MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 chromosome

Total Repeats: 2411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013971	CTTCG	2	10	4284	4293	0 %	40 %	20 %	40 %	292897738
2	NC_013971	CGCGC	2	10	4392	4401	0 %	0 %	40 %	60 %	292897738
3	NC_013971	CATGC	2	10	9545	9554	20 %	20 %	20 %	40 %	292897741
4	NC_013971	CTTGC	2	10	10428	10437	0 %	40 %	20 %	40 %	292897741
5	NC_013971	ATTGC	2	10	11999	12008	20 %	40 %	20 %	20 %	292897741
6	NC_013971	GGGGT	2	10	12421	12430	0 %	20 %	80 %	0 %	292897741
7	NC_013971	TACTG	2	10	14367	14376	20 %	40 %	20 %	20 %	292897741
8	NC_013971	CGTTT	2	10	14853	14862	0 %	60 %	20 %	20 %	292897741
9	NC_013971	CTTGC	2	10	17405	17414	0 %	40 %	20 %	40 %	292897742
10	NC_013971	CTTCT	2	10	18418	18427	0 %	60 %	0 %	40 %	292897742
11	NC_013971	CCTGC	2	10	20059	20068	0 %	20 %	20 %	60 %	292897742
12	NC_013971	TTCTG	2	10	27381	27390	0 %	60 %	20 %	20 %	292897743
13	NC_013971	GCCTT	2	10	27425	27434	0 %	40 %	20 %	40 %	292897743
14	NC_013971	CCGGG	2	10	30424	30433	0 %	0 %	60 %	40 %	292897747
15	NC_013971	GCGCC	2	10	30751	30760	0 %	0 %	40 %	60 %	292897747
16	NC_013971	GAGGG	2	10	32994	33003	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013971	GCGCT	2	10	33644	33653	0 %	20 %	40 %	40 %	292897750
18	NC_013971	TTCCG	2	10	38027	38036	0 %	40 %	20 %	40 %	292897753
19	NC_013971	CCGAT	2	10	39006	39015	20 %	20 %	20 %	40 %	292897754
20	NC_013971	CGCCA	2	10	39253	39262	20 %	0 %	20 %	60 %	292897755
21	NC_013971	CAAAC	2	10	39859	39868	60 %	0 %	0 %	40 %	292897755
22	NC_013971	TGCCT	2	10	42775	42784	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013971	AAGGC	2	10	43153	43162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013971	TCATG	2	10	43431	43440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013971	ACAGC	2	10	50688	50697	40 %	0 %	20 %	40 %	292897759
26	NC_013971	GGTGA	2	10	53536	53545	20 %	20 %	60 %	0 %	292897760
27	NC_013971	CGGGC	2	10	53871	53880	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013971	TGCTG	2	10	54760	54769	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013971	GCTTT	2	10	55560	55569	0 %	60 %	20 %	20 %	292897762
30	NC_013971	AGCTG	2	10	58337	58346	20 %	20 %	40 %	20 %	292897764
31	NC_013971	CATCG	2	10	59220	59229	20 %	20 %	20 %	40 %	292897765
32	NC_013971	TTTGG	2	10	65897	65906	0 %	60 %	40 %	0 %	292897771
33	NC_013971	ACGCC	2	10	69681	69690	20 %	0 %	20 %	60 %	292897773
34	NC_013971	TGCGG	2	10	69890	69899	0 %	20 %	60 %	20 %	292897773
35	NC_013971	CGCGA	2	10	72346	72355	20 %	0 %	40 %	40 %	292897775
36	NC_013971	AGGCA	2	10	77247	77256	40 %	0 %	40 %	20 %	292897779
37	NC_013971	ACAGA	2	10	79690	79699	60 %	0 %	20 %	20 %	292897781
38	NC_013971	TCATA	2	10	79879	79888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013971	AAAGC	2	10	81011	81020	60 %	0 %	20 %	20 %	292897782
40	NC_013971	GCAGC	2	10	81626	81635	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_013971	CTGAA	2	10	82218	82227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013971	AGTAC	2	10	83128	83137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013971	AAAAT	2	10	85894	85903	80 %	20 %	0 %	0 %	292897786
44	NC_013971	AAAAT	2	10	86479	86488	80 %	20 %	0 %	0 %	292897786
45	NC_013971	AAAGC	2	10	88355	88364	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013971	TATTC	2	10	89099	89108	20 %	60 %	0 %	20 %	292897790
47	NC_013971	GCTGA	2	10	89357	89366	20 %	20 %	40 %	20 %	292897791
48	NC_013971	TATTT	2	10	89847	89856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013971	CCAAA	2	10	90896	90905	60 %	0 %	0 %	40 %	292897792
50	NC_013971	TTAGC	2	10	91386	91395	20 %	40 %	20 %	20 %	292897792
51	NC_013971	GAGGG	2	10	91890	91899	20 %	0 %	80 %	0 %	292897793
52	NC_013971	ACCTG	2	10	95540	95549	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013971	GCTGC	2	10	96538	96547	0 %	20 %	40 %	40 %	292897796
54	NC_013971	ATCTC	2	10	96825	96834	20 %	40 %	0 %	40 %	292897797
55	NC_013971	GCAGC	2	10	101627	101636	20 %	0 %	40 %	40 %	292897803
56	NC_013971	TGGCA	2	10	102866	102875	20 %	20 %	40 %	20 %	292897804
57	NC_013971	ATTTT	2	10	103357	103366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013971	TGATT	2	10	103595	103604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013971	TAAGG	2	10	103853	103862	40 %	20 %	40 %	0 %	292897805
60	NC_013971	CAGCG	2	10	105363	105372	20 %	0 %	40 %	40 %	292897808
61	NC_013971	CAGTA	2	10	107849	107858	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013971	TTCAG	2	10	110654	110663	20 %	40 %	20 %	20 %	292897813
63	NC_013971	TAAAA	2	10	113569	113578	80 %	20 %	0 %	0 %	292897816
64	NC_013971	ACAAG	2	10	117002	117011	60 %	0 %	20 %	20 %	292897819
65	NC_013971	GGGCA	2	10	117348	117357	20 %	0 %	60 %	20 %	292897819
66	NC_013971	AGCGT	2	10	117430	117439	20 %	20 %	40 %	20 %	292897819
67	NC_013971	AGCGT	2	10	117607	117616	20 %	20 %	40 %	20 %	292897819
68	NC_013971	GCGCT	2	10	118464	118473	0 %	20 %	40 %	40 %	292897820
69	NC_013971	TCGCA	2	10	118690	118699	20 %	20 %	20 %	40 %	292897820
70	NC_013971	GGCCG	2	10	119233	119242	0 %	0 %	60 %	40 %	292897821
71	NC_013971	GGAAC	2	10	120428	120437	40 %	0 %	40 %	20 %	292897822
72	NC_013971	CGCTG	2	10	122949	122958	0 %	20 %	40 %	40 %	292897824
73	NC_013971	CTCTT	2	10	122978	122987	0 %	60 %	0 %	40 %	292897824
74	NC_013971	GCACA	2	10	124182	124191	40 %	0 %	20 %	40 %	292897826
75	NC_013971	AACAA	2	10	124346	124355	80 %	0 %	0 %	20 %	292897827
76	NC_013971	GTGCA	2	10	124775	124784	20 %	20 %	40 %	20 %	292897827
77	NC_013971	GTTTG	2	10	125110	125119	0 %	60 %	40 %	0 %	292897828
78	NC_013971	CCGCA	2	10	125441	125450	20 %	0 %	20 %	60 %	292897828
79	NC_013971	GCGCT	2	10	125488	125497	0 %	20 %	40 %	40 %	292897828
80	NC_013971	CCACG	2	10	125971	125980	20 %	0 %	20 %	60 %	292897829
81	NC_013971	GCCCG	2	10	127128	127137	0 %	0 %	40 %	60 %	292897830
82	NC_013971	TCTGC	2	10	127706	127715	0 %	40 %	20 %	40 %	292897831
83	NC_013971	TGCCC	2	10	130814	130823	0 %	20 %	20 %	60 %	292897834
84	NC_013971	GCCTG	2	10	130860	130869	0 %	20 %	40 %	40 %	292897834
85	NC_013971	AAATC	2	10	133673	133682	60 %	20 %	0 %	20 %	292897837
86	NC_013971	GGCAG	2	10	137205	137214	20 %	0 %	60 %	20 %	292897840
87	NC_013971	CGCCA	2	10	139974	139983	20 %	0 %	20 %	60 %	292897843
88	NC_013971	GCTTT	2	10	140174	140183	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013971	CCGGG	2	10	140447	140456	0 %	0 %	60 %	40 %	292897844
90	NC_013971	CGTGC	2	10	140496	140505	0 %	20 %	40 %	40 %	292897844
91	NC_013971	TCAGT	2	10	143464	143473	20 %	40 %	20 %	20 %	292897847
92	NC_013971	ACATC	2	10	143997	144006	40 %	20 %	0 %	40 %	292897848
93	NC_013971	TGGCC	2	10	144318	144327	0 %	20 %	40 %	40 %	292897848
94	NC_013971	GGGCA	2	10	145628	145637	20 %	0 %	60 %	20 %	292897849
95	NC_013971	ACTTC	2	10	146727	146736	20 %	40 %	0 %	40 %	292897850
96	NC_013971	ACGCG	2	10	146818	146827	20 %	0 %	40 %	40 %	292897850
97	NC_013971	CGTAT	2	10	149492	149501	20 %	40 %	20 %	20 %	292897853
98	NC_013971	GCTCG	2	10	149974	149983	0 %	20 %	40 %	40 %	292897854
99	NC_013971	GTTGG	2	10	152130	152139	0 %	40 %	60 %	0 %	292897856
100	NC_013971	TGACC	2	10	153777	153786	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013971	AGCGG	2	10	154441	154450	20 %	0 %	60 %	20 %	292897858
102	NC_013971	CTGTT	2	10	154675	154684	0 %	60 %	20 %	20 %	292897858
103	NC_013971	GGCAT	2	10	155852	155861	20 %	20 %	40 %	20 %	292897858
104	NC_013971	AAGGG	2	10	155923	155932	40 %	0 %	60 %	0 %	292897858
105	NC_013971	TTCTT	2	10	157532	157541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013971	ACGGT	2	10	161623	161632	20 %	20 %	40 %	20 %	292897866
107	NC_013971	AACCG	2	10	161675	161684	40 %	0 %	20 %	40 %	292897866
108	NC_013971	GGGGC	2	10	162063	162072	0 %	0 %	80 %	20 %	292897866
109	NC_013971	GGCAT	2	10	164734	164743	20 %	20 %	40 %	20 %	292897868
110	NC_013971	CGGCC	2	10	166746	166755	0 %	0 %	40 %	60 %	292897869
111	NC_013971	CGCAG	2	10	167755	167764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013971	CTATC	2	10	172148	172157	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013971	ATCAC	2	10	173552	173561	40 %	20 %	0 %	40 %	292897875
114	NC_013971	CAGAG	2	10	175583	175592	40 %	0 %	40 %	20 %	292897877
115	NC_013971	TCATG	2	10	180412	180421	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013971	AGTCG	2	10	181503	181512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013971	TGTTT	2	10	184830	184839	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013971	TCACG	2	10	184975	184984	20 %	20 %	20 %	40 %	292897881
119	NC_013971	CAGCG	2	10	186422	186431	20 %	0 %	40 %	40 %	292897882
120	NC_013971	GTCGC	2	10	187033	187042	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013971	AATTA	2	10	187048	187057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013971	CCGGC	2	10	191425	191434	0 %	0 %	40 %	60 %	292897886
123	NC_013971	CTTTG	2	10	192056	192065	0 %	60 %	20 %	20 %	292897886
124	NC_013971	TGCGG	2	10	192499	192508	0 %	20 %	60 %	20 %	292897887
125	NC_013971	TGCTG	2	10	192730	192739	0 %	40 %	40 %	20 %	292897887
126	NC_013971	GGGCA	2	10	194039	194048	20 %	0 %	60 %	20 %	292897888
127	NC_013971	CAGGG	2	10	194665	194674	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013971	GAAGT	2	10	195367	195376	40 %	20 %	40 %	0 %	292897889
129	NC_013971	ATGAA	2	10	195950	195959	60 %	20 %	20 %	0 %	292897889
130	NC_013971	CTTCT	2	10	196502	196511	0 %	60 %	0 %	40 %	292897890
131	NC_013971	AGCGG	2	10	197606	197615	20 %	0 %	60 %	20 %	292897891
132	NC_013971	CAGGC	2	10	200391	200400	20 %	0 %	40 %	40 %	292897893
133	NC_013971	TTCTG	2	10	201444	201453	0 %	60 %	20 %	20 %	292897893
134	NC_013971	CGCCC	2	10	202830	202839	0 %	0 %	20 %	80 %	292897895
135	NC_013971	TCACG	2	10	203008	203017	20 %	20 %	20 %	40 %	292897895
136	NC_013971	CGATG	2	10	203478	203487	20 %	20 %	40 %	20 %	292897895
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