MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 3516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	291280825
2	NC_013941	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	291280826
3	NC_013941	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	291280831
4	NC_013941	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	291280832
5	NC_013941	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_013941	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013941	CCGAT	2	10	16491	16500	20 %	20 %	20 %	40 %	291280839
8	NC_013941	AGCGA	2	10	16879	16888	40 %	0 %	40 %	20 %	291280839
9	NC_013941	GTTTT	2	10	19296	19305	0 %	80 %	20 %	0 %	291280842
10	NC_013941	TTTAT	2	10	20352	20361	20 %	80 %	0 %	0 %	291280842
11	NC_013941	AATGT	2	10	21828	21837	40 %	40 %	20 %	0 %	291280843
12	NC_013941	TGCAA	2	10	22041	22050	40 %	20 %	20 %	20 %	291280843
13	NC_013941	ATAAA	2	10	22112	22121	80 %	20 %	0 %	0 %	291280843
14	NC_013941	TAAAA	2	10	22385	22394	80 %	20 %	0 %	0 %	291280843
15	NC_013941	ATTGC	2	10	24127	24136	20 %	40 %	20 %	20 %	291280845
16	NC_013941	TTAAT	2	10	24762	24771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013941	ATTTA	2	10	33586	33595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013941	GCGAA	2	10	36824	36833	40 %	0 %	40 %	20 %	291280856
19	NC_013941	CCGTT	2	10	37718	37727	0 %	40 %	20 %	40 %	291280856
20	NC_013941	CACGG	2	10	38095	38104	20 %	0 %	40 %	40 %	291280856
21	NC_013941	GATGC	2	10	39086	39095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013941	CGAAT	2	10	40837	40846	40 %	20 %	20 %	20 %	291280861
23	NC_013941	CCATG	2	10	42375	42384	20 %	20 %	20 %	40 %	291280862
24	NC_013941	CCGTA	2	10	44021	44030	20 %	20 %	20 %	40 %	291280863
25	NC_013941	GTACA	2	10	44511	44520	40 %	20 %	20 %	20 %	291280863
26	NC_013941	TTAAA	2	10	44759	44768	60 %	40 %	0 %	0 %	291280863
27	NC_013941	ACCCA	2	10	45502	45511	40 %	0 %	0 %	60 %	291280864
28	NC_013941	TGTTA	2	10	46533	46542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013941	TTTGA	2	10	47129	47138	20 %	60 %	20 %	0 %	291280865
30	NC_013941	CGGCG	2	10	47380	47389	0 %	0 %	60 %	40 %	291280865
31	NC_013941	AATCA	2	10	47662	47671	60 %	20 %	0 %	20 %	291280866
32	NC_013941	CGGTT	2	10	48617	48626	0 %	40 %	40 %	20 %	291280867
33	NC_013941	TGGCG	2	10	50308	50317	0 %	20 %	60 %	20 %	291280869
34	NC_013941	TGCAC	2	10	52070	52079	20 %	20 %	20 %	40 %	291280870
35	NC_013941	AGGGC	2	10	53155	53164	20 %	0 %	60 %	20 %	291280871
36	NC_013941	GGCGC	2	10	53189	53198	0 %	0 %	60 %	40 %	291280871
37	NC_013941	GAAAC	2	10	54002	54011	60 %	0 %	20 %	20 %	291280871
38	NC_013941	AACGT	2	10	56475	56484	40 %	20 %	20 %	20 %	291280876
39	NC_013941	GCGTC	2	10	59459	59468	0 %	20 %	40 %	40 %	291280879
40	NC_013941	ATGTT	2	10	60273	60282	20 %	60 %	20 %	0 %	291280880
41	NC_013941	CTTCG	2	10	60706	60715	0 %	40 %	20 %	40 %	291280880
42	NC_013941	TGCGT	2	10	60992	61001	0 %	40 %	40 %	20 %	291280880
43	NC_013941	AAAGT	2	10	68053	68062	60 %	20 %	20 %	0 %	291280884
44	NC_013941	GTGCT	2	10	69316	69325	0 %	40 %	40 %	20 %	291280885
45	NC_013941	GGTGA	2	10	70300	70309	20 %	20 %	60 %	0 %	291280885
46	NC_013941	CAGCG	2	10	71668	71677	20 %	0 %	40 %	40 %	291280887
47	NC_013941	GGATC	2	10	74163	74172	20 %	20 %	40 %	20 %	291280888
48	NC_013941	TAGTG	2	10	80389	80398	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013941	GTAAC	2	10	80530	80539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013941	GGCAA	2	10	80815	80824	40 %	0 %	40 %	20 %	291280894
51	NC_013941	TTGCT	2	10	81550	81559	0 %	60 %	20 %	20 %	291280895
52	NC_013941	GATGG	2	10	82286	82295	20 %	20 %	60 %	0 %	291280895
53	NC_013941	ATTTT	2	10	83114	83123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013941	GGGAG	2	10	83278	83287	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013941	CGCCA	2	10	83342	83351	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_013941	GCTTC	2	10	83431	83440	0 %	40 %	20 %	40 %	291280896
57	NC_013941	CCTGG	2	10	84539	84548	0 %	20 %	40 %	40 %	291280897
58	NC_013941	GACCG	2	10	86806	86815	20 %	0 %	40 %	40 %	291280899
59	NC_013941	ATGTT	2	10	89353	89362	20 %	60 %	20 %	0 %	291280901
60	NC_013941	TGCAT	2	10	90295	90304	20 %	40 %	20 %	20 %	291280902
61	NC_013941	ATTCC	2	10	90465	90474	20 %	40 %	0 %	40 %	291280902
62	NC_013941	TTACG	2	10	91357	91366	20 %	40 %	20 %	20 %	291280902
63	NC_013941	AGTTC	2	10	95558	95567	20 %	40 %	20 %	20 %	291280907
64	NC_013941	CGTGG	2	10	96931	96940	0 %	20 %	60 %	20 %	291280909
65	NC_013941	GGGCT	2	10	101310	101319	0 %	20 %	60 %	20 %	291280912
66	NC_013941	GCCTG	2	10	101770	101779	0 %	20 %	40 %	40 %	291280913
67	NC_013941	ACCGT	2	10	103683	103692	20 %	20 %	20 %	40 %	291280914
68	NC_013941	ATCAG	2	10	105456	105465	40 %	20 %	20 %	20 %	291280916
69	NC_013941	TGACG	2	10	106928	106937	20 %	20 %	40 %	20 %	291280917
70	NC_013941	AGCCG	2	10	107224	107233	20 %	0 %	40 %	40 %	291280917
71	NC_013941	GCGCA	2	10	109552	109561	20 %	0 %	40 %	40 %	291280919
72	NC_013941	TGGCG	2	10	110546	110555	0 %	20 %	60 %	20 %	291280920
73	NC_013941	CCGGC	2	10	113515	113524	0 %	0 %	40 %	60 %	291280923
74	NC_013941	CGCGG	2	10	116724	116733	0 %	0 %	60 %	40 %	291280927
75	NC_013941	ATCCC	2	10	118968	118977	20 %	20 %	0 %	60 %	291280931
76	NC_013941	CATCG	2	10	118981	118990	20 %	20 %	20 %	40 %	291280931
77	NC_013941	TAACG	2	10	119675	119684	40 %	20 %	20 %	20 %	291280931
78	NC_013941	ATGCC	2	10	120134	120143	20 %	20 %	20 %	40 %	291280931
79	NC_013941	AATGC	2	10	121417	121426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013941	TCTGT	2	10	122363	122372	0 %	60 %	20 %	20 %	291280933
81	NC_013941	GCATG	2	10	123456	123465	20 %	20 %	40 %	20 %	291280934
82	NC_013941	AGCAG	2	10	124794	124803	40 %	0 %	40 %	20 %	291280936
83	NC_013941	CGAAG	2	10	126709	126718	40 %	0 %	40 %	20 %	291280937
84	NC_013941	ACACG	2	10	126842	126851	40 %	0 %	20 %	40 %	291280937
85	NC_013941	TCGCG	2	10	127103	127112	0 %	20 %	40 %	40 %	291280937
86	NC_013941	GCATC	2	10	127193	127202	20 %	20 %	20 %	40 %	291280937
87	NC_013941	GACTG	2	10	128511	128520	20 %	20 %	40 %	20 %	291280938
88	NC_013941	AGAGC	2	10	128921	128930	40 %	0 %	40 %	20 %	291280938
89	NC_013941	AGGCG	2	10	134077	134086	20 %	0 %	60 %	20 %	291280941
90	NC_013941	GGTTG	2	10	134830	134839	0 %	40 %	60 %	0 %	291280941
91	NC_013941	TCTGG	2	10	137476	137485	0 %	40 %	40 %	20 %	291280942
92	NC_013941	GGGCA	2	10	138888	138897	20 %	0 %	60 %	20 %	291280943
93	NC_013941	CAGCG	2	10	139167	139176	20 %	0 %	40 %	40 %	291280944
94	NC_013941	ACGAC	2	10	140447	140456	40 %	0 %	20 %	40 %	291280945
95	NC_013941	CCGTC	2	10	146152	146161	0 %	20 %	20 %	60 %	291280949
96	NC_013941	GTGAA	2	10	146162	146171	40 %	20 %	40 %	0 %	291280949
97	NC_013941	GGCAT	2	10	146324	146333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013941	GTTCA	2	10	146549	146558	20 %	40 %	20 %	20 %	291280950
99	NC_013941	ATCCA	2	10	146875	146884	40 %	20 %	0 %	40 %	291280950
100	NC_013941	GTAAG	2	10	147088	147097	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013941	CTTTA	2	10	148138	148147	20 %	60 %	0 %	20 %	291280952
102	NC_013941	TGGCG	2	10	148365	148374	0 %	20 %	60 %	20 %	291280952
103	NC_013941	TCCTC	2	10	148808	148817	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_013941	TTTCA	2	10	150678	150687	20 %	60 %	0 %	20 %	291280955
105	NC_013941	CCTTT	2	10	155372	155381	0 %	60 %	0 %	40 %	291280959
106	NC_013941	TTTAA	2	10	156932	156941	40 %	60 %	0 %	0 %	291280962
107	NC_013941	TGGTT	2	10	157294	157303	0 %	60 %	40 %	0 %	291280963
108	NC_013941	TAAGA	2	10	161494	161503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013941	AAATA	2	10	161504	161513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013941	GCGAG	2	10	162693	162702	20 %	0 %	60 %	20 %	291280967
111	NC_013941	GGCGT	2	10	163131	163140	0 %	20 %	60 %	20 %	291280967
112	NC_013941	ACCAC	2	10	166034	166043	40 %	0 %	0 %	60 %	291280971
113	NC_013941	GGCGT	2	10	167737	167746	0 %	20 %	60 %	20 %	291280972
114	NC_013941	CGACG	2	10	168776	168785	20 %	0 %	40 %	40 %	291280972
115	NC_013941	CTGCG	2	10	170912	170921	0 %	20 %	40 %	40 %	291280973
116	NC_013941	TTATC	2	10	171688	171697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013941	AAAAC	2	10	172763	172772	80 %	0 %	0 %	20 %	291280974
118	NC_013941	TGGTT	2	10	173020	173029	0 %	60 %	40 %	0 %	291280974
119	NC_013941	AACCT	2	10	175101	175110	40 %	20 %	0 %	40 %	291280976
120	NC_013941	TGGTC	2	10	175143	175152	0 %	40 %	40 %	20 %	291280976
121	NC_013941	TGGCG	2	10	176388	176397	0 %	20 %	60 %	20 %	291280977
122	NC_013941	GGTCC	2	10	181952	181961	0 %	20 %	40 %	40 %	291280982
123	NC_013941	ACGGG	2	10	183869	183878	20 %	0 %	60 %	20 %	291280984
124	NC_013941	GTGAT	2	10	186028	186037	20 %	40 %	40 %	0 %	291280985
125	NC_013941	GTGAT	2	10	186319	186328	20 %	40 %	40 %	0 %	291280985
126	NC_013941	TACGT	2	10	186564	186573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013941	TGGCC	2	10	188289	188298	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013941	GCCAG	2	10	190038	190047	20 %	0 %	40 %	40 %	291280989
129	NC_013941	GTTCT	2	10	191479	191488	0 %	60 %	20 %	20 %	291280989
130	NC_013941	CTGAA	2	10	193471	193480	40 %	20 %	20 %	20 %	291280991
131	NC_013941	AAGCG	2	10	193535	193544	40 %	0 %	40 %	20 %	291280991
132	NC_013941	TGGTG	2	10	195441	195450	0 %	40 %	60 %	0 %	291280993
133	NC_013941	TGCAC	2	10	195567	195576	20 %	20 %	20 %	40 %	291280993
134	NC_013941	TGCGC	2	10	195960	195969	0 %	20 %	40 %	40 %	291280993
135	NC_013941	GTCTG	2	10	196125	196134	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013941	CATGG	2	10	197661	197670	20 %	20 %	40 %	20 %	291280995
137	NC_013941	CAGAT	2	10	198700	198709	40 %	20 %	20 %	20 %	291280996
138	NC_013941	ACTTT	2	10	198833	198842	20 %	60 %	0 %	20 %	291280996
139	NC_013941	GACGT	2	10	202753	202762	20 %	20 %	40 %	20 %	291280999
140	NC_013941	CGACG	2	10	204580	204589	20 %	0 %	40 %	40 %	291281001
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142	NC_013941	ATGCC	2	10	207148	207157	20 %	20 %	20 %	40 %	291281004
143	NC_013941	TGGCC	2	10	208474	208483	0 %	20 %	40 %	40 %	291281006
144	NC_013941	ACCGC	2	10	208487	208496	20 %	0 %	20 %	60 %	291281006
145	NC_013941	GTAAC	2	10	209217	209226	40 %	20 %	20 %	20 %	291281006
146	NC_013941	AGCCG	2	10	209845	209854	20 %	0 %	40 %	40 %	291281006
147	NC_013941	GGTGG	2	10	209954	209963	0 %	20 %	80 %	0 %	291281006
148	NC_013941	TTAGT	2	10	216915	216924	20 %	60 %	20 %	0 %	291281010
149	NC_013941	ACGGT	2	10	221010	221019	20 %	20 %	40 %	20 %	291281017
150	NC_013941	TGATT	2	10	223851	223860	20 %	60 %	20 %	0 %	291281020
151	NC_013941	CGCAA	2	10	225301	225310	40 %	0 %	20 %	40 %	291281022
152	NC_013941	CGGTT	2	10	226814	226823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_013941	GTGAA	2	10	235680	235689	40 %	20 %	40 %	0 %	291281027
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161	NC_013941	GGGCA	2	10	255093	255102	20 %	0 %	60 %	20 %	291281044
162	NC_013941	ATTTC	2	10	255603	255612	20 %	60 %	0 %	20 %	291281044
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168	NC_013941	CTAAT	2	10	263686	263695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_013941	TTTGT	2	10	263713	263722	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013941	ACTGT	2	10	264741	264750	20 %	40 %	20 %	20 %	291281054
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172	NC_013941	GCCCG	2	10	267218	267227	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
173	NC_013941	CGGGG	2	10	267447	267456	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
174	NC_013941	GAAGG	2	10	268520	268529	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013941	TGACC	2	10	269084	269093	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_013941	GGCAG	2	10	270358	270367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
177	NC_013941	GGCAG	2	10	272923	272932	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
178	NC_013941	CCTCA	2	10	274972	274981	20 %	20 %	0 %	60 %	291281059
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182	NC_013941	GGGCA	2	10	278551	278560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
183	NC_013941	AAAAG	2	10	279029	279038	80 %	0 %	20 %	0 %	291281062
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190	NC_013941	TGCAT	2	10	288254	288263	20 %	40 %	20 %	20 %	291281072
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201	NC_013941	AAAAC	2	10	304466	304475	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
202	NC_013941	CAGTG	2	10	309063	309072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
203	NC_013941	TTCGT	2	10	310498	310507	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
204	NC_013941	ACAAA	2	10	310666	310675	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
205	NC_013941	AAGGT	2	10	314272	314281	40 %	20 %	40 %	0 %	291281109
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231	NC_013941	ATTTT	2	10	354092	354101	20 %	80 %	0 %	0 %	291281157
232	NC_013941	ATATG	2	10	354417	354426	40 %	40 %	20 %	0 %	291281157
233	NC_013941	AATTT	2	10	354654	354663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_013941	TTTGC	2	10	355970	355979	0 %	60 %	20 %	20 %	291281159
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236	NC_013941	CGCTT	2	10	356461	356470	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
237	NC_013941	GCATC	2	10	357635	357644	20 %	20 %	20 %	40 %	291281162
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240	NC_013941	TGGCA	2	10	358461	358470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_013941	TGGCA	2	10	360048	360057	20 %	20 %	40 %	20 %	291281166
243	NC_013941	GCCGT	2	10	360241	360250	0 %	20 %	40 %	40 %	291281167
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246	NC_013941	AAACT	2	10	363216	363225	60 %	20 %	0 %	20 %	291281169
247	NC_013941	ATCAA	2	10	364084	364093	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
248	NC_013941	GCCGC	2	10	370249	370258	0 %	0 %	40 %	60 %	291281176
249	NC_013941	GTCGG	2	10	373138	373147	0 %	20 %	60 %	20 %	291281177
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252	NC_013941	TTCGC	2	10	374353	374362	0 %	40 %	20 %	40 %	291281178
253	NC_013941	CGTGA	2	10	375400	375409	20 %	20 %	40 %	20 %	291281179
254	NC_013941	TTCTC	2	10	380198	380207	0 %	60 %	0 %	40 %	291281183
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256	NC_013941	TGTGT	2	10	385059	385068	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013941	TGTTA	2	10	386168	386177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013941	TTGAT	2	10	387057	387066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_013941	TCAAT	2	10	387377	387386	40 %	40 %	0 %	20 %	291281192
260	NC_013941	ACGAT	2	10	388165	388174	40 %	20 %	20 %	20 %	291281192
261	NC_013941	GTAAG	2	10	389091	389100	40 %	20 %	40 %	0 %	291281193
262	NC_013941	GGTAA	2	10	389103	389112	40 %	20 %	40 %	0 %	291281193
263	NC_013941	TTTCA	2	10	389388	389397	20 %	60 %	0 %	20 %	291281193
264	NC_013941	GTTAA	2	10	389532	389541	40 %	40 %	20 %	0 %	291281194
265	NC_013941	GCGTG	2	10	392515	392524	0 %	20 %	60 %	20 %	291281198
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