MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli KO11FL chromosome

Total Repeats: 3215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016902	GCGGA	2	10	245	254	20 %	0 %	60 %	20 %	378710837
2	NC_016902	TTTAC	2	10	2917	2926	20 %	60 %	0 %	20 %	378710839
3	NC_016902	TGGCG	2	10	7596	7605	0 %	20 %	60 %	20 %	378710842
4	NC_016902	TGAAA	2	10	8788	8797	60 %	20 %	20 %	0 %	378710844
5	NC_016902	TTATG	2	10	9702	9711	20 %	60 %	20 %	0 %	378710845
6	NC_016902	AAACT	2	10	10173	10182	60 %	20 %	0 %	20 %	378710845
7	NC_016902	GGTAC	2	10	10355	10364	20 %	20 %	40 %	20 %	378710846
8	NC_016902	AGTGA	2	10	10433	10442	40 %	20 %	40 %	0 %	378710846
9	NC_016902	TTATT	2	10	12293	12302	20 %	80 %	0 %	0 %	378710848
10	NC_016902	TCTCT	2	10	13126	13135	0 %	60 %	0 %	40 %	378710848
11	NC_016902	ACCTG	2	10	16294	16303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016902	CGCAG	2	10	17258	17267	20 %	0 %	40 %	40 %	378710853
13	NC_016902	TGGTG	2	10	21240	21249	0 %	40 %	60 %	0 %	378710856
14	NC_016902	TGAAA	2	10	22692	22701	60 %	20 %	20 %	0 %	378710857
15	NC_016902	AAATG	2	10	26595	26604	60 %	20 %	20 %	0 %	378710859
16	NC_016902	ATTTT	2	10	27336	27345	20 %	80 %	0 %	0 %	378710860
17	NC_016902	CCGCA	2	10	28585	28594	20 %	0 %	20 %	60 %	378710863
18	NC_016902	TGGGC	2	10	32374	32383	0 %	20 %	60 %	20 %	378710867
19	NC_016902	GGCGC	2	10	32414	32423	0 %	0 %	60 %	40 %	378710867
20	NC_016902	GTGTT	2	10	32444	32453	0 %	60 %	40 %	0 %	378710867
21	NC_016902	TCCGA	2	10	33071	33080	20 %	20 %	20 %	40 %	378710868
22	NC_016902	TCTGG	2	10	34334	34343	0 %	40 %	40 %	20 %	378710870
23	NC_016902	CTGGC	2	10	34443	34452	0 %	20 %	40 %	40 %	378710870
24	NC_016902	GCACG	2	10	35237	35246	20 %	0 %	40 %	40 %	378710870
25	NC_016902	GCTGC	2	10	35820	35829	0 %	20 %	40 %	40 %	378710871
26	NC_016902	GCGGA	2	10	38805	38814	20 %	0 %	60 %	20 %	378710873
27	NC_016902	TGCCT	2	10	39524	39533	0 %	40 %	20 %	40 %	378710873
28	NC_016902	ATTCC	2	10	40817	40826	20 %	40 %	0 %	40 %	378710874
29	NC_016902	TCAGG	2	10	41842	41851	20 %	20 %	40 %	20 %	378710875
30	NC_016902	CGCGG	2	10	42200	42209	0 %	0 %	60 %	40 %	378710876
31	NC_016902	CGTTT	2	10	43853	43862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016902	CGACC	2	10	44335	44344	20 %	0 %	20 %	60 %	378710878
33	NC_016902	GTATT	2	10	47023	47032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016902	TTGAT	2	10	47199	47208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016902	AATAG	2	10	47292	47301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016902	CACTT	2	10	50804	50813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016902	AACCA	2	10	53759	53768	60 %	0 %	0 %	40 %	378710893
38	NC_016902	GCTTT	2	10	54005	54014	0 %	60 %	20 %	20 %	378710893
39	NC_016902	GTAAT	2	10	54274	54283	40 %	40 %	20 %	0 %	378710893
40	NC_016902	TTTTC	2	10	54326	54335	0 %	80 %	0 %	20 %	378710893
41	NC_016902	ACTGA	2	10	55337	55346	40 %	20 %	20 %	20 %	378710894
42	NC_016902	CATTG	2	10	57043	57052	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016902	GAAGT	2	10	57845	57854	40 %	20 %	40 %	0 %	378710896
44	NC_016902	GAAAA	2	10	58849	58858	80 %	0 %	20 %	0 %	378710897
45	NC_016902	ATTTT	2	10	59538	59547	20 %	80 %	0 %	0 %	378710897
46	NC_016902	CTTAC	2	10	63942	63951	20 %	40 %	0 %	40 %	378710900
47	NC_016902	TTAAT	2	10	64096	64105	40 %	60 %	0 %	0 %	378710900
48	NC_016902	GTTTG	2	10	66566	66575	0 %	60 %	40 %	0 %	378710901
49	NC_016902	CGGAC	2	10	69663	69672	20 %	0 %	40 %	40 %	378710903
50	NC_016902	CTTGT	2	10	72889	72898	0 %	60 %	20 %	20 %	378710905
51	NC_016902	GTGTG	2	10	78650	78659	0 %	40 %	60 %	0 %	378710910
52	NC_016902	CGGGA	2	10	79433	79442	20 %	0 %	60 %	20 %	378710911
53	NC_016902	CCAGG	2	10	79910	79919	20 %	0 %	40 %	40 %	378710911
54	NC_016902	GAATC	2	10	84324	84333	40 %	20 %	20 %	20 %	378710915
55	NC_016902	CAGAT	2	10	86422	86431	40 %	20 %	20 %	20 %	378710919
56	NC_016902	AACGG	2	10	87599	87608	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016902	ACGCT	2	10	89897	89906	20 %	20 %	20 %	40 %	378710924
58	NC_016902	GAATG	2	10	94477	94486	40 %	20 %	40 %	0 %	378710928
59	NC_016902	GTTTT	2	10	95237	95246	0 %	80 %	20 %	0 %	378710929
60	NC_016902	AATAC	2	10	95774	95783	60 %	20 %	0 %	20 %	378710929
61	NC_016902	AAACA	2	10	96010	96019	80 %	0 %	0 %	20 %	378710929
62	NC_016902	GCTGG	2	10	96906	96915	0 %	20 %	60 %	20 %	378710930
63	NC_016902	ATTAC	2	10	98983	98992	40 %	40 %	0 %	20 %	378710933
64	NC_016902	ATGAG	2	10	100309	100318	40 %	20 %	40 %	0 %	378710934
65	NC_016902	AAAAT	2	10	100323	100332	80 %	20 %	0 %	0 %	378710934
66	NC_016902	GCTTA	2	10	100553	100562	20 %	40 %	20 %	20 %	378710934
67	NC_016902	TGTGC	2	10	102856	102865	0 %	40 %	40 %	20 %	378710936
68	NC_016902	TATCA	2	10	104297	104306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016902	CTGAT	2	10	104632	104641	20 %	40 %	20 %	20 %	378710938
70	NC_016902	ACGGA	2	10	108122	108131	40 %	0 %	40 %	20 %	378710941
71	NC_016902	GCGCG	2	10	108415	108424	0 %	0 %	60 %	40 %	378710941
72	NC_016902	TCATC	2	10	109873	109882	20 %	40 %	0 %	40 %	378710942
73	NC_016902	GCACA	2	10	112743	112752	40 %	0 %	20 %	40 %	378710945
74	NC_016902	AACAA	2	10	112887	112896	80 %	0 %	0 %	20 %	378710946
75	NC_016902	GGGCA	2	10	115449	115458	20 %	0 %	60 %	20 %	378710949
76	NC_016902	CAAAG	2	10	117515	117524	60 %	0 %	20 %	20 %	378710951
77	NC_016902	TCTTT	2	10	117530	117539	0 %	80 %	0 %	20 %	378710951
78	NC_016902	CATGC	2	10	117566	117575	20 %	20 %	20 %	40 %	378710951
79	NC_016902	TTGTG	2	10	119654	119663	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016902	CGGTG	2	10	121846	121855	0 %	20 %	60 %	20 %	378710953
81	NC_016902	CAGAG	2	10	122057	122066	40 %	0 %	40 %	20 %	378710953
82	NC_016902	TTTGG	2	10	123400	123409	0 %	60 %	40 %	0 %	378710953
83	NC_016902	CGCTG	2	10	124051	124060	0 %	20 %	40 %	40 %	378710953
84	NC_016902	CTAAA	2	10	126646	126655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016902	TGCAT	2	10	127021	127030	20 %	40 %	20 %	20 %	378710957
86	NC_016902	GCAGT	2	10	127083	127092	20 %	20 %	40 %	20 %	378710957
87	NC_016902	ATTGC	2	10	127513	127522	20 %	40 %	20 %	20 %	378710958
88	NC_016902	ACCGT	2	10	129133	129142	20 %	20 %	20 %	40 %	378710959
89	NC_016902	GGTCA	2	10	129501	129510	20 %	20 %	40 %	20 %	378710959
90	NC_016902	TGACG	2	10	130987	130996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016902	TTTTG	2	10	131080	131089	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016902	TTTTA	2	10	133426	133435	20 %	80 %	0 %	0 %	378710962
93	NC_016902	CGGTG	2	10	139313	139322	0 %	20 %	60 %	20 %	378710967
94	NC_016902	CGGGC	2	10	141234	141243	0 %	0 %	60 %	40 %	378710967
95	NC_016902	CGCAG	2	10	143449	143458	20 %	0 %	40 %	40 %	378710969
96	NC_016902	CGCGG	2	10	144885	144894	0 %	0 %	60 %	40 %	378710970
97	NC_016902	ACGCA	2	10	147882	147891	40 %	0 %	20 %	40 %	378710972
98	NC_016902	TGATG	2	10	147949	147958	20 %	40 %	40 %	0 %	378710972
99	NC_016902	AGATG	2	10	149896	149905	40 %	20 %	40 %	0 %	378710975
100	NC_016902	AGGTA	2	10	150382	150391	40 %	20 %	40 %	0 %	378710975
101	NC_016902	GCGCC	2	10	153574	153583	0 %	0 %	40 %	60 %	378710979
102	NC_016902	AGTTC	2	10	153651	153660	20 %	40 %	20 %	20 %	378710979
103	NC_016902	GGCGA	2	10	153866	153875	20 %	0 %	60 %	20 %	378710979
104	NC_016902	GCCAG	2	10	157484	157493	20 %	0 %	40 %	40 %	378710982
105	NC_016902	AGCCC	2	10	158538	158547	20 %	0 %	20 %	60 %	378710983
106	NC_016902	TTGGG	2	10	160689	160698	0 %	40 %	60 %	0 %	378710986
107	NC_016902	AGCGG	2	10	161710	161719	20 %	0 %	60 %	20 %	378710987
108	NC_016902	CCCAA	2	10	163640	163649	40 %	0 %	0 %	60 %	378710989
109	NC_016902	GCCCA	2	10	164105	164114	20 %	0 %	20 %	60 %	378710990
110	NC_016902	GTTTT	2	10	164854	164863	0 %	80 %	20 %	0 %	378710990
111	NC_016902	CATGG	2	10	167559	167568	20 %	20 %	40 %	20 %	378710992
112	NC_016902	AAAGC	2	10	168187	168196	60 %	0 %	20 %	20 %	378710992
113	NC_016902	ATGCC	2	10	170532	170541	20 %	20 %	20 %	40 %	378710994
114	NC_016902	AGCGT	2	10	170969	170978	20 %	20 %	40 %	20 %	378710994
115	NC_016902	ATTTT	2	10	172631	172640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016902	CTGGG	2	10	173680	173689	0 %	20 %	60 %	20 %	378710996
117	NC_016902	GCGCA	2	10	176783	176792	20 %	0 %	40 %	40 %	378711000
118	NC_016902	CTGGG	2	10	178608	178617	0 %	20 %	60 %	20 %	378711002
119	NC_016902	ATCGA	2	10	180057	180066	40 %	20 %	20 %	20 %	378711003
120	NC_016902	AGAGG	2	10	182327	182336	40 %	0 %	60 %	0 %	378711005
121	NC_016902	GTTAC	2	10	183330	183339	20 %	40 %	20 %	20 %	378711007
122	NC_016902	GATTC	2	10	184213	184222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016902	TTACG	2	10	184845	184854	20 %	40 %	20 %	20 %	378711009
124	NC_016902	GCTTC	2	10	186773	186782	0 %	40 %	20 %	40 %	378711011
125	NC_016902	TTCGC	2	10	188922	188931	0 %	40 %	20 %	40 %	378711012
126	NC_016902	CATTA	2	10	190975	190984	40 %	40 %	0 %	20 %	378711015
127	NC_016902	TGGTG	2	10	192167	192176	0 %	40 %	60 %	0 %	378711016
128	NC_016902	TTGTG	2	10	193213	193222	0 %	60 %	40 %	0 %	378711017
129	NC_016902	TGCTG	2	10	193725	193734	0 %	40 %	40 %	20 %	378711018
130	NC_016902	TACCT	2	10	193986	193995	20 %	40 %	0 %	40 %	378711018
131	NC_016902	GAAAG	2	10	194277	194286	60 %	0 %	40 %	0 %	378711018
132	NC_016902	AGCGA	2	10	194682	194691	40 %	0 %	40 %	20 %	378711019
133	NC_016902	TGCCT	2	10	194719	194728	0 %	40 %	20 %	40 %	378711019
134	NC_016902	CTTTC	2	10	194874	194883	0 %	60 %	0 %	40 %	378711019
135	NC_016902	GGCAC	2	10	197362	197371	20 %	0 %	40 %	40 %	378711020
136	NC_016902	CGGAA	2	10	198209	198218	40 %	0 %	40 %	20 %	378711021
137	NC_016902	AGAAC	2	10	199748	199757	60 %	0 %	20 %	20 %	378711022
138	NC_016902	GCACG	2	10	200222	200231	20 %	0 %	40 %	40 %	378711022
139	NC_016902	AGCGA	2	10	200746	200755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016902	TCGAC	2	10	200906	200915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_016902	TGAAC	2	10	201902	201911	40 %	20 %	20 %	20 %	378711023
142	NC_016902	AGTGA	2	10	202026	202035	40 %	20 %	40 %	0 %	378711023
143	NC_016902	CAGTT	2	10	202054	202063	20 %	40 %	20 %	20 %	378711023
144	NC_016902	TTGCC	2	10	205025	205034	0 %	40 %	20 %	40 %	378711026
145	NC_016902	CGTTT	2	10	206526	206535	0 %	60 %	20 %	20 %	378711028
146	NC_016902	ACGAA	2	10	207624	207633	60 %	0 %	20 %	20 %	378711029
147	NC_016902	AATGG	2	10	208087	208096	40 %	20 %	40 %	0 %	378711029
148	NC_016902	CAAAG	2	10	211794	211803	60 %	0 %	20 %	20 %	378711034
149	NC_016902	AAAGA	2	10	212975	212984	80 %	0 %	20 %	0 %	378711036
150	NC_016902	ATTTT	2	10	213540	213549	20 %	80 %	0 %	0 %	378711036
151	NC_016902	CCTGG	2	10	215130	215139	0 %	20 %	40 %	40 %	378711039
152	NC_016902	CGGAG	2	10	217571	217580	20 %	0 %	60 %	20 %	378711039
153	NC_016902	GAAAA	2	10	217636	217645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016902	GCAAC	2	10	217715	217724	40 %	0 %	20 %	40 %	378711040
155	NC_016902	TGGTT	2	10	218390	218399	0 %	60 %	40 %	0 %	378711040
156	NC_016902	CAGCG	2	10	219653	219662	20 %	0 %	40 %	40 %	378711040
157	NC_016902	GTTCG	2	10	219745	219754	0 %	40 %	40 %	20 %	378711040
158	NC_016902	CTGGG	2	10	220449	220458	0 %	20 %	60 %	20 %	378711041
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160	NC_016902	ATGCG	2	10	225344	225353	20 %	20 %	40 %	20 %	378711043
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162	NC_016902	AAGTG	2	10	231563	231572	40 %	20 %	40 %	0 %	378711047
163	NC_016902	CGGCA	2	10	233675	233684	20 %	0 %	40 %	40 %	378711048
164	NC_016902	CAAGC	2	10	234653	234662	40 %	0 %	20 %	40 %	378711049
165	NC_016902	GATGC	2	10	235824	235833	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_016902	GCAAA	2	10	237795	237804	60 %	0 %	20 %	20 %	378711051
167	NC_016902	TGCGT	2	10	243006	243015	0 %	40 %	40 %	20 %	378711055
168	NC_016902	AAACC	2	10	243173	243182	60 %	0 %	0 %	40 %	378711055
169	NC_016902	ATAAC	2	10	244114	244123	60 %	20 %	0 %	20 %	378711055
170	NC_016902	CAGGG	2	10	248405	248414	20 %	0 %	60 %	20 %	378711059
171	NC_016902	TTGGG	2	10	250225	250234	0 %	40 %	60 %	0 %	378711060
172	NC_016902	GTCGG	2	10	250278	250287	0 %	20 %	60 %	20 %	378711060
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174	NC_016902	TAAAA	2	10	253430	253439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_016902	ACAGG	2	10	255666	255675	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
176	NC_016902	CTGTC	2	10	257140	257149	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_016902	GAAAT	2	10	259425	259434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_016902	ACCCG	2	10	259535	259544	20 %	0 %	20 %	60 %	378711070
179	NC_016902	CATGC	2	10	259810	259819	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_016902	GATGC	2	10	267418	267427	20 %	20 %	40 %	20 %	378711077
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191	NC_016902	TGTTC	2	10	273057	273066	0 %	60 %	20 %	20 %	378711083
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194	NC_016902	GCATA	2	10	275677	275686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_016902	GTGTG	2	10	276570	276579	0 %	40 %	60 %	0 %	378711085
196	NC_016902	CGTGG	2	10	279866	279875	0 %	20 %	60 %	20 %	378711087
197	NC_016902	TCCCG	2	10	280888	280897	0 %	20 %	20 %	60 %	378711088
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200	NC_016902	TTACG	2	10	285299	285308	20 %	40 %	20 %	20 %	378711090
201	NC_016902	TCTTT	2	10	285509	285518	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
202	NC_016902	CGTGC	2	10	285789	285798	0 %	20 %	40 %	40 %	378711091
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207	NC_016902	TGGCG	2	10	293686	293695	0 %	20 %	60 %	20 %	378711099
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209	NC_016902	CAATG	2	10	295433	295442	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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213	NC_016902	ACGAT	2	10	298713	298722	40 %	20 %	20 %	20 %	378711104
214	NC_016902	TCTTT	2	10	298930	298939	0 %	80 %	0 %	20 %	378711105
215	NC_016902	TCGTT	2	10	298973	298982	0 %	60 %	20 %	20 %	378711105
216	NC_016902	GCTCC	2	10	299021	299030	0 %	20 %	20 %	60 %	378711105
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234	NC_016902	TGAAC	2	10	317376	317385	40 %	20 %	20 %	20 %	378711125
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249	NC_016902	CGGCG	2	10	344276	344285	0 %	0 %	60 %	40 %	378711149
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252	NC_016902	GGTTC	2	10	348298	348307	0 %	40 %	40 %	20 %	378711153
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258	NC_016902	TCACT	2	10	354601	354610	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
259	NC_016902	TGGCG	2	10	355841	355850	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_016902	GTACC	2	10	359104	359113	20 %	20 %	20 %	40 %	378711157
261	NC_016902	GATGC	2	10	359710	359719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
262	NC_016902	ACCGG	2	10	360480	360489	20 %	0 %	40 %	40 %	378711158
263	NC_016902	GGTGA	2	10	372642	372651	20 %	20 %	60 %	0 %	378711168
264	NC_016902	TCGGT	2	10	374319	374328	0 %	40 %	40 %	20 %	378711171
265	NC_016902	CGTTG	2	10	376742	376751	0 %	40 %	40 %	20 %	378711172
266	NC_016902	GGCAG	2	10	377395	377404	20 %	0 %	60 %	20 %	378711172
267	NC_016902	TCGCT	2	10	379140	379149	0 %	40 %	20 %	40 %	378711175
268	NC_016902	ATTTG	2	10	382071	382080	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_016902	GATCT	2	10	383180	383189	20 %	40 %	20 %	20 %	378711178
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393	NC_016902	TTTCA	2	10	604150	604159	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
394	NC_016902	AGAAA	2	10	604192	604201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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