MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	TTCC	2	8	350	357	0 %	50 %	0 %	50 %	378715378
2	NC_016904	GAAC	2	8	503	510	50 %	0 %	25 %	25 %	378715379
3	NC_016904	CTGG	2	8	692	699	0 %	25 %	50 %	25 %	378715379
4	NC_016904	CCGC	2	8	1343	1350	0 %	0 %	25 %	75 %	378715380
5	NC_016904	GGCT	2	8	1683	1690	0 %	25 %	50 %	25 %	378715380
6	NC_016904	CGGG	2	8	1751	1758	0 %	0 %	75 %	25 %	378715380
7	NC_016904	GTGA	2	8	1809	1816	25 %	25 %	50 %	0 %	378715380
8	NC_016904	TAAA	2	8	2107	2114	75 %	25 %	0 %	0 %	378715380
9	NC_016904	GTGA	2	8	2423	2430	25 %	25 %	50 %	0 %	378715380
10	NC_016904	GCAA	2	8	2687	2694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016904	TCGT	2	8	2722	2729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016904	TGTC	2	8	4647	4654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016904	ATCC	2	8	4887	4894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016904	CCGG	2	8	5156	5163	0 %	0 %	50 %	50 %	378715383
15	NC_016904	CGGC	2	8	5320	5327	0 %	0 %	50 %	50 %	378715384
16	NC_016904	CGTC	2	8	5472	5479	0 %	25 %	25 %	50 %	378715384
17	NC_016904	CGGC	2	8	5742	5749	0 %	0 %	50 %	50 %	378715384
18	NC_016904	CGTG	2	8	5826	5833	0 %	25 %	50 %	25 %	378715384
19	NC_016904	ATCC	2	8	6979	6986	25 %	25 %	0 %	50 %	378715385
20	NC_016904	GCTG	2	8	7055	7062	0 %	25 %	50 %	25 %	378715385
21	NC_016904	ATAC	2	8	7086	7093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016904	TACA	2	8	7357	7364	50 %	25 %	0 %	25 %	378715386
23	NC_016904	TCCC	2	8	7694	7701	0 %	25 %	0 %	75 %	378715386
24	NC_016904	AGGA	2	8	8294	8301	50 %	0 %	50 %	0 %	378715387
25	NC_016904	CAGC	2	8	8357	8364	25 %	0 %	25 %	50 %	378715387
26	NC_016904	CAGG	2	8	8419	8426	25 %	0 %	50 %	25 %	378715387
27	NC_016904	CTGA	2	8	9243	9250	25 %	25 %	25 %	25 %	378715388
28	NC_016904	ATCA	2	8	9537	9544	50 %	25 %	0 %	25 %	378715388
29	NC_016904	AACA	2	8	9558	9565	75 %	0 %	0 %	25 %	378715388
30	NC_016904	AACA	2	8	9634	9641	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016904	TGTT	2	8	10336	10343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016904	GAAA	3	12	10735	10746	75 %	0 %	25 %	0 %	378715390
33	NC_016904	AAAT	2	8	11362	11369	75 %	25 %	0 %	0 %	378715391
34	NC_016904	GTTA	2	8	11482	11489	25 %	50 %	25 %	0 %	378715391
35	NC_016904	CAGC	2	8	11996	12003	25 %	0 %	25 %	50 %	378715392
36	NC_016904	GTGA	2	8	13073	13080	25 %	25 %	50 %	0 %	378715393
37	NC_016904	AGAA	2	8	13308	13315	75 %	0 %	25 %	0 %	378715393
38	NC_016904	CAGC	2	8	13489	13496	25 %	0 %	25 %	50 %	378715394
39	NC_016904	GTAT	2	8	14141	14148	25 %	50 %	25 %	0 %	378715396
40	NC_016904	GCTG	2	8	14366	14373	0 %	25 %	50 %	25 %	378715396
41	NC_016904	TTCA	2	8	14779	14786	25 %	50 %	0 %	25 %	378715396
42	NC_016904	TGGC	2	8	14901	14908	0 %	25 %	50 %	25 %	378715396
43	NC_016904	CGGG	2	8	15059	15066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016904	GCAG	2	8	15942	15949	25 %	0 %	50 %	25 %	378715398
45	NC_016904	ATGA	2	8	16191	16198	50 %	25 %	25 %	0 %	378715399
46	NC_016904	CAGT	2	8	17085	17092	25 %	25 %	25 %	25 %	378715401
47	NC_016904	AGTG	2	8	17434	17441	25 %	25 %	50 %	0 %	378715401
48	NC_016904	GTCT	2	8	18061	18068	0 %	50 %	25 %	25 %	378715402
49	NC_016904	ACGG	2	8	18444	18451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016904	GGCA	2	8	18777	18784	25 %	0 %	50 %	25 %	378715403
51	NC_016904	TCAG	2	8	19849	19856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016904	GTAA	2	8	20676	20683	50 %	25 %	25 %	0 %	378715406
53	NC_016904	AAGC	2	8	20782	20789	50 %	0 %	25 %	25 %	378715407
54	NC_016904	CCTG	2	8	20984	20991	0 %	25 %	25 %	50 %	378715407
55	NC_016904	GAAC	2	8	21755	21762	50 %	0 %	25 %	25 %	378715407
56	NC_016904	ACGC	2	8	22052	22059	25 %	0 %	25 %	50 %	378715407
57	NC_016904	GAAG	2	8	22220	22227	50 %	0 %	50 %	0 %	378715407
58	NC_016904	TCAG	2	8	22321	22328	25 %	25 %	25 %	25 %	378715407
59	NC_016904	CAGA	2	8	22656	22663	50 %	0 %	25 %	25 %	378715407
60	NC_016904	TCAC	2	8	22852	22859	25 %	25 %	0 %	50 %	378715408
61	NC_016904	CTTT	2	8	23316	23323	0 %	75 %	0 %	25 %	378715409
62	NC_016904	TGGC	2	8	23420	23427	0 %	25 %	50 %	25 %	378715409
63	NC_016904	CCGT	2	8	23507	23514	0 %	25 %	25 %	50 %	378715409
64	NC_016904	GCCT	2	8	25529	25536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016904	AGCA	2	8	27286	27293	50 %	0 %	25 %	25 %	378715414
66	NC_016904	TCGC	2	8	28038	28045	0 %	25 %	25 %	50 %	378715415
67	NC_016904	CTAT	2	8	28147	28154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016904	CTGG	2	8	28911	28918	0 %	25 %	50 %	25 %	378715417
69	NC_016904	GCTG	2	8	29190	29197	0 %	25 %	50 %	25 %	378715417
70	NC_016904	AGGA	2	8	29264	29271	50 %	0 %	50 %	0 %	378715417
71	NC_016904	TCAC	2	8	29378	29385	25 %	25 %	0 %	50 %	378715417
72	NC_016904	ATAA	2	8	29958	29965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016904	TACA	2	8	30225	30232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016904	CAGC	2	8	30820	30827	25 %	0 %	25 %	50 %	378715420
75	NC_016904	TGAT	2	8	30924	30931	25 %	50 %	25 %	0 %	378715420
76	NC_016904	CCTG	2	8	31437	31444	0 %	25 %	25 %	50 %	378715421
77	NC_016904	AACT	2	8	31790	31797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016904	AGTG	2	8	31975	31982	25 %	25 %	50 %	0 %	378715422
79	NC_016904	AAGA	2	8	31993	32000	75 %	0 %	25 %	0 %	378715422
80	NC_016904	TGTT	2	8	32205	32212	0 %	75 %	25 %	0 %	378715422
81	NC_016904	TTCG	2	8	32360	32367	0 %	50 %	25 %	25 %	378715423
82	NC_016904	GGCA	2	8	32632	32639	25 %	0 %	50 %	25 %	378715423
83	NC_016904	TGCC	2	8	32894	32901	0 %	25 %	25 %	50 %	378715423
84	NC_016904	GATG	2	8	33167	33174	25 %	25 %	50 %	0 %	378715423
85	NC_016904	AAAG	2	8	33768	33775	75 %	0 %	25 %	0 %	378715423
86	NC_016904	TTTG	2	8	34031	34038	0 %	75 %	25 %	0 %	378715423
87	NC_016904	GCTG	2	8	34073	34080	0 %	25 %	50 %	25 %	378715423
88	NC_016904	ACAA	2	8	34798	34805	75 %	0 %	0 %	25 %	378715423
89	NC_016904	GAAG	2	8	34908	34915	50 %	0 %	50 %	0 %	378715423
90	NC_016904	GGTT	2	8	35081	35088	0 %	50 %	50 %	0 %	378715424
91	NC_016904	TCAA	2	8	35674	35681	50 %	25 %	0 %	25 %	378715424
92	NC_016904	CGGT	2	8	37643	37650	0 %	25 %	50 %	25 %	378715425
93	NC_016904	GGCT	2	8	37720	37727	0 %	25 %	50 %	25 %	378715425
94	NC_016904	CAGG	2	8	37748	37755	25 %	0 %	50 %	25 %	378715425
95	NC_016904	GTTC	2	8	37775	37782	0 %	50 %	25 %	25 %	378715425
96	NC_016904	GCAG	2	8	38163	38170	25 %	0 %	50 %	25 %	378715425
97	NC_016904	ATCA	2	8	38215	38222	50 %	25 %	0 %	25 %	378715425
98	NC_016904	ATTT	2	8	39683	39690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016904	TTTG	2	8	40117	40124	0 %	75 %	25 %	0 %	378715427
100	NC_016904	AAAT	2	8	40390	40397	75 %	25 %	0 %	0 %	378715427
101	NC_016904	AAAT	2	8	40412	40419	75 %	25 %	0 %	0 %	378715427
102	NC_016904	AGTT	2	8	40868	40875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016904	GCGG	2	8	40956	40963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016904	TGGT	2	8	41017	41024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016904	TAAT	2	8	41801	41808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016904	AATG	2	8	41828	41835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016904	CAGA	2	8	42000	42007	50 %	0 %	25 %	25 %	378715430
108	NC_016904	CAAA	2	8	42192	42199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016904	TCTT	2	8	42666	42673	0 %	75 %	0 %	25 %	378715431
110	NC_016904	ATTA	2	8	43096	43103	50 %	50 %	0 %	0 %	378715432
111	NC_016904	TAAA	2	8	43492	43499	75 %	25 %	0 %	0 %	378715432
112	NC_016904	TAAA	2	8	43947	43954	75 %	25 %	0 %	0 %	378715432
113	NC_016904	CAGC	2	8	44010	44017	25 %	0 %	25 %	50 %	378715432
114	NC_016904	CCAT	2	8	44074	44081	25 %	25 %	0 %	50 %	378715432
115	NC_016904	GGCT	2	8	44403	44410	0 %	25 %	50 %	25 %	378715432
116	NC_016904	TTAA	2	8	45146	45153	50 %	50 %	0 %	0 %	378715432
117	NC_016904	GCCA	2	8	45237	45244	25 %	0 %	25 %	50 %	378715433
118	NC_016904	TGGC	2	8	45539	45546	0 %	25 %	50 %	25 %	378715433
119	NC_016904	ATGG	2	8	45722	45729	25 %	25 %	50 %	0 %	378715433
120	NC_016904	TGAT	2	8	45825	45832	25 %	50 %	25 %	0 %	378715434
121	NC_016904	TGAT	2	8	46818	46825	25 %	50 %	25 %	0 %	378715434
122	NC_016904	GCCC	2	8	47664	47671	0 %	0 %	25 %	75 %	378715436
123	NC_016904	GCCT	2	8	48323	48330	0 %	25 %	25 %	50 %	378715436
124	NC_016904	CAGA	2	8	49234	49241	50 %	0 %	25 %	25 %	378715436
125	NC_016904	CCGC	2	8	49723	49730	0 %	0 %	25 %	75 %	378715436
126	NC_016904	GCTG	2	8	49831	49838	0 %	25 %	50 %	25 %	378715436
127	NC_016904	CAGG	2	8	49847	49854	25 %	0 %	50 %	25 %	378715436
128	NC_016904	TCTG	2	8	49888	49895	0 %	50 %	25 %	25 %	378715436
129	NC_016904	GCCA	2	8	50143	50150	25 %	0 %	25 %	50 %	378715436
130	NC_016904	CTGT	2	8	50514	50521	0 %	50 %	25 %	25 %	378715436
131	NC_016904	ATCA	2	8	50725	50732	50 %	25 %	0 %	25 %	378715437
132	NC_016904	ATGA	2	8	50748	50755	50 %	25 %	25 %	0 %	378715437
133	NC_016904	TGGA	2	8	50992	50999	25 %	25 %	50 %	0 %	378715437
134	NC_016904	CAGA	2	8	51190	51197	50 %	0 %	25 %	25 %	378715437
135	NC_016904	GATA	2	8	51849	51856	50 %	25 %	25 %	0 %	378715439
136	NC_016904	CGAT	2	8	52260	52267	25 %	25 %	25 %	25 %	378715440
137	NC_016904	TGGT	2	8	54269	54276	0 %	50 %	50 %	0 %	378715442
138	NC_016904	TTTC	2	8	54699	54706	0 %	75 %	0 %	25 %	378715442
139	NC_016904	GAAC	2	8	54879	54886	50 %	0 %	25 %	25 %	378715443
140	NC_016904	TGGT	2	8	55048	55055	0 %	50 %	50 %	0 %	378715443
141	NC_016904	GCAG	2	8	55539	55546	25 %	0 %	50 %	25 %	378715443
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143	NC_016904	GCTG	2	8	56158	56165	0 %	25 %	50 %	25 %	378715444
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.