MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE03

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017443	GAT	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017443	CTG	2	6	22	27	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017443	GCGG	2	8	40	47	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017443	CGG	2	6	77	82	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785442
5	NC_017443	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785442
6	NC_017443	TGC	3	9	122	130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785442
7	NC_017443	ATG	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785442
8	NC_017443	CCCTG	2	10	171	180	0 %	20 %	20 %	60 %	385785442
9	NC_017443	GGA	2	6	186	191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785442
10	NC_017443	CGT	2	6	229	234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785442
11	NC_017443	GCC	2	6	322	327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785443
12	NC_017443	CTGGA	2	10	340	349	20 %	20 %	40 %	20 %	385785443
13	NC_017443	GCA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785443
14	NC_017443	ACC	2	6	397	402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785443
15	NC_017443	TGG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017443	GGC	2	6	711	716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785444
17	NC_017443	TCT	2	6	728	733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785444
18	NC_017443	ACG	2	6	752	757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785444
19	NC_017443	CGGC	2	8	774	781	0 %	0 %	50 %	50 %	385785444
20	NC_017443	CCG	2	6	794	799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785444
21	NC_017443	CGG	2	6	861	866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785444
22	NC_017443	GC	3	6	877	882	0 %	0 %	50 %	50 %	385785444
23	NC_017443	GAC	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017443	GTACC	2	10	960	969	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017443	ACG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017443	CGC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017443	TGG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017443	CGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017443	TCCG	2	8	1188	1195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017443	CCG	3	9	1193	1201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017443	GC	3	6	1206	1211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017443	TGC	2	6	1241	1246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017443	CCG	2	6	1247	1252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017443	CCG	2	6	1302	1307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785445
35	NC_017443	CGA	3	9	1323	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785445
36	NC_017443	CTC	2	6	1405	1410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785445
37	NC_017443	GCC	2	6	1427	1432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785445
38	NC_017443	CTT	2	6	1440	1445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785445
39	NC_017443	CGG	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785445
40	NC_017443	CTG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785445
41	NC_017443	CAG	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017443	CAG	2	6	1525	1530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017443	GCT	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017443	GCC	2	6	1564	1569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017443	CGACCG	2	12	1614	1625	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385785446
46	NC_017443	CAG	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785446
47	NC_017443	ACA	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785446
48	NC_017443	CGC	2	6	1707	1712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785446
49	NC_017443	CGACGC	2	12	1734	1745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385785446
50	NC_017443	CGCC	2	8	1773	1780	0 %	0 %	25 %	75 %	385785446
51	NC_017443	CGCC	2	8	1827	1834	0 %	0 %	25 %	75 %	385785447
52	NC_017443	TGC	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
53	NC_017443	CCG	2	6	1855	1860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785447
54	NC_017443	CAC	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785447
55	NC_017443	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785447
56	NC_017443	GC	5	10	1968	1977	0 %	0 %	50 %	50 %	385785447
57	NC_017443	GCT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
58	NC_017443	CTG	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785447
59	NC_017443	GGTC	2	8	2045	2052	0 %	25 %	50 %	25 %	385785447
60	NC_017443	CGCC	2	8	2088	2095	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_017443	CGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017443	GCC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017443	GCC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
64	NC_017443	GCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785448
65	NC_017443	ACT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785448
66	NC_017443	CAG	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785448
67	NC_017443	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785448
68	NC_017443	CCGA	2	8	2248	2255	25 %	0 %	25 %	50 %	385785448
69	NC_017443	CCGC	2	8	2256	2263	0 %	0 %	25 %	75 %	385785448
70	NC_017443	CCG	2	6	2266	2271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
71	NC_017443	GCC	2	6	2345	2350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785448
72	NC_017443	GCC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785449
73	NC_017443	GGT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785449
74	NC_017443	GCC	2	6	2405	2410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785449
75	NC_017443	CGA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785449
76	NC_017443	GCCG	2	8	2449	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	385785449
77	NC_017443	GAT	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785449
78	NC_017443	CCGC	2	8	2517	2524	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017443	CTG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017443	GGT	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017443	CGC	2	6	2633	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017443	TGC	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017443	CGA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
84	NC_017443	GC	3	6	2804	2809	0 %	0 %	50 %	50 %	385785450
85	NC_017443	CTG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
86	NC_017443	GCA	2	6	2901	2906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
87	NC_017443	GC	3	6	2914	2919	0 %	0 %	50 %	50 %	385785450
88	NC_017443	GCC	2	6	2945	2950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
89	NC_017443	GCT	3	9	2952	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
90	NC_017443	CGGC	2	8	2978	2985	0 %	0 %	50 %	50 %	385785450
91	NC_017443	CTGC	2	8	2997	3004	0 %	25 %	25 %	50 %	385785450
92	NC_017443	AGC	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785450
93	NC_017443	GCC	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
94	NC_017443	CGG	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785450
95	NC_017443	CTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785450
96	NC_017443	TGG	2	6	3152	3157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785450
97	NC_017443	CGC	2	6	3176	3181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785450
98	NC_017443	TGA	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785450
99	NC_017443	CTG	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017443	GCT	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017443	CGA	2	6	3276	3281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017443	GCCC	2	8	3283	3290	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_017443	GCT	3	9	3294	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017443	CGA	3	9	3372	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785451
105	NC_017443	CTTCAG	2	12	3528	3539	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017443	TAC	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017443	CGG	3	9	3641	3649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017443	CGG	2	6	3792	3797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017443	GGA	2	6	3846	3851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785452
110	NC_017443	ACC	2	6	3889	3894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785452
111	NC_017443	CTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785452
112	NC_017443	CTG	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785453
113	NC_017443	GCA	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785453
114	NC_017443	GGC	2	6	4042	4047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785453
115	NC_017443	ACGC	2	8	4130	4137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017443	CGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785454
117	NC_017443	CGTG	2	8	4278	4285	0 %	25 %	50 %	25 %	385785454
118	NC_017443	GCG	2	6	4288	4293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785454
119	NC_017443	ACC	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017443	CGG	2	6	4421	4426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785455
121	NC_017443	CCG	2	6	4476	4481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
122	NC_017443	GAC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785455
123	NC_017443	CAC	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785455
124	NC_017443	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785455
125	NC_017443	CTT	2	6	4614	4619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785455
126	NC_017443	CGG	2	6	4626	4631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785455
127	NC_017443	GCT	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785455
128	NC_017443	GCC	2	6	4670	4675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
129	NC_017443	AGC	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785455
130	NC_017443	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785455
131	NC_017443	GCA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017443	GCC	2	6	4770	4775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017443	GCT	3	9	4776	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017443	TGC	2	6	4817	4822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017443	ATCG	2	8	4849	4856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017443	GC	3	6	4864	4869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017443	CGG	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017443	TGC	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017443	TGA	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017443	CTG	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017443	GAC	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017443	CGC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017443	CTG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017443	GCG	3	9	5023	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785456
145	NC_017443	GGT	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785456
146	NC_017443	GC	3	6	5047	5052	0 %	0 %	50 %	50 %	385785456
147	NC_017443	ACG	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785456
148	NC_017443	TGC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785456
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150	NC_017443	GAGCTG	2	12	5140	5151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385785456
151	NC_017443	GAC	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785456
152	NC_017443	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017443	GCT	2	6	5232	5237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017443	CGC	2	6	5247	5252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_017443	CGC	2	6	5313	5318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_017443	CAG	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017443	GAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017443	GCC	2	6	5376	5381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_017443	CAGC	2	8	5427	5434	25 %	0 %	25 %	50 %	385785457
160	NC_017443	TTC	2	6	5449	5454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785457
161	NC_017443	AC	3	6	5477	5482	50 %	0 %	0 %	50 %	385785457
162	NC_017443	GGT	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785457
163	NC_017443	TGC	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785457
164	NC_017443	GC	3	6	5778	5783	0 %	0 %	50 %	50 %	385785457
165	NC_017443	ACGC	2	8	5806	5813	25 %	0 %	25 %	50 %	385785457
166	NC_017443	GCC	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785457
167	NC_017443	CGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_017443	CTG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_017443	CAC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_017443	CTG	2	6	5971	5976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_017443	GAT	3	9	6019	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785458
172	NC_017443	GATC	2	8	6066	6073	25 %	25 %	25 %	25 %	385785458
173	NC_017443	GTG	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785458
174	NC_017443	GCT	3	9	6189	6197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785458
175	NC_017443	GGC	2	6	6267	6272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.