MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Erwinia sp. Ejp617 chromosome

Total Repeats: 2634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017445	CAGCG	2	10	1465	1474	20 %	0 %	40 %	40 %	385785461
2	NC_017445	ACACC	2	10	3146	3155	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017445	CCATA	2	10	5632	5641	40 %	20 %	0 %	40 %	385785465
4	NC_017445	GCGGT	2	10	5970	5979	0 %	20 %	60 %	20 %	385785466
5	NC_017445	GCCAG	2	10	7254	7263	20 %	0 %	40 %	40 %	385785466
6	NC_017445	AGTTG	2	10	9688	9697	20 %	40 %	40 %	0 %	385785468
7	NC_017445	CGATG	2	10	10799	10808	20 %	20 %	40 %	20 %	385785468
8	NC_017445	TGGCA	2	10	12327	12336	20 %	20 %	40 %	20 %	385785469
9	NC_017445	GCAGC	2	10	13892	13901	20 %	0 %	40 %	40 %	385785470
10	NC_017445	CTGAT	2	10	15848	15857	20 %	40 %	20 %	20 %	385785471
11	NC_017445	CTGAC	2	10	19635	19644	20 %	20 %	20 %	40 %	385785473
12	NC_017445	GGGCC	2	10	21061	21070	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017445	CGTTC	2	10	21737	21746	0 %	40 %	20 %	40 %	385785475
14	NC_017445	AATAC	2	10	22812	22821	60 %	20 %	0 %	20 %	385785477
15	NC_017445	TCCTG	2	10	24884	24893	0 %	40 %	20 %	40 %	385785478
16	NC_017445	TATTT	2	10	24897	24906	20 %	80 %	0 %	0 %	385785478
17	NC_017445	TTCCA	2	10	25637	25646	20 %	40 %	0 %	40 %	385785478
18	NC_017445	TAAAT	2	10	25651	25660	60 %	40 %	0 %	0 %	385785478
19	NC_017445	GCTGA	2	10	28446	28455	20 %	20 %	40 %	20 %	385785481
20	NC_017445	CTGGC	2	10	30465	30474	0 %	20 %	40 %	40 %	385785482
21	NC_017445	AGATA	2	10	32232	32241	60 %	20 %	20 %	0 %	385785485
22	NC_017445	GCACC	2	10	32516	32525	20 %	0 %	20 %	60 %	385785485
23	NC_017445	AATTC	2	10	33447	33456	40 %	40 %	0 %	20 %	385785486
24	NC_017445	CCAAT	2	10	34102	34111	40 %	20 %	0 %	40 %	385785486
25	NC_017445	CGAGA	2	10	35314	35323	40 %	0 %	40 %	20 %	385785487
26	NC_017445	GGGAT	2	10	39400	39409	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017445	CAATG	2	10	40733	40742	40 %	20 %	20 %	20 %	385785492
28	NC_017445	GGTCA	2	10	42325	42334	20 %	20 %	40 %	20 %	385785493
29	NC_017445	CGCCC	2	10	43999	44008	0 %	0 %	20 %	80 %	385785496
30	NC_017445	CGGAG	2	10	45313	45322	20 %	0 %	60 %	20 %	385785496
31	NC_017445	AGGCC	2	10	45561	45570	20 %	0 %	40 %	40 %	385785496
32	NC_017445	TGATC	2	10	45801	45810	20 %	40 %	20 %	20 %	385785496
33	NC_017445	TAACA	2	10	46306	46315	60 %	20 %	0 %	20 %	385785496
34	NC_017445	TCGCT	2	10	47571	47580	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017445	GTTCA	2	10	47650	47659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017445	AAAAC	2	10	49307	49316	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017445	ACCGT	2	10	50343	50352	20 %	20 %	20 %	40 %	385785499
38	NC_017445	TGGCG	2	10	51746	51755	0 %	20 %	60 %	20 %	385785501
39	NC_017445	CGCTG	2	10	54188	54197	0 %	20 %	40 %	40 %	385785503
40	NC_017445	AACGG	2	10	54514	54523	40 %	0 %	40 %	20 %	385785503
41	NC_017445	AGGGA	2	10	56073	56082	40 %	0 %	60 %	0 %	385785505
42	NC_017445	TCATC	2	10	56837	56846	20 %	40 %	0 %	40 %	385785505
43	NC_017445	CCTGC	2	10	60526	60535	0 %	20 %	20 %	60 %	385785509
44	NC_017445	CTGCT	2	10	63866	63875	0 %	40 %	20 %	40 %	385785512
45	NC_017445	CTGGC	2	10	64373	64382	0 %	20 %	40 %	40 %	385785513
46	NC_017445	GCAGT	2	10	64598	64607	20 %	20 %	40 %	20 %	385785513
47	NC_017445	TCCAG	2	10	66271	66280	20 %	20 %	20 %	40 %	385785515
48	NC_017445	GGCGT	2	10	67562	67571	0 %	20 %	60 %	20 %	385785516
49	NC_017445	GCGCC	2	10	68298	68307	0 %	0 %	40 %	60 %	385785516
50	NC_017445	CGTGC	2	10	69579	69588	0 %	20 %	40 %	40 %	385785517
51	NC_017445	GCACA	2	10	70360	70369	40 %	0 %	20 %	40 %	385785518
52	NC_017445	GCGCC	2	10	71171	71180	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_017445	GTCAG	2	10	71204	71213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017445	ATCAC	2	10	73866	73875	40 %	20 %	0 %	40 %	385785521
55	NC_017445	TGAGC	2	10	75074	75083	20 %	20 %	40 %	20 %	385785522
56	NC_017445	CGCAA	2	10	75305	75314	40 %	0 %	20 %	40 %	385785523
57	NC_017445	TATAA	2	10	76766	76775	60 %	40 %	0 %	0 %	385785524
58	NC_017445	GCCAG	2	10	83972	83981	20 %	0 %	40 %	40 %	385785530
59	NC_017445	GGTGG	2	10	86023	86032	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017445	CACTG	2	10	86117	86126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017445	TCGCC	2	10	88559	88568	0 %	20 %	20 %	60 %	385785532
62	NC_017445	GCGCC	2	10	89323	89332	0 %	0 %	40 %	60 %	385785532
63	NC_017445	ACGCC	2	10	90977	90986	20 %	0 %	20 %	60 %	385785533
64	NC_017445	GAGCA	2	10	91610	91619	40 %	0 %	40 %	20 %	385785533
65	NC_017445	CCCGG	2	10	92602	92611	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017445	GGCCA	2	10	93491	93500	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017445	AGCGC	2	10	93980	93989	20 %	0 %	40 %	40 %	385785536
68	NC_017445	CAGGC	2	10	95014	95023	20 %	0 %	40 %	40 %	385785537
69	NC_017445	CTGTC	2	10	95685	95694	0 %	40 %	20 %	40 %	385785538
70	NC_017445	CTGAT	2	10	98847	98856	20 %	40 %	20 %	20 %	385785543
71	NC_017445	ATGGC	2	10	108697	108706	20 %	20 %	40 %	20 %	385785553
72	NC_017445	ATGAA	2	10	108914	108923	60 %	20 %	20 %	0 %	385785553
73	NC_017445	GCCTG	2	10	109248	109257	0 %	20 %	40 %	40 %	385785553
74	NC_017445	TGCGC	2	10	109520	109529	0 %	20 %	40 %	40 %	385785553
75	NC_017445	CGGCG	2	10	111130	111139	0 %	0 %	60 %	40 %	385785555
76	NC_017445	CAGAA	2	10	111697	111706	60 %	0 %	20 %	20 %	385785555
77	NC_017445	ATTCA	2	10	116250	116259	40 %	40 %	0 %	20 %	385785561
78	NC_017445	CCCGG	2	10	121322	121331	0 %	0 %	40 %	60 %	385785568
79	NC_017445	GCGCA	2	10	125659	125668	20 %	0 %	40 %	40 %	385785571
80	NC_017445	CTCCG	2	10	127800	127809	0 %	20 %	20 %	60 %	385785574
81	NC_017445	TGGCG	2	10	128160	128169	0 %	20 %	60 %	20 %	385785574
82	NC_017445	GTCGG	2	10	130012	130021	0 %	20 %	60 %	20 %	385785576
83	NC_017445	TGCAT	2	10	133338	133347	20 %	40 %	20 %	20 %	385785580
84	NC_017445	CACTT	2	10	133901	133910	20 %	40 %	0 %	40 %	385785580
85	NC_017445	GCACC	2	10	138544	138553	20 %	0 %	20 %	60 %	385785584
86	NC_017445	CGGTA	2	10	140347	140356	20 %	20 %	40 %	20 %	385785586
87	NC_017445	GGAGC	2	10	144745	144754	20 %	0 %	60 %	20 %	385785592
88	NC_017445	TGAGT	2	10	145699	145708	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017445	TCGCC	2	10	147660	147669	0 %	20 %	20 %	60 %	385785597
90	NC_017445	CATAT	2	10	148627	148636	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017445	AAAGG	2	10	148767	148776	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017445	TGGCG	2	10	151322	151331	0 %	20 %	60 %	20 %	385785599
93	NC_017445	CGTAG	2	10	155654	155663	20 %	20 %	40 %	20 %	385785603
94	NC_017445	AGGGA	2	10	157056	157065	40 %	0 %	60 %	0 %	385785603
95	NC_017445	AAGGC	2	10	158675	158684	40 %	0 %	40 %	20 %	385785606
96	NC_017445	ACGGT	2	10	159325	159334	20 %	20 %	40 %	20 %	385785606
97	NC_017445	GCCAC	2	10	160376	160385	20 %	0 %	20 %	60 %	385785609
98	NC_017445	ATAAA	2	10	163092	163101	80 %	20 %	0 %	0 %	385785612
99	NC_017445	GATCG	2	10	164243	164252	20 %	20 %	40 %	20 %	385785613
100	NC_017445	TGACT	2	10	167159	167168	20 %	40 %	20 %	20 %	385785616
101	NC_017445	CAGTG	2	10	169579	169588	20 %	20 %	40 %	20 %	385785619
102	NC_017445	TTTAT	2	10	175392	175401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017445	TGAAA	2	10	175593	175602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017445	CAATG	2	10	179584	179593	40 %	20 %	20 %	20 %	385785630
105	NC_017445	AGCCG	2	10	182926	182935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017445	CGTGG	2	10	183872	183881	0 %	20 %	60 %	20 %	385785632
107	NC_017445	ATGCA	2	10	184922	184931	40 %	20 %	20 %	20 %	385785633
108	NC_017445	TGGCG	2	10	190395	190404	0 %	20 %	60 %	20 %	385785639
109	NC_017445	GCGTG	2	10	192442	192451	0 %	20 %	60 %	20 %	385785640
110	NC_017445	GAGCG	2	10	193462	193471	20 %	0 %	60 %	20 %	385785641
111	NC_017445	TCACT	2	10	195793	195802	20 %	40 %	0 %	40 %	385785643
112	NC_017445	TTTAC	2	10	196413	196422	20 %	60 %	0 %	20 %	385785643
113	NC_017445	GCAGA	2	10	197916	197925	40 %	0 %	40 %	20 %	385785644
114	NC_017445	GCCTT	2	10	198084	198093	0 %	40 %	20 %	40 %	385785644
115	NC_017445	AACTC	2	10	200222	200231	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017445	ATCGG	2	10	202839	202848	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017445	TCGGT	2	10	203008	203017	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017445	CATGA	2	10	203588	203597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017445	GCCTT	2	10	203866	203875	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017445	ACACG	2	10	203981	203990	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017445	CCGTG	2	10	211411	211420	0 %	20 %	40 %	40 %	385785653
122	NC_017445	CGCCA	2	10	211600	211609	20 %	0 %	20 %	60 %	385785653
123	NC_017445	CCGCT	2	10	211782	211791	0 %	20 %	20 %	60 %	385785653
124	NC_017445	TACGA	2	10	213020	213029	40 %	20 %	20 %	20 %	385785654
125	NC_017445	GGTTT	2	10	213299	213308	0 %	60 %	40 %	0 %	385785654
126	NC_017445	CCCAG	2	10	215682	215691	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_017445	CGGCG	2	10	215907	215916	0 %	0 %	60 %	40 %	385785658
128	NC_017445	TCCTG	2	10	215962	215971	0 %	40 %	20 %	40 %	385785658
129	NC_017445	CCGGC	2	10	216241	216250	0 %	0 %	40 %	60 %	385785659
130	NC_017445	AGCGC	2	10	216314	216323	20 %	0 %	40 %	40 %	385785659
131	NC_017445	GCAGC	2	10	216536	216545	20 %	0 %	40 %	40 %	385785659
132	NC_017445	GCCAG	2	10	216949	216958	20 %	0 %	40 %	40 %	385785659
133	NC_017445	GTTCA	2	10	220164	220173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017445	CTGTA	2	10	220498	220507	20 %	40 %	20 %	20 %	385785662
135	NC_017445	CCGCC	2	10	222545	222554	0 %	0 %	20 %	80 %	385785663
136	NC_017445	GCACG	2	10	223712	223721	20 %	0 %	40 %	40 %	385785663
137	NC_017445	GCATC	2	10	225943	225952	20 %	20 %	20 %	40 %	385785665
138	NC_017445	CGGCC	2	10	226328	226337	0 %	0 %	40 %	60 %	385785665
139	NC_017445	GGCGT	2	10	226668	226677	0 %	20 %	60 %	20 %	385785666
140	NC_017445	CATTG	2	10	229821	229830	20 %	40 %	20 %	20 %	385785670
141	NC_017445	CGATA	2	10	232039	232048	40 %	20 %	20 %	20 %	385785671
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143	NC_017445	GGTCA	2	10	233483	233492	20 %	20 %	40 %	20 %	385785672
144	NC_017445	GCGCA	2	10	233777	233786	20 %	0 %	40 %	40 %	385785672
145	NC_017445	CAAAC	2	10	233819	233828	60 %	0 %	0 %	40 %	385785672
146	NC_017445	GATGC	2	10	234365	234374	20 %	20 %	40 %	20 %	385785673
147	NC_017445	CAGCG	2	10	235274	235283	20 %	0 %	40 %	40 %	385785674
148	NC_017445	GGCCA	2	10	235491	235500	20 %	0 %	40 %	40 %	385785674
149	NC_017445	GGCCA	2	10	237636	237645	20 %	0 %	40 %	40 %	385785676
150	NC_017445	CGCTT	2	10	239603	239612	0 %	40 %	20 %	40 %	385785678
151	NC_017445	GCTCA	2	10	239666	239675	20 %	20 %	20 %	40 %	385785678
152	NC_017445	CTGGC	2	10	243106	243115	0 %	20 %	40 %	40 %	385785680
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154	NC_017445	CCCCT	2	10	249401	249410	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
155	NC_017445	TTACG	2	10	250013	250022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_017445	CCTCG	2	10	251225	251234	0 %	20 %	20 %	60 %	385785688
157	NC_017445	CCCGG	2	10	251623	251632	0 %	0 %	40 %	60 %	385785688
158	NC_017445	TGCGC	2	10	252398	252407	0 %	20 %	40 %	40 %	385785689
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164	NC_017445	TAAAT	2	10	258506	258515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017445	AATTT	2	10	258789	258798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017445	GAATT	2	10	259177	259186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017445	GGCGC	2	10	259989	259998	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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169	NC_017445	CCACG	2	10	260598	260607	20 %	0 %	20 %	60 %	385785696
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171	NC_017445	CTGCT	2	10	261352	261361	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_017445	ACGAT	2	10	261421	261430	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017445	CCGCA	2	10	263326	263335	20 %	0 %	20 %	60 %	385785697
174	NC_017445	GCCGC	2	10	267798	267807	0 %	0 %	40 %	60 %	385785703
175	NC_017445	CCACG	2	10	267815	267824	20 %	0 %	20 %	60 %	385785703
176	NC_017445	ACGAT	2	10	268426	268435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_017445	ACGAT	2	10	268637	268646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_017445	CCGGC	2	10	270025	270034	0 %	0 %	40 %	60 %	385785704
179	NC_017445	CCGCA	2	10	270479	270488	20 %	0 %	20 %	60 %	385785704
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182	NC_017445	GTCAG	2	10	276502	276511	20 %	20 %	40 %	20 %	385785709
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184	NC_017445	AGCAC	2	10	281222	281231	40 %	0 %	20 %	40 %	385785712
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190	NC_017445	GAGCA	2	10	291645	291654	40 %	0 %	40 %	20 %	385785723
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192	NC_017445	TTTTC	2	10	295133	295142	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_017445	CGTTC	2	10	300847	300856	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
197	NC_017445	ACTCG	2	10	301600	301609	20 %	20 %	20 %	40 %	385785734
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201	NC_017445	AAAAC	2	10	307784	307793	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
202	NC_017445	CGCTG	2	10	312291	312300	0 %	20 %	40 %	40 %	385785745
203	NC_017445	GGCGT	2	10	315837	315846	0 %	20 %	60 %	20 %	385785749
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214	NC_017445	TTCTG	2	10	338582	338591	0 %	60 %	20 %	20 %	385785769
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217	NC_017445	TCTCA	2	10	340653	340662	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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223	NC_017445	CCCCG	2	10	348160	348169	0 %	0 %	20 %	80 %	385785773
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226	NC_017445	CAACT	2	10	352201	352210	40 %	20 %	0 %	40 %	385785778
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230	NC_017445	CCCGG	2	10	365063	365072	0 %	0 %	40 %	60 %	385785794
231	NC_017445	GTATG	2	10	365483	365492	20 %	40 %	40 %	0 %	385785795
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233	NC_017445	AACGC	2	10	370410	370419	40 %	0 %	20 %	40 %	385785800
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235	NC_017445	ATTTG	2	10	374784	374793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
236	NC_017445	GCGCC	2	10	378342	378351	0 %	0 %	40 %	60 %	385785806
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239	NC_017445	TGGTT	2	10	383122	383131	0 %	60 %	40 %	0 %	385785810
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245	NC_017445	CGGAG	2	10	393727	393736	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
246	NC_017445	CTGCG	2	10	395547	395556	0 %	20 %	40 %	40 %	385785822
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252	NC_017445	TGCGG	2	10	401763	401772	0 %	20 %	60 %	20 %	385785826
253	NC_017445	CGATC	2	10	402056	402065	20 %	20 %	20 %	40 %	385785826
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255	NC_017445	TGCCT	2	10	406219	406228	0 %	40 %	20 %	40 %	385785831
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259	NC_017445	TGCTG	2	10	407892	407901	0 %	40 %	40 %	20 %	385785832
260	NC_017445	TGCTG	2	10	409862	409871	0 %	40 %	40 %	20 %	385785834
261	NC_017445	GCCAG	2	10	412827	412836	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_017445	GATCA	2	10	417064	417073	40 %	20 %	20 %	20 %	385785838
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264	NC_017445	CAAAA	2	10	420410	420419	80 %	0 %	0 %	20 %	385785840
265	NC_017445	ACTGA	2	10	420608	420617	40 %	20 %	20 %	20 %	385785840
266	NC_017445	CACGG	2	10	422268	422277	20 %	0 %	40 %	40 %	385785841
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268	NC_017445	CCCGG	2	10	424219	424228	0 %	0 %	40 %	60 %	385785844
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