MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 chromosome

Total Repeats: 2432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013961	CTTCG	2	10	4284	4293	0 %	40 %	20 %	40 %	292486496
2	NC_013961	CGCGC	2	10	4392	4401	0 %	0 %	40 %	60 %	292486496
3	NC_013961	CATGC	2	10	9545	9554	20 %	20 %	20 %	40 %	292486499
4	NC_013961	CTTGC	2	10	10428	10437	0 %	40 %	20 %	40 %	292486499
5	NC_013961	ATTGC	2	10	11999	12008	20 %	40 %	20 %	20 %	292486499
6	NC_013961	GGGGT	2	10	12421	12430	0 %	20 %	80 %	0 %	292486499
7	NC_013961	TACTG	2	10	14367	14376	20 %	40 %	20 %	20 %	292486499
8	NC_013961	CGTTT	2	10	14853	14862	0 %	60 %	20 %	20 %	292486499
9	NC_013961	CTTGC	2	10	17405	17414	0 %	40 %	20 %	40 %	292486501
10	NC_013961	CTTCT	2	10	18418	18427	0 %	60 %	0 %	40 %	292486501
11	NC_013961	CCTGC	2	10	20059	20068	0 %	20 %	20 %	60 %	292486501
12	NC_013961	TTCTG	2	10	27381	27390	0 %	60 %	20 %	20 %	292486502
13	NC_013961	GCCTT	2	10	27425	27434	0 %	40 %	20 %	40 %	292486502
14	NC_013961	CCGGG	2	10	30424	30433	0 %	0 %	60 %	40 %	292486506
15	NC_013961	GCGCC	2	10	30751	30760	0 %	0 %	40 %	60 %	292486506
16	NC_013961	GAGGG	2	10	32994	33003	20 %	0 %	80 %	0 %	292486508
17	NC_013961	GCGCT	2	10	33644	33653	0 %	20 %	40 %	40 %	292486511
18	NC_013961	TTCCG	2	10	38027	38036	0 %	40 %	20 %	40 %	292486514
19	NC_013961	CCGAT	2	10	39006	39015	20 %	20 %	20 %	40 %	292486515
20	NC_013961	CGCCA	2	10	39253	39262	20 %	0 %	20 %	60 %	292486516
21	NC_013961	CAAAC	2	10	39859	39868	60 %	0 %	0 %	40 %	292486516
22	NC_013961	TGCCT	2	10	42775	42784	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013961	AAGGC	2	10	43153	43162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013961	TCATG	2	10	43431	43440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013961	ACAGC	2	10	50688	50697	40 %	0 %	20 %	40 %	292486521
26	NC_013961	GGTGA	2	10	53536	53545	20 %	20 %	60 %	0 %	292486522
27	NC_013961	CGGGC	2	10	53871	53880	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013961	TGCTG	2	10	54760	54769	0 %	40 %	40 %	20 %	292486524
29	NC_013961	GCTTT	2	10	55560	55569	0 %	60 %	20 %	20 %	292486525
30	NC_013961	AGCTG	2	10	58337	58346	20 %	20 %	40 %	20 %	292486527
31	NC_013961	CATCG	2	10	59220	59229	20 %	20 %	20 %	40 %	292486528
32	NC_013961	TTTGG	2	10	65897	65906	0 %	60 %	40 %	0 %	292486534
33	NC_013961	ACGCC	2	10	69681	69690	20 %	0 %	20 %	60 %	292486537
34	NC_013961	TGCGG	2	10	69890	69899	0 %	20 %	60 %	20 %	292486537
35	NC_013961	CGCGA	2	10	72346	72355	20 %	0 %	40 %	40 %	292486540
36	NC_013961	AGGCA	2	10	77247	77256	40 %	0 %	40 %	20 %	292486544
37	NC_013961	ACAGA	2	10	79690	79699	60 %	0 %	20 %	20 %	292486546
38	NC_013961	TCATA	2	10	79879	79888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013961	AAAGC	2	10	81011	81020	60 %	0 %	20 %	20 %	292486547
40	NC_013961	GCAGC	2	10	81626	81635	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_013961	CTGAA	2	10	82218	82227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013961	AGTAC	2	10	83128	83137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013961	AAAAT	2	10	85894	85903	80 %	20 %	0 %	0 %	292486552
44	NC_013961	AAAAT	2	10	86479	86488	80 %	20 %	0 %	0 %	292486552
45	NC_013961	AAAGC	2	10	88355	88364	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013961	TATTC	2	10	89099	89108	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013961	GCTGA	2	10	89357	89366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013961	TATTT	2	10	89847	89856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013961	CCAAA	2	10	90896	90905	60 %	0 %	0 %	40 %	292486555
50	NC_013961	TTAGC	2	10	91386	91395	20 %	40 %	20 %	20 %	292486555
51	NC_013961	GAGGG	2	10	91890	91899	20 %	0 %	80 %	0 %	292486556
52	NC_013961	ACCTG	2	10	95540	95549	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013961	GCTGC	2	10	96538	96547	0 %	20 %	40 %	40 %	292486558
54	NC_013961	ATCTC	2	10	96825	96834	20 %	40 %	0 %	40 %	292486559
55	NC_013961	GCAGC	2	10	101627	101636	20 %	0 %	40 %	40 %	292486565
56	NC_013961	TGGCA	2	10	102866	102875	20 %	20 %	40 %	20 %	292486566
57	NC_013961	ATTTT	2	10	103357	103366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013961	TGATT	2	10	103595	103604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013961	TAAGG	2	10	103853	103862	40 %	20 %	40 %	0 %	292486567
60	NC_013961	CAGCG	2	10	105363	105372	20 %	0 %	40 %	40 %	292486570
61	NC_013961	CAGTA	2	10	107849	107858	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013961	TTCAG	2	10	110654	110663	20 %	40 %	20 %	20 %	292486575
63	NC_013961	TAAAA	2	10	113569	113578	80 %	20 %	0 %	0 %	292486579
64	NC_013961	ACAAG	2	10	117002	117011	60 %	0 %	20 %	20 %	292486582
65	NC_013961	GGGCA	2	10	117348	117357	20 %	0 %	60 %	20 %	292486582
66	NC_013961	AGCGT	2	10	117430	117439	20 %	20 %	40 %	20 %	292486582
67	NC_013961	AGCGT	2	10	117607	117616	20 %	20 %	40 %	20 %	292486582
68	NC_013961	GCGCT	2	10	118464	118473	0 %	20 %	40 %	40 %	292486583
69	NC_013961	TCGCA	2	10	118690	118699	20 %	20 %	20 %	40 %	292486583
70	NC_013961	GGCCG	2	10	119233	119242	0 %	0 %	60 %	40 %	292486584
71	NC_013961	GGAAC	2	10	120428	120437	40 %	0 %	40 %	20 %	292486585
72	NC_013961	CGCTG	2	10	122949	122958	0 %	20 %	40 %	40 %	292486587
73	NC_013961	CTCTT	2	10	122978	122987	0 %	60 %	0 %	40 %	292486587
74	NC_013961	GCACA	2	10	124182	124191	40 %	0 %	20 %	40 %	292486589
75	NC_013961	AACAA	2	10	124346	124355	80 %	0 %	0 %	20 %	292486590
76	NC_013961	GTGCA	2	10	124775	124784	20 %	20 %	40 %	20 %	292486590
77	NC_013961	GTTTG	2	10	125110	125119	0 %	60 %	40 %	0 %	292486591
78	NC_013961	CCGCA	2	10	125441	125450	20 %	0 %	20 %	60 %	292486591
79	NC_013961	GCGCT	2	10	125488	125497	0 %	20 %	40 %	40 %	292486591
80	NC_013961	CCACG	2	10	125971	125980	20 %	0 %	20 %	60 %	292486592
81	NC_013961	GCCCG	2	10	127128	127137	0 %	0 %	40 %	60 %	292486593
82	NC_013961	TCTGC	2	10	127706	127715	0 %	40 %	20 %	40 %	292486594
83	NC_013961	TGCCC	2	10	130814	130823	0 %	20 %	20 %	60 %	292486597
84	NC_013961	GCCTG	2	10	130860	130869	0 %	20 %	40 %	40 %	292486597
85	NC_013961	AAATC	2	10	133673	133682	60 %	20 %	0 %	20 %	292486600
86	NC_013961	GGCAG	2	10	137205	137214	20 %	0 %	60 %	20 %	292486604
87	NC_013961	CGCCA	2	10	139974	139983	20 %	0 %	20 %	60 %	292486606
88	NC_013961	GCTTT	2	10	140174	140183	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013961	CCGGG	2	10	140447	140456	0 %	0 %	60 %	40 %	292486607
90	NC_013961	CGTGC	2	10	140496	140505	0 %	20 %	40 %	40 %	292486607
91	NC_013961	TCAGT	2	10	143464	143473	20 %	40 %	20 %	20 %	292486611
92	NC_013961	ACATC	2	10	143997	144006	40 %	20 %	0 %	40 %	292486612
93	NC_013961	TGGCC	2	10	144318	144327	0 %	20 %	40 %	40 %	292486612
94	NC_013961	GGGCA	2	10	145628	145637	20 %	0 %	60 %	20 %	292486614
95	NC_013961	ACTTC	2	10	146727	146736	20 %	40 %	0 %	40 %	292486615
96	NC_013961	ACGCG	2	10	146818	146827	20 %	0 %	40 %	40 %	292486615
97	NC_013961	CGTAT	2	10	149492	149501	20 %	40 %	20 %	20 %	292486618
98	NC_013961	GCTCG	2	10	149974	149983	0 %	20 %	40 %	40 %	292486619
99	NC_013961	GTTGG	2	10	152130	152139	0 %	40 %	60 %	0 %	292486621
100	NC_013961	TGACC	2	10	153777	153786	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013961	AGCGG	2	10	154441	154450	20 %	0 %	60 %	20 %	292486623
102	NC_013961	CTGTT	2	10	154675	154684	0 %	60 %	20 %	20 %	292486623
103	NC_013961	GGCAT	2	10	155852	155861	20 %	20 %	40 %	20 %	292486623
104	NC_013961	AAGGG	2	10	155923	155932	40 %	0 %	60 %	0 %	292486623
105	NC_013961	TTCTT	2	10	157532	157541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013961	ACGGT	2	10	161623	161632	20 %	20 %	40 %	20 %	292486627
107	NC_013961	AACCG	2	10	161675	161684	40 %	0 %	20 %	40 %	292486627
108	NC_013961	GGGGC	2	10	162063	162072	0 %	0 %	80 %	20 %	292486627
109	NC_013961	GGCAT	2	10	164734	164743	20 %	20 %	40 %	20 %	292486630
110	NC_013961	CGGCC	2	10	166746	166755	0 %	0 %	40 %	60 %	292486631
111	NC_013961	CGCAG	2	10	167755	167764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013961	CTATC	2	10	172148	172157	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013961	ATCAC	2	10	173552	173561	40 %	20 %	0 %	40 %	292486637
114	NC_013961	CAGAG	2	10	175583	175592	40 %	0 %	40 %	20 %	292486640
115	NC_013961	TCATG	2	10	180412	180421	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013961	AGTCG	2	10	181503	181512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013961	TGTTT	2	10	184830	184839	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013961	TCACG	2	10	184975	184984	20 %	20 %	20 %	40 %	292486644
119	NC_013961	CAGCG	2	10	186422	186431	20 %	0 %	40 %	40 %	292486645
120	NC_013961	GTCGC	2	10	187033	187042	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013961	AATTA	2	10	187048	187057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013961	CCGGC	2	10	191425	191434	0 %	0 %	40 %	60 %	292486649
123	NC_013961	CTTTG	2	10	192056	192065	0 %	60 %	20 %	20 %	292486649
124	NC_013961	TGCGG	2	10	192499	192508	0 %	20 %	60 %	20 %	292486650
125	NC_013961	TGCTG	2	10	192730	192739	0 %	40 %	40 %	20 %	292486650
126	NC_013961	GGGCA	2	10	194039	194048	20 %	0 %	60 %	20 %	292486651
127	NC_013961	CAGGG	2	10	194665	194674	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013961	GAAGT	2	10	195367	195376	40 %	20 %	40 %	0 %	292486652
129	NC_013961	ATGAA	2	10	195950	195959	60 %	20 %	20 %	0 %	292486652
130	NC_013961	CTTCT	2	10	196502	196511	0 %	60 %	0 %	40 %	292486653
131	NC_013961	AGCGG	2	10	197606	197615	20 %	0 %	60 %	20 %	292486654
132	NC_013961	CAGGC	2	10	200391	200400	20 %	0 %	40 %	40 %	292486656
133	NC_013961	TTCTG	2	10	201444	201453	0 %	60 %	20 %	20 %	292486656
134	NC_013961	CGCCC	2	10	202830	202839	0 %	0 %	20 %	80 %	292486658
135	NC_013961	TCACG	2	10	203008	203017	20 %	20 %	20 %	40 %	292486658
136	NC_013961	CGATG	2	10	203478	203487	20 %	20 %	40 %	20 %	292486658
137	NC_013961	CGAAC	2	10	206459	206468	40 %	0 %	20 %	40 %	292486661
138	NC_013961	GGGCT	2	10	207215	207224	0 %	20 %	60 %	20 %	292486662
139	NC_013961	CCGCG	2	10	208632	208641	0 %	0 %	40 %	60 %	292486663
140	NC_013961	CTGCG	2	10	211033	211042	0 %	20 %	40 %	40 %	292486665
141	NC_013961	AGGTC	2	10	211742	211751	20 %	20 %	40 %	20 %	292486666
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145	NC_013961	CGGCG	2	10	216635	216644	0 %	0 %	60 %	40 %	292486670
146	NC_013961	AGCGA	2	10	217346	217355	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013961	AGCGA	2	10	217708	217717	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013961	AGCGA	2	10	217865	217874	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013961	AGCGA	2	10	218022	218031	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_013961	CGCGG	2	10	219264	219273	0 %	0 %	60 %	40 %	292486672
151	NC_013961	CAACA	2	10	224110	224119	60 %	0 %	0 %	40 %	292486676
152	NC_013961	TTGGC	2	10	227642	227651	0 %	40 %	40 %	20 %	292486679
153	NC_013961	GCCGG	2	10	229373	229382	0 %	0 %	60 %	40 %	292486681
154	NC_013961	GCCGC	2	10	229736	229745	0 %	0 %	40 %	60 %	292486682
155	NC_013961	CCGTA	2	10	230798	230807	20 %	20 %	20 %	40 %	292486682
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158	NC_013961	GCTGG	2	10	234506	234515	0 %	20 %	60 %	20 %	292486685
159	NC_013961	TCATC	2	10	237476	237485	20 %	40 %	0 %	40 %	292486688
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161	NC_013961	CGGGC	2	10	238069	238078	0 %	0 %	60 %	40 %	292486688
162	NC_013961	AATTA	2	10	238335	238344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013961	CGATA	2	10	240220	240229	40 %	20 %	20 %	20 %	292486691
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172	NC_013961	ATCGC	2	10	254934	254943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_013961	TGCCT	2	10	264089	264098	0 %	40 %	20 %	40 %	292486714
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180	NC_013961	AGTCG	2	10	268639	268648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
181	NC_013961	AATTC	2	10	270785	270794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_013961	TACCG	2	10	272472	272481	20 %	20 %	20 %	40 %	292486717
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243	NC_013961	CCTGG	2	10	376280	376289	0 %	20 %	40 %	40 %	292486804
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245	NC_013961	ATTAA	2	10	381688	381697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_013961	TGGCC	2	10	382042	382051	0 %	20 %	40 %	40 %	292486811
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249	NC_013961	CAGTT	2	10	386307	386316	20 %	40 %	20 %	20 %	292486817
250	NC_013961	GAAAA	2	10	389128	389137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_013961	AAGCA	2	10	392041	392050	60 %	0 %	20 %	20 %	292486823
252	NC_013961	AAAGA	2	10	395293	395302	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_013961	GCCAT	2	10	397816	397825	20 %	20 %	20 %	40 %	292486829
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257	NC_013961	CTGAA	2	10	404431	404440	40 %	20 %	20 %	20 %	292486837
258	NC_013961	ACGTG	2	10	406298	406307	20 %	20 %	40 %	20 %	292486837
259	NC_013961	TATTG	2	10	408623	408632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_013961	CGCTG	2	10	414936	414945	0 %	20 %	40 %	40 %	292486844
261	NC_013961	GTGTG	2	10	415153	415162	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
262	NC_013961	GATCG	2	10	415832	415841	20 %	20 %	40 %	20 %	292486845
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266	NC_013961	CGATG	2	10	424670	424679	20 %	20 %	40 %	20 %	292486851
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283	NC_013961	CAGTC	2	10	463130	463139	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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