MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	GCATG	2	10	519	528	20 %	20 %	40 %	20 %	378715379
2	NC_016904	GCCAG	2	10	2505	2514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016904	TGGAG	2	10	4757	4766	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016904	TGTCA	2	10	6176	6185	20 %	40 %	20 %	20 %	378715384
5	NC_016904	CAGCA	2	10	7799	7808	40 %	0 %	20 %	40 %	378715386
6	NC_016904	TGGGA	2	10	9461	9470	20 %	20 %	60 %	0 %	378715388
7	NC_016904	CTTTC	2	10	10086	10095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016904	CAGAG	2	10	11691	11700	40 %	0 %	40 %	20 %	378715391
9	NC_016904	AGACC	2	10	11722	11731	40 %	0 %	20 %	40 %	378715391
10	NC_016904	GTTCA	2	10	11898	11907	20 %	40 %	20 %	20 %	378715392
11	NC_016904	CGTAC	2	10	12361	12370	20 %	20 %	20 %	40 %	378715392
12	NC_016904	CGCGG	2	10	15131	15140	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016904	ACGGG	2	10	15182	15191	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016904	GCTGG	2	10	15827	15836	0 %	20 %	60 %	20 %	378715398
15	NC_016904	CCGCC	2	10	17500	17509	0 %	0 %	20 %	80 %	378715401
16	NC_016904	GGCAC	2	10	17964	17973	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016904	ACCGT	2	10	18253	18262	20 %	20 %	20 %	40 %	378715402
18	NC_016904	TGTAC	2	10	18488	18497	20 %	40 %	20 %	20 %	378715403
19	NC_016904	CCGGC	2	10	19195	19204	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_016904	CCGCC	2	10	22716	22725	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_016904	ACTGA	2	10	22764	22773	40 %	20 %	20 %	20 %	378715408
22	NC_016904	CTGGT	2	10	23692	23701	0 %	40 %	40 %	20 %	378715409
23	NC_016904	GGCAC	2	10	24913	24922	20 %	0 %	40 %	40 %	378715411
24	NC_016904	TGACC	2	10	25041	25050	20 %	20 %	20 %	40 %	378715411
25	NC_016904	CCTCT	2	10	26734	26743	0 %	40 %	0 %	60 %	378715413
26	NC_016904	GTTAC	2	10	28794	28803	20 %	40 %	20 %	20 %	378715417
27	NC_016904	GAGCA	2	10	29435	29444	40 %	0 %	40 %	20 %	378715418
28	NC_016904	TTTAT	2	10	29924	29933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016904	ATGAC	2	10	32398	32407	40 %	20 %	20 %	20 %	378715423
30	NC_016904	ATCGT	2	10	32965	32974	20 %	40 %	20 %	20 %	378715423
31	NC_016904	CAGGG	2	10	38598	38607	20 %	0 %	60 %	20 %	378715426
32	NC_016904	ATAGA	2	10	40571	40580	60 %	20 %	20 %	0 %	378715427
33	NC_016904	CATAA	2	10	44696	44705	60 %	20 %	0 %	20 %	378715432
34	NC_016904	TGAGC	2	10	44706	44715	20 %	20 %	40 %	20 %	378715432
35	NC_016904	GTCTG	2	10	45749	45758	0 %	40 %	40 %	20 %	378715433
36	NC_016904	TCTTT	2	10	48970	48979	0 %	80 %	0 %	20 %	378715436
37	NC_016904	ACCGG	2	10	52599	52608	20 %	0 %	40 %	40 %	378715440
38	NC_016904	CCAGT	2	10	61221	61230	20 %	20 %	20 %	40 %	378715448
39	NC_016904	GACAG	2	10	61763	61772	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016904	AAAGG	2	10	64953	64962	60 %	0 %	40 %	0 %	378715450
41	NC_016904	GAAAA	2	10	65998	66007	80 %	0 %	20 %	0 %	378715451
42	NC_016904	CTATA	2	10	70489	70498	40 %	40 %	0 %	20 %	378715455
43	NC_016904	TGACA	2	10	71921	71930	40 %	20 %	20 %	20 %	378715458
44	NC_016904	ATCAC	2	10	74504	74513	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016904	GTTGT	2	10	74894	74903	0 %	60 %	40 %	0 %	378715460
46	NC_016904	ACTGA	2	10	75091	75100	40 %	20 %	20 %	20 %	378715461
47	NC_016904	TCCAG	2	10	76921	76930	20 %	20 %	20 %	40 %	378715462
48	NC_016904	GCTGT	2	10	79213	79222	0 %	40 %	40 %	20 %	378715464
49	NC_016904	TGGTG	2	10	79775	79784	0 %	40 %	60 %	0 %	378715465
50	NC_016904	GAAAA	2	10	80801	80810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016904	TTGAA	2	10	81768	81777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016904	GCCCG	2	10	81782	81791	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016904	CAGCA	2	10	82842	82851	40 %	0 %	20 %	40 %	378715469
54	NC_016904	GCTTC	2	10	82893	82902	0 %	40 %	20 %	40 %	378715469
55	NC_016904	TATGG	2	10	83241	83250	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016904	ATTTT	2	10	83806	83815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016904	GAAGA	2	10	83867	83876	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016904	GCAGC	2	10	85022	85031	20 %	0 %	40 %	40 %	378715470
59	NC_016904	GCCGC	2	10	85602	85611	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_016904	TCTTT	2	10	88512	88521	0 %	80 %	0 %	20 %	378715476
61	NC_016904	ATTCC	2	10	92099	92108	20 %	40 %	0 %	40 %	378715478
62	NC_016904	TCTTT	2	10	93507	93516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016904	GTAAA	2	10	94156	94165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016904	GAATG	2	10	96162	96171	40 %	20 %	40 %	0 %	378715482
65	NC_016904	GCAGA	2	10	97933	97942	40 %	0 %	40 %	20 %	378715483
66	NC_016904	TTTAT	2	10	98702	98711	20 %	80 %	0 %	0 %	378715485
67	NC_016904	TGACC	2	10	98895	98904	20 %	20 %	20 %	40 %	378715485
68	NC_016904	CGTTA	2	10	100768	100777	20 %	40 %	20 %	20 %	378715488
69	NC_016904	TAACT	2	10	101743	101752	40 %	40 %	0 %	20 %	378715488
70	NC_016904	TATAA	2	10	101762	101771	60 %	40 %	0 %	0 %	378715488
71	NC_016904	CATAA	2	10	102792	102801	60 %	20 %	0 %	20 %	378715489
72	NC_016904	AATGC	2	10	103616	103625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016904	TTTCC	2	10	103664	103673	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.