MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli DH1 chromosome

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017625	GCGGA	2	10	232	241	20 %	0 %	60 %	20 %	386593591
2	NC_017625	TTTAC	2	10	2904	2913	20 %	60 %	0 %	20 %	386593593
3	NC_017625	TGGCG	2	10	7583	7592	0 %	20 %	60 %	20 %	386593596
4	NC_017625	TGAAA	2	10	8775	8784	60 %	20 %	20 %	0 %	386593598
5	NC_017625	AAACT	2	10	10160	10169	60 %	20 %	0 %	20 %	386593599
6	NC_017625	GGTAC	2	10	10342	10351	20 %	20 %	40 %	20 %	386593600
7	NC_017625	AGTGA	2	10	10420	10429	40 %	20 %	40 %	0 %	386593600
8	NC_017625	GTTGG	2	10	11116	11125	0 %	40 %	60 %	0 %	386593601
9	NC_017625	TTATT	2	10	12280	12289	20 %	80 %	0 %	0 %	386593602
10	NC_017625	CGGAA	2	10	15247	15256	40 %	0 %	40 %	20 %	386593604
11	NC_017625	ACCTG	2	10	16281	16290	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017625	CGCAG	2	10	17245	17254	20 %	0 %	40 %	40 %	386593607
13	NC_017625	TGGTG	2	10	21226	21235	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017625	TGAAA	2	10	22678	22687	60 %	20 %	20 %	0 %	386593610
15	NC_017625	AAATG	2	10	26581	26590	60 %	20 %	20 %	0 %	386593612
16	NC_017625	ATTTT	2	10	27322	27331	20 %	80 %	0 %	0 %	386593613
17	NC_017625	CCGCA	2	10	28569	28578	20 %	0 %	20 %	60 %	386593616
18	NC_017625	GCATC	2	10	30037	30046	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017625	TGGGC	2	10	32219	32228	0 %	20 %	60 %	20 %	386593619
20	NC_017625	GCGCT	2	10	32260	32269	0 %	20 %	40 %	40 %	386593619
21	NC_017625	GTGTT	2	10	32289	32298	0 %	60 %	40 %	0 %	386593619
22	NC_017625	TCCGA	2	10	32916	32925	20 %	20 %	20 %	40 %	386593620
23	NC_017625	TCTGG	2	10	34180	34189	0 %	40 %	40 %	20 %	386593622
24	NC_017625	CTGGC	2	10	34289	34298	0 %	20 %	40 %	40 %	386593622
25	NC_017625	GCACG	2	10	35083	35092	20 %	0 %	40 %	40 %	386593622
26	NC_017625	GCTGC	2	10	35666	35675	0 %	20 %	40 %	40 %	386593623
27	NC_017625	GCGGA	2	10	38652	38661	20 %	0 %	60 %	20 %	386593625
28	NC_017625	TGCCT	2	10	39371	39380	0 %	40 %	20 %	40 %	386593625
29	NC_017625	ATTCC	2	10	40664	40673	20 %	40 %	0 %	40 %	386593626
30	NC_017625	CTCGC	2	10	41661	41670	0 %	20 %	20 %	60 %	386593627
31	NC_017625	TCAGG	2	10	41689	41698	20 %	20 %	40 %	20 %	386593627
32	NC_017625	CGCGG	2	10	42047	42056	0 %	0 %	60 %	40 %	386593628
33	NC_017625	CGTTT	2	10	43700	43709	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017625	CGACC	2	10	44182	44191	20 %	0 %	20 %	60 %	386593631
35	NC_017625	GTATT	2	10	46870	46879	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017625	TTGAT	2	10	47046	47055	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017625	AATAG	2	10	47139	47148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017625	CTTAC	2	10	48187	48196	20 %	40 %	0 %	40 %	386593635
39	NC_017625	TTAAT	2	10	48341	48350	40 %	60 %	0 %	0 %	386593635
40	NC_017625	GTTTG	2	10	50811	50820	0 %	60 %	40 %	0 %	386593636
41	NC_017625	CTTTA	2	10	51357	51366	20 %	60 %	0 %	20 %	386593636
42	NC_017625	CGGAC	2	10	53909	53918	20 %	0 %	40 %	40 %	386593638
43	NC_017625	CGCTT	2	10	56354	56363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017625	GTGTG	2	10	62211	62220	0 %	40 %	60 %	0 %	386593644
45	NC_017625	GCTTT	2	10	62538	62547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017625	CGGGA	2	10	62994	63003	20 %	0 %	60 %	20 %	386593645
47	NC_017625	TGTGG	2	10	63728	63737	0 %	40 %	60 %	0 %	386593645
48	NC_017625	AGGGG	2	10	64958	64967	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017625	TGCTG	2	10	65545	65554	0 %	40 %	40 %	20 %	386593647
50	NC_017625	CTGCC	2	10	65685	65694	0 %	20 %	20 %	60 %	386593647
51	NC_017625	GAATC	2	10	67883	67892	40 %	20 %	20 %	20 %	386593649
52	NC_017625	CAGAT	2	10	69981	69990	40 %	20 %	20 %	20 %	386593653
53	NC_017625	TGGCG	2	10	71419	71428	0 %	20 %	60 %	20 %	386593654
54	NC_017625	ACGCT	2	10	73456	73465	20 %	20 %	20 %	40 %	386593658
55	NC_017625	CTTAA	2	10	75592	75601	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017625	GCCTG	2	10	76965	76974	0 %	20 %	40 %	40 %	386593661
57	NC_017625	CATCA	2	10	81898	81907	40 %	20 %	0 %	40 %	386593666
58	NC_017625	TACAA	2	10	82463	82472	60 %	20 %	0 %	20 %	386593666
59	NC_017625	TATAA	2	10	82888	82897	60 %	40 %	0 %	0 %	386593667
60	NC_017625	CATGG	2	10	83257	83266	20 %	20 %	40 %	20 %	386593667
61	NC_017625	CAGCG	2	10	83348	83357	20 %	0 %	40 %	40 %	386593667
62	NC_017625	AAAAT	2	10	83616	83625	80 %	20 %	0 %	0 %	386593668
63	NC_017625	ATAAA	2	10	85046	85055	80 %	20 %	0 %	0 %	386593669
64	NC_017625	CGTTG	2	10	85269	85278	0 %	40 %	40 %	20 %	386593669
65	NC_017625	ATCAC	2	10	85644	85653	40 %	20 %	0 %	40 %	386593670
66	NC_017625	CCATG	2	10	87442	87451	20 %	20 %	20 %	40 %	386593671
67	NC_017625	TGTGC	2	10	88389	88398	0 %	40 %	40 %	20 %	386593672
68	NC_017625	CTGAT	2	10	91387	91396	20 %	40 %	20 %	20 %	386593675
69	NC_017625	ACGGA	2	10	94877	94886	40 %	0 %	40 %	20 %	386593678
70	NC_017625	GCGCG	2	10	95170	95179	0 %	0 %	60 %	40 %	386593678
71	NC_017625	GCGTA	2	10	95378	95387	20 %	20 %	40 %	20 %	386593678
72	NC_017625	TCATC	2	10	96628	96637	20 %	40 %	0 %	40 %	386593679
73	NC_017625	GCACA	2	10	99498	99507	40 %	0 %	20 %	40 %	386593682
74	NC_017625	AACAA	2	10	99642	99651	80 %	0 %	0 %	20 %	386593683
75	NC_017625	GCGCG	2	10	101845	101854	0 %	0 %	60 %	40 %	386593685
76	NC_017625	GGGAT	2	10	102009	102018	20 %	20 %	60 %	0 %	386593685
77	NC_017625	GGGCA	2	10	102204	102213	20 %	0 %	60 %	20 %	386593686
78	NC_017625	CAAAG	2	10	104313	104322	60 %	0 %	20 %	20 %	386593688
79	NC_017625	TCTTT	2	10	104328	104337	0 %	80 %	0 %	20 %	386593688
80	NC_017625	CATGC	2	10	104364	104373	20 %	20 %	20 %	40 %	386593688
81	NC_017625	TTGTG	2	10	106452	106461	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017625	CTAAA	2	10	107326	107335	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017625	TGCAT	2	10	107701	107710	20 %	40 %	20 %	20 %	386593692
84	NC_017625	GCAGT	2	10	107763	107772	20 %	20 %	40 %	20 %	386593692
85	NC_017625	ATTGC	2	10	108193	108202	20 %	40 %	20 %	20 %	386593693
86	NC_017625	ACCGT	2	10	109813	109822	20 %	20 %	20 %	40 %	386593694
87	NC_017625	GGTCA	2	10	110181	110190	20 %	20 %	40 %	20 %	386593694
88	NC_017625	TGACG	2	10	111667	111676	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017625	TTTTG	2	10	111760	111769	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017625	TTTTA	2	10	114107	114116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017625	GTTTT	2	10	115506	115515	0 %	80 %	20 %	0 %	386593697
92	NC_017625	CGGTG	2	10	119453	119462	0 %	20 %	60 %	20 %	386593699
93	NC_017625	CGGGC	2	10	121374	121383	0 %	0 %	60 %	40 %	386593699
94	NC_017625	CGCAG	2	10	123588	123597	20 %	0 %	40 %	40 %	386593701
95	NC_017625	CGCGG	2	10	125024	125033	0 %	0 %	60 %	40 %	386593702
96	NC_017625	ACGCA	2	10	128021	128030	40 %	0 %	20 %	40 %	386593704
97	NC_017625	TGATG	2	10	128088	128097	20 %	40 %	40 %	0 %	386593704
98	NC_017625	TGGTG	2	10	129876	129885	0 %	40 %	60 %	0 %	386593707
99	NC_017625	AGATG	2	10	130035	130044	40 %	20 %	40 %	0 %	386593707
100	NC_017625	AGGTA	2	10	130521	130530	40 %	20 %	40 %	0 %	386593707
101	NC_017625	GCCAG	2	10	137623	137632	20 %	0 %	40 %	40 %	386593714
102	NC_017625	AGCCC	2	10	138677	138686	20 %	0 %	20 %	60 %	386593715
103	NC_017625	ATACA	2	10	139375	139384	60 %	20 %	0 %	20 %	386593716
104	NC_017625	TTGGG	2	10	140828	140837	0 %	40 %	60 %	0 %	386593718
105	NC_017625	AGCGG	2	10	141849	141858	20 %	0 %	60 %	20 %	386593719
106	NC_017625	CCCAA	2	10	143779	143788	40 %	0 %	0 %	60 %	386593721
107	NC_017625	TGCCC	2	10	144243	144252	0 %	20 %	20 %	60 %	386593722
108	NC_017625	CATGG	2	10	147786	147795	20 %	20 %	40 %	20 %	386593724
109	NC_017625	AAAGC	2	10	148414	148423	60 %	0 %	20 %	20 %	386593724
110	NC_017625	ATGCC	2	10	150759	150768	20 %	20 %	20 %	40 %	386593726
111	NC_017625	AGCGT	2	10	151196	151205	20 %	20 %	40 %	20 %	386593726
112	NC_017625	ATTTT	2	10	152858	152867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017625	CTGGG	2	10	153907	153916	0 %	20 %	60 %	20 %	386593728
114	NC_017625	GGGGC	2	10	155572	155581	0 %	0 %	80 %	20 %	386593729
115	NC_017625	GCGCA	2	10	157010	157019	20 %	0 %	40 %	40 %	386593732
116	NC_017625	CTGGG	2	10	158835	158844	0 %	20 %	60 %	20 %	386593734
117	NC_017625	ATCGA	2	10	160284	160293	40 %	20 %	20 %	20 %	386593735
118	NC_017625	CCTCT	2	10	162256	162265	0 %	40 %	0 %	60 %	386593736
119	NC_017625	GTTAC	2	10	163512	163521	20 %	40 %	20 %	20 %	386593739
120	NC_017625	GATTC	2	10	164395	164404	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017625	TTACG	2	10	165027	165036	20 %	40 %	20 %	20 %	386593741
122	NC_017625	GCTTC	2	10	166955	166964	0 %	40 %	20 %	40 %	386593743
123	NC_017625	TTCGC	2	10	169104	169113	0 %	40 %	20 %	40 %	386593744
124	NC_017625	CATTA	2	10	171157	171166	40 %	40 %	0 %	20 %	386593747
125	NC_017625	TGGTG	2	10	172349	172358	0 %	40 %	60 %	0 %	386593748
126	NC_017625	AGAAC	2	10	174238	174247	60 %	0 %	20 %	20 %	386593749
127	NC_017625	GCACG	2	10	174712	174721	20 %	0 %	40 %	40 %	386593749
128	NC_017625	AGCGA	2	10	175236	175245	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017625	TCGAC	2	10	175396	175405	20 %	20 %	20 %	40 %	386593750
130	NC_017625	TGAAC	2	10	176390	176399	40 %	20 %	20 %	20 %	386593751
131	NC_017625	AGTGA	2	10	176514	176523	40 %	20 %	40 %	0 %	386593751
132	NC_017625	TTGCC	2	10	179513	179522	0 %	40 %	20 %	40 %	386593753
133	NC_017625	CGTTT	2	10	181014	181023	0 %	60 %	20 %	20 %	386593755
134	NC_017625	ACGAA	2	10	182112	182121	60 %	0 %	20 %	20 %	386593756
135	NC_017625	AATGG	2	10	182575	182584	40 %	20 %	40 %	0 %	386593756
136	NC_017625	CAAAG	2	10	185316	185325	60 %	0 %	20 %	20 %	386593758
137	NC_017625	AAAGA	2	10	186497	186506	80 %	0 %	20 %	0 %	386593760
138	NC_017625	ATTTT	2	10	187062	187071	20 %	80 %	0 %	0 %	386593760
139	NC_017625	ACGGT	2	10	187546	187555	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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143	NC_017625	GCAAC	2	10	191237	191246	40 %	0 %	20 %	40 %	386593764
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159	NC_017625	TTGGG	2	10	223694	223703	0 %	40 %	60 %	0 %	386593783
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163	NC_017625	CTGTC	2	10	231810	231819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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175	NC_017625	CGCGG	2	10	246174	246183	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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246	NC_017625	TTGAT	2	10	331115	331124	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_017625	GTACC	2	10	335189	335198	20 %	20 %	20 %	40 %	386593876
249	NC_017625	GATGC	2	10	335795	335804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_017625	GGTGA	2	10	348811	348820	20 %	20 %	60 %	0 %	386593888
253	NC_017625	TCGGT	2	10	349743	349752	0 %	40 %	40 %	20 %	386593889
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394	NC_017625	TGGCA	2	10	591677	591686	20 %	20 %	40 %	20 %	386594137
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399	NC_017625	ATTCG	2	10	599771	599780	20 %	40 %	20 %	20 %	386594145
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443	NC_017625	GCGCC	2	10	666514	666523	0 %	0 %	40 %	60 %	386594206
444	NC_017625	AACGC	2	10	666524	666533	40 %	0 %	20 %	40 %	386594206
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497	NC_017625	GTCAG	2	10	759121	759130	20 %	20 %	40 %	20 %	386594292
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