MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	GC	3	6	514	519	0 %	0 %	50 %	50 %	387604869
2	NC_017627	AT	3	6	2532	2537	50 %	50 %	0 %	0 %	387604871
3	NC_017627	AT	3	6	2914	2919	50 %	50 %	0 %	0 %	387604871
4	NC_017627	AT	3	6	4355	4360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017627	CA	3	6	4377	4382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017627	TA	3	6	4412	4417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017627	TA	3	6	4446	4451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017627	AT	3	6	4738	4743	50 %	50 %	0 %	0 %	387604874
9	NC_017627	AG	3	6	5151	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
10	NC_017627	AG	3	6	5172	5177	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
11	NC_017627	AG	3	6	5254	5259	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
12	NC_017627	TA	3	6	5851	5856	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
13	NC_017627	AT	3	6	5982	5987	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
14	NC_017627	GA	3	6	6001	6006	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
15	NC_017627	TA	3	6	6013	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
16	NC_017627	GA	3	6	6082	6087	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
17	NC_017627	GA	3	6	6249	6254	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
18	NC_017627	AG	3	6	6267	6272	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
19	NC_017627	TA	3	6	6712	6717	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
20	NC_017627	TA	3	6	7355	7360	50 %	50 %	0 %	0 %	387604876
21	NC_017627	AT	3	6	7817	7822	50 %	50 %	0 %	0 %	387604877
22	NC_017627	TC	3	6	7997	8002	0 %	50 %	0 %	50 %	387604877
23	NC_017627	AT	3	6	8441	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	387604878
24	NC_017627	TA	3	6	8885	8890	50 %	50 %	0 %	0 %	387604878
25	NC_017627	AT	3	6	9177	9182	50 %	50 %	0 %	0 %	387604878
26	NC_017627	CT	3	6	9612	9617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017627	AG	3	6	9622	9627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017627	CT	3	6	11057	11062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017627	CT	3	6	11858	11863	0 %	50 %	0 %	50 %	387604880
30	NC_017627	GC	3	6	13173	13178	0 %	0 %	50 %	50 %	387604882
31	NC_017627	CT	4	8	13690	13697	0 %	50 %	0 %	50 %	387604883
32	NC_017627	AC	3	6	13960	13965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017627	GC	3	6	14877	14882	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
34	NC_017627	GC	3	6	14925	14930	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
35	NC_017627	GC	3	6	15027	15032	0 %	0 %	50 %	50 %	387604885
36	NC_017627	TA	3	6	15491	15496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017627	GA	3	6	16110	16115	50 %	0 %	50 %	0 %	387604886
38	NC_017627	TA	3	6	16223	16228	50 %	50 %	0 %	0 %	387604886
39	NC_017627	AT	3	6	17766	17771	50 %	50 %	0 %	0 %	387604888
40	NC_017627	GA	3	6	17873	17878	50 %	0 %	50 %	0 %	387604888
41	NC_017627	CT	3	6	18850	18855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017627	TG	3	6	19505	19510	0 %	50 %	50 %	0 %	387604889
43	NC_017627	GA	3	6	19625	19630	50 %	0 %	50 %	0 %	387604889
44	NC_017627	TG	3	6	20548	20553	0 %	50 %	50 %	0 %	387604890
45	NC_017627	TC	3	6	22008	22013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017627	AT	3	6	22592	22597	50 %	50 %	0 %	0 %	387604892
47	NC_017627	TC	3	6	23094	23099	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
48	NC_017627	CT	3	6	23520	23525	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
49	NC_017627	GT	3	6	24144	24149	0 %	50 %	50 %	0 %	387604893
50	NC_017627	CA	3	6	25590	25595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017627	CT	3	6	25967	25972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017627	AC	3	6	26370	26375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017627	AT	3	6	26649	26654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017627	TA	3	6	26657	26662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017627	CA	3	6	27960	27965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017627	GA	3	6	28063	28068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017627	AT	3	6	28069	28074	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
58	NC_017627	AT	3	6	28239	28244	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
59	NC_017627	CA	3	6	28440	28445	50 %	0 %	0 %	50 %	387604896
60	NC_017627	AG	3	6	29605	29610	50 %	0 %	50 %	0 %	387604896
61	NC_017627	AT	3	6	30085	30090	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
62	NC_017627	AT	3	6	31408	31413	50 %	50 %	0 %	0 %	387604896
63	NC_017627	CA	3	6	32767	32772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017627	CG	3	6	33212	33217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017627	AC	3	6	34232	34237	50 %	0 %	0 %	50 %	387604898
66	NC_017627	TC	3	6	34798	34803	0 %	50 %	0 %	50 %	387604899
67	NC_017627	AT	3	6	38068	38073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017627	TA	3	6	39060	39065	50 %	50 %	0 %	0 %	387604901
69	NC_017627	TA	3	6	39114	39119	50 %	50 %	0 %	0 %	387604901
70	NC_017627	AT	3	6	39315	39320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017627	TA	3	6	39593	39598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017627	AT	3	6	40093	40098	50 %	50 %	0 %	0 %	387604903
73	NC_017627	AT	3	6	41409	41414	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
74	NC_017627	AT	3	6	41461	41466	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
75	NC_017627	AT	3	6	41706	41711	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
76	NC_017627	CT	3	6	41718	41723	0 %	50 %	0 %	50 %	387604906
77	NC_017627	TA	3	6	41799	41804	50 %	50 %	0 %	0 %	387604906
78	NC_017627	AT	3	6	41952	41957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017627	AC	3	6	42142	42147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017627	GC	3	6	42387	42392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017627	TC	3	6	43041	43046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017627	TA	3	6	43062	43067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017627	AT	3	6	43185	43190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017627	AT	3	6	43316	43321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017627	AT	3	6	43469	43474	50 %	50 %	0 %	0 %	387604908
86	NC_017627	GT	3	6	43862	43867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017627	AT	3	6	44133	44138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017627	CT	3	6	44995	45000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017627	AT	3	6	45974	45979	50 %	50 %	0 %	0 %	387604909
90	NC_017627	TC	3	6	46119	46124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017627	TA	3	6	46411	46416	50 %	50 %	0 %	0 %	387604910
92	NC_017627	GA	3	6	48766	48771	50 %	0 %	50 %	0 %	387604913
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94	NC_017627	GT	3	6	49512	49517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017627	CT	3	6	50509	50514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017627	CA	3	6	50685	50690	50 %	0 %	0 %	50 %	387604915
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98	NC_017627	TG	3	6	54180	54185	0 %	50 %	50 %	0 %	387604917
99	NC_017627	CT	3	6	54301	54306	0 %	50 %	0 %	50 %	387604917
100	NC_017627	TG	3	6	54801	54806	0 %	50 %	50 %	0 %	387604917
101	NC_017627	CT	3	6	55392	55397	0 %	50 %	0 %	50 %	387604917
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104	NC_017627	GT	3	6	58611	58616	0 %	50 %	50 %	0 %	387604918
105	NC_017627	AT	3	6	59231	59236	50 %	50 %	0 %	0 %	387604918
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108	NC_017627	GA	3	6	61552	61557	50 %	0 %	50 %	0 %	387604921
109	NC_017627	TA	3	6	61580	61585	50 %	50 %	0 %	0 %	387604921
110	NC_017627	TG	3	6	63134	63139	0 %	50 %	50 %	0 %	387604922
111	NC_017627	GA	3	6	63432	63437	50 %	0 %	50 %	0 %	387604922
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113	NC_017627	AT	4	8	66289	66296	50 %	50 %	0 %	0 %	387604924
114	NC_017627	AT	3	6	66431	66436	50 %	50 %	0 %	0 %	387604925
115	NC_017627	GT	3	6	66737	66742	0 %	50 %	50 %	0 %	387604926
116	NC_017627	GA	3	6	67170	67175	50 %	0 %	50 %	0 %	387604926
117	NC_017627	TG	3	6	67505	67510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017627	TG	3	6	69764	69769	0 %	50 %	50 %	0 %	387604931
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121	NC_017627	AT	3	6	71563	71568	50 %	50 %	0 %	0 %	387604933
122	NC_017627	AT	3	6	71724	71729	50 %	50 %	0 %	0 %	387604933
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125	NC_017627	TG	3	6	74213	74218	0 %	50 %	50 %	0 %	387604937
126	NC_017627	GC	3	6	74632	74637	0 %	0 %	50 %	50 %	387604937
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128	NC_017627	CT	3	6	75101	75106	0 %	50 %	0 %	50 %	387604937
129	NC_017627	GC	3	6	75107	75112	0 %	0 %	50 %	50 %	387604937
130	NC_017627	AC	3	6	75695	75700	50 %	0 %	0 %	50 %	387604937
131	NC_017627	TG	3	6	75815	75820	0 %	50 %	50 %	0 %	387604937
132	NC_017627	CG	3	6	76131	76136	0 %	0 %	50 %	50 %	387604937
133	NC_017627	GC	3	6	78719	78724	0 %	0 %	50 %	50 %	387604942
134	NC_017627	GC	3	6	79782	79787	0 %	0 %	50 %	50 %	387604943
135	NC_017627	AT	3	6	80726	80731	50 %	50 %	0 %	0 %	387604944
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138	NC_017627	TA	3	6	82578	82583	50 %	50 %	0 %	0 %	387604948
139	NC_017627	CT	3	6	82585	82590	0 %	50 %	0 %	50 %	387604948
140	NC_017627	CA	3	6	82772	82777	50 %	0 %	0 %	50 %	387604948
141	NC_017627	CA	4	8	84341	84348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017627	TA	4	8	84409	84416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017627	CA	3	6	85019	85024	50 %	0 %	0 %	50 %	387604951
144	NC_017627	AT	3	6	85267	85272	50 %	50 %	0 %	0 %	387604951
145	NC_017627	GC	3	6	86478	86483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017627	GA	3	6	88241	88246	50 %	0 %	50 %	0 %	387604957
147	NC_017627	GT	3	6	88392	88397	0 %	50 %	50 %	0 %	387604957
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.