MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 chromosome

Total Repeats: 81418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013961	CCA	2	6	259389	259394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486711
5502	NC_013961	CGGG	2	8	259444	259451	0 %	0 %	75 %	25 %	292486711
5503	NC_013961	CGGA	2	8	259513	259520	25 %	0 %	50 %	25 %	292486711
5504	NC_013961	ATG	2	6	259522	259527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486711
5505	NC_013961	CCA	2	6	259569	259574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486711
5506	NC_013961	ACC	2	6	259583	259588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486711
5507	NC_013961	CTGG	2	8	259623	259630	0 %	25 %	50 %	25 %	292486711
5508	NC_013961	ATG	2	6	259640	259645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486711
5509	NC_013961	TTA	2	6	259688	259693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486711
5510	NC_013961	AGC	2	6	259694	259699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5511	NC_013961	CGC	2	6	259702	259707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486711
5512	NC_013961	TCA	2	6	259749	259754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486711
5513	NC_013961	GCAG	2	8	259771	259778	25 %	0 %	50 %	25 %	292486711
5514	NC_013961	GCC	3	9	259792	259800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486711
5515	NC_013961	ATG	2	6	259802	259807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486711
5516	NC_013961	GCA	2	6	259823	259828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5517	NC_013961	T	6	6	259858	259863	0 %	100 %	0 %	0 %	292486711
5518	NC_013961	AAGA	2	8	259891	259898	75 %	0 %	25 %	0 %	292486711
5519	NC_013961	GC	3	6	259908	259913	0 %	0 %	50 %	50 %	292486711
5520	NC_013961	TCA	2	6	259919	259924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486711
5521	NC_013961	GC	3	6	259927	259932	0 %	0 %	50 %	50 %	292486711
5522	NC_013961	CAC	2	6	260008	260013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486711
5523	NC_013961	GCCG	2	8	260038	260045	0 %	0 %	50 %	50 %	292486711
5524	NC_013961	GCA	2	6	260049	260054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5525	NC_013961	CGG	2	6	260064	260069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486711
5526	NC_013961	TGC	2	6	260083	260088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5527	NC_013961	CTT	2	6	260163	260168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486711
5528	NC_013961	TGC	2	6	260182	260187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5529	NC_013961	CCA	2	6	260220	260225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486711
5530	NC_013961	CCG	2	6	260264	260269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486711
5531	NC_013961	ATA	2	6	260273	260278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486711
5532	NC_013961	CAG	2	6	260299	260304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5533	NC_013961	CA	3	6	260410	260415	50 %	0 %	0 %	50 %	292486711
5534	NC_013961	CCG	2	6	260423	260428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486711
5535	NC_013961	GCCA	2	8	260507	260514	25 %	0 %	25 %	50 %	292486711
5536	NC_013961	ATA	2	6	260561	260566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486711
5537	NC_013961	CGA	2	6	260574	260579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5538	NC_013961	AGC	2	6	260603	260608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5539	NC_013961	GCT	2	6	260625	260630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486711
5540	NC_013961	CCAG	2	8	260733	260740	25 %	0 %	25 %	50 %	292486711
5541	NC_013961	GCG	2	6	260889	260894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_013961	GCTG	2	8	260910	260917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_013961	GAT	2	6	260924	260929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_013961	CAG	2	6	261015	261020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486712
5545	NC_013961	GC	3	6	261027	261032	0 %	0 %	50 %	50 %	292486712
5546	NC_013961	ATTC	2	8	261054	261061	25 %	50 %	0 %	25 %	292486712
5547	NC_013961	GAT	2	6	261294	261299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486712
5548	NC_013961	GCC	2	6	261354	261359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486712
5549	NC_013961	GAT	2	6	261479	261484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486712
5550	NC_013961	GGC	2	6	261503	261508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486712
5551	NC_013961	CAG	2	6	261657	261662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486712
5552	NC_013961	TGAT	2	8	261688	261695	25 %	50 %	25 %	0 %	292486712
5553	NC_013961	GCG	2	6	261744	261749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486712
5554	NC_013961	GAA	2	6	261795	261800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292486712
5555	NC_013961	ATC	2	6	261847	261852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486712
5556	NC_013961	CTG	2	6	261879	261884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486712
5557	NC_013961	GCA	2	6	262046	262051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486712
5558	NC_013961	GCT	2	6	262133	262138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486712
5559	NC_013961	TGA	2	6	262190	262195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486712
5560	NC_013961	GGC	2	6	262209	262214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486712
5561	NC_013961	CG	3	6	262267	262272	0 %	0 %	50 %	50 %	292486712
5562	NC_013961	A	8	8	262339	262346	100 %	0 %	0 %	0 %	292486713
5563	NC_013961	GCT	2	6	262360	262365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486713
5564	NC_013961	CAG	2	6	262418	262423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486713
5565	NC_013961	GCA	2	6	262430	262435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486713
5566	NC_013961	GAT	2	6	262472	262477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486713
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5568	NC_013961	GAT	2	6	262499	262504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486713
5569	NC_013961	CCG	2	6	262521	262526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486713
5570	NC_013961	CGG	2	6	262575	262580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486713
5571	NC_013961	CGG	2	6	262597	262602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486713
5572	NC_013961	CGG	2	6	262618	262623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486713
5573	NC_013961	CAG	2	6	262652	262657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486713
5574	NC_013961	CTG	2	6	262667	262672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486713
5575	NC_013961	TCGC	2	8	262752	262759	0 %	25 %	25 %	50 %	292486713
5576	NC_013961	AGGAA	2	10	262912	262921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5578	NC_013961	T	7	7	263054	263060	0 %	100 %	0 %	0 %	292486714
5579	NC_013961	TGA	2	6	263068	263073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486714
5580	NC_013961	TGG	2	6	263088	263093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486714
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5587	NC_013961	TTC	2	6	263374	263379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486714
5588	NC_013961	G	7	7	263393	263399	0 %	0 %	100 %	0 %	292486714
5589	NC_013961	ACA	2	6	263440	263445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292486714
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5591	NC_013961	TGGC	2	8	263529	263536	0 %	25 %	50 %	25 %	292486714
5592	NC_013961	CCA	2	6	263575	263580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486714
5593	NC_013961	TGG	2	6	263588	263593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486714
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5595	NC_013961	CAA	2	6	263635	263640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292486714
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5598	NC_013961	T	6	6	263852	263857	0 %	100 %	0 %	0 %	292486714
5599	NC_013961	GTT	2	6	263862	263867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486714
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5603	NC_013961	TGT	2	6	263938	263943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486714
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5606	NC_013961	CTG	3	9	264006	264014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486714
5607	NC_013961	TGCCT	2	10	264089	264098	0 %	40 %	20 %	40 %	292486714
5608	NC_013961	TTC	2	6	264126	264131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486714
5609	NC_013961	ACTTC	2	10	264265	264274	20 %	40 %	0 %	40 %	292486714
5610	NC_013961	AATG	2	8	264275	264282	50 %	25 %	25 %	0 %	292486714
5611	NC_013961	TTA	2	6	264342	264347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486714
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5617	NC_013961	GCA	2	6	264622	264627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486715
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5619	NC_013961	TCT	2	6	264642	264647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486715
5620	NC_013961	CGC	2	6	264684	264689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486715
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5754	NC_013961	AC	3	6	274079	274084	50 %	0 %	0 %	50 %	292486718
5755	NC_013961	CAG	2	6	274215	274220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486718
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5757	NC_013961	CTT	2	6	274250	274255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486718
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5761	NC_013961	T	6	6	274389	274394	0 %	100 %	0 %	0 %	292486718
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5764	NC_013961	CA	3	6	274473	274478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5770	NC_013961	ATG	2	6	274728	274733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5878	NC_013961	GCT	2	6	280075	280080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486725
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5880	NC_013961	GCT	3	9	280102	280110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486725
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5882	NC_013961	TCT	2	6	280126	280131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5897	NC_013961	GGAC	2	8	280837	280844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5898	NC_013961	A	6	6	280902	280907	100 %	0 %	0 %	0 %	292486727
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5999	NC_013961	CACC	2	8	286271	286278	25 %	0 %	0 %	75 %	292486728
6000	NC_013961	TGA	2	6	286442	286447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486728

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