MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Enterobacter cloacae EcWSU1 plasmid pEcWSU1_A

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016515	CGGA	2	8	910	917	25 %	0 %	50 %	25 %	365972836
2	NC_016515	CATG	2	8	975	982	25 %	25 %	25 %	25 %	365972836
3	NC_016515	CCGC	2	8	1361	1368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016515	TGTT	2	8	1463	1470	0 %	75 %	25 %	0 %	365972837
5	NC_016515	GCCT	2	8	1515	1522	0 %	25 %	25 %	50 %	365972837
6	NC_016515	CAGG	2	8	1778	1785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016515	CGTT	2	8	2305	2312	0 %	50 %	25 %	25 %	365972839
8	NC_016515	TTTA	2	8	2777	2784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016515	CGAA	2	8	2943	2950	50 %	0 %	25 %	25 %	365972840
10	NC_016515	AAAT	2	8	2952	2959	75 %	25 %	0 %	0 %	365972840
11	NC_016515	TGCA	2	8	3132	3139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016515	CGTG	2	8	3518	3525	0 %	25 %	50 %	25 %	365972842
13	NC_016515	ACTA	2	8	4639	4646	50 %	25 %	0 %	25 %	365972845
14	NC_016515	GTTT	2	8	4773	4780	0 %	75 %	25 %	0 %	365972845
15	NC_016515	GCTC	2	8	5577	5584	0 %	25 %	25 %	50 %	365972845
16	NC_016515	CGCC	2	8	5932	5939	0 %	0 %	25 %	75 %	365972846
17	NC_016515	GATT	2	8	6748	6755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016515	TAAT	2	8	7273	7280	50 %	50 %	0 %	0 %	365972847
19	NC_016515	ATTT	2	8	7502	7509	25 %	75 %	0 %	0 %	365972847
20	NC_016515	CCAT	2	8	7547	7554	25 %	25 %	0 %	50 %	365972847
21	NC_016515	AAAG	2	8	7815	7822	75 %	0 %	25 %	0 %	365972848
22	NC_016515	ATAC	2	8	7891	7898	50 %	25 %	0 %	25 %	365972848
23	NC_016515	GTTT	2	8	8096	8103	0 %	75 %	25 %	0 %	365972848
24	NC_016515	CATA	2	8	8273	8280	50 %	25 %	0 %	25 %	365972848
25	NC_016515	CTGC	2	8	8752	8759	0 %	25 %	25 %	50 %	365972849
26	NC_016515	CCGG	2	8	8993	9000	0 %	0 %	50 %	50 %	365972849
27	NC_016515	GAAG	2	8	9048	9055	50 %	0 %	50 %	0 %	365972849
28	NC_016515	TGCC	2	8	9356	9363	0 %	25 %	25 %	50 %	365972849
29	NC_016515	GACC	2	8	9471	9478	25 %	0 %	25 %	50 %	365972849
30	NC_016515	ATCA	2	8	10432	10439	50 %	25 %	0 %	25 %	365972852
31	NC_016515	GTTG	2	8	10932	10939	0 %	50 %	50 %	0 %	365972853
32	NC_016515	TGGC	2	8	10946	10953	0 %	25 %	50 %	25 %	365972853
33	NC_016515	CTTT	2	8	11284	11291	0 %	75 %	0 %	25 %	365972854
34	NC_016515	TGAC	2	8	11592	11599	25 %	25 %	25 %	25 %	365972854
35	NC_016515	ATGT	2	8	11721	11728	25 %	50 %	25 %	0 %	365972854
36	NC_016515	TTCT	2	8	11799	11806	0 %	75 %	0 %	25 %	365972854
37	NC_016515	CGTC	2	8	12218	12225	0 %	25 %	25 %	50 %	365972855
38	NC_016515	CGCC	2	8	12853	12860	0 %	0 %	25 %	75 %	365972855
39	NC_016515	GCTG	2	8	13043	13050	0 %	25 %	50 %	25 %	365972855
40	NC_016515	TGTC	2	8	13070	13077	0 %	50 %	25 %	25 %	365972855
41	NC_016515	CTTC	2	8	13361	13368	0 %	50 %	0 %	50 %	365972855
42	NC_016515	CGGC	2	8	13576	13583	0 %	0 %	50 %	50 %	365972856
43	NC_016515	CTGT	2	8	14019	14026	0 %	50 %	25 %	25 %	365972856
44	NC_016515	CCTC	2	8	14788	14795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_016515	ACTG	2	8	15006	15013	25 %	25 %	25 %	25 %	365972857
46	NC_016515	CTTT	2	8	15347	15354	0 %	75 %	0 %	25 %	365972857
47	NC_016515	CCTT	2	8	15780	15787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016515	GCAG	2	8	16031	16038	25 %	0 %	50 %	25 %	365972858
49	NC_016515	TCCA	2	8	16105	16112	25 %	25 %	0 %	50 %	365972858
50	NC_016515	ATGA	2	8	16230	16237	50 %	25 %	25 %	0 %	365972858
51	NC_016515	AACA	2	8	17562	17569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016515	CAGT	2	8	18330	18337	25 %	25 %	25 %	25 %	365972860
53	NC_016515	GCTG	2	8	19028	19035	0 %	25 %	50 %	25 %	365972861
54	NC_016515	CGGC	2	8	19093	19100	0 %	0 %	50 %	50 %	365972861
55	NC_016515	CCGC	2	8	19118	19125	0 %	0 %	25 %	75 %	365972861
56	NC_016515	CCCG	2	8	19940	19947	0 %	0 %	25 %	75 %	365972862
57	NC_016515	GTTT	2	8	20086	20093	0 %	75 %	25 %	0 %	365972862
58	NC_016515	GTCC	2	8	20307	20314	0 %	25 %	25 %	50 %	365972863
59	NC_016515	TCTG	2	8	20566	20573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016515	GGTG	2	8	21116	21123	0 %	25 %	75 %	0 %	365972866
61	NC_016515	CTTT	2	8	21614	21621	0 %	75 %	0 %	25 %	365972866
62	NC_016515	ATGA	2	8	21666	21673	50 %	25 %	25 %	0 %	365972867
63	NC_016515	AAAC	2	8	21776	21783	75 %	0 %	0 %	25 %	365972867
64	NC_016515	AGTG	2	8	21871	21878	25 %	25 %	50 %	0 %	365972867
65	NC_016515	AAAC	2	8	22471	22478	75 %	0 %	0 %	25 %	365972867
66	NC_016515	GGCA	2	8	22515	22522	25 %	0 %	50 %	25 %	365972867
67	NC_016515	GCAG	2	8	23040	23047	25 %	0 %	50 %	25 %	365972867
68	NC_016515	TTAT	2	8	23074	23081	25 %	75 %	0 %	0 %	365972867
69	NC_016515	GACA	2	8	23520	23527	50 %	0 %	25 %	25 %	365972867
70	NC_016515	CCCG	2	8	23551	23558	0 %	0 %	25 %	75 %	365972867
71	NC_016515	CATA	2	8	23816	23823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016515	GAGC	2	8	24012	24019	25 %	0 %	50 %	25 %	365972868
73	NC_016515	GTTC	2	8	24077	24084	0 %	50 %	25 %	25 %	365972868
74	NC_016515	CGGC	2	8	24496	24503	0 %	0 %	50 %	50 %	365972869
75	NC_016515	CAGC	3	12	25041	25052	25 %	0 %	25 %	50 %	365972870
76	NC_016515	GATT	2	8	25617	25624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016515	CATC	2	8	25754	25761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016515	ACAG	2	8	26249	26256	50 %	0 %	25 %	25 %	365972871
79	NC_016515	GTCA	2	8	26363	26370	25 %	25 %	25 %	25 %	365972871
80	NC_016515	ACGG	2	8	27035	27042	25 %	0 %	50 %	25 %	365972872
81	NC_016515	GATT	2	8	27325	27332	25 %	50 %	25 %	0 %	365972873
82	NC_016515	ATTC	2	8	27588	27595	25 %	50 %	0 %	25 %	365972874
83	NC_016515	CGGG	2	8	27782	27789	0 %	0 %	75 %	25 %	365972874
84	NC_016515	CGCA	2	8	28388	28395	25 %	0 %	25 %	50 %	365972874
85	NC_016515	CATC	2	8	28828	28835	25 %	25 %	0 %	50 %	365972874
86	NC_016515	GACG	2	8	28918	28925	25 %	0 %	50 %	25 %	365972874
87	NC_016515	GGCC	2	8	29569	29576	0 %	0 %	50 %	50 %	365972874
88	NC_016515	CCGC	2	8	29914	29921	0 %	0 %	25 %	75 %	365972874
89	NC_016515	TGCG	2	8	30386	30393	0 %	25 %	50 %	25 %	365972874
90	NC_016515	GTCA	2	8	30449	30456	25 %	25 %	25 %	25 %	365972874
91	NC_016515	GCCG	2	8	30569	30576	0 %	0 %	50 %	50 %	365972874
92	NC_016515	CCGG	2	8	30744	30751	0 %	0 %	50 %	50 %	365972875
93	NC_016515	CCGT	2	8	31537	31544	0 %	25 %	25 %	50 %	365972875
94	NC_016515	CAGG	2	8	32246	32253	25 %	0 %	50 %	25 %	365972876
95	NC_016515	CGCA	2	8	33024	33031	25 %	0 %	25 %	50 %	365972876
96	NC_016515	CGTG	2	8	33159	33166	0 %	25 %	50 %	25 %	365972877
97	NC_016515	GGCA	2	8	33197	33204	25 %	0 %	50 %	25 %	365972877
98	NC_016515	CAGC	2	8	33361	33368	25 %	0 %	25 %	50 %	365972877
99	NC_016515	CTGG	2	8	34586	34593	0 %	25 %	50 %	25 %	365972878
100	NC_016515	TATT	2	8	34759	34766	25 %	75 %	0 %	0 %	365972879
101	NC_016515	CTGG	2	8	34897	34904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016515	GTTG	2	8	35199	35206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016515	AGTC	2	8	35367	35374	25 %	25 %	25 %	25 %	365972880
104	NC_016515	GCTG	2	8	35538	35545	0 %	25 %	50 %	25 %	365972880
105	NC_016515	GTCA	2	8	36008	36015	25 %	25 %	25 %	25 %	365972882
106	NC_016515	CCAA	2	8	36141	36148	50 %	0 %	0 %	50 %	365972882
107	NC_016515	ACTG	2	8	36428	36435	25 %	25 %	25 %	25 %	365972882
108	NC_016515	GAAT	2	8	36603	36610	50 %	25 %	25 %	0 %	365972883
109	NC_016515	ACAT	2	8	36984	36991	50 %	25 %	0 %	25 %	365972884
110	NC_016515	CGGT	2	8	37111	37118	0 %	25 %	50 %	25 %	365972885
111	NC_016515	CAGG	2	8	37311	37318	25 %	0 %	50 %	25 %	365972885
112	NC_016515	TTGC	2	8	37422	37429	0 %	50 %	25 %	25 %	365972885
113	NC_016515	AGGT	2	8	37653	37660	25 %	25 %	50 %	0 %	365972885
114	NC_016515	GAGC	2	8	37953	37960	25 %	0 %	50 %	25 %	365972885
115	NC_016515	TTTG	2	8	38346	38353	0 %	75 %	25 %	0 %	365972886
116	NC_016515	TGGG	2	8	38446	38453	0 %	25 %	75 %	0 %	365972886
117	NC_016515	ATGC	2	8	38461	38468	25 %	25 %	25 %	25 %	365972886
118	NC_016515	GAAA	2	8	38498	38505	75 %	0 %	25 %	0 %	365972886
119	NC_016515	TAAC	2	8	39416	39423	50 %	25 %	0 %	25 %	365972886
120	NC_016515	CATA	2	8	39527	39534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016515	TGCT	2	8	39570	39577	0 %	50 %	25 %	25 %	365972887
122	NC_016515	ACGG	2	8	39643	39650	25 %	0 %	50 %	25 %	365972887
123	NC_016515	ACCA	2	8	39910	39917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016515	AAGC	2	8	40099	40106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016515	GTAC	2	8	40397	40404	25 %	25 %	25 %	25 %	365972888
126	NC_016515	CATG	2	8	40455	40462	25 %	25 %	25 %	25 %	365972888
127	NC_016515	CACC	2	8	40791	40798	25 %	0 %	0 %	75 %	365972888
128	NC_016515	GACA	2	8	40803	40810	50 %	0 %	25 %	25 %	365972888
129	NC_016515	CTGG	2	8	40978	40985	0 %	25 %	50 %	25 %	365972888
130	NC_016515	AGCC	2	8	41619	41626	25 %	0 %	25 %	50 %	365972890
131	NC_016515	AGCC	2	8	42343	42350	25 %	0 %	25 %	50 %	365972891
132	NC_016515	TTCA	2	8	42398	42405	25 %	50 %	0 %	25 %	365972891
133	NC_016515	GCTG	2	8	42930	42937	0 %	25 %	50 %	25 %	365972891
134	NC_016515	GATA	2	8	43128	43135	50 %	25 %	25 %	0 %	365972892
135	NC_016515	CCGG	2	8	43260	43267	0 %	0 %	50 %	50 %	365972892
136	NC_016515	GTGG	2	8	43903	43910	0 %	25 %	75 %	0 %	365972893
137	NC_016515	ACTG	2	8	43971	43978	25 %	25 %	25 %	25 %	365972893
138	NC_016515	CATG	2	8	46287	46294	25 %	25 %	25 %	25 %	365972896
139	NC_016515	GCCA	2	8	46305	46312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016515	GGCT	2	8	46320	46327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016515	TCTA	2	8	46349	46356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016515	TTCT	2	8	46613	46620	0 %	75 %	0 %	25 %	365972897
143	NC_016515	CCTG	2	8	47121	47128	0 %	25 %	25 %	50 %	365972897
144	NC_016515	TGGC	2	8	47443	47450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016515	CTTT	2	8	48310	48317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016515	GCTG	2	8	48544	48551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016515	TAAG	2	8	48567	48574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016515	GCTG	2	8	48624	48631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016515	ATCA	2	8	48936	48943	50 %	25 %	0 %	25 %	365972898
150	NC_016515	GTCT	2	8	49587	49594	0 %	50 %	25 %	25 %	365972901
151	NC_016515	TGAT	2	8	49614	49621	25 %	50 %	25 %	0 %	365972901
152	NC_016515	GGGA	2	8	49783	49790	25 %	0 %	75 %	0 %	365972901
153	NC_016515	ACCT	2	8	49799	49806	25 %	25 %	0 %	50 %	365972901
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162	NC_016515	TTAT	2	8	53476	53483	25 %	75 %	0 %	0 %	365972906
163	NC_016515	CAAC	2	8	53723	53730	50 %	0 %	0 %	50 %	365972906
164	NC_016515	TAAG	2	8	53803	53810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016515	AATT	2	8	53938	53945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016515	GTTT	2	8	54031	54038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016515	ATCA	2	8	55011	55018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_016515	ATTA	2	8	55037	55044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016515	AGCT	2	8	55583	55590	25 %	25 %	25 %	25 %	365972908
170	NC_016515	CAGC	2	8	56197	56204	25 %	0 %	25 %	50 %	365972910
171	NC_016515	TGGC	2	8	56771	56778	0 %	25 %	50 %	25 %	365972910
172	NC_016515	ATGG	2	8	57385	57392	25 %	25 %	50 %	0 %	365972911
173	NC_016515	CATT	2	8	57971	57978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_016515	GAGT	2	8	58498	58505	25 %	25 %	50 %	0 %	365972912
175	NC_016515	TGAT	2	8	58603	58610	25 %	50 %	25 %	0 %	365972912
176	NC_016515	GATG	2	8	58772	58779	25 %	25 %	50 %	0 %	365972912
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179	NC_016515	GTTT	2	8	59522	59529	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
180	NC_016515	CATG	2	8	59699	59706	25 %	25 %	25 %	25 %	365972915
181	NC_016515	AGAT	2	8	60211	60218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_016515	TTAA	2	8	60358	60365	50 %	50 %	0 %	0 %	365972917
183	NC_016515	TGGG	2	8	60380	60387	0 %	25 %	75 %	0 %	365972917
184	NC_016515	CAGA	2	8	60429	60436	50 %	0 %	25 %	25 %	365972917
185	NC_016515	GCTG	2	8	61082	61089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_016515	GCCA	2	8	61163	61170	25 %	0 %	25 %	50 %	365972918
187	NC_016515	CTGG	2	8	61577	61584	0 %	25 %	50 %	25 %	365972918
188	NC_016515	GCAG	2	8	62785	62792	25 %	0 %	50 %	25 %	365972920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.