MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013972	CATT	2	8	1711	1718	25 %	50 %	0 %	25 %	293386376
2	NC_013972	TCTG	2	8	1865	1872	0 %	50 %	25 %	25 %	293386376
3	NC_013972	CTGT	2	8	2359	2366	0 %	50 %	25 %	25 %	293386377
4	NC_013972	CAGA	2	8	2444	2451	50 %	0 %	25 %	25 %	293386377
5	NC_013972	AATG	2	8	2537	2544	50 %	25 %	25 %	0 %	293386377
6	NC_013972	AATT	2	8	2570	2577	50 %	50 %	0 %	0 %	293386378
7	NC_013972	GCAG	2	8	3747	3754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013972	TCAG	2	8	4777	4784	25 %	25 %	25 %	25 %	293386383
9	NC_013972	CCCG	2	8	4892	4899	0 %	0 %	25 %	75 %	293386383
10	NC_013972	GTGC	2	8	5014	5021	0 %	25 %	50 %	25 %	293386383
11	NC_013972	GGGC	2	8	5184	5191	0 %	0 %	75 %	25 %	293386383
12	NC_013972	GCTG	2	8	5420	5427	0 %	25 %	50 %	25 %	293386383
13	NC_013972	TGGA	2	8	7144	7151	25 %	25 %	50 %	0 %	293386384
14	NC_013972	CGGT	2	8	7190	7197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013972	CCTG	2	8	7425	7432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013972	ACAG	2	8	7710	7717	50 %	0 %	25 %	25 %	293386385
17	NC_013972	TAAT	2	8	7746	7753	50 %	50 %	0 %	0 %	293386385
18	NC_013972	GCTG	2	8	8025	8032	0 %	25 %	50 %	25 %	293386385
19	NC_013972	GCTG	2	8	8130	8137	0 %	25 %	50 %	25 %	293386385
20	NC_013972	AAGA	2	8	8933	8940	75 %	0 %	25 %	0 %	293386385
21	NC_013972	GCCA	2	8	9546	9553	25 %	0 %	25 %	50 %	293386386
22	NC_013972	AATA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013972	ATTT	2	8	10229	10236	25 %	75 %	0 %	0 %	293386388
24	NC_013972	AGGA	2	8	10578	10585	50 %	0 %	50 %	0 %	293386388
25	NC_013972	TAAA	2	8	11388	11395	75 %	25 %	0 %	0 %	293386388
26	NC_013972	ATCG	2	8	12222	12229	25 %	25 %	25 %	25 %	293386390
27	NC_013972	TCAA	2	8	12652	12659	50 %	25 %	0 %	25 %	293386391
28	NC_013972	TGCG	2	8	12668	12675	0 %	25 %	50 %	25 %	293386391
29	NC_013972	ATCG	2	8	13521	13528	25 %	25 %	25 %	25 %	293386392
30	NC_013972	CGGC	3	12	14004	14015	0 %	0 %	50 %	50 %	293386393
31	NC_013972	TCAT	2	8	15970	15977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013972	GATG	2	8	16354	16361	25 %	25 %	50 %	0 %	293386399
33	NC_013972	GAAG	2	8	16442	16449	50 %	0 %	50 %	0 %	293386399
34	NC_013972	ACTA	2	8	16653	16660	50 %	25 %	0 %	25 %	293386400
35	NC_013972	TCCT	2	8	17047	17054	0 %	50 %	0 %	50 %	293386400
36	NC_013972	ATAA	2	8	18102	18109	75 %	25 %	0 %	0 %	293386403
37	NC_013972	CGAT	2	8	18118	18125	25 %	25 %	25 %	25 %	293386403
38	NC_013972	GATA	2	8	18491	18498	50 %	25 %	25 %	0 %	293386404
39	NC_013972	CGGC	2	8	18695	18702	0 %	0 %	50 %	50 %	293386404
40	NC_013972	TGCC	2	8	18949	18956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013972	AATT	2	8	19149	19156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013972	AGCA	2	8	19195	19202	50 %	0 %	25 %	25 %	293386405
43	NC_013972	CAAA	2	8	19372	19379	75 %	0 %	0 %	25 %	293386405
44	NC_013972	AATA	2	8	19511	19518	75 %	25 %	0 %	0 %	293386405
45	NC_013972	AATG	2	8	19684	19691	50 %	25 %	25 %	0 %	293386405
46	NC_013972	TAAA	2	8	19894	19901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013972	ACCA	2	8	20023	20030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013972	TGCG	2	8	20306	20313	0 %	25 %	50 %	25 %	293386406
49	NC_013972	GGTA	2	8	20315	20322	25 %	25 %	50 %	0 %	293386406
50	NC_013972	GGCA	2	8	20427	20434	25 %	0 %	50 %	25 %	293386406
51	NC_013972	AAAC	2	8	21135	21142	75 %	0 %	0 %	25 %	293386406
52	NC_013972	CGAA	2	8	21618	21625	50 %	0 %	25 %	25 %	293386406
53	NC_013972	CAGC	2	8	21962	21969	25 %	0 %	25 %	50 %	293386406
54	NC_013972	ATTG	2	8	22374	22381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013972	CCAG	2	8	22486	22493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013972	CAGG	2	8	23235	23242	25 %	0 %	50 %	25 %	293386407
57	NC_013972	GGGC	2	8	23355	23362	0 %	0 %	75 %	25 %	293386407
58	NC_013972	TGGC	2	8	23782	23789	0 %	25 %	50 %	25 %	293386408
59	NC_013972	CTGG	2	8	24226	24233	0 %	25 %	50 %	25 %	293386409
60	NC_013972	AAAC	2	8	24676	24683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013972	AAAC	2	8	24895	24902	75 %	0 %	0 %	25 %	293386410
62	NC_013972	GGAT	2	8	24958	24965	25 %	25 %	50 %	0 %	293386410
63	NC_013972	CCAC	2	8	25352	25359	25 %	0 %	0 %	75 %	293386411
64	NC_013972	GAGT	2	8	25476	25483	25 %	25 %	50 %	0 %	293386411
65	NC_013972	CGCC	2	8	25671	25678	0 %	0 %	25 %	75 %	293386412
66	NC_013972	CTTA	2	8	25973	25980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013972	GCGT	2	8	26496	26503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013972	TCGA	2	8	26740	26747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013972	TACT	2	8	27525	27532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013972	ATGT	2	8	27953	27960	25 %	50 %	25 %	0 %	293386414
71	NC_013972	TTAA	2	8	27989	27996	50 %	50 %	0 %	0 %	293386414
72	NC_013972	CCTG	2	8	28198	28205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.