MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB102

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014304	CAGG	2	8	408	415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014304	TTCA	2	8	459	466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014304	GCCG	2	8	781	788	0 %	0 %	50 %	50 %	300781823
4	NC_014304	CAGC	2	8	814	821	25 %	0 %	25 %	50 %	300781823
5	NC_014304	GCCG	2	8	861	868	0 %	0 %	50 %	50 %	300781823
6	NC_014304	GCCG	2	8	1243	1250	0 %	0 %	50 %	50 %	300781823
7	NC_014304	GCCC	2	8	1663	1670	0 %	0 %	25 %	75 %	300781824
8	NC_014304	CTTC	2	8	1849	1856	0 %	50 %	0 %	50 %	300781825
9	NC_014304	GCCG	2	8	1982	1989	0 %	0 %	50 %	50 %	300781825
10	NC_014304	AAGC	2	8	2128	2135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014304	GTTA	2	8	2259	2266	25 %	50 %	25 %	0 %	300781826
12	NC_014304	ACCA	2	8	2367	2374	50 %	0 %	0 %	50 %	300781826
13	NC_014304	CATT	2	8	2696	2703	25 %	50 %	0 %	25 %	300781826
14	NC_014304	AAGG	2	8	2815	2822	50 %	0 %	50 %	0 %	300781826
15	NC_014304	CCGG	2	8	2998	3005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014304	CGTT	2	8	3472	3479	0 %	50 %	25 %	25 %	300781828
17	NC_014304	ACGT	2	8	3882	3889	25 %	25 %	25 %	25 %	300781828
18	NC_014304	CGGC	2	8	4557	4564	0 %	0 %	50 %	50 %	300781829
19	NC_014304	ATCA	2	8	4810	4817	50 %	25 %	0 %	25 %	300781830
20	NC_014304	AACC	2	8	5389	5396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014304	AGGC	2	8	6098	6105	25 %	0 %	50 %	25 %	300781831
22	NC_014304	TATT	2	8	6227	6234	25 %	75 %	0 %	0 %	300781832
23	NC_014304	GACT	2	8	6961	6968	25 %	25 %	25 %	25 %	300781832
24	NC_014304	AATA	2	8	7363	7370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014304	TGGA	2	8	7878	7885	25 %	25 %	50 %	0 %	300781833
26	NC_014304	CATC	2	8	8225	8232	25 %	25 %	0 %	50 %	300781833
27	NC_014304	CTGG	2	8	8330	8337	0 %	25 %	50 %	25 %	300781833
28	NC_014304	GGGA	2	8	9773	9780	25 %	0 %	75 %	0 %	300781835
29	NC_014304	CTTT	2	8	10485	10492	0 %	75 %	0 %	25 %	300781835
30	NC_014304	CTGA	2	8	10611	10618	25 %	25 %	25 %	25 %	300781835
31	NC_014304	TAAT	2	8	10834	10841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014304	CATA	2	8	10854	10861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014304	CAGT	2	8	10864	10871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014304	CAGT	2	8	11206	11213	25 %	25 %	25 %	25 %	300781837
35	NC_014304	TTCT	2	8	11220	11227	0 %	75 %	0 %	25 %	300781837
36	NC_014304	TTTG	2	8	13373	13380	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014304	GAAT	2	8	13440	13447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014304	GATA	2	8	13554	13561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014304	CGGA	2	8	14866	14873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014304	GAAA	2	8	15170	15177	75 %	0 %	25 %	0 %	300781840
41	NC_014304	CAGC	2	8	15347	15354	25 %	0 %	25 %	50 %	300781840
42	NC_014304	TGGT	2	8	16266	16273	0 %	50 %	50 %	0 %	300781841
43	NC_014304	TGAT	2	8	16291	16298	25 %	50 %	25 %	0 %	300781841
44	NC_014304	CGTC	2	8	16483	16490	0 %	25 %	25 %	50 %	300781841
45	NC_014304	CTGT	2	8	16761	16768	0 %	50 %	25 %	25 %	300781841
46	NC_014304	TGAC	2	8	16823	16830	25 %	25 %	25 %	25 %	300781842
47	NC_014304	CGGT	2	8	17379	17386	0 %	25 %	50 %	25 %	300781843
48	NC_014304	CAGA	2	8	17957	17964	50 %	0 %	25 %	25 %	300781844
49	NC_014304	CCGT	2	8	18366	18373	0 %	25 %	25 %	50 %	300781844
50	NC_014304	GAAT	2	8	18639	18646	50 %	25 %	25 %	0 %	300781845
51	NC_014304	AATG	2	8	19000	19007	50 %	25 %	25 %	0 %	300781845
52	NC_014304	AGCC	2	8	19060	19067	25 %	0 %	25 %	50 %	300781845
53	NC_014304	GCGT	2	8	19587	19594	0 %	25 %	50 %	25 %	300781845
54	NC_014304	CTGT	2	8	19628	19635	0 %	50 %	25 %	25 %	300781845
55	NC_014304	GTCA	2	8	19673	19680	25 %	25 %	25 %	25 %	300781845
56	NC_014304	AAAT	2	8	19848	19855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014304	TTGC	2	8	19954	19961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014304	TGAT	2	8	20062	20069	25 %	50 %	25 %	0 %	300781846
59	NC_014304	ACTG	2	8	20744	20751	25 %	25 %	25 %	25 %	300781847
60	NC_014304	TTCA	2	8	21478	21485	25 %	50 %	0 %	25 %	300781847
61	NC_014304	GCGT	2	8	21530	21537	0 %	25 %	50 %	25 %	300781847
62	NC_014304	AAAT	2	8	21709	21716	75 %	25 %	0 %	0 %	300781847
63	NC_014304	TATT	2	8	22277	22284	25 %	75 %	0 %	0 %	300781847
64	NC_014304	AATT	2	8	22408	22415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014304	GATC	2	8	22851	22858	25 %	25 %	25 %	25 %	300781849
66	NC_014304	GTCA	2	8	22973	22980	25 %	25 %	25 %	25 %	300781849
67	NC_014304	CTGT	2	8	23378	23385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014304	CTTT	2	8	23511	23518	0 %	75 %	0 %	25 %	300781850
69	NC_014304	CCTG	2	8	23854	23861	0 %	25 %	25 %	50 %	300781850
70	NC_014304	GCAG	2	8	24176	24183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014304	ATAA	2	8	24246	24253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014304	TCCT	2	8	24335	24342	0 %	50 %	0 %	50 %	300781851
73	NC_014304	AGCG	2	8	24582	24589	25 %	0 %	50 %	25 %	300781852
74	NC_014304	TATG	2	8	24902	24909	25 %	50 %	25 %	0 %	300781852
75	NC_014304	CTAA	2	8	25301	25308	50 %	25 %	0 %	25 %	300781852
76	NC_014304	CAAA	2	8	25762	25769	75 %	0 %	0 %	25 %	300781853
77	NC_014304	TTTG	2	8	26060	26067	0 %	75 %	25 %	0 %	300781853
78	NC_014304	ACCC	2	8	27126	27133	25 %	0 %	0 %	75 %	300781854
79	NC_014304	ACCG	2	8	28072	28079	25 %	0 %	25 %	50 %	300781855
80	NC_014304	TGGT	2	8	28468	28475	0 %	50 %	50 %	0 %	300781856
81	NC_014304	TGGT	2	8	28535	28542	0 %	50 %	50 %	0 %	300781856
82	NC_014304	TTTC	2	8	28647	28654	0 %	75 %	0 %	25 %	300781856
83	NC_014304	ACGA	2	8	29334	29341	50 %	0 %	25 %	25 %	300781857
84	NC_014304	CTGA	2	8	29942	29949	25 %	25 %	25 %	25 %	300781857
85	NC_014304	GTGC	2	8	30724	30731	0 %	25 %	50 %	25 %	300781858
86	NC_014304	CAAA	2	8	30920	30927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014304	CTGT	2	8	31000	31007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014304	TCGC	2	8	31360	31367	0 %	25 %	25 %	50 %	300781859
89	NC_014304	GGCT	2	8	31381	31388	0 %	25 %	50 %	25 %	300781859
90	NC_014304	ATTT	2	8	31466	31473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014304	GCCA	2	8	31718	31725	25 %	0 %	25 %	50 %	300781860
92	NC_014304	AGTA	2	8	32598	32605	50 %	25 %	25 %	0 %	300781860
93	NC_014304	GCAA	2	8	32676	32683	50 %	0 %	25 %	25 %	300781861
94	NC_014304	GGAA	2	8	33005	33012	50 %	0 %	50 %	0 %	300781861
95	NC_014304	CATC	2	8	33801	33808	25 %	25 %	0 %	50 %	300781862
96	NC_014304	GCTG	2	8	34504	34511	0 %	25 %	50 %	25 %	300781862
97	NC_014304	TGGC	2	8	34820	34827	0 %	25 %	50 %	25 %	300781862
98	NC_014304	CTGG	2	8	34993	35000	0 %	25 %	50 %	25 %	300781862
99	NC_014304	ACCA	2	8	35697	35704	50 %	0 %	0 %	50 %	300781863
100	NC_014304	CCAG	2	8	36775	36782	25 %	0 %	25 %	50 %	300781865
101	NC_014304	GCGA	2	8	37452	37459	25 %	0 %	50 %	25 %	300781865
102	NC_014304	CCGG	2	8	37552	37559	0 %	0 %	50 %	50 %	300781865
103	NC_014304	TCCA	2	8	38207	38214	25 %	25 %	0 %	50 %	300781866
104	NC_014304	CGAT	2	8	38572	38579	25 %	25 %	25 %	25 %	300781867
105	NC_014304	GGCT	2	8	39458	39465	0 %	25 %	50 %	25 %	300781867
106	NC_014304	ATCG	2	8	40517	40524	25 %	25 %	25 %	25 %	300781868
107	NC_014304	GCCG	2	8	40793	40800	0 %	0 %	50 %	50 %	300781868
108	NC_014304	TCAG	2	8	41120	41127	25 %	25 %	25 %	25 %	300781869
109	NC_014304	GCCA	2	8	41167	41174	25 %	0 %	25 %	50 %	300781869
110	NC_014304	GATC	2	8	42330	42337	25 %	25 %	25 %	25 %	300781870
111	NC_014304	TTTA	2	8	42490	42497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014304	GATC	2	8	44275	44282	25 %	25 %	25 %	25 %	300781872
113	NC_014304	ACGC	2	8	44664	44671	25 %	0 %	25 %	50 %	300781872
114	NC_014304	ATTT	2	8	44802	44809	25 %	75 %	0 %	0 %	300781872
115	NC_014304	GTCG	2	8	45152	45159	0 %	25 %	50 %	25 %	300781872
116	NC_014304	CGGG	2	8	45702	45709	0 %	0 %	75 %	25 %	300781872
117	NC_014304	TGCG	2	8	45966	45973	0 %	25 %	50 %	25 %	300781873
118	NC_014304	TTTG	2	8	46136	46143	0 %	75 %	25 %	0 %	300781873
119	NC_014304	ATCG	2	8	46300	46307	25 %	25 %	25 %	25 %	300781874
120	NC_014304	CTGG	2	8	46495	46502	0 %	25 %	50 %	25 %	300781874
121	NC_014304	AAAC	2	8	46746	46753	75 %	0 %	0 %	25 %	300781874
122	NC_014304	ACGC	2	8	46774	46781	25 %	0 %	25 %	50 %	300781874
123	NC_014304	GGAC	2	8	47158	47165	25 %	0 %	50 %	25 %	300781874
124	NC_014304	CTGT	2	8	47621	47628	0 %	50 %	25 %	25 %	300781874
125	NC_014304	CAGC	2	8	47891	47898	25 %	0 %	25 %	50 %	300781875
126	NC_014304	AGCC	2	8	49531	49538	25 %	0 %	25 %	50 %	300781877
127	NC_014304	CAAC	2	8	49740	49747	50 %	0 %	0 %	50 %	300781878
128	NC_014304	GCTT	2	8	49828	49835	0 %	50 %	25 %	25 %	300781878
129	NC_014304	CGAT	2	8	50447	50454	25 %	25 %	25 %	25 %	300781880
130	NC_014304	TAAT	2	8	50959	50966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014304	GTGA	2	8	50970	50977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014304	AGGG	2	8	51189	51196	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014304	TTTG	2	8	51846	51853	0 %	75 %	25 %	0 %	300781881
134	NC_014304	TGAA	2	8	52102	52109	50 %	25 %	25 %	0 %	300781881
135	NC_014304	CCAG	2	8	52398	52405	25 %	0 %	25 %	50 %	300781881
136	NC_014304	CAGC	2	8	52716	52723	25 %	0 %	25 %	50 %	300781881
137	NC_014304	CAGG	2	8	52796	52803	25 %	0 %	50 %	25 %	300781881
138	NC_014304	ATGC	2	8	53051	53058	25 %	25 %	25 %	25 %	300781881
139	NC_014304	ATAA	2	8	53572	53579	75 %	25 %	0 %	0 %	300781881
140	NC_014304	TGAG	2	8	53861	53868	25 %	25 %	50 %	0 %	300781881
141	NC_014304	GAAG	2	8	54100	54107	50 %	0 %	50 %	0 %	300781882
142	NC_014304	CAGC	2	8	54433	54440	25 %	0 %	25 %	50 %	300781882
143	NC_014304	CAGG	2	8	55468	55475	25 %	0 %	50 %	25 %	300781883
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283	NC_014304	CTGG	2	8	100263	100270	0 %	25 %	50 %	25 %	300781932
284	NC_014304	CAGC	2	8	100329	100336	25 %	0 %	25 %	50 %	300781932
285	NC_014304	ATCA	2	8	100402	100409	50 %	25 %	0 %	25 %	300781932
286	NC_014304	AATG	2	8	100453	100460	50 %	25 %	25 %	0 %	300781932
287	NC_014304	AATA	2	8	100853	100860	75 %	25 %	0 %	0 %	300781933
288	NC_014304	CATC	2	8	101421	101428	25 %	25 %	0 %	50 %	300781935
289	NC_014304	GGCT	2	8	101540	101547	0 %	25 %	50 %	25 %	300781935
290	NC_014304	GCCA	2	8	101771	101778	25 %	0 %	25 %	50 %	300781935
291	NC_014304	ATAC	2	8	101998	102005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
292	NC_014304	CAGG	2	8	102154	102161	25 %	0 %	50 %	25 %	300781936
293	NC_014304	CTGC	2	8	102200	102207	0 %	25 %	25 %	50 %	300781936

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.