50 %	25 %	386602537
73	NC_017630	CCCA	2	8	26360	26367	25 %	0 %	0 %	75 %	386602537
74	NC_017630	GCCA	2	8	26580	26587	25 %	0 %	25 %	50 %	386602537
75	NC_017630	GGTG	2	8	26957	26964	0 %	25 %	75 %	0 %	386602537
76	NC_017630	ACGG	2	8	27315	27322	25 %	0 %	50 %	25 %	386602537
77	NC_017630	ACCA	2	8	28013	28020	50 %	0 %	0 %	50 %	386602537
78	NC_017630	TCAT	2	8	28158	28165	25 %	50 %	0 %	25 %	386602537
79	NC_017630	TTTC	2	8	28565	28572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017630	CAGT	2	8	29127	29134	25 %	25 %	25 %	25 %	386602540
81	NC_017630	TCAG	2	8	29189	29196	25 %	25 %	25 %	25 %	386602540
82	NC_017630	TTAT	2	8	29393	29400	25 %	75 %	0 %	0 %	386602540
83	NC_017630	ATTT	2	8	29606	29613	25 %	75 %	0 %	0 %	386602541
84	NC_017630	TTAA	2	8	29824	29831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017630	GCGG	2	8	29955	29962	0 %	0 %	75 %	25 %	386602542
86	NC_017630	AATA	2	8	30316	30323	75 %	25 %	0 %	0 %	386602542
87	NC_017630	ATTT	2	8	30545	30552	25 %	75 %	0 %	0 %	386602543
88	NC_017630	AGGA	2	8	30787	30794	50 %	0 %	50 %	0 %	386602544
89	NC_017630	GCAT	2	8	30824	30831	25 %	25 %	25 %	25 %	386602544
90	NC_017630	TGTT	2	8	30919	30926	0 %	75 %	25 %	0 %	386602544
91	NC_017630	CTTC	2	8	30994	31001	0 %	50 %	0 %	50 %	386602544
92	NC_017630	ACAT	2	8	31086	31093	50 %	25 %	0 %	25 %	386602545
93	NC_017630	AAAC	2	8	31336	31343	75 %	0 %	0 %	25 %	386602545
94	NC_017630	TGCG	2	8	31633	31640	0 %	25 %	50 %	25 %	386602546
95	NC_017630	AGGC	2	8	32473	32480	25 %	0 %	50 %	25 %	386602546
96	NC_017630	TGTT	2	8	32601	32608	0 %	75 %	25 %	0 %	386602546
97	NC_017630	CAGA	2	8	32791	32798	50 %	0 %	25 %	25 %	386602546
98	NC_017630	CTGG	2	8	32950	32957	0 %	25 %	50 %	25 %	386602546
99	NC_017630	GGCT	2	8	32960	32967	0 %	25 %	50 %	25 %	386602546
100	NC_017630	CCAG	2	8	33635	33642	25 %	0 %	25 %	50 %	386602547
101	NC_017630	TGGT	2	8	34437	34444	0 %	50 %	50 %	0 %	386602549
102	NC_017630	AATA	2	8	34540	34547	75 %	25 %	0 %	0 %	386602549
103	NC_017630	CTGT	2	8	35369	35376	0 %	50 %	25 %	25 %	386602552
104	NC_017630	TATT	2	8	35855	35862	25 %	75 %	0 %	0 %	386602552
105	NC_017630	TAAT	2	8	36013	36020	50 %	50 %	0 %	0 %	386602552
106	NC_017630	TATT	2	8	36436	36443	25 %	75 %	0 %	0 %	386602553
107	NC_017630	ATTT	2	8	36520	36527	25 %	75 %	0 %	0 %	386602553
108	NC_017630	AAAT	2	8	36737	36744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017630	AAAT	2	8	37988	37995	75 %	25 %	0 %	0 %	386602555
110	NC_017630	ATTG	2	8	38374	38381	25 %	50 %	25 %	0 %	386602555
111	NC_017630	TCAG	2	8	38820	38827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017630	CAGT	2	8	39173	39180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017630	GCCC	2	8	39463	39470	0 %	0 %	25 %	75 %	386602556
114	NC_017630	CCAG	2	8	41544	41551	25 %	0 %	25 %	50 %	386602560
115	NC_017630	CCTT	2	8	41953	41960	0 %	50 %	0 %	50 %	386602561
116	NC_017630	GCGT	2	8	42122	42129	0 %	25 %	50 %	25 %	386602561
117	NC_017630	GTTC	2	8	42419	42426	0 %	50 %	25 %	25 %	386602561
118	NC_017630	CACT	2	8	43325	43332	25 %	25 %	0 %	50 %	386602561
119	NC_017630	GCTT	2	8	43392	43399	0 %	50 %	25 %	25 %	386602561
120	NC_017630	CAGT	2	8	43774	43781	25 %	25 %	25 %	25 %	386602562
121	NC_017630	TGGC	2	8	43917	43924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017630	CAGT	2	8	44554	44561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017630	ACAA	2	8	44624	44631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017630	GCCC	2	8	44857	44864	0 %	0 %	25 %	75 %	386602564
125	NC_017630	ACAG	2	8	44910	44917	50 %	0 %	25 %	25 %	386602564
126	NC_017630	AGAC	2	8	45269	45276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017630	ACTG	2	8	45700	45707	25 %	25 %	25 %	25 %	386602565
128	NC_017630	CGGG	2	8	46742	46749	0 %	0 %	75 %	25 %	386602566
129	NC_017630	AGCG	2	8	46854	46861	25 %	0 %	50 %	25 %	386602566
130	NC_017630	TGAC	2	8	47565	47572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017630	AAAT	2	8	47604	47611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017630	CAGT	2	8	47835	47842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017630	GGCA	2	8	47904	47911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017630	GCCC	2	8	48123	48130	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_017630	CTGC	2	8	48674	48681	0 %	25 %	25 %	50 %	386602568
136	NC_017630	CCGT	2	8	49008	49015	0 %	25 %	25 %	50 %	386602569
137	NC_017630	CCCG	2	8	49674	49681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_017630	GCCA	2	8	50299	50306	25 %	0 %	25 %	50 %	386602572
139	NC_017630	ACTG	2	8	50369	50376	25 %	25 %	25 %	25 %	386602572
140	NC_017630	TCAT	2	8	50618	50625	25 %	50 %	0 %	25 %	386602572
141	NC_017630	CTGC	2	8	51491	51498	0 %	25 %	25 %	50 %	386602574
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143	NC_017630	GCCC	2	8	52373	52380	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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322	NC_017630	TTCA	2	8	109311	109318	25 %	50 %	0 %	25 %	386602636
323	NC_017630	GCCA	2	8	109932	109939	25 %	0 %	25 %	50 %	386602637
324	NC_017630	CAGC	2	8	109968	109975	25 %	0 %	25 %	50 %	386602637
325	NC_017630	GGCG	2	8	110520	110527	0 %	0 %	75 %	25 %	386602639
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327	NC_017630	TGAT	2	8	111239	111246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
328	NC_017630	CCAG	2	8	111414	111421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
329	NC_017630	TCTG	2	8	111640	111647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
330	NC_017630	AATG	2	8	111683	111690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
331	NC_017630	TGTT	2	8	112323	112330	0 %	75 %	25 %	0 %	386602640
332	NC_017630	GTCG	2	8	112418	112425	0 %	25 %	50 %	25 %	386602640
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335	NC_017630	AGAA	2	8	112893	112900	75 %	0 %	25 %	0 %	386602640
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337	NC_017630	TTTC	2	8	113186	113193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
338	NC_017630	GCCT	2	8	113763	113770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
339	NC_017630	TGGC	2	8	113820	113827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
340	NC_017630	GAAC	2	8	113858	113865	50 %	0 %	25 %	25 %	386602642
341	NC_017630	TAAT	2	8	114260	114267	50 %	50 %	0 %	0 %	386602642

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.