MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 chromosome

Total Repeats: 81418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013961	CCGTCA	2	12	141997	142008	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292486609
3002	NC_013961	T	6	6	142040	142045	0 %	100 %	0 %	0 %	292486609
3003	NC_013961	T	6	6	142140	142145	0 %	100 %	0 %	0 %	292486610
3004	NC_013961	A	9	9	142209	142217	100 %	0 %	0 %	0 %	292486610
3005	NC_013961	CAG	2	6	142222	142227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486610
3006	NC_013961	T	7	7	142232	142238	0 %	100 %	0 %	0 %	292486610
3007	NC_013961	CGCT	2	8	142273	142280	0 %	25 %	25 %	50 %	292486610
3008	NC_013961	CTG	2	6	142336	142341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_013961	T	6	6	142351	142356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_013961	TTG	2	6	142427	142432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486611
3011	NC_013961	CTAT	2	8	142455	142462	25 %	50 %	0 %	25 %	292486611
3012	NC_013961	TGC	2	6	142483	142488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3013	NC_013961	TGA	2	6	142539	142544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486611
3014	NC_013961	CGT	2	6	142595	142600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3015	NC_013961	TAT	2	6	142630	142635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486611
3016	NC_013961	AGC	2	6	142661	142666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3017	NC_013961	CG	3	6	142743	142748	0 %	0 %	50 %	50 %	292486611
3018	NC_013961	GGC	2	6	142757	142762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486611
3019	NC_013961	GC	3	6	142764	142769	0 %	0 %	50 %	50 %	292486611
3020	NC_013961	CTG	2	6	142787	142792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3021	NC_013961	CTT	2	6	142879	142884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486611
3022	NC_013961	CTG	3	9	142886	142894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3023	NC_013961	CGG	2	6	142908	142913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486611
3024	NC_013961	TGC	2	6	142917	142922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3025	NC_013961	CTG	2	6	142988	142993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3026	NC_013961	GCG	2	6	143070	143075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486611
3027	NC_013961	GTG	2	6	143085	143090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486611
3028	NC_013961	CTG	2	6	143120	143125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3029	NC_013961	CTGC	2	8	143138	143145	0 %	25 %	25 %	50 %	292486611
3030	NC_013961	TTC	2	6	143150	143155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486611
3031	NC_013961	CTGC	2	8	143221	143228	0 %	25 %	25 %	50 %	292486611
3032	NC_013961	GGCG	2	8	143230	143237	0 %	0 %	75 %	25 %	292486611
3033	NC_013961	TGA	2	6	143238	143243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486611
3034	NC_013961	GGCT	2	8	143255	143262	0 %	25 %	50 %	25 %	292486611
3035	NC_013961	CCA	2	6	143340	143345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486611
3036	NC_013961	CCG	2	6	143382	143387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486611
3037	NC_013961	TGG	2	6	143394	143399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486611
3038	NC_013961	TGC	2	6	143448	143453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3039	NC_013961	TCAGT	2	10	143464	143473	20 %	40 %	20 %	20 %	292486611
3040	NC_013961	GCT	2	6	143500	143505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3041	NC_013961	CTG	2	6	143510	143515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486611
3042	NC_013961	GCTG	2	8	143517	143524	0 %	25 %	50 %	25 %	292486611
3043	NC_013961	GCCC	2	8	143588	143595	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3044	NC_013961	GCG	2	6	143662	143667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486612
3045	NC_013961	CAG	2	6	143692	143697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486612
3046	NC_013961	TGG	2	6	143706	143711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486612
3047	NC_013961	CGC	2	6	143748	143753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486612
3048	NC_013961	GC	3	6	143791	143796	0 %	0 %	50 %	50 %	292486612
3049	NC_013961	GC	3	6	143943	143948	0 %	0 %	50 %	50 %	292486612
3050	NC_013961	GCT	2	6	143954	143959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486612
3051	NC_013961	GC	3	6	143979	143984	0 %	0 %	50 %	50 %	292486612
3052	NC_013961	ACATC	2	10	143997	144006	40 %	20 %	0 %	40 %	292486612
3053	NC_013961	GGC	2	6	144040	144045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486612
3054	NC_013961	CAT	2	6	144108	144113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486612
3055	NC_013961	CAG	2	6	144127	144132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486612
3056	NC_013961	TTC	2	6	144190	144195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486612
3057	NC_013961	GATC	2	8	144210	144217	25 %	25 %	25 %	25 %	292486612
3058	NC_013961	GCC	2	6	144227	144232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486612
3059	NC_013961	ACC	2	6	144239	144244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486612
3060	NC_013961	TGGCC	2	10	144318	144327	0 %	20 %	40 %	40 %	292486612
3061	NC_013961	TTA	2	6	144476	144481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486612
3062	NC_013961	CCG	2	6	144516	144521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486612
3063	NC_013961	AGCC	2	8	144552	144559	25 %	0 %	25 %	50 %	292486612
3064	NC_013961	ATC	2	6	144629	144634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_013961	GGC	2	6	144636	144641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_013961	ATC	2	6	144648	144653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_013961	GTCTGC	2	12	144827	144838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486613
3068	NC_013961	ATTT	2	8	144891	144898	25 %	75 %	0 %	0 %	292486614
3069	NC_013961	ACA	2	6	144945	144950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292486614
3070	NC_013961	GGCGTT	2	12	144974	144985	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	292486614
3071	NC_013961	TGC	2	6	145141	145146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486614
3072	NC_013961	TGC	2	6	145162	145167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486614
3073	NC_013961	TGT	2	6	145187	145192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486614
3074	NC_013961	CTG	3	9	145227	145235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486614
3075	NC_013961	TGC	3	9	145267	145275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486614
3076	NC_013961	GCA	2	6	145411	145416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486614
3077	NC_013961	CCG	2	6	145468	145473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486614
3078	NC_013961	TTAT	2	8	145479	145486	25 %	75 %	0 %	0 %	292486614
3079	NC_013961	GTG	2	6	145488	145493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486614
3080	NC_013961	CTG	2	6	145621	145626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486614
3081	NC_013961	GGGCA	2	10	145628	145637	20 %	0 %	60 %	20 %	292486614
3082	NC_013961	CT	3	6	145664	145669	0 %	50 %	0 %	50 %	292486614
3083	NC_013961	GGT	2	6	145670	145675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486614
3084	NC_013961	CGCTGG	2	12	145681	145692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292486614
3085	NC_013961	GA	3	6	145835	145840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_013961	TGT	2	6	145878	145883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486615
3087	NC_013961	GGT	2	6	145951	145956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486615
3088	NC_013961	CG	3	6	146094	146099	0 %	0 %	50 %	50 %	292486615
3089	NC_013961	ATA	2	6	146252	146257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486615
3090	NC_013961	CG	3	6	146274	146279	0 %	0 %	50 %	50 %	292486615
3091	NC_013961	CAC	2	6	146295	146300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486615
3092	NC_013961	CGC	2	6	146451	146456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486615
3093	NC_013961	CAC	2	6	146493	146498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486615
3094	NC_013961	TGG	2	6	146514	146519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486615
3095	NC_013961	CAG	2	6	146521	146526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486615
3096	NC_013961	TCA	2	6	146562	146567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486615
3097	NC_013961	AGC	2	6	146574	146579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486615
3098	NC_013961	CTGC	2	8	146637	146644	0 %	25 %	25 %	50 %	292486615
3099	NC_013961	ACTTC	2	10	146727	146736	20 %	40 %	0 %	40 %	292486615
3100	NC_013961	GCA	2	6	146739	146744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486615
3101	NC_013961	CAT	2	6	146809	146814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486615
3102	NC_013961	ACGCG	2	10	146818	146827	20 %	0 %	40 %	40 %	292486615
3103	NC_013961	CCAG	2	8	146874	146881	25 %	0 %	25 %	50 %	292486615
3104	NC_013961	CAG	2	6	146899	146904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486615
3105	NC_013961	CG	3	6	146925	146930	0 %	0 %	50 %	50 %	292486615
3106	NC_013961	GGT	2	6	146998	147003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486615
3107	NC_013961	TGT	2	6	147029	147034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486615
3108	NC_013961	GT	3	6	147104	147109	0 %	50 %	50 %	0 %	292486615
3109	NC_013961	TGG	2	6	147123	147128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486615
3110	NC_013961	CCA	2	6	147198	147203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486615
3111	NC_013961	CCAG	2	8	147250	147257	25 %	0 %	25 %	50 %	292486615
3112	NC_013961	TGG	2	6	147339	147344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486615
3113	NC_013961	CGA	2	6	147360	147365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486615
3114	NC_013961	CGG	2	6	147378	147383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486615
3115	NC_013961	GC	3	6	147441	147446	0 %	0 %	50 %	50 %	292486616
3116	NC_013961	AGC	2	6	147537	147542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486616
3117	NC_013961	GCC	2	6	147581	147586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486616
3118	NC_013961	CAGC	2	8	147606	147613	25 %	0 %	25 %	50 %	292486616
3119	NC_013961	TGG	2	6	147694	147699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486616
3120	NC_013961	CAT	2	6	147782	147787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486616
3121	NC_013961	GCG	2	6	147957	147962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486616
3122	NC_013961	A	6	6	148190	148195	100 %	0 %	0 %	0 %	292486616
3123	NC_013961	ATG	2	6	148197	148202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486616
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3125	NC_013961	ATG	2	6	148263	148268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486616
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3128	NC_013961	TCA	2	6	148499	148504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3130	NC_013961	AG	3	6	148519	148524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_013961	CTG	2	6	148579	148584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_013961	GCT	3	9	148592	148600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_013961	GTT	2	6	148621	148626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_013961	CAT	2	6	148667	148672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3144	NC_013961	GTC	2	6	149063	149068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486618
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3154	NC_013961	CAG	2	6	149321	149326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486618
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3212	NC_013961	A	7	7	151583	151589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_013961	CGG	2	6	151659	151664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486621
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3220	NC_013961	GAC	2	6	152012	152017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486621
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3223	NC_013961	GTTC	2	8	152106	152113	0 %	50 %	25 %	25 %	292486621
3224	NC_013961	GTTGG	2	10	152130	152139	0 %	40 %	60 %	0 %	292486621
3225	NC_013961	CTG	2	6	152140	152145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486621
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3229	NC_013961	TA	3	6	152278	152283	50 %	50 %	0 %	0 %	292486621
3230	NC_013961	TTC	2	6	152293	152298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486621
3231	NC_013961	TCG	2	6	152343	152348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486621
3232	NC_013961	T	6	6	152359	152364	0 %	100 %	0 %	0 %	292486621
3233	NC_013961	ATG	2	6	152365	152370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486621
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3235	NC_013961	ACGGCC	2	12	152408	152419	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292486621
3236	NC_013961	GCT	2	6	152452	152457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_013961	T	6	6	152461	152466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_013961	CTG	2	6	152474	152479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3239	NC_013961	T	6	6	152482	152487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_013961	CGCC	2	8	152503	152510	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3241	NC_013961	CGA	2	6	152642	152647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_013961	TAC	2	6	152738	152743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486622
3243	NC_013961	GCT	2	6	152804	152809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486622
3244	NC_013961	CAAG	2	8	152810	152817	50 %	0 %	25 %	25 %	292486622
3245	NC_013961	ATC	2	6	152901	152906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486622
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3247	NC_013961	G	6	6	153009	153014	0 %	0 %	100 %	0 %	292486622
3248	NC_013961	TCA	2	6	153026	153031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486622
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3263	NC_013961	TGC	2	6	153620	153625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486622
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3273	NC_013961	TTAA	2	8	154037	154044	50 %	50 %	0 %	0 %	292486623
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3275	NC_013961	CTG	2	6	154210	154215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486623
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3340	NC_013961	GCTT	2	8	156936	156943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3342	NC_013961	TTC	2	6	157017	157022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3343	NC_013961	ATA	2	6	157043	157048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3345	NC_013961	T	6	6	157063	157068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3346	NC_013961	AT	3	6	157075	157080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3347	NC_013961	CG	3	6	157101	157106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3348	NC_013961	GGAT	2	8	157115	157122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3349	NC_013961	AT	3	6	157121	157126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3350	NC_013961	TTG	2	6	157144	157149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3351	NC_013961	CCG	2	6	157263	157268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3352	NC_013961	CTT	2	6	157282	157287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3353	NC_013961	TC	3	6	157288	157293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3354	NC_013961	GGA	2	6	157328	157333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3356	NC_013961	GAT	2	6	157390	157395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3358	NC_013961	TGA	2	6	157464	157469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3359	NC_013961	ACG	2	6	157487	157492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3360	NC_013961	TTCTT	2	10	157532	157541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3361	NC_013961	TGAT	2	8	157617	157624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_013961	ATT	2	6	157675	157680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_013961	A	7	7	157782	157788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3364	NC_013961	TGAC	2	8	157830	157837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3365	NC_013961	CG	3	6	157851	157856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3366	NC_013961	GAA	2	6	157901	157906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3367	NC_013961	ACA	2	6	157934	157939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3368	NC_013961	TGG	2	6	158130	158135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486625
3369	NC_013961	GGC	2	6	158157	158162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486625
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3371	NC_013961	T	8	8	158217	158224	0 %	100 %	0 %	0 %	292486625
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3493	NC_013961	ATC	2	6	164383	164388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486630
3494	NC_013961	CGG	2	6	164430	164435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486630
3495	NC_013961	CAG	2	6	164442	164447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486630
3496	NC_013961	CGC	2	6	164448	164453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486630
3497	NC_013961	GCC	2	6	164466	164471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486630
3498	NC_013961	CCG	2	6	164485	164490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486630
3499	NC_013961	GCC	2	6	164575	164580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486630
3500	NC_013961	ATC	2	6	164617	164622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486630

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